MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 22084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_000922	GTT	2	6	231775	231780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618115
4002	NC_000922	CAA	2	6	231889	231894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618115
4003	NC_000922	ATG	2	6	232031	232036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618116
4004	NC_000922	CT	3	6	232092	232097	0 %	50 %	0 %	50 %	15618116
4005	NC_000922	TAC	2	6	232154	232159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618116
4006	NC_000922	ATAA	2	8	232224	232231	75 %	25 %	0 %	0 %	15618116
4007	NC_000922	CTT	2	6	232251	232256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618116
4008	NC_000922	TGC	2	6	232335	232340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618116
4009	NC_000922	AAT	2	6	232359	232364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618116
4010	NC_000922	AT	3	6	232416	232421	50 %	50 %	0 %	0 %	15618116
4011	NC_000922	AATA	2	8	232434	232441	75 %	25 %	0 %	0 %	15618116
4012	NC_000922	CA	3	6	232572	232577	50 %	0 %	0 %	50 %	15618116
4013	NC_000922	AAC	2	6	232600	232605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618116
4014	NC_000922	TAGC	2	8	232616	232623	25 %	25 %	25 %	25 %	15618116
4015	NC_000922	CAA	2	6	232725	232730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618117
4016	NC_000922	AGC	2	6	232824	232829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618117
4017	NC_000922	AAG	2	6	232835	232840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618117
4018	NC_000922	AG	3	6	232870	232875	50 %	0 %	50 %	0 %	15618117
4019	NC_000922	AG	3	6	232890	232895	50 %	0 %	50 %	0 %	15618117
4020	NC_000922	TCT	2	6	232916	232921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618117
4021	NC_000922	CAC	2	6	232949	232954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618117
4022	NC_000922	GAC	2	6	233005	233010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618117
4023	NC_000922	TCC	2	6	233053	233058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618117
4024	NC_000922	T	9	9	233115	233123	0 %	100 %	0 %	0 %	15618117
4025	NC_000922	CTGC	2	8	233247	233254	0 %	25 %	25 %	50 %	15618118
4026	NC_000922	ATT	2	6	233291	233296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618118
4027	NC_000922	ATAA	2	8	233381	233388	75 %	25 %	0 %	0 %	15618118
4028	NC_000922	ACA	2	6	233395	233400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618118
4029	NC_000922	A	7	7	233512	233518	100 %	0 %	0 %	0 %	15618118
4030	NC_000922	TGC	2	6	233557	233562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618118
4031	NC_000922	T	6	6	233633	233638	0 %	100 %	0 %	0 %	15618118
4032	NC_000922	GAT	2	6	233681	233686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618118
4033	NC_000922	TTCA	2	8	233827	233834	25 %	50 %	0 %	25 %	15618118
4034	NC_000922	ATA	2	6	233874	233879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618118
4035	NC_000922	GCT	2	6	233933	233938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618118
4036	NC_000922	ACT	2	6	233960	233965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618118
4037	NC_000922	TAT	2	6	233986	233991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618118
4038	NC_000922	C	6	6	234094	234099	0 %	0 %	0 %	100 %	15618118
4039	NC_000922	TGC	2	6	234121	234126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618118
4040	NC_000922	A	7	7	234159	234165	100 %	0 %	0 %	0 %	15618118
4041	NC_000922	TCC	2	6	234245	234250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618119
4042	NC_000922	CTC	2	6	234273	234278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618119
4043	NC_000922	CTT	2	6	234349	234354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618119
4044	NC_000922	AAT	2	6	234403	234408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618119
4045	NC_000922	AGA	2	6	234438	234443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618119
4046	NC_000922	CT	3	6	234447	234452	0 %	50 %	0 %	50 %	15618119
4047	NC_000922	CGGA	2	8	234458	234465	25 %	0 %	50 %	25 %	15618119
4048	NC_000922	AAG	2	6	234563	234568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618119
4049	NC_000922	TTG	2	6	234680	234685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618119
4050	NC_000922	CAAA	2	8	234822	234829	75 %	0 %	0 %	25 %	15618119
4051	NC_000922	A	6	6	234849	234854	100 %	0 %	0 %	0 %	15618119
4052	NC_000922	ACT	2	6	234860	234865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618119
4053	NC_000922	ACGATT	2	12	234892	234903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15618119
4054	NC_000922	CAG	2	6	234926	234931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618119
4055	NC_000922	CCT	2	6	234970	234975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618119
4056	NC_000922	TCAATA	2	12	235070	235081	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15618119
4057	NC_000922	CAA	2	6	235092	235097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618119
4058	NC_000922	ATC	2	6	235184	235189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618119
4059	NC_000922	CCTA	2	8	235191	235198	25 %	25 %	0 %	50 %	15618119
4060	NC_000922	A	6	6	235261	235266	100 %	0 %	0 %	0 %	15618119
4061	NC_000922	AAG	2	6	235274	235279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618119
4062	NC_000922	AGA	2	6	235284	235289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618119
4063	NC_000922	ATCTTA	2	12	235319	235330	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15618119
4064	NC_000922	GAAA	2	8	235389	235396	75 %	0 %	25 %	0 %	15618119
4065	NC_000922	AGG	2	6	235482	235487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618119
4066	NC_000922	TCC	2	6	235551	235556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618119
4067	NC_000922	ATT	2	6	235675	235680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618119
4068	NC_000922	ACG	2	6	235694	235699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618119
4069	NC_000922	A	6	6	235720	235725	100 %	0 %	0 %	0 %	15618119
4070	NC_000922	TTC	2	6	235948	235953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618120
4071	NC_000922	TCG	2	6	236120	236125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618120
4072	NC_000922	GA	3	6	236144	236149	50 %	0 %	50 %	0 %	15618120
4073	NC_000922	GGAA	2	8	236273	236280	50 %	0 %	50 %	0 %	15618120
4074	NC_000922	TCC	2	6	236299	236304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618120
4075	NC_000922	TGA	2	6	236352	236357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618120
4076	NC_000922	GC	3	6	236432	236437	0 %	0 %	50 %	50 %	15618120
4077	NC_000922	T	7	7	236465	236471	0 %	100 %	0 %	0 %	15618120
4078	NC_000922	ATA	2	6	236600	236605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618120
4079	NC_000922	ATT	2	6	236629	236634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618120
4080	NC_000922	CCT	2	6	236704	236709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618120
4081	NC_000922	A	8	8	236813	236820	100 %	0 %	0 %	0 %	15618120
4082	NC_000922	CAA	2	6	236995	237000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618120
4083	NC_000922	GAA	2	6	237007	237012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618120
4084	NC_000922	CTTTT	2	10	237075	237084	0 %	80 %	0 %	20 %	15618120
4085	NC_000922	GAA	2	6	237123	237128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618120
4086	NC_000922	TAG	2	6	237152	237157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618120
4087	NC_000922	A	7	7	237179	237185	100 %	0 %	0 %	0 %	15618120
4088	NC_000922	GCA	2	6	237229	237234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618120
4089	NC_000922	GGA	2	6	237277	237282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618120
4090	NC_000922	A	6	6	237349	237354	100 %	0 %	0 %	0 %	15618120
4091	NC_000922	TTA	2	6	237371	237376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618120
4092	NC_000922	CGA	2	6	237484	237489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618120
4093	NC_000922	TAT	2	6	237606	237611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618121
4094	NC_000922	CTC	2	6	237631	237636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618121
4095	NC_000922	ATT	2	6	237665	237670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618121
4096	NC_000922	GAC	2	6	237680	237685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618121
4097	NC_000922	CTT	2	6	237743	237748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618121
4098	NC_000922	TCA	2	6	237983	237988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618121
4099	NC_000922	CTT	2	6	238037	238042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618121
4100	NC_000922	CATT	2	8	238132	238139	25 %	50 %	0 %	25 %	15618121
4101	NC_000922	ATT	2	6	238202	238207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618121
4102	NC_000922	AT	4	8	238212	238219	50 %	50 %	0 %	0 %	15618121
4103	NC_000922	CCT	2	6	238231	238236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618121
4104	NC_000922	ACT	2	6	238317	238322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618121
4105	NC_000922	GAA	2	6	238439	238444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618121
4106	NC_000922	CAA	2	6	238460	238465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618121
4107	NC_000922	GAG	2	6	238485	238490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618121
4108	NC_000922	A	6	6	238511	238516	100 %	0 %	0 %	0 %	15618121
4109	NC_000922	GCT	2	6	238616	238621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618121
4110	NC_000922	TGTT	2	8	238659	238666	0 %	75 %	25 %	0 %	15618121
4111	NC_000922	TTA	2	6	238717	238722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618121
4112	NC_000922	GAA	2	6	238745	238750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618121
4113	NC_000922	CTA	2	6	238786	238791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618121
4114	NC_000922	ACCT	2	8	239183	239190	25 %	25 %	0 %	50 %	15618122
4115	NC_000922	TCT	2	6	239210	239215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618122
4116	NC_000922	GCT	2	6	239239	239244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618122
4117	NC_000922	TG	3	6	239471	239476	0 %	50 %	50 %	0 %	15618122
4118	NC_000922	CACTC	2	10	239486	239495	20 %	20 %	0 %	60 %	15618122
4119	NC_000922	AAC	2	6	239524	239529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618122
4120	NC_000922	GAA	2	6	239538	239543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618122
4121	NC_000922	CATA	2	8	239555	239562	50 %	25 %	0 %	25 %	15618122
4122	NC_000922	TTC	2	6	239585	239590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618122
4123	NC_000922	GAT	2	6	239643	239648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618122
4124	NC_000922	TCGC	2	8	239701	239708	0 %	25 %	25 %	50 %	15618122
4125	NC_000922	TCA	2	6	239726	239731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618122
4126	NC_000922	A	7	7	239801	239807	100 %	0 %	0 %	0 %	15618122
4127	NC_000922	ACT	2	6	239821	239826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618122
4128	NC_000922	A	7	7	239836	239842	100 %	0 %	0 %	0 %	15618122
4129	NC_000922	ACT	2	6	239848	239853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618122
4130	NC_000922	GATTG	2	10	239946	239955	20 %	40 %	40 %	0 %	15618122
4131	NC_000922	TC	3	6	239999	240004	0 %	50 %	0 %	50 %	15618122
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4133	NC_000922	CTT	2	6	240045	240050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618122
4134	NC_000922	ATCT	2	8	240125	240132	25 %	50 %	0 %	25 %	15618122
4135	NC_000922	AAG	2	6	240154	240159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618122
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4137	NC_000922	ACAA	2	8	240227	240234	75 %	0 %	0 %	25 %	15618122
4138	NC_000922	AAG	2	6	240253	240258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618122
4139	NC_000922	TCC	2	6	240327	240332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618122
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4142	NC_000922	TTC	2	6	240441	240446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618122
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4145	NC_000922	CA	3	6	240524	240529	50 %	0 %	0 %	50 %	15618122
4146	NC_000922	ATA	2	6	240615	240620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618122
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4152	NC_000922	A	6	6	241056	241061	100 %	0 %	0 %	0 %	15618123
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4156	NC_000922	CTCCA	2	10	241246	241255	20 %	20 %	0 %	60 %	15618123
4157	NC_000922	CAT	2	6	241311	241316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618123
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4159	NC_000922	AGG	2	6	241374	241379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618123
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4164	NC_000922	ATACT	2	10	241556	241565	40 %	40 %	0 %	20 %	15618123
4165	NC_000922	TCA	2	6	241601	241606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618123
4166	NC_000922	GCA	2	6	241633	241638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618123
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4229	NC_000922	CT	3	6	246194	246199	0 %	50 %	0 %	50 %	15618129
4230	NC_000922	T	6	6	246223	246228	0 %	100 %	0 %	0 %	15618129
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4236	NC_000922	CTAG	2	8	246727	246734	25 %	25 %	25 %	25 %	15618130
4237	NC_000922	ATG	2	6	246743	246748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618130
4238	NC_000922	AATC	2	8	246783	246790	50 %	25 %	0 %	25 %	15618130
4239	NC_000922	GGA	2	6	246997	247002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618130
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4241	NC_000922	TCA	2	6	247019	247024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618130
4242	NC_000922	GAA	2	6	247054	247059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618130
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4245	NC_000922	AGA	2	6	247140	247145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618130
4246	NC_000922	A	9	9	247214	247222	100 %	0 %	0 %	0 %	15618131
4247	NC_000922	TC	3	6	247232	247237	0 %	50 %	0 %	50 %	15618131
4248	NC_000922	TC	3	6	247272	247277	0 %	50 %	0 %	50 %	15618131
4249	NC_000922	ACT	2	6	247331	247336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618131
4250	NC_000922	ATT	2	6	247382	247387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618131
4251	NC_000922	ACT	3	9	247399	247407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618131
4252	NC_000922	CA	3	6	247408	247413	50 %	0 %	0 %	50 %	15618131
4253	NC_000922	CTT	2	6	247534	247539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618131
4254	NC_000922	T	6	6	247597	247602	0 %	100 %	0 %	0 %	15618131
4255	NC_000922	TCCT	2	8	247724	247731	0 %	50 %	0 %	50 %	15618131
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4270	NC_000922	CT	3	6	248276	248281	0 %	50 %	0 %	50 %	15618131
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4282	NC_000922	CTC	2	6	249158	249163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618132
4283	NC_000922	AGG	2	6	249186	249191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618132
4284	NC_000922	AGG	2	6	249201	249206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618132
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4289	NC_000922	AGGA	2	8	249378	249385	50 %	0 %	50 %	0 %	15618132
4290	NC_000922	A	7	7	249385	249391	100 %	0 %	0 %	0 %	15618132
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4324	NC_000922	TTCA	2	8	253236	253243	25 %	50 %	0 %	25 %	15618136
4325	NC_000922	CA	3	6	253257	253262	50 %	0 %	0 %	50 %	15618136
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4331	NC_000922	TTC	2	6	253484	253489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618136
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4357	NC_000922	AG	3	6	254835	254840	50 %	0 %	50 %	0 %	15618138
4358	NC_000922	CTTT	2	8	254873	254880	0 %	75 %	0 %	25 %	15618138
4359	NC_000922	T	6	6	254900	254905	0 %	100 %	0 %	0 %	15618138
4360	NC_000922	CTT	2	6	254940	254945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618138
4361	NC_000922	TCATT	2	10	254958	254967	20 %	60 %	0 %	20 %	15618138
4362	NC_000922	CTT	2	6	254974	254979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618138
4363	NC_000922	ATCTA	2	10	255007	255016	40 %	40 %	0 %	20 %	15618138
4364	NC_000922	TCA	2	6	255056	255061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618138
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4366	NC_000922	A	7	7	255094	255100	100 %	0 %	0 %	0 %	15618138
4367	NC_000922	TCT	2	6	255226	255231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618138
4368	NC_000922	ATCT	2	8	255243	255250	25 %	50 %	0 %	25 %	15618138
4369	NC_000922	TCT	2	6	255278	255283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618138
4370	NC_000922	TCTT	2	8	255425	255432	0 %	75 %	0 %	25 %	15618138
4371	NC_000922	ATA	2	6	255463	255468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618138
4372	NC_000922	ATAA	2	8	255635	255642	75 %	25 %	0 %	0 %	15618138
4373	NC_000922	ACC	2	6	255650	255655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618138
4374	NC_000922	ATC	2	6	255768	255773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618139
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4491	NC_000922	CT	3	6	263175	263180	0 %	50 %	0 %	50 %	15618147
4492	NC_000922	CTTAGG	2	12	263246	263257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15618147
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4496	NC_000922	T	7	7	263454	263460	0 %	100 %	0 %	0 %	15618148
4497	NC_000922	GAC	2	6	263619	263624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618148
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4499	NC_000922	AC	3	6	263677	263682	50 %	0 %	0 %	50 %	15618148
4500	NC_000922	ACA	2	6	263900	263905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618149

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