MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002491	TCA	2	6	244732	244737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835738
4502	NC_002491	ACCA	2	8	244739	244746	50 %	0 %	0 %	50 %	15835738
4503	NC_002491	ATTAG	2	10	244749	244758	40 %	40 %	20 %	0 %	15835738
4504	NC_002491	A	7	7	244764	244770	100 %	0 %	0 %	0 %	15835738
4505	NC_002491	CTA	2	6	244786	244791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835738
4506	NC_002491	CT	3	6	244812	244817	0 %	50 %	0 %	50 %	15835738
4507	NC_002491	CTG	2	6	244824	244829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835738
4508	NC_002491	ACGAAG	2	12	244918	244929	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15835738
4509	NC_002491	CTT	2	6	244932	244937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835738
4510	NC_002491	CTT	2	6	244988	244993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835738
4511	NC_002491	TTA	2	6	245017	245022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835738
4512	NC_002491	AATCT	2	10	245116	245125	40 %	40 %	0 %	20 %	15835738
4513	NC_002491	AGA	2	6	245162	245167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835738
4514	NC_002491	ATT	2	6	245174	245179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835738
4515	NC_002491	A	6	6	245232	245237	100 %	0 %	0 %	0 %	15835738
4516	NC_002491	AAC	2	6	245284	245289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835738
4517	NC_002491	TCA	2	6	245360	245365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835738
4518	NC_002491	TTC	2	6	245390	245395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835738
4519	NC_002491	CAT	2	6	245402	245407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835738
4520	NC_002491	ATAAAA	2	12	245417	245428	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15835738
4521	NC_002491	A	6	6	245459	245464	100 %	0 %	0 %	0 %	15835739
4522	NC_002491	TAATCC	2	12	245497	245508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835739
4523	NC_002491	CTT	2	6	245512	245517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835739
4524	NC_002491	ACAG	2	8	245590	245597	50 %	0 %	25 %	25 %	15835739
4525	NC_002491	TTCT	2	8	245757	245764	0 %	75 %	0 %	25 %	15835740
4526	NC_002491	TACT	2	8	245785	245792	25 %	50 %	0 %	25 %	15835740
4527	NC_002491	CT	3	6	245809	245814	0 %	50 %	0 %	50 %	15835740
4528	NC_002491	T	6	6	245838	245843	0 %	100 %	0 %	0 %	15835740
4529	NC_002491	TAC	2	6	245884	245889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835740
4530	NC_002491	ACG	2	6	246151	246156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835741
4531	NC_002491	ATG	2	6	246184	246189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835741
4532	NC_002491	TCA	2	6	246259	246264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835741
4533	NC_002491	GAT	2	6	246285	246290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835741
4534	NC_002491	CTAG	2	8	246342	246349	25 %	25 %	25 %	25 %	15835741
4535	NC_002491	ATG	2	6	246358	246363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835741
4536	NC_002491	AATC	2	8	246398	246405	50 %	25 %	0 %	25 %	15835741
4537	NC_002491	GGA	2	6	246612	246617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835741
4538	NC_002491	TTG	2	6	246619	246624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835741
4539	NC_002491	TCA	2	6	246634	246639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835741
4540	NC_002491	GAA	2	6	246669	246674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835741
4541	NC_002491	TTC	2	6	246704	246709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835741
4542	NC_002491	AGA	2	6	246734	246739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835741
4543	NC_002491	AGA	2	6	246755	246760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835741
4544	NC_002491	A	9	9	246829	246837	100 %	0 %	0 %	0 %	15835742
4545	NC_002491	TC	3	6	246847	246852	0 %	50 %	0 %	50 %	15835742
4546	NC_002491	TC	3	6	246887	246892	0 %	50 %	0 %	50 %	15835742
4547	NC_002491	ACT	2	6	246946	246951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835742
4548	NC_002491	ATT	2	6	246997	247002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835742
4549	NC_002491	ACT	3	9	247014	247022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835742
4550	NC_002491	CA	3	6	247023	247028	50 %	0 %	0 %	50 %	15835742
4551	NC_002491	CTT	2	6	247149	247154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835742
4552	NC_002491	T	6	6	247212	247217	0 %	100 %	0 %	0 %	15835742
4553	NC_002491	TCCT	2	8	247339	247346	0 %	50 %	0 %	50 %	15835742
4554	NC_002491	TGG	2	6	247418	247423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835742
4555	NC_002491	CTC	2	6	247495	247500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835742
4556	NC_002491	CCA	2	6	247540	247545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835742
4557	NC_002491	A	7	7	247611	247617	100 %	0 %	0 %	0 %	15835742
4558	NC_002491	GAA	2	6	247618	247623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835742
4559	NC_002491	A	6	6	247622	247627	100 %	0 %	0 %	0 %	15835742
4560	NC_002491	TGA	2	6	247634	247639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835742
4561	NC_002491	TCC	2	6	247646	247651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835742
4562	NC_002491	CAA	2	6	247694	247699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835742
4563	NC_002491	CAG	2	6	247700	247705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835742
4564	NC_002491	TC	3	6	247720	247725	0 %	50 %	0 %	50 %	15835742
4565	NC_002491	ACA	2	6	247774	247779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835742
4566	NC_002491	ATG	2	6	247816	247821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835742
4567	NC_002491	CTTC	2	8	247823	247830	0 %	50 %	0 %	50 %	15835742
4568	NC_002491	CAG	3	9	247868	247876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835742
4569	NC_002491	CT	3	6	247891	247896	0 %	50 %	0 %	50 %	15835742
4570	NC_002491	TCTACT	2	12	247928	247939	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15835742
4571	NC_002491	GCA	2	6	248035	248040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835742
4572	NC_002491	GCAA	2	8	248056	248063	50 %	0 %	25 %	25 %	15835742
4573	NC_002491	GGA	2	6	248071	248076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835742
4574	NC_002491	CTCA	2	8	248077	248084	25 %	25 %	0 %	50 %	15835742
4575	NC_002491	GTG	2	6	248142	248147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835742
4576	NC_002491	TGG	2	6	248209	248214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835742
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4580	NC_002491	ACC	2	6	248725	248730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835743
4581	NC_002491	CTC	2	6	248773	248778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835743
4582	NC_002491	AGG	2	6	248801	248806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835743
4583	NC_002491	AGG	2	6	248816	248821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835743
4584	NC_002491	TCC	2	6	248874	248879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835743
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4587	NC_002491	TC	3	6	248948	248953	0 %	50 %	0 %	50 %	15835743
4588	NC_002491	AGGA	2	8	248993	249000	50 %	0 %	50 %	0 %	15835743
4589	NC_002491	A	7	7	249000	249006	100 %	0 %	0 %	0 %	15835743
4590	NC_002491	ATT	2	6	249075	249080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835743
4591	NC_002491	ACG	2	6	249134	249139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835743
4592	NC_002491	ACA	2	6	249188	249193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835743
4593	NC_002491	CTT	2	6	249197	249202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835743
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4595	NC_002491	GAA	2	6	249384	249389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835743
4596	NC_002491	A	7	7	249397	249403	100 %	0 %	0 %	0 %	15835743
4597	NC_002491	CAT	2	6	249419	249424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835743
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4601	NC_002491	ATC	2	6	249627	249632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835743
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4603	NC_002491	ATC	2	6	249721	249726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835743
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4605	NC_002491	ATA	2	6	249814	249819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835743
4606	NC_002491	TC	3	6	249881	249886	0 %	50 %	0 %	50 %	15835743
4607	NC_002491	ACA	2	6	249965	249970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835743
4608	NC_002491	A	6	6	249999	250004	100 %	0 %	0 %	0 %	15835743
4609	NC_002491	CTC	2	6	250111	250116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835743
4610	NC_002491	CTC	2	6	250141	250146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835743
4611	NC_002491	TAC	2	6	250208	250213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835743
4612	NC_002491	ATTA	2	8	250216	250223	50 %	50 %	0 %	0 %	15835743
4613	NC_002491	TC	3	6	250693	250698	0 %	50 %	0 %	50 %	15835744
4614	NC_002491	TAT	2	6	250723	250728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835744
4615	NC_002491	CT	3	6	250807	250812	0 %	50 %	0 %	50 %	15835744
4616	NC_002491	TC	3	6	250852	250857	0 %	50 %	0 %	50 %	15835744
4617	NC_002491	ATA	2	6	250890	250895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835744
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4619	NC_002491	ACTT	2	8	251162	251169	25 %	50 %	0 %	25 %	15835745
4620	NC_002491	GTTT	2	8	251197	251204	0 %	75 %	25 %	0 %	15835745
4621	NC_002491	CTC	2	6	251250	251255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835745
4622	NC_002491	CAA	2	6	251319	251324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835745
4623	NC_002491	TGAT	2	8	251340	251347	25 %	50 %	25 %	0 %	15835745
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4625	NC_002491	CTC	2	6	251367	251372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835745
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