MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_000117	CTT	2	6	281512	281517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604972
5502	NC_000117	GTT	2	6	281524	281529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604972
5503	NC_000117	CAG	2	6	281557	281562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604972
5504	NC_000117	CTG	2	6	281570	281575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604972
5505	NC_000117	GAA	2	6	281605	281610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604972
5506	NC_000117	TATC	2	8	281680	281687	25 %	50 %	0 %	25 %	15604972
5507	NC_000117	AGCT	2	8	281701	281708	25 %	25 %	25 %	25 %	15604972
5508	NC_000117	CTG	2	6	281867	281872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604972
5509	NC_000117	ACG	2	6	281906	281911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604972
5510	NC_000117	TAA	2	6	281969	281974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604972
5511	NC_000117	ATA	2	6	281976	281981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604972
5512	NC_000117	ATA	2	6	282031	282036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604972
5513	NC_000117	TGC	2	6	282038	282043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604972
5514	NC_000117	GGA	2	6	282267	282272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604972
5515	NC_000117	AGA	2	6	282314	282319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604972
5516	NC_000117	GAG	2	6	282394	282399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604972
5517	NC_000117	GTT	2	6	282404	282409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604972
5518	NC_000117	TTC	2	6	282471	282476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604972
5519	NC_000117	TCT	2	6	282555	282560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604972
5520	NC_000117	AGT	2	6	282569	282574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604972
5521	NC_000117	GCT	2	6	282601	282606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604972
5522	NC_000117	TTC	2	6	282622	282627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604972
5523	NC_000117	CCA	2	6	282633	282638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604972
5524	NC_000117	CT	3	6	282645	282650	0 %	50 %	0 %	50 %	15604972
5525	NC_000117	TAT	2	6	282664	282669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604972
5526	NC_000117	ACA	2	6	282678	282683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604972
5527	NC_000117	CT	3	6	282757	282762	0 %	50 %	0 %	50 %	15604972
5528	NC_000117	ATA	2	6	282800	282805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604972
5529	NC_000117	CT	3	6	282896	282901	0 %	50 %	0 %	50 %	15604972
5530	NC_000117	TCT	2	6	282936	282941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604972
5531	NC_000117	GTA	2	6	283028	283033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604972
5532	NC_000117	AC	3	6	283107	283112	50 %	0 %	0 %	50 %	15604972
5533	NC_000117	TCT	2	6	283113	283118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604972
5534	NC_000117	ATG	2	6	283174	283179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604972
5535	NC_000117	CTA	2	6	283270	283275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604972
5536	NC_000117	CTT	2	6	283333	283338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604972
5537	NC_000117	CAG	2	6	283451	283456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604972
5538	NC_000117	CTC	2	6	283505	283510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604972
5539	NC_000117	TAC	2	6	283529	283534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604972
5540	NC_000117	GCT	2	6	283579	283584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604972
5541	NC_000117	GAA	2	6	283625	283630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604972
5542	NC_000117	ATA	2	6	283672	283677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604972
5543	NC_000117	CGTT	2	8	283679	283686	0 %	50 %	25 %	25 %	15604972
5544	NC_000117	ATTC	2	8	283688	283695	25 %	50 %	0 %	25 %	15604972
5545	NC_000117	CAT	2	6	284007	284012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604973
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5547	NC_000117	ATC	2	6	284055	284060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604973
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5549	NC_000117	GT	3	6	284120	284125	0 %	50 %	50 %	0 %	15604973
5550	NC_000117	CTG	2	6	284176	284181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604973
5551	NC_000117	CCA	2	6	284301	284306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604973
5552	NC_000117	CAC	2	6	284492	284497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604973
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5554	NC_000117	CTCC	2	8	284574	284581	0 %	25 %	0 %	75 %	15604973
5555	NC_000117	AAGC	2	8	284596	284603	50 %	0 %	25 %	25 %	15604973
5556	NC_000117	ATG	2	6	284613	284618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604973
5557	NC_000117	T	6	6	284669	284674	0 %	100 %	0 %	0 %	15604973
5558	NC_000117	CTC	2	6	284675	284680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604973
5559	NC_000117	GAT	2	6	284724	284729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604973
5560	NC_000117	A	7	7	284730	284736	100 %	0 %	0 %	0 %	15604973
5561	NC_000117	AG	3	6	284797	284802	50 %	0 %	50 %	0 %	15604973
5562	NC_000117	CTT	2	6	285100	285105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604974
5563	NC_000117	ACT	2	6	285129	285134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604974
5564	NC_000117	GCTGT	2	10	285142	285151	0 %	40 %	40 %	20 %	15604974
5565	NC_000117	GTC	2	6	285210	285215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604974
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5570	NC_000117	T	7	7	285372	285378	0 %	100 %	0 %	0 %	15604974
5571	NC_000117	CTCCTA	2	12	285379	285390	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15604974
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5574	NC_000117	ATC	2	6	285604	285609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604974
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5576	NC_000117	TTCGA	2	10	285633	285642	20 %	40 %	20 %	20 %	15604974
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5579	NC_000117	TTG	2	6	285682	285687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604974
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5589	NC_000117	AAC	2	6	286135	286140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604975
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5597	NC_000117	TTTG	2	8	286382	286389	0 %	75 %	25 %	0 %	15604975
5598	NC_000117	TCTTT	2	10	286390	286399	0 %	80 %	0 %	20 %	15604975
5599	NC_000117	TTTA	2	8	286410	286417	25 %	75 %	0 %	0 %	15604975
5600	NC_000117	A	8	8	286498	286505	100 %	0 %	0 %	0 %	15604975
5601	NC_000117	TTA	2	6	286704	286709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604976
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5603	NC_000117	TTC	2	6	286746	286751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604976
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5607	NC_000117	AGTA	2	8	286893	286900	50 %	25 %	25 %	0 %	15604976
5608	NC_000117	TA	3	6	286980	286985	50 %	50 %	0 %	0 %	15604976
5609	NC_000117	TTC	2	6	287082	287087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604976
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5611	NC_000117	GTTT	2	8	287332	287339	0 %	75 %	25 %	0 %	15604977
5612	NC_000117	CTT	2	6	287370	287375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604977
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5623	NC_000117	TA	3	6	287934	287939	50 %	50 %	0 %	0 %	15604977
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5999	NC_000117	TATT	2	8	306881	306888	25 %	75 %	0 %	0 %	15604996
6000	NC_000117	TGG	2	6	306891	306896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604996

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