MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022786	CTTCT	2	10	176	185	0 %	60 %	0 %	40 %	557693446
2	NC_022786	GCGAT	2	10	3539	3548	20 %	20 %	40 %	20 %	557693449
3	NC_022786	CGGTG	2	10	5208	5217	0 %	20 %	60 %	20 %	557693452
4	NC_022786	CTCTG	2	10	5923	5932	0 %	40 %	20 %	40 %	557693453
5	NC_022786	GATGG	2	10	6464	6473	20 %	20 %	60 %	0 %	557693455
6	NC_022786	TGAGG	2	10	7099	7108	20 %	20 %	60 %	0 %	557693456
7	NC_022786	TCTCC	2	10	7170	7179	0 %	40 %	0 %	60 %	557693456
8	NC_022786	GTTGC	2	10	8209	8218	0 %	40 %	40 %	20 %	557693457
9	NC_022786	GCGGA	2	10	14318	14327	20 %	0 %	60 %	20 %	557693462
10	NC_022786	CTTCT	2	10	16265	16274	0 %	60 %	0 %	40 %	557693465
11	NC_022786	CAGAC	2	10	19745	19754	40 %	0 %	20 %	40 %	557693469
12	NC_022786	TACCG	2	10	21492	21501	20 %	20 %	20 %	40 %	557693470
13	NC_022786	TCAAC	2	10	23873	23882	40 %	20 %	0 %	40 %	557693470
14	NC_022786	AGCCT	2	10	25610	25619	20 %	20 %	20 %	40 %	557693471
15	NC_022786	AGAAA	2	10	25681	25690	80 %	0 %	20 %	0 %	557693471
16	NC_022786	ATTGG	2	10	26585	26594	20 %	40 %	40 %	0 %	557693471
17	NC_022786	CTTCG	2	10	29866	29875	0 %	40 %	20 %	40 %	557693475
18	NC_022786	AGTGA	2	10	30569	30578	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022786	TTGGA	2	10	31420	31429	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022786	AGGAC	2	10	31489	31498	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022786	CAGTC	2	10	38124	38133	20 %	20 %	20 %	40 %	557693481
22	NC_022786	GGATT	2	10	39544	39553	20 %	40 %	40 %	0 %	557693482
23	NC_022786	TATGT	2	10	41779	41788	20 %	60 %	20 %	0 %	557693484
24	NC_022786	AGAAT	2	10	42064	42073	60 %	20 %	20 %	0 %	557693484
25	NC_022786	CTGTT	2	10	42742	42751	0 %	60 %	20 %	20 %	557693485
26	NC_022786	ACCGA	2	10	43738	43747	40 %	0 %	20 %	40 %	557693485
27	NC_022786	TGGGT	2	10	44682	44691	0 %	40 %	60 %	0 %	557693485
28	NC_022786	TTCTC	2	10	45248	45257	0 %	60 %	0 %	40 %	557693487
29	NC_022786	GAAGG	2	10	46842	46851	40 %	0 %	60 %	0 %	557693488
30	NC_022786	CGGCT	2	10	47227	47236	0 %	20 %	40 %	40 %	557693488
31	NC_022786	AGACC	2	10	47533	47542	40 %	0 %	20 %	40 %	557693488
32	NC_022786	GTGAA	2	10	49687	49696	40 %	20 %	40 %	0 %	557693489
33	NC_022786	GGGTA	2	10	50905	50914	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022786	TCCTC	2	10	57359	57368	0 %	40 %	0 %	60 %	557693496
35	NC_022786	ACGTC	2	10	66293	66302	20 %	20 %	20 %	40 %	557693502
36	NC_022786	CTGGG	2	10	73009	73018	0 %	20 %	60 %	20 %	557693509
37	NC_022786	CCAGC	2	10	73045	73054	20 %	0 %	20 %	60 %	557693509
38	NC_022786	ATGCT	2	10	73737	73746	20 %	40 %	20 %	20 %	557693509
39	NC_022786	CGTTG	2	10	77715	77724	0 %	40 %	40 %	20 %	557693512
40	NC_022786	GGCTG	2	10	78511	78520	0 %	20 %	60 %	20 %	557693513
41	NC_022786	TATAC	2	10	85828	85837	40 %	40 %	0 %	20 %	557693520
42	NC_022786	AGGCG	2	10	89039	89048	20 %	0 %	60 %	20 %	557693523
43	NC_022786	GCCCT	2	10	91830	91839	0 %	20 %	20 %	60 %	557693526
44	NC_022786	AGGCG	2	10	93191	93200	20 %	0 %	60 %	20 %	557693528
45	NC_022786	CCACA	2	10	96274	96283	40 %	0 %	0 %	60 %	557693529
46	NC_022786	GCATC	2	10	97622	97631	20 %	20 %	20 %	40 %	557693532
47	NC_022786	TGCTT	2	10	101656	101665	0 %	60 %	20 %	20 %	557693534
48	NC_022786	GGCAA	2	10	105493	105502	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022786	ATGAA	2	10	108626	108635	60 %	20 %	20 %	0 %	557693539
50	NC_022786	TCTCC	2	10	109140	109149	0 %	40 %	0 %	60 %	557693539
51	NC_022786	AACAG	2	10	110038	110047	60 %	0 %	20 %	20 %	557693541
52	NC_022786	GGCAC	2	10	111871	111880	20 %	0 %	40 %	40 %	557693543
53	NC_022786	GGGCT	2	10	113259	113268	0 %	20 %	60 %	20 %	557693545
54	NC_022786	GGGCT	2	10	114043	114052	0 %	20 %	60 %	20 %	557693545
55	NC_022786	TTTTC	2	10	114192	114201	0 %	80 %	0 %	20 %	557693545
56	NC_022786	AAAGC	2	10	115559	115568	60 %	0 %	20 %	20 %	557693547
57	NC_022786	GTCCG	2	10	119793	119802	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_022786	CTCGA	2	10	124267	124276	20 %	20 %	20 %	40 %	557693557
59	NC_022786	CCCAG	2	10	125745	125754	20 %	0 %	20 %	60 %	557693558
60	NC_022786	TGGCG	2	10	126186	126195	0 %	20 %	60 %	20 %	557693559
61	NC_022786	CCACT	2	10	127638	127647	20 %	20 %	0 %	60 %	557693560
62	NC_022786	AAGCC	2	10	128315	128324	40 %	0 %	20 %	40 %	557693561
63	NC_022786	AGCCA	2	10	135553	135562	40 %	0 %	20 %	40 %	557693569
64	NC_022786	TCACA	2	10	136161	136170	40 %	20 %	0 %	40 %	557693569
65	NC_022786	CCACA	2	10	138569	138578	40 %	0 %	0 %	60 %	557693572
66	NC_022786	CCCCG	2	10	138697	138706	0 %	0 %	20 %	80 %	557693572
67	NC_022786	CCGCA	2	10	139105	139114	20 %	0 %	20 %	60 %	557693573
68	NC_022786	ACCTC	2	10	140723	140732	20 %	20 %	0 %	60 %	557693574
69	NC_022786	TTTTC	2	10	141346	141355	0 %	80 %	0 %	20 %	557693576
70	NC_022786	GTGGA	2	10	141514	141523	20 %	20 %	60 %	0 %	557693577
71	NC_022786	TGACA	2	10	142084	142093	40 %	20 %	20 %	20 %	557693577
72	NC_022786	GTTGC	2	10	144081	144090	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022786	ACCAA	2	10	144488	144497	60 %	0 %	0 %	40 %	557693580
74	NC_022786	TGTCT	2	10	144794	144803	0 %	60 %	20 %	20 %	557693580
75	NC_022786	AAGCG	2	10	145249	145258	40 %	0 %	40 %	20 %	557693580
76	NC_022786	ATCTT	2	10	146082	146091	20 %	60 %	0 %	20 %	557693580
77	NC_022786	AAAGC	2	10	146419	146428	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022786	TGGCT	2	10	149167	149176	0 %	40 %	40 %	20 %	557693582
79	NC_022786	CTAAC	2	10	151434	151443	40 %	20 %	0 %	40 %	557693585
80	NC_022786	ACCTA	2	10	152651	152660	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_022786	TCCAC	2	10	153754	153763	20 %	20 %	0 %	60 %	557693588
82	NC_022786	GGTTC	2	10	158178	158187	0 %	40 %	40 %	20 %	557693593
83	NC_022786	ATGAG	2	10	160168	160177	40 %	20 %	40 %	0 %	557693596
84	NC_022786	CATCC	2	10	161519	161528	20 %	20 %	0 %	60 %	557693597
85	NC_022786	TATCT	2	10	162448	162457	20 %	60 %	0 %	20 %	557693597
86	NC_022786	AAGGC	2	10	163595	163604	40 %	0 %	40 %	20 %	557693597
87	NC_022786	AGAGC	2	10	164211	164220	40 %	0 %	40 %	20 %	557693598
88	NC_022786	AACAC	2	10	165242	165251	60 %	0 %	0 %	40 %	557693599
89	NC_022786	GATGG	2	10	165900	165909	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022786	GGCTG	2	10	168369	168378	0 %	20 %	60 %	20 %	557693603
91	NC_022786	CTCTC	2	10	168498	168507	0 %	40 %	0 %	60 %	557693603
92	NC_022786	TGTGG	2	10	170542	170551	0 %	40 %	60 %	0 %	557693606
93	NC_022786	AAGAG	2	10	170821	170830	60 %	0 %	40 %	0 %	557693607
94	NC_022786	AACAA	2	10	171668	171677	80 %	0 %	0 %	20 %	557693608
95	NC_022786	ATACG	2	10	172874	172883	40 %	20 %	20 %	20 %	557693609
96	NC_022786	TCTCC	2	10	175623	175632	0 %	40 %	0 %	60 %	557693611
97	NC_022786	TGCTC	2	10	177661	177670	0 %	40 %	20 %	40 %	557693613
98	NC_022786	GGCTT	2	10	181621	181630	0 %	40 %	40 %	20 %	557693618
99	NC_022786	CCTGT	2	10	181990	181999	0 %	40 %	20 %	40 %	557693619
100	NC_022786	GAGAA	2	10	182546	182555	60 %	0 %	40 %	0 %	557693620
101	NC_022786	TTGGT	2	10	183241	183250	0 %	60 %	40 %	0 %	557693622
102	NC_022786	CGGCG	2	10	183379	183388	0 %	0 %	60 %	40 %	557693622
103	NC_022786	GTGTA	2	10	183553	183562	20 %	40 %	40 %	0 %	557693622
104	NC_022786	TTCAT	2	10	185197	185206	20 %	60 %	0 %	20 %	557693623
105	NC_022786	TGGGC	2	10	189434	189443	0 %	20 %	60 %	20 %	557693627
106	NC_022786	AGCTG	2	10	190525	190534	20 %	20 %	40 %	20 %	557693627
107	NC_022786	TCCCA	2	10	191742	191751	20 %	20 %	0 %	60 %	557693629
108	NC_022786	TTGTG	2	10	197519	197528	0 %	60 %	40 %	0 %	557693635
109	NC_022786	TTGGT	2	10	197575	197584	0 %	60 %	40 %	0 %	557693635
110	NC_022786	GGCTT	2	10	198002	198011	0 %	40 %	40 %	20 %	557693635
111	NC_022786	GGTGA	2	10	200242	200251	20 %	20 %	60 %	0 %	557693637
112	NC_022786	GAGCC	2	10	203686	203695	20 %	0 %	40 %	40 %	557693640
113	NC_022786	GCTTG	2	10	205958	205967	0 %	40 %	40 %	20 %	557693642
114	NC_022786	TTGAT	2	10	207933	207942	20 %	60 %	20 %	0 %	557693643
115	NC_022786	AGCAA	2	10	209958	209967	60 %	0 %	20 %	20 %	557693646
116	NC_022786	GCTCG	2	10	215675	215684	0 %	20 %	40 %	40 %	557693652
117	NC_022786	GCGTC	2	10	216813	216822	0 %	20 %	40 %	40 %	557693653
118	NC_022786	ATGTC	2	10	218979	218988	20 %	40 %	20 %	20 %	557693655
119	NC_022786	GAACA	2	10	225788	225797	60 %	0 %	20 %	20 %	557693661
120	NC_022786	CCGTT	2	10	228255	228264	0 %	40 %	20 %	40 %	557693664
121	NC_022786	AGACG	2	10	229648	229657	40 %	0 %	40 %	20 %	557693664
122	NC_022786	CTGAA	2	10	229956	229965	40 %	20 %	20 %	20 %	557693664
123	NC_022786	TCAAA	2	10	230068	230077	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022786	GAGCT	2	10	230553	230562	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022786	ATGGA	2	10	231993	232002	40 %	20 %	40 %	0 %	557693667
126	NC_022786	TAGAT	2	10	233521	233530	40 %	40 %	20 %	0 %	557693669
127	NC_022786	GCCAA	2	10	234327	234336	40 %	0 %	20 %	40 %	557693670
128	NC_022786	AACAC	2	10	234900	234909	60 %	0 %	0 %	40 %	557693670
129	NC_022786	GCTGA	2	10	235046	235055	20 %	20 %	40 %	20 %	557693671
130	NC_022786	CGAGG	2	10	235923	235932	20 %	0 %	60 %	20 %	557693672
131	NC_022786	CGAGC	2	10	240012	240021	20 %	0 %	40 %	40 %	557693676
132	NC_022786	CATCA	2	10	246140	246149	40 %	20 %	0 %	40 %	557693680
133	NC_022786	AGCCA	2	10	247526	247535	40 %	0 %	20 %	40 %	557693681
134	NC_022786	CGCCT	2	10	249296	249305	0 %	20 %	20 %	60 %	557693683
135	NC_022786	TCAGG	2	10	250044	250053	20 %	20 %	40 %	20 %	557693683
136	NC_022786	GAGCT	2	10	256458	256467	20 %	20 %	40 %	20 %	557693689
137	NC_022786	GCCGC	2	10	257222	257231	0 %	0 %	40 %	60 %	557693690
138	NC_022786	GCTCC	2	10	259125	259134	0 %	20 %	20 %	60 %	557693693
139	NC_022786	ACCTC	2	10	263738	263747	20 %	20 %	0 %	60 %	557693699
140	NC_022786	AAACC	2	10	264899	264908	60 %	0 %	0 %	40 %	557693701
141	NC_022786	CTGGG	2	10	267109	267118	0 %	20 %	60 %	20 %	557693703
142	NC_022786	ATGTG	2	10	268856	268865	20 %	40 %	40 %	0 %	557693705
143	NC_022786	ATCAA	2	10	269687	269696	60 %	20 %	0 %	20 %	557693705
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145	NC_022786	CGATG	2	10	271504	271513	20 %	20 %	40 %	20 %	557693707
146	NC_022786	AGCTA	2	10	272807	272816	40 %	20 %	20 %	20 %	557693708
147	NC_022786	ATTGT	2	10	279422	279431	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_022786	TTGTT	2	10	279505	279514	0 %	80 %	20 %	0 %	557693717
150	NC_022786	GGCTT	2	10	283354	283363	0 %	40 %	40 %	20 %	557693721
151	NC_022786	GATAG	2	10	283487	283496	40 %	20 %	40 %	0 %	557693721
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157	NC_022786	GAGCG	2	10	303198	303207	20 %	0 %	60 %	20 %	557693746
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162	NC_022786	TGGTG	2	10	305208	305217	0 %	40 %	60 %	0 %	557693748
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165	NC_022786	GTCTG	2	10	311855	311864	0 %	40 %	40 %	20 %	557693759
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167	NC_022786	CCTCT	2	10	318586	318595	0 %	40 %	0 %	60 %	557693767
168	NC_022786	ATATG	2	10	319776	319785	40 %	40 %	20 %	0 %	557693769
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174	NC_022786	TAGAG	2	10	327576	327585	40 %	20 %	40 %	0 %	557693775
175	NC_022786	GCTTG	2	10	331314	331323	0 %	40 %	40 %	20 %	557693778
176	NC_022786	CCCTA	2	10	336742	336751	20 %	20 %	0 %	60 %	557693783
177	NC_022786	CCAGC	2	10	336969	336978	20 %	0 %	20 %	60 %	557693783
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234	NC_022786	AGAGG	2	10	432024	432033	40 %	0 %	60 %	0 %	557693889
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244	NC_022786	GGGTG	2	10	458788	458797	0 %	20 %	80 %	0 %	557693928
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247	NC_022786	CGGGG	2	10	463188	463197	0 %	0 %	80 %	20 %	557693932
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249	NC_022786	TGGGC	2	10	464845	464854	0 %	20 %	60 %	20 %	557693934
250	NC_022786	TATTC	2	10	467293	467302	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
251	NC_022786	AGCAG	2	10	470173	470182	40 %	0 %	40 %	20 %	557693940
252	NC_022786	GATAA	2	10	475140	475149	60 %	20 %	20 %	0 %	557693947
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254	NC_022786	TTAAA	2	10	482878	482887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_022786	TTTCT	2	10	486729	486738	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
256	NC_022786	GGTTG	2	10	488548	488557	0 %	40 %	60 %	0 %	557693959
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261	NC_022786	AAACA	2	10	501636	501645	80 %	0 %	0 %	20 %	557693970
262	NC_022786	GGCGA	2	10	506224	506233	20 %	0 %	60 %	20 %	557693972
263	NC_022786	CCGAG	2	10	508805	508814	20 %	0 %	40 %	40 %	557693976
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392	NC_022786	ATAGG	2	10	693087	693096	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
393	NC_022786	GGACA	2	10	693453	693462	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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397	NC_022786	GGGCG	2	10	700733	700742	0 %	0 %	80 %	20 %	557694168
398	NC_022786	ATGGC	2	10	702237	702246	20 %	20 %	40 %	20 %	557694169
399	NC_022786	CATCG	2	10	702634	702643	20 %	20 %	20 %	40 %	557694169
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412	NC_022786	TAAAC	2	10	721873	721882	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_022786	CATTT	2	10	892592	892601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

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