MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 22542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002179	ATC	2	6	210604	210609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752495
4002	NC_002179	TCGT	2	8	210802	210809	0 %	50 %	25 %	25 %	16752496
4003	NC_002179	AG	3	6	210811	210816	50 %	0 %	50 %	0 %	16752496
4004	NC_002179	GGTCGT	2	12	210846	210857	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	16752496
4005	NC_002179	GAT	2	6	210858	210863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752496
4006	NC_002179	GTA	2	6	210891	210896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752496
4007	NC_002179	TGT	2	6	210926	210931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752496
4008	NC_002179	GTT	2	6	211102	211107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161353773
4009	NC_002179	AGG	2	6	211137	211142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161353773
4010	NC_002179	TGG	2	6	211158	211163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161353773
4011	NC_002179	GGC	2	6	211168	211173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161353773
4012	NC_002179	CCA	2	6	211190	211195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161353773
4013	NC_002179	GTCA	2	8	211253	211260	25 %	25 %	25 %	25 %	161353773
4014	NC_002179	AGG	2	6	211401	211406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161353773
4015	NC_002179	AGGAAA	2	12	211413	211424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353773
4016	NC_002179	CTT	2	6	211428	211433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161353773
4017	NC_002179	TCA	2	6	211716	211721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161353773
4018	NC_002179	TTC	2	6	211745	211750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161353773
4019	NC_002179	AG	4	8	211801	211808	50 %	0 %	50 %	0 %	161353773
4020	NC_002179	GAA	2	6	211819	211824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353773
4021	NC_002179	TCA	2	6	211857	211862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161353773
4022	NC_002179	AAAG	2	8	211875	211882	75 %	0 %	25 %	0 %	161353773
4023	NC_002179	TAAA	2	8	211898	211905	75 %	25 %	0 %	0 %	161353773
4024	NC_002179	TGA	2	6	211908	211913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161353773
4025	NC_002179	TCT	2	6	211914	211919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161353773
4026	NC_002179	GAA	2	6	211933	211938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353773
4027	NC_002179	CTT	2	6	212028	212033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161353773
4028	NC_002179	CA	3	6	212034	212039	50 %	0 %	0 %	50 %	161353773
4029	NC_002179	TAACC	2	10	212053	212062	40 %	20 %	0 %	40 %	161353773
4030	NC_002179	AAG	2	6	212286	212291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752498
4031	NC_002179	TCA	2	6	212341	212346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752498
4032	NC_002179	AAG	2	6	212397	212402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752498
4033	NC_002179	TGA	2	6	212468	212473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752498
4034	NC_002179	ATC	2	6	212539	212544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752498
4035	NC_002179	CATA	2	8	212630	212637	50 %	25 %	0 %	25 %	16752498
4036	NC_002179	A	6	6	212641	212646	100 %	0 %	0 %	0 %	16752498
4037	NC_002179	GA	3	6	212647	212652	50 %	0 %	50 %	0 %	16752498
4038	NC_002179	TCC	2	6	212688	212693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752498
4039	NC_002179	CGC	2	6	212762	212767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16752498
4040	NC_002179	AAG	2	6	212814	212819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752498
4041	NC_002179	GAG	2	6	212842	212847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752498
4042	NC_002179	ACA	2	6	212879	212884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752499
4043	NC_002179	A	6	6	212941	212946	100 %	0 %	0 %	0 %	16752499
4044	NC_002179	TTA	2	6	212949	212954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752499
4045	NC_002179	TCG	2	6	212962	212967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752499
4046	NC_002179	T	6	6	213018	213023	0 %	100 %	0 %	0 %	16752499
4047	NC_002179	TTG	2	6	213041	213046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752499
4048	NC_002179	GTC	2	6	213066	213071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752499
4049	NC_002179	TCA	2	6	213075	213080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752499
4050	NC_002179	AGG	2	6	213100	213105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752499
4051	NC_002179	TCC	2	6	213140	213145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752499
4052	NC_002179	GA	3	6	213147	213152	50 %	0 %	50 %	0 %	16752499
4053	NC_002179	GTG	4	12	213164	213175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16752499
4054	NC_002179	CAA	2	6	213187	213192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752499
4055	NC_002179	TCTT	2	8	213222	213229	0 %	75 %	0 %	25 %	16752499
4056	NC_002179	ACA	2	6	213276	213281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752499
4057	NC_002179	GTTT	2	8	213351	213358	0 %	75 %	25 %	0 %	16752499
4058	NC_002179	AAGC	2	8	213407	213414	50 %	0 %	25 %	25 %	16752499
4059	NC_002179	C	6	6	213443	213448	0 %	0 %	0 %	100 %	16752499
4060	NC_002179	CAT	2	6	213481	213486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752499
4061	NC_002179	AGAA	2	8	213493	213500	75 %	0 %	25 %	0 %	16752499
4062	NC_002179	CAT	2	6	213502	213507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752499
4063	NC_002179	GTC	2	6	213587	213592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752500
4064	NC_002179	ACT	2	6	213678	213683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752500
4065	NC_002179	GAA	2	6	213704	213709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752500
4066	NC_002179	AGA	2	6	213714	213719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752500
4067	NC_002179	GA	3	6	213806	213811	50 %	0 %	50 %	0 %	16752500
4068	NC_002179	GTT	2	6	213866	213871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752500
4069	NC_002179	TC	3	6	213932	213937	0 %	50 %	0 %	50 %	16752500
4070	NC_002179	T	6	6	213972	213977	0 %	100 %	0 %	0 %	16752500
4071	NC_002179	TTG	2	6	214116	214121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752500
4072	NC_002179	TC	3	6	214134	214139	0 %	50 %	0 %	50 %	16752500
4073	NC_002179	T	6	6	214145	214150	0 %	100 %	0 %	0 %	16752500
4074	NC_002179	GAG	2	6	214208	214213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752500
4075	NC_002179	CAT	2	6	214343	214348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752500
4076	NC_002179	CTTTT	2	10	214876	214885	0 %	80 %	0 %	20 %	16752501
4077	NC_002179	AG	3	6	214888	214893	50 %	0 %	50 %	0 %	16752501
4078	NC_002179	ATT	2	6	214915	214920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752501
4079	NC_002179	TAT	2	6	214956	214961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752501
4080	NC_002179	AAT	2	6	214966	214971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752501
4081	NC_002179	TGAGGT	2	12	215138	215149	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16752501
4082	NC_002179	T	7	7	215213	215219	0 %	100 %	0 %	0 %	16752501
4083	NC_002179	TAG	2	6	215234	215239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752501
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4085	NC_002179	AGA	2	6	215319	215324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752501
4086	NC_002179	CTGA	2	8	215419	215426	25 %	25 %	25 %	25 %	16752501
4087	NC_002179	AAAT	2	8	215439	215446	75 %	25 %	0 %	0 %	16752501
4088	NC_002179	CAG	2	6	215469	215474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752501
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4090	NC_002179	GTT	2	6	215563	215568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752501
4091	NC_002179	AAT	2	6	215731	215736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752501
4092	NC_002179	T	6	6	215785	215790	0 %	100 %	0 %	0 %	16752501
4093	NC_002179	AGA	2	6	215924	215929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752501
4094	NC_002179	ATCTT	2	10	215951	215960	20 %	60 %	0 %	20 %	16752501
4095	NC_002179	GTGG	2	8	215996	216003	0 %	25 %	75 %	0 %	16752501
4096	NC_002179	TAG	2	6	216024	216029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752501
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4099	NC_002179	CTT	2	6	216081	216086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752501
4100	NC_002179	ATTT	2	8	216228	216235	25 %	75 %	0 %	0 %	16752501
4101	NC_002179	TGG	2	6	216318	216323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16752501
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4104	NC_002179	TTTG	2	8	216412	216419	0 %	75 %	25 %	0 %	16752501
4105	NC_002179	ATT	2	6	216496	216501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752501
4106	NC_002179	ATT	2	6	216523	216528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752501
4107	NC_002179	CAT	2	6	216636	216641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752501
4108	NC_002179	TC	3	6	216693	216698	0 %	50 %	0 %	50 %	16752501
4109	NC_002179	ATAG	2	8	216700	216707	50 %	25 %	25 %	0 %	16752501
4110	NC_002179	CTC	2	6	216816	216821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752501
4111	NC_002179	CTC	2	6	216894	216899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752501
4112	NC_002179	TGC	2	6	216925	216930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752501
4113	NC_002179	ATT	2	6	216955	216960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752501
4114	NC_002179	AAT	2	6	216967	216972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752501
4115	NC_002179	CCA	2	6	217019	217024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752501
4116	NC_002179	TGT	2	6	217036	217041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752501
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4118	NC_002179	GCA	2	6	217058	217063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752501
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4121	NC_002179	AT	3	6	217206	217211	50 %	50 %	0 %	0 %	16752501
4122	NC_002179	CCA	2	6	217247	217252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752501
4123	NC_002179	TAG	2	6	217266	217271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752501
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4125	NC_002179	CAC	2	6	217356	217361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752501
4126	NC_002179	TAA	2	6	217395	217400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752501
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4129	NC_002179	CCA	2	6	217517	217522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752501
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4132	NC_002179	CAC	2	6	217614	217619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752501
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4236	NC_002179	AG	3	6	222833	222838	50 %	0 %	50 %	0 %	16752502
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