MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002491	T	6	6	299117	299122	0 %	100 %	0 %	0 %	15835801
5502	NC_002491	CTT	2	6	299214	299219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835801
5503	NC_002491	GTC	2	6	299229	299234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835801
5504	NC_002491	T	6	6	299241	299246	0 %	100 %	0 %	0 %	15835801
5505	NC_002491	TG	3	6	299272	299277	0 %	50 %	50 %	0 %	15835801
5506	NC_002491	TTG	2	6	299308	299313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835801
5507	NC_002491	AAG	2	6	299353	299358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835801
5508	NC_002491	GCTCCG	2	12	299359	299370	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15835801
5509	NC_002491	TCAA	2	8	299378	299385	50 %	25 %	0 %	25 %	15835801
5510	NC_002491	TTG	2	6	299389	299394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835801
5511	NC_002491	AGC	2	6	299411	299416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835801
5512	NC_002491	AAT	2	6	299749	299754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835802
5513	NC_002491	TCAA	2	8	299781	299788	50 %	25 %	0 %	25 %	15835802
5514	NC_002491	CTG	2	6	299796	299801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835802
5515	NC_002491	AT	3	6	299827	299832	50 %	50 %	0 %	0 %	15835802
5516	NC_002491	TGA	2	6	299889	299894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835802
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5518	NC_002491	CAA	2	6	299958	299963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835802
5519	NC_002491	AAC	2	6	299980	299985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835802
5520	NC_002491	CT	3	6	299997	300002	0 %	50 %	0 %	50 %	15835802
5521	NC_002491	A	6	6	300029	300034	100 %	0 %	0 %	0 %	15835802
5522	NC_002491	AAG	2	6	300069	300074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835802
5523	NC_002491	CTT	2	6	300248	300253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835802
5524	NC_002491	GTC	2	6	300263	300268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835802
5525	NC_002491	TTG	2	6	300342	300347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835802
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5527	NC_002491	CTAT	2	8	300415	300422	25 %	50 %	0 %	25 %	15835802
5528	NC_002491	GAA	2	6	300434	300439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835802
5529	NC_002491	GAAAC	2	10	300441	300450	60 %	0 %	20 %	20 %	15835802
5530	NC_002491	GCAG	2	8	300498	300505	25 %	0 %	50 %	25 %	15835802
5531	NC_002491	A	6	6	300507	300512	100 %	0 %	0 %	0 %	15835802
5532	NC_002491	GAA	2	6	300622	300627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835803
5533	NC_002491	C	6	6	300635	300640	0 %	0 %	0 %	100 %	15835803
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5535	NC_002491	GAT	2	6	300770	300775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835803
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5537	NC_002491	CAA	2	6	300817	300822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835803
5538	NC_002491	AAG	3	9	300897	300905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835803
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5541	NC_002491	A	6	6	301199	301204	100 %	0 %	0 %	0 %	15835804
5542	NC_002491	A	6	6	301260	301265	100 %	0 %	0 %	0 %	15835804
5543	NC_002491	GGA	2	6	301343	301348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835804
5544	NC_002491	TCT	2	6	301419	301424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835804
5545	NC_002491	GAT	2	6	301463	301468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835804
5546	NC_002491	CAT	2	6	301625	301630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835804
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5548	NC_002491	G	6	6	301754	301759	0 %	0 %	100 %	0 %	15835804
5549	NC_002491	ATC	2	6	301764	301769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835804
5550	NC_002491	TAC	2	6	301793	301798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835804
5551	NC_002491	T	8	8	301815	301822	0 %	100 %	0 %	0 %	15835804
5552	NC_002491	TCT	3	9	301840	301848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835804
5553	NC_002491	ATA	2	6	301856	301861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835804
5554	NC_002491	A	7	7	301892	301898	100 %	0 %	0 %	0 %	15835804
5555	NC_002491	AG	3	6	301900	301905	50 %	0 %	50 %	0 %	15835804
5556	NC_002491	C	6	6	301928	301933	0 %	0 %	0 %	100 %	15835804
5557	NC_002491	CA	3	6	301955	301960	50 %	0 %	0 %	50 %	15835804
5558	NC_002491	CTG	2	6	301962	301967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835804
5559	NC_002491	GTT	2	6	301988	301993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835804
5560	NC_002491	AAGT	2	8	302043	302050	50 %	25 %	25 %	0 %	15835804
5561	NC_002491	ATA	2	6	302096	302101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835805
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5563	NC_002491	ATAA	2	8	302150	302157	75 %	25 %	0 %	0 %	15835805
5564	NC_002491	T	6	6	302178	302183	0 %	100 %	0 %	0 %	15835805
5565	NC_002491	A	6	6	302265	302270	100 %	0 %	0 %	0 %	15835805
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5593	NC_002491	T	6	6	304375	304380	0 %	100 %	0 %	0 %	15835807
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5598	NC_002491	AT	3	6	304576	304581	50 %	50 %	0 %	0 %	15835807
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5604	NC_002491	T	7	7	304997	305003	0 %	100 %	0 %	0 %	15835808
5605	NC_002491	AGGA	2	8	305083	305090	50 %	0 %	50 %	0 %	15835808
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5608	NC_002491	GA	3	6	305289	305294	50 %	0 %	50 %	0 %	15835808
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5623	NC_002491	T	6	6	306098	306103	0 %	100 %	0 %	0 %	15835809
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5998	NC_002491	T	7	7	325959	325965	0 %	100 %	0 %	0 %	15835824
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