MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002491	GTT	2	6	160491	160496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835662
3002	NC_002491	TTATA	2	10	160533	160542	40 %	60 %	0 %	0 %	15835662
3003	NC_002491	TTA	2	6	160544	160549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835662
3004	NC_002491	AAC	2	6	160721	160726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835662
3005	NC_002491	ATT	2	6	160837	160842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835663
3006	NC_002491	AGA	2	6	160847	160852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835663
3007	NC_002491	TTC	2	6	160888	160893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835663
3008	NC_002491	AGG	2	6	160911	160916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835663
3009	NC_002491	TCC	2	6	160919	160924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835663
3010	NC_002491	CTT	2	6	160948	160953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835663
3011	NC_002491	GAAG	2	8	160959	160966	50 %	0 %	50 %	0 %	15835663
3012	NC_002491	GA	3	6	161043	161048	50 %	0 %	50 %	0 %	15835663
3013	NC_002491	CAA	2	6	161117	161122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835663
3014	NC_002491	TG	3	6	161164	161169	0 %	50 %	50 %	0 %	15835663
3015	NC_002491	AAT	3	9	161198	161206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835663
3016	NC_002491	GAT	2	6	161219	161224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835663
3017	NC_002491	GATT	2	8	161292	161299	25 %	50 %	25 %	0 %	15835663
3018	NC_002491	TTG	2	6	161326	161331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835663
3019	NC_002491	TAGAG	2	10	161359	161368	40 %	20 %	40 %	0 %	15835663
3020	NC_002491	GGC	2	6	161375	161380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15835663
3021	NC_002491	GT	3	6	161405	161410	0 %	50 %	50 %	0 %	15835663
3022	NC_002491	TGA	2	6	161425	161430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835663
3023	NC_002491	CTG	2	6	161436	161441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835663
3024	NC_002491	CGG	2	6	161500	161505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15835663
3025	NC_002491	CAG	2	6	161594	161599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835663
3026	NC_002491	AGG	2	6	161607	161612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835663
3027	NC_002491	AT	3	6	161625	161630	50 %	50 %	0 %	0 %	15835663
3028	NC_002491	T	7	7	161638	161644	0 %	100 %	0 %	0 %	15835663
3029	NC_002491	T	6	6	161658	161663	0 %	100 %	0 %	0 %	15835663
3030	NC_002491	GCAA	2	8	161669	161676	50 %	0 %	25 %	25 %	15835663
3031	NC_002491	AGGC	2	8	161778	161785	25 %	0 %	50 %	25 %	15835663
3032	NC_002491	GAA	2	6	161983	161988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835664
3033	NC_002491	TTA	2	6	162035	162040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835664
3034	NC_002491	ATACG	2	10	162049	162058	40 %	20 %	20 %	20 %	15835664
3035	NC_002491	AAG	2	6	162082	162087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835664
3036	NC_002491	T	6	6	162119	162124	0 %	100 %	0 %	0 %	15835664
3037	NC_002491	GAA	2	6	162144	162149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835664
3038	NC_002491	ACG	2	6	162150	162155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835664
3039	NC_002491	ATC	2	6	162193	162198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835664
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3041	NC_002491	GAT	2	6	162296	162301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835664
3042	NC_002491	G	6	6	162477	162482	0 %	0 %	100 %	0 %	15835664
3043	NC_002491	T	6	6	162485	162490	0 %	100 %	0 %	0 %	15835664
3044	NC_002491	TCC	2	6	162676	162681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835664
3045	NC_002491	CTG	2	6	162761	162766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835664
3046	NC_002491	ATC	2	6	162790	162795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835665
3047	NC_002491	AGT	2	6	162923	162928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835665
3048	NC_002491	TA	3	6	162966	162971	50 %	50 %	0 %	0 %	15835665
3049	NC_002491	AC	3	6	163040	163045	50 %	0 %	0 %	50 %	15835665
3050	NC_002491	AGT	2	6	163055	163060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835665
3051	NC_002491	CTAT	2	8	163103	163110	25 %	50 %	0 %	25 %	15835665
3052	NC_002491	AGT	2	6	163112	163117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835665
3053	NC_002491	TTTC	2	8	163124	163131	0 %	75 %	0 %	25 %	15835665
3054	NC_002491	T	6	6	163171	163176	0 %	100 %	0 %	0 %	15835665
3055	NC_002491	TAGA	2	8	163183	163190	50 %	25 %	25 %	0 %	15835665
3056	NC_002491	TAC	2	6	163240	163245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835665
3057	NC_002491	AGT	2	6	163251	163256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835665
3058	NC_002491	TGT	2	6	163270	163275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835665
3059	NC_002491	GTT	2	6	163351	163356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835665
3060	NC_002491	T	6	6	163386	163391	0 %	100 %	0 %	0 %	15835665
3061	NC_002491	AAGA	2	8	163516	163523	75 %	0 %	25 %	0 %	15835665
3062	NC_002491	T	7	7	163524	163530	0 %	100 %	0 %	0 %	15835665
3063	NC_002491	TTC	2	6	163534	163539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835665
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3066	NC_002491	AGT	2	6	163592	163597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835665
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3069	NC_002491	AAG	2	6	163650	163655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835665
3070	NC_002491	TAT	2	6	163780	163785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835665
3071	NC_002491	ATGC	2	8	163826	163833	25 %	25 %	25 %	25 %	15835665
3072	NC_002491	GA	3	6	163864	163869	50 %	0 %	50 %	0 %	15835665
3073	NC_002491	AGC	2	6	163882	163887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835665
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3089	NC_002491	TGA	2	6	164885	164890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835666
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3093	NC_002491	TCAGT	2	10	165416	165425	20 %	40 %	20 %	20 %	15835667
3094	NC_002491	TAT	2	6	165429	165434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835667
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3096	NC_002491	ATT	2	6	165490	165495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835667
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3098	NC_002491	TGCT	2	8	165503	165510	0 %	50 %	25 %	25 %	15835667
3099	NC_002491	TCTT	2	8	165527	165534	0 %	75 %	0 %	25 %	15835667
3100	NC_002491	TCT	2	6	165550	165555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835667
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3103	NC_002491	TCT	2	6	165697	165702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835667
3104	NC_002491	T	6	6	165720	165725	0 %	100 %	0 %	0 %	15835667
3105	NC_002491	GAAG	2	8	165771	165778	50 %	0 %	50 %	0 %	15835667
3106	NC_002491	T	6	6	165801	165806	0 %	100 %	0 %	0 %	15835667
3107	NC_002491	TTA	2	6	165811	165816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835667
3108	NC_002491	TGA	2	6	165885	165890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835667
3109	NC_002491	AAG	2	6	165934	165939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835667
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3111	NC_002491	TCTA	2	8	166009	166016	25 %	50 %	0 %	25 %	15835667
3112	NC_002491	TTA	2	6	166036	166041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835667
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3115	NC_002491	GAAGT	2	10	166130	166139	40 %	20 %	40 %	0 %	15835667
3116	NC_002491	TTC	2	6	166211	166216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835667
3117	NC_002491	GCAAA	2	10	166218	166227	60 %	0 %	20 %	20 %	15835667
3118	NC_002491	AG	3	6	166228	166233	50 %	0 %	50 %	0 %	15835667
3119	NC_002491	CT	3	6	166266	166271	0 %	50 %	0 %	50 %	15835667
3120	NC_002491	AGA	2	6	166280	166285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835668
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