MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 22542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002179	ATC	2	6	24794	24799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752312
502	NC_002179	AAT	2	6	24818	24823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752312
503	NC_002179	GAG	2	6	24824	24829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752312
504	NC_002179	GTTT	2	8	24936	24943	0 %	75 %	25 %	0 %	16752312
505	NC_002179	CAG	2	6	24960	24965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
506	NC_002179	CAG	2	6	25010	25015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
507	NC_002179	CT	3	6	25033	25038	0 %	50 %	0 %	50 %	16752312
508	NC_002179	AAC	2	6	25059	25064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752312
509	NC_002179	CTG	2	6	25504	25509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752313
510	NC_002179	TAAA	2	8	25557	25564	75 %	25 %	0 %	0 %	16752313
511	NC_002179	CCT	2	6	25574	25579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752313
512	NC_002179	AGC	2	6	25624	25629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752313
513	NC_002179	TCA	2	6	25646	25651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752313
514	NC_002179	AC	3	6	25668	25673	50 %	0 %	0 %	50 %	16752313
515	NC_002179	TTA	2	6	25688	25693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752313
516	NC_002179	ATA	2	6	25780	25785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752313
517	NC_002179	AG	3	6	25835	25840	50 %	0 %	50 %	0 %	16752313
518	NC_002179	T	6	6	25845	25850	0 %	100 %	0 %	0 %	16752313
519	NC_002179	AG	3	6	25999	26004	50 %	0 %	50 %	0 %	16752313
520	NC_002179	TAG	2	6	26009	26014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752313
521	NC_002179	TTC	2	6	26092	26097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752313
522	NC_002179	A	6	6	26111	26116	100 %	0 %	0 %	0 %	16752313
523	NC_002179	AGC	2	6	26191	26196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752313
524	NC_002179	CTTT	2	8	26253	26260	0 %	75 %	0 %	25 %	16752313
525	NC_002179	TGTAAT	2	12	26276	26287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16752313
526	NC_002179	ACC	2	6	26398	26403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752313
527	NC_002179	TGT	2	6	26431	26436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752313
528	NC_002179	A	6	6	26498	26503	100 %	0 %	0 %	0 %	16752313
529	NC_002179	TTTGA	2	10	26548	26557	20 %	60 %	20 %	0 %	16752313
530	NC_002179	ACC	2	6	26644	26649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752313
531	NC_002179	AAC	2	6	26650	26655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752313
532	NC_002179	TCA	2	6	26705	26710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752313
533	NC_002179	CAG	2	6	26781	26786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752313
534	NC_002179	AT	3	6	26789	26794	50 %	50 %	0 %	0 %	16752313
535	NC_002179	TTA	2	6	26795	26800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752313
536	NC_002179	TTG	2	6	26860	26865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752313
537	NC_002179	GTT	2	6	26899	26904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752313
538	NC_002179	AG	3	6	26926	26931	50 %	0 %	50 %	0 %	16752313
539	NC_002179	GTA	2	6	27105	27110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752313
540	NC_002179	CCA	2	6	27131	27136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752313
541	NC_002179	CAT	2	6	27159	27164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752313
542	NC_002179	AGG	2	6	27235	27240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752313
543	NC_002179	AGC	2	6	27248	27253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752313
544	NC_002179	TCAT	2	8	27266	27273	25 %	50 %	0 %	25 %	16752313
545	NC_002179	ATGT	2	8	27306	27313	25 %	50 %	25 %	0 %	16752313
546	NC_002179	GAA	2	6	27337	27342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752313
547	NC_002179	CTG	2	6	27345	27350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752313
548	NC_002179	TCT	2	6	27431	27436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752313
549	NC_002179	CAG	2	6	27453	27458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752313
550	NC_002179	T	7	7	27488	27494	0 %	100 %	0 %	0 %	16752313
551	NC_002179	GCT	3	9	27680	27688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752313
552	NC_002179	TGA	2	6	27712	27717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752313
553	NC_002179	AGCT	2	8	27732	27739	25 %	25 %	25 %	25 %	16752313
554	NC_002179	TGT	2	6	27772	27777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752313
555	NC_002179	TAA	2	6	27802	27807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752313
556	NC_002179	AGC	2	6	27808	27813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752313
557	NC_002179	TGA	2	6	27942	27947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752313
558	NC_002179	GCGA	2	8	28381	28388	25 %	0 %	50 %	25 %	16752314
559	NC_002179	CAG	2	6	28529	28534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752314
560	NC_002179	TAT	2	6	28558	28563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752314
561	NC_002179	TAAAT	2	10	28677	28686	60 %	40 %	0 %	0 %	16752314
562	NC_002179	AAT	2	6	28717	28722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752314
563	NC_002179	AGA	2	6	28728	28733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752314
564	NC_002179	CT	3	6	28745	28750	0 %	50 %	0 %	50 %	16752314
565	NC_002179	GGCA	2	8	28836	28843	25 %	0 %	50 %	25 %	16752314
566	NC_002179	TGA	2	6	29010	29015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752314
567	NC_002179	CGC	2	6	29055	29060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16752314
568	NC_002179	TTC	2	6	29070	29075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752314
569	NC_002179	TTG	2	6	29231	29236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752314
570	NC_002179	TAG	2	6	29292	29297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752314
571	NC_002179	CTG	2	6	29360	29365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752314
572	NC_002179	GTG	2	6	29417	29422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16752314
573	NC_002179	GCT	2	6	29506	29511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752314
574	NC_002179	GAA	2	6	29518	29523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752314
575	NC_002179	CAT	2	6	29558	29563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752314
576	NC_002179	TA	3	6	29646	29651	50 %	50 %	0 %	0 %	16752314
577	NC_002179	AAAC	2	8	29741	29748	75 %	0 %	0 %	25 %	16752314
578	NC_002179	TGC	2	6	29790	29795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752314
579	NC_002179	CAA	2	6	29848	29853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752314
580	NC_002179	GATC	2	8	29952	29959	25 %	25 %	25 %	25 %	16752314
581	NC_002179	AAG	2	6	30001	30006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752314
582	NC_002179	TAT	2	6	30010	30015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752314
583	NC_002179	TCT	2	6	30028	30033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752314
584	NC_002179	ATT	2	6	30046	30051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752314
585	NC_002179	ACA	2	6	30111	30116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752314
586	NC_002179	GCT	2	6	30202	30207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752314
587	NC_002179	GAA	2	6	30247	30252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752314
588	NC_002179	GAT	2	6	30274	30279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752314
589	NC_002179	AGC	2	6	30293	30298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752314
590	NC_002179	ACA	2	6	30335	30340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752314
591	NC_002179	TTAC	2	8	30378	30385	25 %	50 %	0 %	25 %	16752314
592	NC_002179	GAA	2	6	30475	30480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752314
593	NC_002179	TAG	2	6	30497	30502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752314
594	NC_002179	GCA	2	6	30621	30626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752314
595	NC_002179	TTC	2	6	30706	30711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752314
596	NC_002179	CTC	2	6	30781	30786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752315
597	NC_002179	CTCG	2	8	30846	30853	0 %	25 %	25 %	50 %	16752315
598	NC_002179	ATT	2	6	30905	30910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752315
599	NC_002179	CT	3	6	30969	30974	0 %	50 %	0 %	50 %	16752315
600	NC_002179	CTA	2	6	30987	30992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752315
601	NC_002179	GATTA	2	10	30993	31002	40 %	40 %	20 %	0 %	16752315
602	NC_002179	TG	3	6	31071	31076	0 %	50 %	50 %	0 %	16752316
603	NC_002179	GCTT	2	8	31210	31217	0 %	50 %	25 %	25 %	16752316
604	NC_002179	AGG	2	6	31314	31319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752316
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606	NC_002179	T	7	7	31340	31346	0 %	100 %	0 %	0 %	16752316
607	NC_002179	GTA	2	6	31353	31358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752316
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609	NC_002179	ATG	2	6	31461	31466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752316
610	NC_002179	ATG	2	6	31520	31525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752316
611	NC_002179	ACT	2	6	31547	31552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752316
612	NC_002179	ATC	2	6	31556	31561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752316
613	NC_002179	AC	3	6	31591	31596	50 %	0 %	0 %	50 %	16752316
614	NC_002179	A	6	6	31600	31605	100 %	0 %	0 %	0 %	16752316
615	NC_002179	GAG	2	6	31764	31769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752316
616	NC_002179	AGA	3	9	31792	31800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752316
617	NC_002179	AGA	2	6	31953	31958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752317
618	NC_002179	AAT	2	6	31969	31974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752317
619	NC_002179	AAC	2	6	32120	32125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752317
620	NC_002179	TCG	2	6	32170	32175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752317
621	NC_002179	ATC	2	6	32230	32235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752317
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624	NC_002179	TGT	2	6	32467	32472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752317
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627	NC_002179	CTT	2	6	32563	32568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752317
628	NC_002179	AC	3	6	32578	32583	50 %	0 %	0 %	50 %	16752317
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