MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 34858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022786	GATGG	2	10	165900	165909	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_022786	A	6	6	165912	165917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_022786	CTT	2	6	165959	165964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693600
3504	NC_022786	CTG	2	6	165966	165971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693600
3505	NC_022786	CGG	2	6	165992	165997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693600
3506	NC_022786	GCG	3	9	166021	166029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693600
3507	NC_022786	TCG	2	6	166084	166089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693600
3508	NC_022786	GCT	2	6	166153	166158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693600
3509	NC_022786	CT	3	6	166166	166171	0 %	50 %	0 %	50 %	557693600
3510	NC_022786	CTT	2	6	166178	166183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693600
3511	NC_022786	TTC	2	6	166258	166263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_022786	GGGC	2	8	166290	166297	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_022786	TCT	2	6	166356	166361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_022786	TGG	2	6	166380	166385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_022786	TGG	2	6	166450	166455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693601
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3518	NC_022786	GAC	2	6	166589	166594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693601
3519	NC_022786	GCT	2	6	166703	166708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693601
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3521	NC_022786	CAT	2	6	166847	166852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693601
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3529	NC_022786	CATA	2	8	167260	167267	50 %	25 %	0 %	25 %	557693601
3530	NC_022786	CATG	2	8	167372	167379	25 %	25 %	25 %	25 %	557693601
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3534	NC_022786	AG	3	6	167596	167601	50 %	0 %	50 %	0 %	557693602
3535	NC_022786	ACA	2	6	167789	167794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693603
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3539	NC_022786	GCCA	2	8	167892	167899	25 %	0 %	25 %	50 %	557693603
3540	NC_022786	GAG	2	6	167919	167924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693603
3541	NC_022786	CTCA	2	8	167934	167941	25 %	25 %	0 %	50 %	557693603
3542	NC_022786	T	6	6	167969	167974	0 %	100 %	0 %	0 %	557693603
3543	NC_022786	CGG	3	9	167975	167983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693603
3544	NC_022786	GCA	2	6	167986	167991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693603
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3546	NC_022786	GTC	2	6	168030	168035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693603
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3549	NC_022786	AGC	2	6	168145	168150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693603
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3552	NC_022786	GGCTG	2	10	168369	168378	0 %	20 %	60 %	20 %	557693603
3553	NC_022786	CAC	2	6	168381	168386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693603
3554	NC_022786	GA	3	6	168427	168432	50 %	0 %	50 %	0 %	557693603
3555	NC_022786	TCA	2	6	168488	168493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693603
3556	NC_022786	CTCTC	2	10	168498	168507	0 %	40 %	0 %	60 %	557693603
3557	NC_022786	CCT	2	6	168533	168538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693603
3558	NC_022786	AGAA	2	8	168639	168646	75 %	0 %	25 %	0 %	557693603
3559	NC_022786	CCT	2	6	168692	168697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693604
3560	NC_022786	A	6	6	168708	168713	100 %	0 %	0 %	0 %	557693604
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3562	NC_022786	TCAA	2	8	168810	168817	50 %	25 %	0 %	25 %	557693604
3563	NC_022786	AAC	2	6	168899	168904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693604
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3565	NC_022786	GTTT	2	8	168953	168960	0 %	75 %	25 %	0 %	557693604
3566	NC_022786	GT	3	6	168962	168967	0 %	50 %	50 %	0 %	557693604
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3570	NC_022786	GAT	2	6	169133	169138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693604
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3572	NC_022786	ATG	2	6	169179	169184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693604
3573	NC_022786	TTA	2	6	169251	169256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_022786	CCG	3	9	169259	169267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_022786	CGC	2	6	169318	169323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_022786	CAC	2	6	169324	169329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3578	NC_022786	AGG	2	6	169488	169493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3587	NC_022786	TGA	2	6	169957	169962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693605
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3589	NC_022786	CGT	2	6	170084	170089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693605
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3591	NC_022786	TA	3	6	170180	170185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_022786	CGG	2	6	170196	170201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_022786	TTC	2	6	170253	170258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693606
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3601	NC_022786	TTCT	2	8	170573	170580	0 %	75 %	0 %	25 %	557693606
3602	NC_022786	GCT	2	6	170641	170646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693606
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3608	NC_022786	GAC	2	6	170854	170859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693607
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3611	NC_022786	A	6	6	170968	170973	100 %	0 %	0 %	0 %	557693607
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3622	NC_022786	AAT	2	6	171217	171222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693607
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3749	NC_022786	GT	3	6	177026	177031	0 %	50 %	50 %	0 %	557693612
3750	NC_022786	GTTT	2	8	177044	177051	0 %	75 %	25 %	0 %	557693612
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3755	NC_022786	AGC	2	6	177138	177143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693612
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3769	NC_022786	TGCTC	2	10	177661	177670	0 %	40 %	20 %	40 %	557693613
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3779	NC_022786	CAT	2	6	178019	178024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693613
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3787	NC_022786	GCCG	2	8	178271	178278	0 %	0 %	50 %	50 %	557693613
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3815	NC_022786	CT	3	6	179442	179447	0 %	50 %	0 %	50 %	557693616
3816	NC_022786	GCT	2	6	179510	179515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693616
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3821	NC_022786	GAT	2	6	179809	179814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3839	NC_022786	CTT	2	6	180780	180785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693617
3840	NC_022786	T	6	6	180784	180789	0 %	100 %	0 %	0 %	557693617
3841	NC_022786	TGT	2	6	180822	180827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693617
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3844	NC_022786	AG	3	6	180948	180953	50 %	0 %	50 %	0 %	557693617
3845	NC_022786	CAT	2	6	180990	180995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693617
3846	NC_022786	CAT	2	6	181103	181108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693618
3847	NC_022786	ATG	2	6	181204	181209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693618
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3850	NC_022786	ATA	2	6	181404	181409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693618
3851	NC_022786	GCCA	2	8	181467	181474	25 %	0 %	25 %	50 %	557693618
3852	NC_022786	CGG	2	6	181603	181608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693618
3853	NC_022786	AGG	2	6	181609	181614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693618
3854	NC_022786	GGCTT	2	10	181621	181630	0 %	40 %	40 %	20 %	557693618
3855	NC_022786	GGA	2	6	181664	181669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693618
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3858	NC_022786	AAG	2	6	181825	181830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693618
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3861	NC_022786	CCTGT	2	10	181990	181999	0 %	40 %	20 %	40 %	557693619
3862	NC_022786	TCT	2	6	182063	182068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693619
3863	NC_022786	GCAT	2	8	182095	182102	25 %	25 %	25 %	25 %	557693619
3864	NC_022786	TGT	2	6	182123	182128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693619
3865	NC_022786	TTC	2	6	182157	182162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693619
3866	NC_022786	TCC	2	6	182228	182233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693619
3867	NC_022786	GAA	2	6	182334	182339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693619
3868	NC_022786	TCT	2	6	182341	182346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693619
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3870	NC_022786	TGA	2	6	182380	182385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693619
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