MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 22084

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22001	NC_000922	GCT	2	6	1224961	1224966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618978
22002	NC_000922	TAG	2	6	1224969	1224974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618978
22003	NC_000922	CCT	2	6	1225004	1225009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618978
22004	NC_000922	TCT	2	6	1225046	1225051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618978
22005	NC_000922	GTT	2	6	1225115	1225120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618978
22006	NC_000922	ATC	2	6	1225149	1225154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618978
22007	NC_000922	AGC	2	6	1225166	1225171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618978
22008	NC_000922	CT	3	6	1225218	1225223	0 %	50 %	0 %	50 %	15618978
22009	NC_000922	AAT	2	6	1225250	1225255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618978
22010	NC_000922	ATT	2	6	1225290	1225295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618978
22011	NC_000922	CGAG	2	8	1225343	1225350	25 %	0 %	50 %	25 %	15618978
22012	NC_000922	TGT	2	6	1225381	1225386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618978
22013	NC_000922	CCT	2	6	1225420	1225425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618978
22014	NC_000922	TCT	2	6	1225441	1225446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618978
22015	NC_000922	TGG	2	6	1225458	1225463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618978
22016	NC_000922	ATA	2	6	1225476	1225481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618978
22017	NC_000922	ACAATT	2	12	1225482	1225493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15618978
22018	NC_000922	TCA	3	9	1225973	1225981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618979
22019	NC_000922	TCT	3	9	1225994	1226002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618979
22020	NC_000922	T	6	6	1226081	1226086	0 %	100 %	0 %	0 %	15618979
22021	NC_000922	AGA	2	6	1226136	1226141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618979
22022	NC_000922	ATC	2	6	1226155	1226160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618979
22023	NC_000922	ACG	2	6	1226234	1226239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618979
22024	NC_000922	TG	3	6	1226281	1226286	0 %	50 %	50 %	0 %	15618979
22025	NC_000922	TAGAA	2	10	1226290	1226299	60 %	20 %	20 %	0 %	15618979
22026	NC_000922	GCCAT	2	10	1226426	1226435	20 %	20 %	20 %	40 %	15618979
22027	NC_000922	T	7	7	1226446	1226452	0 %	100 %	0 %	0 %	15618979
22028	NC_000922	CGT	2	6	1226524	1226529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618979
22029	NC_000922	AGA	2	6	1226584	1226589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618979
22030	NC_000922	T	6	6	1226619	1226624	0 %	100 %	0 %	0 %	15618979
22031	NC_000922	TTC	2	6	1226797	1226802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618979
22032	NC_000922	T	7	7	1226816	1226822	0 %	100 %	0 %	0 %	15618979
22033	NC_000922	AGC	2	6	1226857	1226862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618979
22034	NC_000922	CT	3	6	1226929	1226934	0 %	50 %	0 %	50 %	15618979
22035	NC_000922	CTT	2	6	1227084	1227089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618979
22036	NC_000922	TCA	2	6	1227110	1227115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618979
22037	NC_000922	TAG	2	6	1227162	1227167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618979
22038	NC_000922	AGC	2	6	1227184	1227189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618979
22039	NC_000922	TCC	2	6	1227190	1227195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618979
22040	NC_000922	CTT	2	6	1227207	1227212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618979
22041	NC_000922	GTT	2	6	1227239	1227244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618979
22042	NC_000922	TCT	2	6	1227245	1227250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618979
22043	NC_000922	GTT	3	9	1227251	1227259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618979
22044	NC_000922	CA	3	6	1227288	1227293	50 %	0 %	0 %	50 %	15618979
22045	NC_000922	ATT	2	6	1227307	1227312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618979
22046	NC_000922	A	7	7	1227984	1227990	100 %	0 %	0 %	0 %	15618980
22047	NC_000922	TG	3	6	1227994	1227999	0 %	50 %	50 %	0 %	15618980
22048	NC_000922	TCA	2	6	1228009	1228014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618980
22049	NC_000922	GCA	2	6	1228053	1228058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618980
22050	NC_000922	AAAGAA	2	12	1228061	1228072	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15618980
22051	NC_000922	A	6	6	1228121	1228126	100 %	0 %	0 %	0 %	15618980
22052	NC_000922	ATCA	2	8	1228246	1228253	50 %	25 %	0 %	25 %	15618980
22053	NC_000922	AACG	2	8	1228260	1228267	50 %	0 %	25 %	25 %	15618980
22054	NC_000922	GAA	2	6	1228275	1228280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618980
22055	NC_000922	TCT	2	6	1228386	1228391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618980
22056	NC_000922	ATCT	2	8	1228441	1228448	25 %	50 %	0 %	25 %	15618980
22057	NC_000922	T	6	6	1228519	1228524	0 %	100 %	0 %	0 %	15618980
22058	NC_000922	GA	3	6	1228546	1228551	50 %	0 %	50 %	0 %	15618980
22059	NC_000922	ATT	2	6	1228577	1228582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618980
22060	NC_000922	A	7	7	1228605	1228611	100 %	0 %	0 %	0 %	15618980
22061	NC_000922	T	6	6	1228720	1228725	0 %	100 %	0 %	0 %	15618980
22062	NC_000922	AAG	2	6	1228762	1228767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618980
22063	NC_000922	TA	3	6	1229048	1229053	50 %	50 %	0 %	0 %	15618981
22064	NC_000922	AGC	2	6	1229055	1229060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618981
22065	NC_000922	GCAG	2	8	1229097	1229104	25 %	0 %	50 %	25 %	15618981
22066	NC_000922	AG	3	6	1229119	1229124	50 %	0 %	50 %	0 %	15618981
22067	NC_000922	AG	3	6	1229206	1229211	50 %	0 %	50 %	0 %	15618981
22068	NC_000922	GAA	2	6	1229236	1229241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618981
22069	NC_000922	AG	3	6	1229248	1229253	50 %	0 %	50 %	0 %	15618981
22070	NC_000922	TTTCT	2	10	1229279	1229288	0 %	80 %	0 %	20 %	15618981
22071	NC_000922	A	6	6	1229394	1229399	100 %	0 %	0 %	0 %	15618981
22072	NC_000922	CT	3	6	1229470	1229475	0 %	50 %	0 %	50 %	15618981
22073	NC_000922	ACA	2	6	1229491	1229496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618981
22074	NC_000922	A	7	7	1229519	1229525	100 %	0 %	0 %	0 %	15618981
22075	NC_000922	TGTT	2	8	1229531	1229538	0 %	75 %	25 %	0 %	15618981
22076	NC_000922	CT	3	6	1229541	1229546	0 %	50 %	0 %	50 %	15618981
22077	NC_000922	TTC	2	6	1229582	1229587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618981
22078	NC_000922	TC	3	6	1229586	1229591	0 %	50 %	0 %	50 %	15618981
22079	NC_000922	TCT	2	6	1229599	1229604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618981
22080	NC_000922	CCT	2	6	1229605	1229610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618981
22081	NC_000922	ATC	2	6	1229617	1229622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618981
22082	NC_000922	A	6	6	1229671	1229676	100 %	0 %	0 %	0 %	15618981
22083	NC_000922	ATTT	2	8	1229683	1229690	25 %	75 %	0 %	0 %	15618981
22084	NC_000922	AGC	2	6	1229717	1229722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618981

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.