MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000117	GAA	2	6	180302	180307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604874
3502	NC_000117	AGG	2	6	180324	180329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604874
3503	NC_000117	AAG	3	9	180330	180338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604874
3504	NC_000117	TGA	2	6	180451	180456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604875
3505	NC_000117	TTCC	2	8	180581	180588	0 %	50 %	0 %	50 %	15604875
3506	NC_000117	T	6	6	180754	180759	0 %	100 %	0 %	0 %	15604876
3507	NC_000117	TTGAA	2	10	180780	180789	40 %	40 %	20 %	0 %	15604876
3508	NC_000117	TTTG	2	8	180794	180801	0 %	75 %	25 %	0 %	15604876
3509	NC_000117	TGCA	2	8	180912	180919	25 %	25 %	25 %	25 %	15604876
3510	NC_000117	TGT	2	6	180930	180935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604876
3511	NC_000117	AGT	2	6	180949	180954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604876
3512	NC_000117	CT	3	6	180994	180999	0 %	50 %	0 %	50 %	15604876
3513	NC_000117	T	6	6	180999	181004	0 %	100 %	0 %	0 %	15604876
3514	NC_000117	CTC	2	6	181028	181033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604876
3515	NC_000117	GA	3	6	181073	181078	50 %	0 %	50 %	0 %	15604876
3516	NC_000117	GAT	2	6	181128	181133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604876
3517	NC_000117	AAAG	2	8	181281	181288	75 %	0 %	25 %	0 %	15604876
3518	NC_000117	CA	3	6	181386	181391	50 %	0 %	0 %	50 %	15604876
3519	NC_000117	ACA	2	6	181444	181449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604876
3520	NC_000117	CGA	2	6	181462	181467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604876
3521	NC_000117	AAT	2	6	181488	181493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604876
3522	NC_000117	ATT	2	6	181528	181533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604876
3523	NC_000117	GTTT	2	8	181584	181591	0 %	75 %	25 %	0 %	15604876
3524	NC_000117	CTT	2	6	181672	181677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604876
3525	NC_000117	AGA	2	6	181752	181757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604876
3526	NC_000117	TG	3	6	181785	181790	0 %	50 %	50 %	0 %	15604876
3527	NC_000117	AGGGG	2	10	181791	181800	20 %	0 %	80 %	0 %	15604876
3528	NC_000117	GA	3	6	181832	181837	50 %	0 %	50 %	0 %	15604876
3529	NC_000117	AGG	2	6	181860	181865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604876
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3531	NC_000117	GAA	2	6	181885	181890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604876
3532	NC_000117	AGA	3	9	181929	181937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604876
3533	NC_000117	TCG	2	6	182083	182088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532524891
3534	NC_000117	TGT	2	6	182095	182100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532524891
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3536	NC_000117	T	7	7	182120	182126	0 %	100 %	0 %	0 %	532524891
3537	NC_000117	AAG	2	6	182173	182178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532524891
3538	NC_000117	GATG	2	8	182204	182211	25 %	25 %	50 %	0 %	532524891
3539	NC_000117	TCT	2	6	182221	182226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532524891
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3541	NC_000117	GGA	2	6	182309	182314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532524891
3542	NC_000117	TTGAG	2	10	182354	182363	20 %	40 %	40 %	0 %	532524891
3543	NC_000117	GAATG	2	10	182379	182388	40 %	20 %	40 %	0 %	532524891
3544	NC_000117	CT	3	6	182429	182434	0 %	50 %	0 %	50 %	532524891
3545	NC_000117	TGA	2	6	182443	182448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532524891
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3547	NC_000117	AAC	2	6	182526	182531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532524891
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3549	NC_000117	TGC	2	6	182581	182586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532524891
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3555	NC_000117	GCG	2	6	182683	182688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532524891
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3559	NC_000117	AGA	2	6	182874	182879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604878
3560	NC_000117	GCA	2	6	182883	182888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604878
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3562	NC_000117	GAA	2	6	182953	182958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604878
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3565	NC_000117	GTT	2	6	183048	183053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604878
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3575	NC_000117	TGA	2	6	183354	183359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604878
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3579	NC_000117	GGA	3	9	183525	183533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604878
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3595	NC_000117	TCA	2	6	184356	184361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604880
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3603	NC_000117	T	7	7	185720	185726	0 %	100 %	0 %	0 %	15604882
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3611	NC_000117	GAA	2	6	186018	186023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604882
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3613	NC_000117	TA	3	6	186172	186177	50 %	50 %	0 %	0 %	15604882
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3615	NC_000117	TAG	2	6	186199	186204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604882
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3618	NC_000117	GCTT	2	8	186269	186276	0 %	50 %	25 %	25 %	15604882
3619	NC_000117	CAC	2	6	186301	186306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604882
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3623	NC_000117	ACGAT	2	10	186536	186545	40 %	20 %	20 %	20 %	15604882
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