MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002491	TTA	2	6	215296	215301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835711
4002	NC_002491	TTC	2	6	215337	215342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835711
4003	NC_002491	ATC	2	6	215355	215360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835711
4004	NC_002491	TGG	2	6	215379	215384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835711
4005	NC_002491	AGA	2	6	215543	215548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835711
4006	NC_002491	AG	3	6	215583	215588	50 %	0 %	50 %	0 %	15835711
4007	NC_002491	AGA	2	6	215601	215606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835711
4008	NC_002491	ATTCA	2	10	215637	215646	40 %	40 %	0 %	20 %	15835711
4009	NC_002491	AGC	2	6	215670	215675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835711
4010	NC_002491	TA	3	6	215704	215709	50 %	50 %	0 %	0 %	15835711
4011	NC_002491	ATT	2	6	215711	215716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835711
4012	NC_002491	CT	3	6	215771	215776	0 %	50 %	0 %	50 %	15835711
4013	NC_002491	TGA	2	6	215793	215798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835711
4014	NC_002491	CAA	2	6	215809	215814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835711
4015	NC_002491	ATA	2	6	215825	215830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835711
4016	NC_002491	AT	3	6	215835	215840	50 %	50 %	0 %	0 %	15835711
4017	NC_002491	ATG	2	6	215894	215899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835711
4018	NC_002491	GAG	2	6	216236	216241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835712
4019	NC_002491	GAA	2	6	216355	216360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835712
4020	NC_002491	AGCA	2	8	216413	216420	50 %	0 %	25 %	25 %	15835712
4021	NC_002491	TCT	3	9	216535	216543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835712
4022	NC_002491	CGT	2	6	216571	216576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835712
4023	NC_002491	T	6	6	216649	216654	0 %	100 %	0 %	0 %	15835712
4024	NC_002491	GCT	2	6	216739	216744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835712
4025	NC_002491	TC	3	6	216820	216825	0 %	50 %	0 %	50 %	15835712
4026	NC_002491	TCA	2	6	216844	216849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835712
4027	NC_002491	TTC	2	6	216963	216968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835712
4028	NC_002491	AGG	2	6	217013	217018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835712
4029	NC_002491	TTCTCT	2	12	217430	217441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835713
4030	NC_002491	GTT	2	6	217477	217482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835713
4031	NC_002491	GTT	2	6	217560	217565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835713
4032	NC_002491	TCC	2	6	217583	217588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835713
4033	NC_002491	GA	3	6	217597	217602	50 %	0 %	50 %	0 %	15835713
4034	NC_002491	TTTG	2	8	217617	217624	0 %	75 %	25 %	0 %	15835713
4035	NC_002491	AGGTT	2	10	217701	217710	20 %	40 %	40 %	0 %	15835714
4036	NC_002491	GA	3	6	217734	217739	50 %	0 %	50 %	0 %	15835714
4037	NC_002491	AGG	2	6	217771	217776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835714
4038	NC_002491	TCTT	2	8	217791	217798	0 %	75 %	0 %	25 %	15835714
4039	NC_002491	AAG	2	6	217833	217838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835714
4040	NC_002491	TGA	2	6	217839	217844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835714
4041	NC_002491	TAC	2	6	217847	217852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835714
4042	NC_002491	GTTGT	2	10	217886	217895	0 %	60 %	40 %	0 %	15835714
4043	NC_002491	CATTTA	2	12	217966	217977	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15835714
4044	NC_002491	T	7	7	217988	217994	0 %	100 %	0 %	0 %	15835714
4045	NC_002491	CTT	2	6	218073	218078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835715
4046	NC_002491	TCT	2	6	218105	218110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835715
4047	NC_002491	CAA	2	6	218181	218186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835715
4048	NC_002491	T	6	6	218309	218314	0 %	100 %	0 %	0 %	15835715
4049	NC_002491	AAT	2	6	218373	218378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835715
4050	NC_002491	TAA	2	6	218398	218403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835715
4051	NC_002491	CTAG	2	8	218620	218627	25 %	25 %	25 %	25 %	15835716
4052	NC_002491	TGT	2	6	218634	218639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835716
4053	NC_002491	TCCCC	2	10	218641	218650	0 %	20 %	0 %	80 %	15835716
4054	NC_002491	ATG	2	6	218706	218711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835716
4055	NC_002491	AAT	2	6	218723	218728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835716
4056	NC_002491	TAT	2	6	218729	218734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835716
4057	NC_002491	T	6	6	218751	218756	0 %	100 %	0 %	0 %	15835716
4058	NC_002491	A	7	7	218757	218763	100 %	0 %	0 %	0 %	15835716
4059	NC_002491	TAA	2	6	218764	218769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835716
4060	NC_002491	ATT	2	6	218949	218954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835717
4061	NC_002491	A	7	7	218966	218972	100 %	0 %	0 %	0 %	15835717
4062	NC_002491	TGG	2	6	219054	219059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835717
4063	NC_002491	CAC	2	6	219079	219084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835717
4064	NC_002491	ATAGCT	2	12	219117	219128	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15835717
4065	NC_002491	TCT	2	6	219129	219134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835717
4066	NC_002491	ATA	2	6	219176	219181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835717
4067	NC_002491	AGG	2	6	219182	219187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835717
4068	NC_002491	AGG	2	6	219239	219244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835717
4069	NC_002491	ATA	2	6	219248	219253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835717
4070	NC_002491	ATT	2	6	219281	219286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835717
4071	NC_002491	GAT	2	6	219317	219322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835717
4072	NC_002491	CTT	2	6	219415	219420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835717
4073	NC_002491	T	6	6	219473	219478	0 %	100 %	0 %	0 %	15835717
4074	NC_002491	TAA	2	6	219488	219493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835717
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4076	NC_002491	TCAA	2	8	219603	219610	50 %	25 %	0 %	25 %	15835717
4077	NC_002491	TTA	2	6	219741	219746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835717
4078	NC_002491	CGGCTT	2	12	219751	219762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835717
4079	NC_002491	TAA	2	6	219850	219855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835717
4080	NC_002491	T	6	6	219871	219876	0 %	100 %	0 %	0 %	15835717
4081	NC_002491	AAT	2	6	219908	219913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835717
4082	NC_002491	GCA	2	6	219966	219971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835717
4083	NC_002491	CAT	2	6	219983	219988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835717
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4087	NC_002491	ATG	2	6	220317	220322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835717
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4090	NC_002491	ACAA	2	8	220450	220457	75 %	0 %	0 %	25 %	15835718
4091	NC_002491	AAG	2	6	220494	220499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835718
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4093	NC_002491	TAG	2	6	220572	220577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835718
4094	NC_002491	GTA	2	6	220595	220600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835718
4095	NC_002491	T	6	6	220618	220623	0 %	100 %	0 %	0 %	15835718
4096	NC_002491	CTG	2	6	220670	220675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835718
4097	NC_002491	CCCT	2	8	220703	220710	0 %	25 %	0 %	75 %	15835718
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4101	NC_002491	GAAT	2	8	221119	221126	50 %	25 %	25 %	0 %	15835719
4102	NC_002491	A	7	7	221151	221157	100 %	0 %	0 %	0 %	15835719
4103	NC_002491	TC	3	6	221243	221248	0 %	50 %	0 %	50 %	15835719
4104	NC_002491	AAC	2	6	221252	221257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835719
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4107	NC_002491	CTGTA	2	10	221625	221634	20 %	40 %	20 %	20 %	15835720
4108	NC_002491	GGAA	2	8	221677	221684	50 %	0 %	50 %	0 %	15835720
4109	NC_002491	GAAG	2	8	221686	221693	50 %	0 %	50 %	0 %	15835720
4110	NC_002491	T	7	7	221745	221751	0 %	100 %	0 %	0 %	15835720
4111	NC_002491	GAAC	2	8	221818	221825	50 %	0 %	25 %	25 %	15835720
4112	NC_002491	GCA	2	6	221902	221907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835720
4113	NC_002491	CCAT	2	8	221947	221954	25 %	25 %	0 %	50 %	15835720
4114	NC_002491	T	7	7	221994	222000	0 %	100 %	0 %	0 %	15835720
4115	NC_002491	TTC	2	6	222067	222072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835720
4116	NC_002491	AC	3	6	222541	222546	50 %	0 %	0 %	50 %	15835721
4117	NC_002491	ACA	2	6	222597	222602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835721
4118	NC_002491	CTT	2	6	222738	222743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835721
4119	NC_002491	TCT	2	6	222748	222753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835721
4120	NC_002491	GGA	2	6	222801	222806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835721
4121	NC_002491	GAA	2	6	222807	222812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835721
4122	NC_002491	AGA	2	6	222824	222829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835721
4123	NC_002491	TC	3	6	222832	222837	0 %	50 %	0 %	50 %	15835721
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4125	NC_002491	CTG	2	6	222976	222981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835721
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4244	NC_002491	AGC	2	6	230022	230027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835725
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4250	NC_002491	AGG	2	6	230151	230156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835725
4251	NC_002491	ATT	2	6	230243	230248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835725
4252	NC_002491	GCAA	2	8	230419	230426	50 %	0 %	25 %	25 %	15835725
4253	NC_002491	CT	4	8	230608	230615	0 %	50 %	0 %	50 %	15835725
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4258	NC_002491	TC	3	6	230795	230800	0 %	50 %	0 %	50 %	15835725
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4260	NC_002491	AT	3	6	230942	230947	50 %	50 %	0 %	0 %	15835726
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4282	NC_002491	AT	3	6	232031	232036	50 %	50 %	0 %	0 %	15835727
4283	NC_002491	AATA	2	8	232049	232056	75 %	25 %	0 %	0 %	15835727
4284	NC_002491	CA	3	6	232187	232192	50 %	0 %	0 %	50 %	15835727
4285	NC_002491	AAC	2	6	232215	232220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835727
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4291	NC_002491	AG	3	6	232505	232510	50 %	0 %	50 %	0 %	15835728
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4362	NC_002491	A	6	6	236964	236969	100 %	0 %	0 %	0 %	15835731
4363	NC_002491	TTA	2	6	236986	236991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835731
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4366	NC_002491	CTC	2	6	237246	237251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835732
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4372	NC_002491	CATT	2	8	237747	237754	25 %	50 %	0 %	25 %	15835732
4373	NC_002491	ATT	2	6	237817	237822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835732
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4375	NC_002491	CCT	2	6	237846	237851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835732
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