MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_000117	CAT	2	6	306952	306957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604996
6002	NC_000117	TTA	2	6	306995	307000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604996
6003	NC_000117	TCA	2	6	307011	307016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604996
6004	NC_000117	ATCG	2	8	307055	307062	25 %	25 %	25 %	25 %	15604996
6005	NC_000117	TCG	2	6	307076	307081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604996
6006	NC_000117	TTG	2	6	307169	307174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604996
6007	NC_000117	TTG	2	6	307244	307249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604996
6008	NC_000117	TA	3	6	307345	307350	50 %	50 %	0 %	0 %	15604996
6009	NC_000117	TAA	2	6	307395	307400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604996
6010	NC_000117	TAA	2	6	307425	307430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604996
6011	NC_000117	AAC	2	6	307443	307448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604996
6012	NC_000117	TTG	2	6	307643	307648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604996
6013	NC_000117	TGC	2	6	307656	307661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604996
6014	NC_000117	ACTC	2	8	307672	307679	25 %	25 %	0 %	50 %	15604996
6015	NC_000117	A	6	6	307737	307742	100 %	0 %	0 %	0 %	15604996
6016	NC_000117	AAT	2	6	307762	307767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604996
6017	NC_000117	CAC	2	6	307781	307786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604996
6018	NC_000117	A	6	6	307856	307861	100 %	0 %	0 %	0 %	15604997
6019	NC_000117	TGA	2	6	307868	307873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604997
6020	NC_000117	GTG	2	6	307897	307902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604997
6021	NC_000117	TA	3	6	307922	307927	50 %	50 %	0 %	0 %	15604997
6022	NC_000117	AGAAC	2	10	307935	307944	60 %	0 %	20 %	20 %	15604997
6023	NC_000117	AAG	2	6	308008	308013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604997
6024	NC_000117	CAA	2	6	308034	308039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604997
6025	NC_000117	GAA	2	6	308040	308045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604997
6026	NC_000117	GAA	2	6	308073	308078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604997
6027	NC_000117	ACT	2	6	308085	308090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604997
6028	NC_000117	GA	3	6	308130	308135	50 %	0 %	50 %	0 %	15604997
6029	NC_000117	ATT	2	6	308187	308192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604997
6030	NC_000117	GAA	2	6	308232	308237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604997
6031	NC_000117	TG	3	6	308340	308345	0 %	50 %	50 %	0 %	15604997
6032	NC_000117	TG	3	6	308362	308367	0 %	50 %	50 %	0 %	15604997
6033	NC_000117	TTC	2	6	308455	308460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604998
6034	NC_000117	AGAA	2	8	308488	308495	75 %	0 %	25 %	0 %	15604998
6035	NC_000117	CTG	2	6	308508	308513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604998
6036	NC_000117	CTTTT	2	10	308523	308532	0 %	80 %	0 %	20 %	15604998
6037	NC_000117	TC	3	6	308596	308601	0 %	50 %	0 %	50 %	15604998
6038	NC_000117	GAA	2	6	308612	308617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604998
6039	NC_000117	AGC	2	6	308665	308670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604998
6040	NC_000117	AG	3	6	308761	308766	50 %	0 %	50 %	0 %	15604998
6041	NC_000117	TAC	2	6	308865	308870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604998
6042	NC_000117	CGC	2	6	308873	308878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15604998
6043	NC_000117	CAA	2	6	308879	308884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604998
6044	NC_000117	TC	3	6	308895	308900	0 %	50 %	0 %	50 %	15604998
6045	NC_000117	GCA	2	6	308920	308925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604998
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6047	NC_000117	T	6	6	308981	308986	0 %	100 %	0 %	0 %	15604998
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6051	NC_000117	TCT	2	6	309173	309178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604999
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6053	NC_000117	GAT	2	6	309217	309222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604999
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6055	NC_000117	CTC	2	6	309425	309430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604999
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6057	NC_000117	TAT	2	6	309475	309480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604999
6058	NC_000117	TCCT	2	8	309537	309544	0 %	50 %	0 %	50 %	15604999
6059	NC_000117	CTA	2	6	309546	309551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604999
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6063	NC_000117	AAAG	2	8	309731	309738	75 %	0 %	25 %	0 %	15604999
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6109	NC_000117	TGGT	2	8	312347	312354	0 %	50 %	50 %	0 %	15605002
6110	NC_000117	ATT	2	6	312357	312362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605002
6111	NC_000117	CTTGG	2	10	312382	312391	0 %	40 %	40 %	20 %	15605002
6112	NC_000117	TTG	2	6	312447	312452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605002
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6117	NC_000117	TAT	2	6	312573	312578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605002
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6119	NC_000117	TGG	2	6	312644	312649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605002
6120	NC_000117	ATGGCT	2	12	312752	312763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15605002
6121	NC_000117	AGA	2	6	312871	312876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605002
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6123	NC_000117	GAA	2	6	313008	313013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605003
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6125	NC_000117	CTT	2	6	313116	313121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605003
6126	NC_000117	TAA	2	6	313122	313127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605003
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6142	NC_000117	CTT	2	6	313741	313746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605004
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