MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000117	ACAT	2	8	55468	55475	50 %	25 %	0 %	25 %	15604768
1002	NC_000117	ACT	2	6	55490	55495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604768
1003	NC_000117	TTA	2	6	55579	55584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604768
1004	NC_000117	GTT	2	6	55747	55752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604769
1005	NC_000117	TCC	2	6	55767	55772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604769
1006	NC_000117	TCC	2	6	55785	55790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604769
1007	NC_000117	TTA	2	6	55798	55803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604769
1008	NC_000117	TTGC	2	8	55841	55848	0 %	50 %	25 %	25 %	15604769
1009	NC_000117	AG	3	6	55881	55886	50 %	0 %	50 %	0 %	15604769
1010	NC_000117	GTA	2	6	55924	55929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604769
1011	NC_000117	CTGGAG	2	12	56027	56038	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15604769
1012	NC_000117	TGG	2	6	56052	56057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604769
1013	NC_000117	AGG	2	6	56064	56069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604769
1014	NC_000117	TGT	2	6	56076	56081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604769
1015	NC_000117	ACT	3	9	56133	56141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604769
1016	NC_000117	T	6	6	56186	56191	0 %	100 %	0 %	0 %	15604769
1017	NC_000117	GAAAAG	2	12	56221	56232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604769
1018	NC_000117	TCC	2	6	56236	56241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604769
1019	NC_000117	AGT	4	12	56325	56336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604769
1020	NC_000117	AGCT	2	8	56340	56347	25 %	25 %	25 %	25 %	15604769
1021	NC_000117	GAA	2	6	56374	56379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604769
1022	NC_000117	ATT	2	6	56388	56393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604769
1023	NC_000117	GAA	2	6	56458	56463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604769
1024	NC_000117	GTT	2	6	56592	56597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604769
1025	NC_000117	T	6	6	56596	56601	0 %	100 %	0 %	0 %	15604769
1026	NC_000117	AGA	2	6	56752	56757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604769
1027	NC_000117	CAG	2	6	56915	56920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604769
1028	NC_000117	TTG	2	6	56937	56942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604769
1029	NC_000117	TGT	2	6	57015	57020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604769
1030	NC_000117	TG	3	6	57118	57123	0 %	50 %	50 %	0 %	15604769
1031	NC_000117	GTTG	2	8	57128	57135	0 %	50 %	50 %	0 %	15604769
1032	NC_000117	TAA	2	6	57183	57188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604769
1033	NC_000117	ACT	2	6	57199	57204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604769
1034	NC_000117	TTA	2	6	57205	57210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604769
1035	NC_000117	GAA	3	9	57223	57231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604769
1036	NC_000117	ATT	2	6	57234	57239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604769
1037	NC_000117	T	6	6	57238	57243	0 %	100 %	0 %	0 %	15604769
1038	NC_000117	ATT	2	6	57253	57258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604769
1039	NC_000117	TGA	2	6	57394	57399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604770
1040	NC_000117	TGT	2	6	57424	57429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604770
1041	NC_000117	GGA	2	6	57431	57436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604770
1042	NC_000117	GTT	2	6	57437	57442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604770
1043	NC_000117	GCT	2	6	57476	57481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604770
1044	NC_000117	GAT	2	6	57494	57499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604770
1045	NC_000117	TGA	2	6	57511	57516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604770
1046	NC_000117	TCC	2	6	57526	57531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604770
1047	NC_000117	AGTTGT	2	12	57590	57601	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15604770
1048	NC_000117	AGA	2	6	57661	57666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604770
1049	NC_000117	CTA	2	6	57677	57682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604770
1050	NC_000117	CTA	2	6	57695	57700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604770
1051	NC_000117	TGA	2	6	57847	57852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604770
1052	NC_000117	TGT	2	6	57919	57924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604770
1053	NC_000117	AGAA	2	8	57988	57995	75 %	0 %	25 %	0 %	15604770
1054	NC_000117	CT	3	6	57999	58004	0 %	50 %	0 %	50 %	15604770
1055	NC_000117	GTT	2	6	58008	58013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604770
1056	NC_000117	AGGT	2	8	58028	58035	25 %	25 %	50 %	0 %	15604770
1057	NC_000117	CAC	2	6	58141	58146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604770
1058	NC_000117	AGG	2	6	58192	58197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604770
1059	NC_000117	TCT	2	6	58208	58213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604770
1060	NC_000117	T	9	9	58323	58331	0 %	100 %	0 %	0 %	15604770
1061	NC_000117	CAA	2	6	58389	58394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604770
1062	NC_000117	GCT	2	6	58418	58423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604770
1063	NC_000117	TGC	2	6	58444	58449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604770
1064	NC_000117	ATC	2	6	58456	58461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604770
1065	NC_000117	T	7	7	58464	58470	0 %	100 %	0 %	0 %	15604770
1066	NC_000117	TGT	2	6	58491	58496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604770
1067	NC_000117	TCTTGT	2	12	58508	58519	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15604770
1068	NC_000117	T	6	6	58530	58535	0 %	100 %	0 %	0 %	15604770
1069	NC_000117	TCT	3	9	58547	58555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604770
1070	NC_000117	GGAA	2	8	58582	58589	50 %	0 %	50 %	0 %	15604770
1071	NC_000117	GCT	2	6	58611	58616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604770
1072	NC_000117	TAGA	2	8	58707	58714	50 %	25 %	25 %	0 %	15604770
1073	NC_000117	TGAA	2	8	58812	58819	50 %	25 %	25 %	0 %	15604770
1074	NC_000117	TGT	2	6	58826	58831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604770
1075	NC_000117	T	8	8	58889	58896	0 %	100 %	0 %	0 %	15604770
1076	NC_000117	T	6	6	58909	58914	0 %	100 %	0 %	0 %	15604770
1077	NC_000117	T	6	6	58920	58925	0 %	100 %	0 %	0 %	15604770
1078	NC_000117	TGAAAA	2	12	58980	58991	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15604771
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1081	NC_000117	T	6	6	59040	59045	0 %	100 %	0 %	0 %	15604771
1082	NC_000117	CGTT	2	8	59191	59198	0 %	50 %	25 %	25 %	15604771
1083	NC_000117	GGAG	2	8	59200	59207	25 %	0 %	75 %	0 %	15604771
1084	NC_000117	GTAA	2	8	59252	59259	50 %	25 %	25 %	0 %	15604771
1085	NC_000117	TCCTAA	2	12	59319	59330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604771
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1087	NC_000117	T	6	6	59380	59385	0 %	100 %	0 %	0 %	15604771
1088	NC_000117	TAG	2	6	59427	59432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604771
1089	NC_000117	GCT	2	6	59440	59445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604771
1090	NC_000117	GTC	2	6	59466	59471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604771
1091	NC_000117	ATGG	2	8	59479	59486	25 %	25 %	50 %	0 %	15604771
1092	NC_000117	AGG	2	6	59513	59518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604771
1093	NC_000117	GA	3	6	59565	59570	50 %	0 %	50 %	0 %	15604771
1094	NC_000117	CAA	2	6	59588	59593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604771
1095	NC_000117	ATAA	2	8	59625	59632	75 %	25 %	0 %	0 %	15604771
1096	NC_000117	GAGCA	2	10	59665	59674	40 %	0 %	40 %	20 %	15604771
1097	NC_000117	GT	3	6	59703	59708	0 %	50 %	50 %	0 %	15604771
1098	NC_000117	TAG	2	6	59715	59720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604771
1099	NC_000117	AAG	2	6	59900	59905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604771
1100	NC_000117	CTC	2	6	59912	59917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604771
1101	NC_000117	AAC	2	6	59945	59950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604771
1102	NC_000117	T	7	7	59964	59970	0 %	100 %	0 %	0 %	15604771
1103	NC_000117	CTT	2	6	60014	60019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604771
1104	NC_000117	AAT	2	6	60044	60049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604771
1105	NC_000117	TTC	2	6	60055	60060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604771
1106	NC_000117	ATGT	2	8	60075	60082	25 %	50 %	25 %	0 %	15604771
1107	NC_000117	CATT	2	8	60104	60111	25 %	50 %	0 %	25 %	15604771
1108	NC_000117	ATG	2	6	60125	60130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604772
1109	NC_000117	CCT	2	6	60131	60136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604772
1110	NC_000117	AGT	2	6	60186	60191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604772
1111	NC_000117	TCT	2	6	60209	60214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604772
1112	NC_000117	TCA	2	6	60221	60226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604772
1113	NC_000117	TTC	2	6	60342	60347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604772
1114	NC_000117	CTTT	2	8	60377	60384	0 %	75 %	0 %	25 %	15604772
1115	NC_000117	TTCT	2	8	60400	60407	0 %	75 %	0 %	25 %	15604772
1116	NC_000117	TTC	2	6	60439	60444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604772
1117	NC_000117	TC	3	6	60451	60456	0 %	50 %	0 %	50 %	15604772
1118	NC_000117	T	6	6	60463	60468	0 %	100 %	0 %	0 %	15604772
1119	NC_000117	T	7	7	60523	60529	0 %	100 %	0 %	0 %	15604772
1120	NC_000117	TCA	2	6	60908	60913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604773
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1122	NC_000117	TCT	2	6	61034	61039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604773
1123	NC_000117	A	6	6	61070	61075	100 %	0 %	0 %	0 %	15604773
1124	NC_000117	CA	3	6	61077	61082	50 %	0 %	0 %	50 %	15604773
1125	NC_000117	TGA	2	6	61089	61094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604773
1126	NC_000117	TTA	2	6	61102	61107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604773
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1128	NC_000117	GAA	2	6	61148	61153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604773
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