MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 22084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_000922	CTT	2	6	94951	94956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618005
1502	NC_000922	ATT	2	6	94981	94986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618005
1503	NC_000922	CCT	2	6	94994	94999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618005
1504	NC_000922	CT	3	6	94998	95003	0 %	50 %	0 %	50 %	15618005
1505	NC_000922	TGA	2	6	95097	95102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618005
1506	NC_000922	ATC	2	6	95105	95110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618005
1507	NC_000922	TAT	2	6	95112	95117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618005
1508	NC_000922	CTA	2	6	95222	95227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618005
1509	NC_000922	CTT	2	6	95238	95243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618005
1510	NC_000922	GAT	2	6	95314	95319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618005
1511	NC_000922	AGA	2	6	95349	95354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618005
1512	NC_000922	ATC	2	6	95426	95431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618005
1513	NC_000922	AG	4	8	95515	95522	50 %	0 %	50 %	0 %	15618005
1514	NC_000922	ACCAA	2	10	95642	95651	60 %	0 %	0 %	40 %	15618005
1515	NC_000922	ACG	2	6	95676	95681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618005
1516	NC_000922	AGG	2	6	95700	95705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618005
1517	NC_000922	CT	3	6	95814	95819	0 %	50 %	0 %	50 %	15618005
1518	NC_000922	GAA	3	9	95926	95934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618005
1519	NC_000922	TG	3	6	95935	95940	0 %	50 %	50 %	0 %	15618005
1520	NC_000922	GATT	2	8	96092	96099	25 %	50 %	25 %	0 %	15618005
1521	NC_000922	ACG	2	6	96113	96118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618005
1522	NC_000922	CTTA	2	8	96168	96175	25 %	50 %	0 %	25 %	15618005
1523	NC_000922	TGT	2	6	96189	96194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618005
1524	NC_000922	TGC	2	6	96216	96221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618005
1525	NC_000922	TTG	3	9	96239	96247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618005
1526	NC_000922	AGA	3	9	96249	96257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618005
1527	NC_000922	GTT	2	6	96262	96267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618005
1528	NC_000922	TTG	2	6	96272	96277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618005
1529	NC_000922	AGT	2	6	96288	96293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618005
1530	NC_000922	TGC	2	6	96297	96302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618005
1531	NC_000922	ATC	2	6	96332	96337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618005
1532	NC_000922	TG	3	6	96389	96394	0 %	50 %	50 %	0 %	15618005
1533	NC_000922	GTGAT	2	10	96419	96428	20 %	40 %	40 %	0 %	15618005
1534	NC_000922	AGA	2	6	96552	96557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618005
1535	NC_000922	AGA	2	6	96621	96626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618005
1536	NC_000922	TGA	2	6	96654	96659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618005
1537	NC_000922	TTG	2	6	96728	96733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618005
1538	NC_000922	AGA	2	6	96771	96776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618005
1539	NC_000922	GCT	2	6	96808	96813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618005
1540	NC_000922	CGT	2	6	96858	96863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618005
1541	NC_000922	TGA	2	6	96909	96914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618005
1542	NC_000922	AGA	2	6	96924	96929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618005
1543	NC_000922	CT	3	6	97013	97018	0 %	50 %	0 %	50 %	15618005
1544	NC_000922	ATT	2	6	97045	97050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618005
1545	NC_000922	CGT	2	6	97054	97059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618005
1546	NC_000922	CAG	2	6	97061	97066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618005
1547	NC_000922	GTT	2	6	97072	97077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618005
1548	NC_000922	AAG	2	6	97124	97129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618005
1549	NC_000922	GAC	2	6	97349	97354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618005
1550	NC_000922	GTT	2	6	97369	97374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618005
1551	NC_000922	TC	3	6	97407	97412	0 %	50 %	0 %	50 %	15618005
1552	NC_000922	AC	3	6	97489	97494	50 %	0 %	0 %	50 %	15618005
1553	NC_000922	GCA	2	6	97504	97509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618005
1554	NC_000922	AAC	2	6	97559	97564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618005
1555	NC_000922	ATG	2	6	97576	97581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618005
1556	NC_000922	AGA	2	6	97599	97604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618005
1557	NC_000922	CTT	2	6	97614	97619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618005
1558	NC_000922	ATG	2	6	97622	97627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618005
1559	NC_000922	CTATAT	2	12	97668	97679	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15618005
1560	NC_000922	CAA	2	6	97750	97755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618005
1561	NC_000922	GGT	2	6	97762	97767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618005
1562	NC_000922	GGA	2	6	97780	97785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618005
1563	NC_000922	TGA	2	6	97869	97874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618005
1564	NC_000922	GAA	2	6	97883	97888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618005
1565	NC_000922	A	6	6	98018	98023	100 %	0 %	0 %	0 %	15618005
1566	NC_000922	AAT	2	6	98039	98044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618006
1567	NC_000922	TTCT	2	8	98074	98081	0 %	75 %	0 %	25 %	15618006
1568	NC_000922	AAG	2	6	98083	98088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618006
1569	NC_000922	A	6	6	98224	98229	100 %	0 %	0 %	0 %	15618006
1570	NC_000922	CTA	2	6	98239	98244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618006
1571	NC_000922	TGC	2	6	98259	98264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618006
1572	NC_000922	A	7	7	98274	98280	100 %	0 %	0 %	0 %	15618006
1573	NC_000922	CGAT	2	8	98303	98310	25 %	25 %	25 %	25 %	15618006
1574	NC_000922	CGT	2	6	98340	98345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618006
1575	NC_000922	AAC	2	6	98402	98407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618006
1576	NC_000922	TAT	2	6	98466	98471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618006
1577	NC_000922	GAA	2	6	98472	98477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618006
1578	NC_000922	AGAC	2	8	98500	98507	50 %	0 %	25 %	25 %	15618006
1579	NC_000922	CTAA	2	8	98508	98515	50 %	25 %	0 %	25 %	15618006
1580	NC_000922	A	6	6	98514	98519	100 %	0 %	0 %	0 %	15618006
1581	NC_000922	CTT	2	6	98523	98528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618006
1582	NC_000922	ATG	2	6	98530	98535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618006
1583	NC_000922	GTT	2	6	98550	98555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618006
1584	NC_000922	CTAT	2	8	98602	98609	25 %	50 %	0 %	25 %	15618006
1585	NC_000922	GCTT	2	8	98638	98645	0 %	50 %	25 %	25 %	15618006
1586	NC_000922	CAAAA	2	10	98669	98678	80 %	0 %	0 %	20 %	15618006
1587	NC_000922	TTC	2	6	98735	98740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618006
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1589	NC_000922	A	6	6	98768	98773	100 %	0 %	0 %	0 %	15618006
1590	NC_000922	AGT	2	6	98780	98785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618006
1591	NC_000922	CCG	2	6	98858	98863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15618006
1592	NC_000922	TAAT	2	8	98866	98873	50 %	50 %	0 %	0 %	15618006
1593	NC_000922	AAG	2	6	98950	98955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618006
1594	NC_000922	A	6	6	99050	99055	100 %	0 %	0 %	0 %	15618006
1595	NC_000922	ACT	2	6	99094	99099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618006
1596	NC_000922	ATT	2	6	99114	99119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618006
1597	NC_000922	TAT	2	6	99191	99196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618006
1598	NC_000922	GAG	2	6	99259	99264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618006
1599	NC_000922	CTT	2	6	99315	99320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618006
1600	NC_000922	ATG	2	6	99501	99506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618006
1601	NC_000922	ACA	2	6	99514	99519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618006
1602	NC_000922	CTTC	3	12	99521	99532	0 %	50 %	0 %	50 %	15618006
1603	NC_000922	ATTAT	2	10	99578	99587	40 %	60 %	0 %	0 %	15618006
1604	NC_000922	CCTA	2	8	99600	99607	25 %	25 %	0 %	50 %	15618006
1605	NC_000922	GAA	2	6	99615	99620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618006
1606	NC_000922	GGA	2	6	99624	99629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618006
1607	NC_000922	TGA	2	6	99692	99697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618006
1608	NC_000922	TCG	2	6	99710	99715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618006
1609	NC_000922	TGA	2	6	99716	99721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618006
1610	NC_000922	ATT	2	6	99777	99782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618006
1611	NC_000922	A	6	6	100059	100064	100 %	0 %	0 %	0 %	15618006
1612	NC_000922	ATG	3	9	100069	100077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618006
1613	NC_000922	CAAA	2	8	100172	100179	75 %	0 %	0 %	25 %	15618006
1614	NC_000922	AGCA	2	8	100185	100192	50 %	0 %	25 %	25 %	15618006
1615	NC_000922	TGA	2	6	100207	100212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618006
1616	NC_000922	TAA	2	6	100232	100237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618006
1617	NC_000922	ATT	2	6	100296	100301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618006
1618	NC_000922	GAA	2	6	100524	100529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618006
1619	NC_000922	ACT	2	6	100604	100609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618006
1620	NC_000922	TGA	2	6	100655	100660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618006
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1622	NC_000922	TGC	2	6	100793	100798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618006
1623	NC_000922	TGC	2	6	100859	100864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618006
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1625	NC_000922	GTT	2	6	100929	100934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618006
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1627	NC_000922	TCTTG	2	10	100955	100964	0 %	60 %	20 %	20 %	15618006
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