MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 plasmid pSOL1

Total Repeats: 3850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_001988	TA	3	6	25062	25067	50 %	50 %	0 %	0 %	15004729
502	NC_001988	TGAAT	2	10	25106	25115	40 %	40 %	20 %	0 %	15004729
503	NC_001988	TGC	2	6	25124	25129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004729
504	NC_001988	ACA	2	6	25170	25175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15004729
505	NC_001988	GTT	2	6	25239	25244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15004729
506	NC_001988	CA	3	6	25299	25304	50 %	0 %	0 %	50 %	15004729
507	NC_001988	T	6	6	25329	25334	0 %	100 %	0 %	0 %	15004729
508	NC_001988	GAA	2	6	25377	25382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004729
509	NC_001988	GCA	2	6	25386	25391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004729
510	NC_001988	TAA	2	6	25567	25572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004729
511	NC_001988	A	6	6	25580	25585	100 %	0 %	0 %	0 %	15004729
512	NC_001988	A	6	6	25654	25659	100 %	0 %	0 %	0 %	15004729
513	NC_001988	TGA	2	6	25775	25780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004729
514	NC_001988	ATT	2	6	25791	25796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004729
515	NC_001988	A	6	6	25902	25907	100 %	0 %	0 %	0 %	15004729
516	NC_001988	T	7	7	26051	26057	0 %	100 %	0 %	0 %	15004729
517	NC_001988	AAAAGA	2	12	26078	26089	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15004729
518	NC_001988	TAT	2	6	26092	26097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004729
519	NC_001988	T	6	6	26118	26123	0 %	100 %	0 %	0 %	15004729
520	NC_001988	AC	3	6	26194	26199	50 %	0 %	0 %	50 %	15004729
521	NC_001988	TTA	2	6	26208	26213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004729
522	NC_001988	A	6	6	26233	26238	100 %	0 %	0 %	0 %	15004729
523	NC_001988	CAA	2	6	26296	26301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15004729
524	NC_001988	TAT	2	6	26324	26329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004729
525	NC_001988	T	7	7	26329	26335	0 %	100 %	0 %	0 %	15004729
526	NC_001988	TAA	2	6	26339	26344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004729
527	NC_001988	TA	3	6	26389	26394	50 %	50 %	0 %	0 %	15004729
528	NC_001988	GTT	2	6	26544	26549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15004729
529	NC_001988	AAT	2	6	26610	26615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004729
530	NC_001988	TAA	2	6	26817	26822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004730
531	NC_001988	AT	3	6	26909	26914	50 %	50 %	0 %	0 %	15004730
532	NC_001988	GGA	2	6	26916	26921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15004730
533	NC_001988	GAA	2	6	26950	26955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004730
534	NC_001988	A	6	6	26979	26984	100 %	0 %	0 %	0 %	15004730
535	NC_001988	CATT	2	8	27007	27014	25 %	50 %	0 %	25 %	15004730
536	NC_001988	TCC	2	6	27051	27056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15004730
537	NC_001988	A	7	7	27128	27134	100 %	0 %	0 %	0 %	15004730
538	NC_001988	A	7	7	27268	27274	100 %	0 %	0 %	0 %	15004730
539	NC_001988	TAT	2	6	27291	27296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004730
540	NC_001988	CTT	2	6	27331	27336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004730
541	NC_001988	ATG	2	6	27517	27522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004731
542	NC_001988	TCA	2	6	27631	27636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004731
543	NC_001988	TGC	2	6	27645	27650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004731
544	NC_001988	AGA	2	6	27651	27656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004731
545	NC_001988	TATCT	2	10	27755	27764	20 %	60 %	0 %	20 %	15004731
546	NC_001988	ATA	2	6	27769	27774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004731
547	NC_001988	TA	3	6	27802	27807	50 %	50 %	0 %	0 %	15004731
548	NC_001988	AGC	2	6	27852	27857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004731
549	NC_001988	TAGTGC	2	12	27891	27902	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15004731
550	NC_001988	GCT	2	6	27910	27915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004731
551	NC_001988	ATT	2	6	27936	27941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004731
552	NC_001988	TTATAG	2	12	27956	27967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15004731
553	NC_001988	TATT	2	8	27968	27975	25 %	75 %	0 %	0 %	15004731
554	NC_001988	ATG	2	6	28060	28065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004731
555	NC_001988	GAG	2	6	28106	28111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15004731
556	NC_001988	TAA	2	6	28125	28130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004731
557	NC_001988	GTAA	2	8	28222	28229	50 %	25 %	25 %	0 %	15004731
558	NC_001988	TAC	2	6	28283	28288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004731
559	NC_001988	TCT	2	6	28291	28296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004731
560	NC_001988	ATA	2	6	28297	28302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004731
561	NC_001988	GA	3	6	28358	28363	50 %	0 %	50 %	0 %	15004731
562	NC_001988	GAA	2	6	28403	28408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004731
563	NC_001988	TATG	2	8	28494	28501	25 %	50 %	25 %	0 %	15004731
564	NC_001988	GGAT	2	8	28512	28519	25 %	25 %	50 %	0 %	15004731
565	NC_001988	AAAG	2	8	28717	28724	75 %	0 %	25 %	0 %	15004731
566	NC_001988	TAA	2	6	28745	28750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004731
567	NC_001988	TGT	2	6	28764	28769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15004731
568	NC_001988	AAC	2	6	28770	28775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15004731
569	NC_001988	AAC	2	6	28779	28784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15004731
570	NC_001988	ATA	2	6	28789	28794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004731
571	NC_001988	TAA	2	6	28829	28834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004731
572	NC_001988	ACA	2	6	28883	28888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15004731
573	NC_001988	AGC	2	6	28898	28903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004731
574	NC_001988	GGC	2	6	28929	28934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15004731
575	NC_001988	A	8	8	28943	28950	100 %	0 %	0 %	0 %	15004731
576	NC_001988	CA	3	6	28953	28958	50 %	0 %	0 %	50 %	15004731
577	NC_001988	GTT	2	6	28966	28971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15004731
578	NC_001988	TAAA	2	8	28985	28992	75 %	25 %	0 %	0 %	15004731
579	NC_001988	CTT	2	6	28994	28999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004731
580	NC_001988	CTT	2	6	29164	29169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004731
581	NC_001988	GAT	2	6	29179	29184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004731
582	NC_001988	TGA	2	6	29202	29207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004731
583	NC_001988	AGT	2	6	29220	29225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004731
584	NC_001988	GTG	2	6	29250	29255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15004731
585	NC_001988	CAA	2	6	29271	29276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15004731
586	NC_001988	TCTT	2	8	29285	29292	0 %	75 %	0 %	25 %	15004731
587	NC_001988	AG	4	8	29293	29300	50 %	0 %	50 %	0 %	15004731
588	NC_001988	GAT	3	9	29350	29358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004731
589	NC_001988	ATAAA	2	10	29436	29445	80 %	20 %	0 %	0 %	15004732
590	NC_001988	TCT	2	6	29471	29476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004732
591	NC_001988	CTT	2	6	29537	29542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004732
592	NC_001988	T	6	6	29576	29581	0 %	100 %	0 %	0 %	15004732
593	NC_001988	GAA	2	6	29601	29606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004732
594	NC_001988	ATT	2	6	29611	29616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004732
595	NC_001988	CTT	2	6	29640	29645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004732
596	NC_001988	CAG	2	6	29736	29741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004732
597	NC_001988	TAA	2	6	29794	29799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004732
598	NC_001988	TGT	2	6	29803	29808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15004732
599	NC_001988	TA	3	6	29847	29852	50 %	50 %	0 %	0 %	15004732
600	NC_001988	GAT	2	6	29944	29949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004732
601	NC_001988	T	6	6	29971	29976	0 %	100 %	0 %	0 %	15004732
602	NC_001988	CTG	2	6	29979	29984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004732
603	NC_001988	A	8	8	30124	30131	100 %	0 %	0 %	0 %	15004733
604	NC_001988	TTG	2	6	30141	30146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15004733
605	NC_001988	TAC	2	6	30194	30199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004733
606	NC_001988	T	6	6	30293	30298	0 %	100 %	0 %	0 %	15004733
607	NC_001988	GCT	2	6	30316	30321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004733
608	NC_001988	CTT	2	6	30346	30351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004733
609	NC_001988	AAT	2	6	30372	30377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004733
610	NC_001988	ACAGC	2	10	30455	30464	40 %	0 %	20 %	40 %	15004733
611	NC_001988	CTG	2	6	30533	30538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004733
612	NC_001988	CTT	2	6	30553	30558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004733
613	NC_001988	TGG	2	6	30570	30575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15004733
614	NC_001988	AGA	2	6	30582	30587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004733
615	NC_001988	TATT	2	8	30641	30648	25 %	75 %	0 %	0 %	15004733
616	NC_001988	GAAG	2	8	30666	30673	50 %	0 %	50 %	0 %	15004733
617	NC_001988	GAA	2	6	30708	30713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004733
618	NC_001988	A	6	6	30734	30739	100 %	0 %	0 %	0 %	15004733
619	NC_001988	T	6	6	30766	30771	0 %	100 %	0 %	0 %	15004733
620	NC_001988	T	6	6	30872	30877	0 %	100 %	0 %	0 %	15004733
621	NC_001988	GCA	2	6	30904	30909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004733
622	NC_001988	T	6	6	31030	31035	0 %	100 %	0 %	0 %	15004733
623	NC_001988	TTA	2	6	31042	31047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004733
624	NC_001988	AGG	2	6	31059	31064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15004733
625	NC_001988	AT	3	6	31082	31087	50 %	50 %	0 %	0 %	15004733
626	NC_001988	GAA	2	6	31121	31126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004733
627	NC_001988	CAG	2	6	31145	31150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004733
628	NC_001988	AGG	2	6	31182	31187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15004733
629	NC_001988	T	6	6	31222	31227	0 %	100 %	0 %	0 %	15004733
630	NC_001988	CTG	2	6	31240	31245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004733
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