MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 22084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_000922	TGT	3	9	147785	147793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618039
2502	NC_000922	TGA	2	6	147934	147939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618039
2503	NC_000922	GAA	2	6	148215	148220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618039
2504	NC_000922	A	6	6	148236	148241	100 %	0 %	0 %	0 %	15618039
2505	NC_000922	TAT	2	6	148272	148277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618039
2506	NC_000922	TCG	2	6	148295	148300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618039
2507	NC_000922	ATG	2	6	148329	148334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618039
2508	NC_000922	TAA	2	6	148343	148348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618039
2509	NC_000922	AAC	2	6	148384	148389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618039
2510	NC_000922	AG	3	6	148433	148438	50 %	0 %	50 %	0 %	15618039
2511	NC_000922	TGG	2	6	148447	148452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618039
2512	NC_000922	A	6	6	148545	148550	100 %	0 %	0 %	0 %	15618039
2513	NC_000922	T	6	6	148551	148556	0 %	100 %	0 %	0 %	15618039
2514	NC_000922	A	7	7	148593	148599	100 %	0 %	0 %	0 %	15618039
2515	NC_000922	AGG	2	6	148604	148609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618039
2516	NC_000922	TGT	2	6	148660	148665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618040
2517	NC_000922	ATT	2	6	148720	148725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618040
2518	NC_000922	T	6	6	148779	148784	0 %	100 %	0 %	0 %	15618040
2519	NC_000922	AG	3	6	148792	148797	50 %	0 %	50 %	0 %	15618040
2520	NC_000922	TTC	2	6	148810	148815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618040
2521	NC_000922	AAG	2	6	148878	148883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618040
2522	NC_000922	AGTT	2	8	148890	148897	25 %	50 %	25 %	0 %	15618040
2523	NC_000922	AAG	2	6	148904	148909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618040
2524	NC_000922	AGA	2	6	148945	148950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618040
2525	NC_000922	GTAG	2	8	148972	148979	25 %	25 %	50 %	0 %	15618040
2526	NC_000922	CTTT	2	8	149004	149011	0 %	75 %	0 %	25 %	15618041
2527	NC_000922	TGA	2	6	149135	149140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618041
2528	NC_000922	GTG	3	9	149152	149160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618041
2529	NC_000922	CT	3	6	149235	149240	0 %	50 %	0 %	50 %	15618041
2530	NC_000922	TTG	2	6	149253	149258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618041
2531	NC_000922	GCT	3	9	149283	149291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618041
2532	NC_000922	TGA	2	6	149330	149335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618041
2533	NC_000922	AG	3	6	149345	149350	50 %	0 %	50 %	0 %	15618041
2534	NC_000922	TGG	2	6	149396	149401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618041
2535	NC_000922	TGC	2	6	149405	149410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618041
2536	NC_000922	AG	3	6	149465	149470	50 %	0 %	50 %	0 %	15618041
2537	NC_000922	GA	4	8	149475	149482	50 %	0 %	50 %	0 %	15618041
2538	NC_000922	AG	3	6	149529	149534	50 %	0 %	50 %	0 %	15618041
2539	NC_000922	AAG	2	6	149545	149550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618041
2540	NC_000922	TTG	2	6	149562	149567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618041
2541	NC_000922	GA	3	6	149628	149633	50 %	0 %	50 %	0 %	15618041
2542	NC_000922	TGA	2	6	149687	149692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618041
2543	NC_000922	ACA	2	6	149700	149705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618041
2544	NC_000922	GTA	2	6	149739	149744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618041
2545	NC_000922	GC	3	6	149765	149770	0 %	0 %	50 %	50 %	15618041
2546	NC_000922	A	6	6	149771	149776	100 %	0 %	0 %	0 %	15618041
2547	NC_000922	A	8	8	149883	149890	100 %	0 %	0 %	0 %	15618041
2548	NC_000922	CT	3	6	149899	149904	0 %	50 %	0 %	50 %	15618041
2549	NC_000922	TCT	2	6	149945	149950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618041
2550	NC_000922	AGA	2	6	149952	149957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618041
2551	NC_000922	TGG	2	6	149969	149974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618041
2552	NC_000922	GTT	2	6	149978	149983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618041
2553	NC_000922	TGA	2	6	149996	150001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618041
2554	NC_000922	GCAT	2	8	150038	150045	25 %	25 %	25 %	25 %	15618041
2555	NC_000922	AGA	2	6	150073	150078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618041
2556	NC_000922	AGAACA	2	12	150125	150136	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15618042
2557	NC_000922	TCG	2	6	150248	150253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618042
2558	NC_000922	GGC	3	9	150255	150263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15618042
2559	NC_000922	GA	3	6	150268	150273	50 %	0 %	50 %	0 %	15618042
2560	NC_000922	TAT	2	6	150393	150398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618042
2561	NC_000922	GCT	2	6	150420	150425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618042
2562	NC_000922	TTTC	2	8	150553	150560	0 %	75 %	0 %	25 %	15618043
2563	NC_000922	AGA	2	6	150591	150596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618043
2564	NC_000922	GTC	2	6	150604	150609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618043
2565	NC_000922	AAG	2	6	150712	150717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618043
2566	NC_000922	AAC	2	6	150728	150733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618043
2567	NC_000922	AG	3	6	150801	150806	50 %	0 %	50 %	0 %	15618043
2568	NC_000922	TCT	2	6	150862	150867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618043
2569	NC_000922	TTC	2	6	150887	150892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618043
2570	NC_000922	TTTA	2	8	150905	150912	25 %	75 %	0 %	0 %	15618043
2571	NC_000922	GCG	2	6	150970	150975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15618043
2572	NC_000922	TGA	2	6	151002	151007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618043
2573	NC_000922	ACG	2	6	151095	151100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618043
2574	NC_000922	TG	3	6	151151	151156	0 %	50 %	50 %	0 %	15618043
2575	NC_000922	CTG	2	6	151243	151248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618044
2576	NC_000922	ACA	2	6	151260	151265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618044
2577	NC_000922	TCT	2	6	151293	151298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618044
2578	NC_000922	AAC	2	6	151322	151327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618044
2579	NC_000922	GAA	2	6	151383	151388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618044
2580	NC_000922	CT	3	6	151414	151419	0 %	50 %	0 %	50 %	15618044
2581	NC_000922	GCTGTT	2	12	151500	151511	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15618044
2582	NC_000922	AGG	2	6	151585	151590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618044
2583	NC_000922	AGAA	2	8	151595	151602	75 %	0 %	25 %	0 %	15618044
2584	NC_000922	AAAGA	2	10	151636	151645	80 %	0 %	20 %	0 %	15618044
2585	NC_000922	AGC	2	6	151673	151678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618044
2586	NC_000922	ATT	2	6	151701	151706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618044
2587	NC_000922	ACG	2	6	151708	151713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618044
2588	NC_000922	GAA	2	6	151758	151763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618044
2589	NC_000922	A	6	6	151784	151789	100 %	0 %	0 %	0 %	15618045
2590	NC_000922	CTC	2	6	151897	151902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618045
2591	NC_000922	TAGA	2	8	151932	151939	50 %	25 %	25 %	0 %	15618045
2592	NC_000922	GTA	2	6	151973	151978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618045
2593	NC_000922	GAAA	2	8	151997	152004	75 %	0 %	25 %	0 %	15618045
2594	NC_000922	A	7	7	152029	152035	100 %	0 %	0 %	0 %	15618045
2595	NC_000922	TTTCT	2	10	152343	152352	0 %	80 %	0 %	20 %	15618046
2596	NC_000922	GAC	2	6	152355	152360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618046
2597	NC_000922	GATT	2	8	152417	152424	25 %	50 %	25 %	0 %	15618046
2598	NC_000922	AAC	2	6	152441	152446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618046
2599	NC_000922	AGAACA	2	12	152454	152465	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15618046
2600	NC_000922	GAG	2	6	152528	152533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618046
2601	NC_000922	A	7	7	152616	152622	100 %	0 %	0 %	0 %	15618046
2602	NC_000922	CTTT	2	8	152671	152678	0 %	75 %	0 %	25 %	15618046
2603	NC_000922	TGT	2	6	152718	152723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618046
2604	NC_000922	TATG	2	8	152812	152819	25 %	50 %	25 %	0 %	15618046
2605	NC_000922	AT	3	6	152838	152843	50 %	50 %	0 %	0 %	15618046
2606	NC_000922	A	6	6	153007	153012	100 %	0 %	0 %	0 %	15618046
2607	NC_000922	GGC	2	6	153141	153146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15618046
2608	NC_000922	AGA	2	6	153306	153311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618046
2609	NC_000922	GAA	2	6	153331	153336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618046
2610	NC_000922	AG	3	6	153373	153378	50 %	0 %	50 %	0 %	15618046
2611	NC_000922	CAA	2	6	153445	153450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618046
2612	NC_000922	AAG	2	6	153470	153475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618046
2613	NC_000922	GTT	2	6	153528	153533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618046
2614	NC_000922	TAT	2	6	153552	153557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618046
2615	NC_000922	GAT	2	6	153585	153590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618046
2616	NC_000922	AGA	2	6	153651	153656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618046
2617	NC_000922	GAA	2	6	153676	153681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618046
2618	NC_000922	TTA	2	6	153703	153708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618046
2619	NC_000922	TAC	2	6	153711	153716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618046
2620	NC_000922	GTAGA	2	10	153718	153727	40 %	20 %	40 %	0 %	15618046
2621	NC_000922	ATT	2	6	153849	153854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618047
2622	NC_000922	TTG	2	6	153857	153862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618047
2623	NC_000922	T	7	7	153876	153882	0 %	100 %	0 %	0 %	15618047
2624	NC_000922	T	6	6	153903	153908	0 %	100 %	0 %	0 %	15618047
2625	NC_000922	AGA	2	6	153931	153936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618047
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2750	NC_000922	GTT	2	6	160780	160785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618050
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