MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002491	GGT	2	6	27400	27405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835555
502	NC_002491	CTG	2	6	27434	27439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835555
503	NC_002491	TAC	2	6	27594	27599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835555
504	NC_002491	TGG	2	6	27687	27692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835555
505	NC_002491	A	6	6	27766	27771	100 %	0 %	0 %	0 %	15835555
506	NC_002491	AGG	2	6	27858	27863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835555
507	NC_002491	TGC	2	6	27942	27947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835555
508	NC_002491	CTT	2	6	27998	28003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835555
509	NC_002491	TGG	2	6	28035	28040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835555
510	NC_002491	AGG	2	6	28119	28124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835555
511	NC_002491	TC	3	6	28141	28146	0 %	50 %	0 %	50 %	15835555
512	NC_002491	CT	3	6	28172	28177	0 %	50 %	0 %	50 %	15835555
513	NC_002491	TAA	2	6	28182	28187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835555
514	NC_002491	AGG	2	6	28212	28217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835555
515	NC_002491	AGG	2	6	28236	28241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835555
516	NC_002491	AGG	2	6	28263	28268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835555
517	NC_002491	ACA	2	6	28300	28305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835555
518	NC_002491	TGC	2	6	28371	28376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835555
519	NC_002491	CTAT	2	8	28391	28398	25 %	50 %	0 %	25 %	15835555
520	NC_002491	ACC	2	6	28414	28419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835555
521	NC_002491	GA	4	8	28502	28509	50 %	0 %	50 %	0 %	15835555
522	NC_002491	CAG	2	6	28517	28522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835555
523	NC_002491	TAG	2	6	28571	28576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835555
524	NC_002491	CA	3	6	28614	28619	50 %	0 %	0 %	50 %	15835555
525	NC_002491	CTT	2	6	28648	28653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835555
526	NC_002491	TCA	2	6	28697	28702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835556
527	NC_002491	CAG	2	6	28763	28768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835556
528	NC_002491	GGGA	2	8	28890	28897	25 %	0 %	75 %	0 %	15835556
529	NC_002491	TTG	2	6	29105	29110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835556
530	NC_002491	TAG	2	6	29142	29147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835556
531	NC_002491	GTA	2	6	29338	29343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835556
532	NC_002491	CTC	2	6	29433	29438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835556
533	NC_002491	GTC	2	6	29458	29463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835556
534	NC_002491	AAT	2	6	29497	29502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835556
535	NC_002491	ATG	2	6	29555	29560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835556
536	NC_002491	TAC	3	9	29590	29598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835556
537	NC_002491	T	6	6	29610	29615	0 %	100 %	0 %	0 %	15835556
538	NC_002491	TAC	2	6	29623	29628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835556
539	NC_002491	AGG	2	6	29685	29690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835556
540	NC_002491	GA	3	6	29755	29760	50 %	0 %	50 %	0 %	15835556
541	NC_002491	TC	3	6	29886	29891	0 %	50 %	0 %	50 %	15835556
542	NC_002491	T	6	6	30283	30288	0 %	100 %	0 %	0 %	15835557
543	NC_002491	AAG	3	9	30305	30313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835557
544	NC_002491	ATC	2	6	30389	30394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835557
545	NC_002491	GCCA	2	8	30429	30436	25 %	0 %	25 %	50 %	15835557
546	NC_002491	AAT	2	6	30482	30487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835557
547	NC_002491	AG	4	8	30514	30521	50 %	0 %	50 %	0 %	15835557
548	NC_002491	TTTC	2	8	30724	30731	0 %	75 %	0 %	25 %	15835557
549	NC_002491	AACG	2	8	30970	30977	50 %	0 %	25 %	25 %	15835557
550	NC_002491	ATA	2	6	30983	30988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835557
551	NC_002491	GAG	2	6	31067	31072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835557
552	NC_002491	GGA	2	6	31117	31122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835557
553	NC_002491	GC	3	6	31165	31170	0 %	0 %	50 %	50 %	15835557
554	NC_002491	TAT	2	6	31269	31274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835557
555	NC_002491	TTGG	2	8	31318	31325	0 %	50 %	50 %	0 %	15835557
556	NC_002491	AGA	2	6	31351	31356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835557
557	NC_002491	GTT	2	6	31432	31437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835557
558	NC_002491	ATA	2	6	31582	31587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835557
559	NC_002491	GAG	2	6	31691	31696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835557
560	NC_002491	TCC	2	6	31750	31755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835557
561	NC_002491	TCC	2	6	31759	31764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835557
562	NC_002491	AC	3	6	31840	31845	50 %	0 %	0 %	50 %	15835557
563	NC_002491	TGT	2	6	31852	31857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835557
564	NC_002491	AGAA	2	8	31867	31874	75 %	0 %	25 %	0 %	15835557
565	NC_002491	GAA	2	6	31883	31888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835557
566	NC_002491	T	6	6	31921	31926	0 %	100 %	0 %	0 %	15835557
567	NC_002491	AT	3	6	31946	31951	50 %	50 %	0 %	0 %	15835557
568	NC_002491	C	6	6	31996	32001	0 %	0 %	0 %	100 %	15835557
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570	NC_002491	TACA	2	8	32161	32168	50 %	25 %	0 %	25 %	15835557
571	NC_002491	GTT	2	6	32191	32196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835557
572	NC_002491	TTTTTC	2	12	32267	32278	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15835557
573	NC_002491	TGA	2	6	32288	32293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835557
574	NC_002491	AAG	2	6	32342	32347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835557
575	NC_002491	T	6	6	32418	32423	0 %	100 %	0 %	0 %	15835558
576	NC_002491	TCA	2	6	32437	32442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835558
577	NC_002491	T	6	6	32616	32621	0 %	100 %	0 %	0 %	15835558
578	NC_002491	GA	3	6	32633	32638	50 %	0 %	50 %	0 %	15835558
579	NC_002491	T	8	8	32642	32649	0 %	100 %	0 %	0 %	15835558
580	NC_002491	GAT	2	6	32696	32701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835558
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582	NC_002491	AGT	2	6	32783	32788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835558
583	NC_002491	CTT	2	6	32842	32847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835558
584	NC_002491	TAGG	2	8	32848	32855	25 %	25 %	50 %	0 %	15835558
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587	NC_002491	AG	3	6	33076	33081	50 %	0 %	50 %	0 %	15835558
588	NC_002491	CTC	2	6	33197	33202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835558
589	NC_002491	TGCT	2	8	33206	33213	0 %	50 %	25 %	25 %	15835558
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593	NC_002491	T	6	6	33309	33314	0 %	100 %	0 %	0 %	15835558
594	NC_002491	GTA	2	6	33320	33325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835558
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598	NC_002491	TTG	2	6	33428	33433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835558
599	NC_002491	TTC	2	6	33515	33520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835558
600	NC_002491	TTC	2	6	33563	33568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835558
601	NC_002491	ATGA	2	8	33578	33585	50 %	25 %	25 %	0 %	15835558
602	NC_002491	GAT	2	6	33595	33600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835558
603	NC_002491	TTC	2	6	33615	33620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835558
604	NC_002491	GGC	2	6	33638	33643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15835558
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609	NC_002491	TGCTT	2	10	33862	33871	0 %	60 %	20 %	20 %	15835558
610	NC_002491	TCT	2	6	33879	33884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835558
611	NC_002491	GAA	2	6	33902	33907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835558
612	NC_002491	CTG	2	6	33956	33961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835558
613	NC_002491	TA	3	6	33977	33982	50 %	50 %	0 %	0 %	15835558
614	NC_002491	CAA	2	6	34018	34023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835558
615	NC_002491	AG	3	6	34057	34062	50 %	0 %	50 %	0 %	15835558
616	NC_002491	CTC	2	6	34096	34101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835559
617	NC_002491	CCA	2	6	34178	34183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835559
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620	NC_002491	CAT	2	6	34338	34343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835559
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627	NC_002491	GAA	2	6	34730	34735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835560
628	NC_002491	ATCTT	2	10	34740	34749	20 %	60 %	0 %	20 %	15835560
629	NC_002491	GA	3	6	34801	34806	50 %	0 %	50 %	0 %	15835560
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631	NC_002491	CTAAGT	2	12	34864	34875	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15835560
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