MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2010	NC_000117	TGA	2	6	105058	105063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604809
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2126	NC_000117	TCT	2	6	111733	111738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604815
2127	NC_000117	AGA	2	6	111741	111746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604815
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2129	NC_000117	GATC	2	8	111811	111818	25 %	25 %	25 %	25 %	15604815
2130	NC_000117	TTA	2	6	111841	111846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604815
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2133	NC_000117	AAG	2	6	111872	111877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604815
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2146	NC_000117	TCT	2	6	112165	112170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604815
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2231	NC_000117	GA	3	6	116578	116583	50 %	0 %	50 %	0 %	15604818
2232	NC_000117	A	6	6	116631	116636	100 %	0 %	0 %	0 %	15604818
2233	NC_000117	GTTC	2	8	116687	116694	0 %	50 %	25 %	25 %	15604818
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2245	NC_000117	GAAA	2	8	117195	117202	75 %	0 %	25 %	0 %	15604819
2246	NC_000117	GTT	2	6	117238	117243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604819
2247	NC_000117	TAT	2	6	117254	117259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604819
2248	NC_000117	TCC	2	6	117281	117286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604819
2249	NC_000117	TAA	3	9	117344	117352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604820
2250	NC_000117	AGA	2	6	117427	117432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604820
2251	NC_000117	AGC	2	6	117449	117454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604820
2252	NC_000117	TTG	2	6	117459	117464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604820
2253	NC_000117	CAA	2	6	117475	117480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604820
2254	NC_000117	AGA	2	6	117481	117486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604820
2255	NC_000117	AAG	2	6	117527	117532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604820
2256	NC_000117	TAA	2	6	117540	117545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604820
2257	NC_000117	T	7	7	117561	117567	0 %	100 %	0 %	0 %	15604820
2258	NC_000117	CA	3	6	117749	117754	50 %	0 %	0 %	50 %	15604820
2259	NC_000117	ATC	2	6	117797	117802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604820
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2262	NC_000117	AGA	3	9	117971	117979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604821
2263	NC_000117	CTTT	2	8	118008	118015	0 %	75 %	0 %	25 %	15604821
2264	NC_000117	GTAG	2	8	118053	118060	25 %	25 %	50 %	0 %	15604821
2265	NC_000117	G	6	6	118101	118106	0 %	0 %	100 %	0 %	15604821
2266	NC_000117	T	6	6	118124	118129	0 %	100 %	0 %	0 %	15604821
2267	NC_000117	GTT	2	6	118242	118247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604821
2268	NC_000117	GA	3	6	118251	118256	50 %	0 %	50 %	0 %	15604821
2269	NC_000117	TTA	2	6	118272	118277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604821
2270	NC_000117	TCC	2	6	118286	118291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604821
2271	NC_000117	A	8	8	118327	118334	100 %	0 %	0 %	0 %	15604821
2272	NC_000117	CTC	2	6	118342	118347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604821
2273	NC_000117	AAAGA	2	10	118383	118392	80 %	0 %	20 %	0 %	15604821
2274	NC_000117	AAT	2	6	118393	118398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604821
2275	NC_000117	TTA	2	6	118447	118452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604822
2276	NC_000117	T	6	6	118552	118557	0 %	100 %	0 %	0 %	15604822
2277	NC_000117	TTC	2	6	118638	118643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604822
2278	NC_000117	TCC	2	6	118651	118656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604822
2279	NC_000117	TTTA	2	8	118669	118676	25 %	75 %	0 %	0 %	15604822
2280	NC_000117	CTG	2	6	118867	118872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604822
2281	NC_000117	AGA	2	6	118896	118901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604822
2282	NC_000117	TTGCCA	2	12	118919	118930	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15604822
2283	NC_000117	GA	4	8	118942	118949	50 %	0 %	50 %	0 %	15604822
2284	NC_000117	GAA	2	6	118956	118961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604822
2285	NC_000117	TTC	2	6	118995	119000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604822
2286	NC_000117	TACT	2	8	119057	119064	25 %	50 %	0 %	25 %	15604822
2287	NC_000117	GTT	2	6	119101	119106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604822
2288	NC_000117	TAT	2	6	119136	119141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604822
2289	NC_000117	GAT	2	6	119152	119157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604822
2290	NC_000117	GAG	2	6	119183	119188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604822
2291	NC_000117	TC	3	6	119274	119279	0 %	50 %	0 %	50 %	15604822
2292	NC_000117	AG	3	6	119377	119382	50 %	0 %	50 %	0 %	15604823
2293	NC_000117	GCTA	2	8	119399	119406	25 %	25 %	25 %	25 %	15604823
2294	NC_000117	GA	3	6	119410	119415	50 %	0 %	50 %	0 %	15604823
2295	NC_000117	AAG	2	6	119418	119423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604823
2296	NC_000117	GCT	3	9	119424	119432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604823
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2299	NC_000117	TC	3	6	119498	119503	0 %	50 %	0 %	50 %	15604823
2300	NC_000117	GCTA	2	8	119531	119538	25 %	25 %	25 %	25 %	15604823
2301	NC_000117	CGGC	2	8	119580	119587	0 %	0 %	50 %	50 %	15604823
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2306	NC_000117	GA	4	8	119731	119738	50 %	0 %	50 %	0 %	15604823
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2334	NC_000117	TTTC	2	8	121614	121621	0 %	75 %	0 %	25 %	15604824
2335	NC_000117	AAC	2	6	121665	121670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604824
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2339	NC_000117	GTT	2	6	121865	121870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604824
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2343	NC_000117	TGA	2	6	121969	121974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604824
2344	NC_000117	CTT	2	6	122012	122017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604824
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2346	NC_000117	ATC	2	6	122218	122223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604824
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2348	NC_000117	GA	3	6	122365	122370	50 %	0 %	50 %	0 %	15604824
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2350	NC_000117	TCTA	2	8	122414	122421	25 %	50 %	0 %	25 %	15604824
2351	NC_000117	ACT	2	6	122575	122580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604825
2352	NC_000117	AAGGGT	2	12	122645	122656	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15604825
2353	NC_000117	AG	3	6	122671	122676	50 %	0 %	50 %	0 %	15604825
2354	NC_000117	T	6	6	122687	122692	0 %	100 %	0 %	0 %	15604825
2355	NC_000117	AGCT	2	8	122720	122727	25 %	25 %	25 %	25 %	15604825
2356	NC_000117	CAA	2	6	122789	122794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604825
2357	NC_000117	GGC	2	6	122852	122857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15604825
2358	NC_000117	AAG	2	6	122859	122864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604825
2359	NC_000117	ATA	2	6	122945	122950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604825
2360	NC_000117	TAA	2	6	123074	123079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604825
2361	NC_000117	TGA	2	6	123163	123168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604825
2362	NC_000117	TCC	2	6	123223	123228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604825
2363	NC_000117	GAT	2	6	123255	123260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604825
2364	NC_000117	T	7	7	123362	123368	0 %	100 %	0 %	0 %	15604825
2365	NC_000117	AGA	2	6	123399	123404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604825
2366	NC_000117	T	6	6	123507	123512	0 %	100 %	0 %	0 %	15604826
2367	NC_000117	GA	3	6	123585	123590	50 %	0 %	50 %	0 %	15604826
2368	NC_000117	GGGTTT	2	12	123608	123619	0 %	50 %	50 %	0 %	15604826
2369	NC_000117	CAA	2	6	123634	123639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604826
2370	NC_000117	GTG	2	6	123652	123657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604826
2371	NC_000117	T	6	6	123666	123671	0 %	100 %	0 %	0 %	15604826
2372	NC_000117	TGGA	2	8	123676	123683	25 %	25 %	50 %	0 %	15604826
2373	NC_000117	GCAA	2	8	123711	123718	50 %	0 %	25 %	25 %	15604826
2374	NC_000117	TTA	2	6	123756	123761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604826
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2376	NC_000117	GGA	2	6	123814	123819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604826
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2378	NC_000117	TTGCAT	2	12	123890	123901	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15604826
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2483	NC_000117	AGAA	2	8	128659	128666	75 %	0 %	25 %	0 %	15604831
2484	NC_000117	GTA	2	6	128728	128733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604831
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2492	NC_000117	ACC	2	6	129106	129111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604831
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2497	NC_000117	AAT	2	6	129336	129341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604831
2498	NC_000117	CAT	2	6	129378	129383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604831
2499	NC_000117	GA	3	6	129398	129403	50 %	0 %	50 %	0 %	15604831
2500	NC_000117	GT	5	10	129445	129454	0 %	50 %	50 %	0 %	15604831

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