MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 22084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000922	TAA	2	6	175215	175220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618065
3002	NC_000922	A	6	6	175253	175258	100 %	0 %	0 %	0 %	15618065
3003	NC_000922	TGC	2	6	175274	175279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618065
3004	NC_000922	TAA	2	6	175286	175291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618065
3005	NC_000922	AAT	2	6	175353	175358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618065
3006	NC_000922	TCA	2	6	175429	175434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618065
3007	NC_000922	TGC	2	6	175445	175450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618065
3008	NC_000922	TGC	2	6	175455	175460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618065
3009	NC_000922	CCA	2	6	175495	175500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618065
3010	NC_000922	ATC	2	6	175507	175512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618065
3011	NC_000922	TCA	2	6	175531	175536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618065
3012	NC_000922	GCT	2	6	175598	175603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618065
3013	NC_000922	GAA	2	6	175627	175632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618065
3014	NC_000922	AGC	2	6	175749	175754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618065
3015	NC_000922	T	6	6	175770	175775	0 %	100 %	0 %	0 %	15618065
3016	NC_000922	ATGAAG	2	12	175779	175790	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15618065
3017	NC_000922	ATT	2	6	176210	176215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618067
3018	NC_000922	CTT	2	6	176222	176227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618067
3019	NC_000922	CTT	2	6	176267	176272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618067
3020	NC_000922	ATTT	2	8	176279	176286	25 %	75 %	0 %	0 %	15618067
3021	NC_000922	AG	4	8	176323	176330	50 %	0 %	50 %	0 %	15618067
3022	NC_000922	CTG	2	6	176351	176356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618067
3023	NC_000922	T	6	6	176435	176440	0 %	100 %	0 %	0 %	15618067
3024	NC_000922	GAGAG	2	10	176457	176466	40 %	0 %	60 %	0 %	15618067
3025	NC_000922	TAG	2	6	176500	176505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618067
3026	NC_000922	TTTG	2	8	176515	176522	0 %	75 %	25 %	0 %	15618067
3027	NC_000922	ATC	2	6	176616	176621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618067
3028	NC_000922	ATT	2	6	176643	176648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618067
3029	NC_000922	AGA	2	6	176653	176658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618067
3030	NC_000922	TTG	2	6	176661	176666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618067
3031	NC_000922	ATACC	2	10	176695	176704	40 %	20 %	0 %	40 %	15618067
3032	NC_000922	CTA	2	6	176723	176728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618067
3033	NC_000922	CAGC	2	8	176767	176774	25 %	0 %	25 %	50 %	15618067
3034	NC_000922	CAA	2	6	176810	176815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618067
3035	NC_000922	TAT	2	6	176867	176872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618067
3036	NC_000922	ATC	2	6	176881	176886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618067
3037	NC_000922	TTTGC	2	10	176918	176927	0 %	60 %	20 %	20 %	15618067
3038	NC_000922	TCT	2	6	176941	176946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618067
3039	NC_000922	GTG	2	6	176982	176987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618067
3040	NC_000922	TGTC	2	8	177002	177009	0 %	50 %	25 %	25 %	15618067
3041	NC_000922	ATC	2	6	177018	177023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618067
3042	NC_000922	GTG	2	6	177069	177074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618067
3043	NC_000922	TAA	2	6	177140	177145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618067
3044	NC_000922	AAGA	2	8	177146	177153	75 %	0 %	25 %	0 %	15618067
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3049	NC_000922	A	6	6	177277	177282	100 %	0 %	0 %	0 %	15618067
3050	NC_000922	ACA	2	6	177289	177294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618067
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3053	NC_000922	CTT	2	6	178224	178229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618068
3054	NC_000922	ATC	2	6	178282	178287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618068
3055	NC_000922	TGC	2	6	178288	178293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618068
3056	NC_000922	CAAA	2	8	178309	178316	75 %	0 %	0 %	25 %	15618068
3057	NC_000922	ACA	2	6	178341	178346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618068
3058	NC_000922	AGTT	2	8	178349	178356	25 %	50 %	25 %	0 %	15618068
3059	NC_000922	ACG	2	6	178388	178393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618068
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3061	NC_000922	TC	3	6	178650	178655	0 %	50 %	0 %	50 %	15618068
3062	NC_000922	GAA	2	6	178725	178730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618068
3063	NC_000922	TGA	2	6	178790	178795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618068
3064	NC_000922	TTG	2	6	178807	178812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618068
3065	NC_000922	TGC	2	6	178841	178846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618068
3066	NC_000922	CGA	2	6	178897	178902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618068
3067	NC_000922	TGC	2	6	178937	178942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618068
3068	NC_000922	CTT	2	6	178981	178986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618068
3069	NC_000922	GGA	2	6	178988	178993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618068
3070	NC_000922	TTC	2	6	179005	179010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618068
3071	NC_000922	TTC	2	6	179113	179118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618068
3072	NC_000922	TCTTCC	2	12	179180	179191	0 %	50 %	0 %	50 %	15618068
3073	NC_000922	TGA	2	6	179195	179200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618068
3074	NC_000922	GA	4	8	179205	179212	50 %	0 %	50 %	0 %	15618068
3075	NC_000922	TGC	2	6	179216	179221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618068
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3079	NC_000922	GAAGA	2	10	179349	179358	60 %	0 %	40 %	0 %	15618068
3080	NC_000922	A	7	7	179380	179386	100 %	0 %	0 %	0 %	15618068
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3091	NC_000922	TCT	2	6	179907	179912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618068
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3098	NC_000922	A	7	7	180152	180158	100 %	0 %	0 %	0 %	15618068
3099	NC_000922	AAG	2	6	180175	180180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618068
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3102	NC_000922	TGA	2	6	180245	180250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618068
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3104	NC_000922	CGG	2	6	180339	180344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15618068
3105	NC_000922	GAT	2	6	180360	180365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618068
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3107	NC_000922	GCCC	2	8	180414	180421	0 %	0 %	25 %	75 %	15618068
3108	NC_000922	CAA	2	6	180438	180443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618068
3109	NC_000922	A	6	6	180540	180545	100 %	0 %	0 %	0 %	15618068
3110	NC_000922	CTT	2	6	180556	180561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618068
3111	NC_000922	AG	3	6	180562	180567	50 %	0 %	50 %	0 %	15618068
3112	NC_000922	AAT	2	6	180861	180866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618069
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3114	NC_000922	CAA	2	6	181069	181074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618069
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3122	NC_000922	TGA	2	6	181448	181453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618069
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3124	NC_000922	TTC	2	6	181466	181471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618069
3125	NC_000922	TCTCT	2	10	181507	181516	0 %	60 %	0 %	40 %	15618069
3126	NC_000922	CCT	2	6	181566	181571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618069
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3129	NC_000922	GAA	2	6	181698	181703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618069
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3133	NC_000922	CTT	2	6	182002	182007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618069
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3141	NC_000922	TTTAT	2	10	182288	182297	20 %	80 %	0 %	0 %	15618069
3142	NC_000922	A	7	7	182304	182310	100 %	0 %	0 %	0 %	15618069
3143	NC_000922	CTC	2	6	182326	182331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618069
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3147	NC_000922	TTGT	2	8	182764	182771	0 %	75 %	25 %	0 %	15618070
3148	NC_000922	TTG	2	6	182786	182791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618070
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3156	NC_000922	AG	3	6	183294	183299	50 %	0 %	50 %	0 %	15618071
3157	NC_000922	GA	3	6	183324	183329	50 %	0 %	50 %	0 %	15618071
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3229	NC_000922	TCA	2	6	186565	186570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618073
3230	NC_000922	AG	3	6	186592	186597	50 %	0 %	50 %	0 %	15618073
3231	NC_000922	CTT	2	6	186669	186674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618073
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3240	NC_000922	ACT	2	6	187131	187136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618073
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3245	NC_000922	GA	3	6	187357	187362	50 %	0 %	50 %	0 %	15618073
3246	NC_000922	GT	3	6	187440	187445	0 %	50 %	50 %	0 %	15618073
3247	NC_000922	CTC	2	6	187571	187576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618073
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3374	NC_000922	TCA	2	6	194475	194480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618076
3375	NC_000922	TTG	2	6	194486	194491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618076
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3381	NC_000922	TTC	2	6	194956	194961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618076
3382	NC_000922	ACA	2	6	195019	195024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618076
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3384	NC_000922	CTT	2	6	195124	195129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618076
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3393	NC_000922	ATG	2	6	195785	195790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618077
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3480	NC_000922	T	6	6	201143	201148	0 %	100 %	0 %	0 %	15618082
3481	NC_000922	AAGA	2	8	201171	201178	75 %	0 %	25 %	0 %	15618082
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3485	NC_000922	ATA	2	6	201350	201355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618082
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3487	NC_000922	CTCA	2	8	201371	201378	25 %	25 %	0 %	50 %	15618082
3488	NC_000922	GTAG	2	8	201504	201511	25 %	25 %	50 %	0 %	15618083
3489	NC_000922	GCT	2	6	201540	201545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618083
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3496	NC_000922	CTC	2	6	202220	202225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618084
3497	NC_000922	TTG	2	6	202289	202294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618084
3498	NC_000922	CAG	2	6	202309	202314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618084
3499	NC_000922	TAA	2	6	202342	202347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618084
3500	NC_000922	CAT	2	6	202382	202387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618084

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