MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 34858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022786	TTGC	2	8	120165	120172	0 %	50 %	25 %	25 %	557693553
2502	NC_022786	CGC	2	6	120188	120193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693553
2503	NC_022786	CA	3	6	120204	120209	50 %	0 %	0 %	50 %	557693553
2504	NC_022786	CGG	3	9	120302	120310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693553
2505	NC_022786	ATC	2	6	120378	120383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693553
2506	NC_022786	TAG	2	6	120385	120390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693554
2507	NC_022786	GCT	2	6	120423	120428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693554
2508	NC_022786	TAT	2	6	120448	120453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693554
2509	NC_022786	TTG	2	6	120461	120466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693554
2510	NC_022786	TGA	2	6	120561	120566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693554
2511	NC_022786	TCC	2	6	120598	120603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693554
2512	NC_022786	ACG	2	6	120620	120625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693554
2513	NC_022786	TGA	2	6	120644	120649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693554
2514	NC_022786	CGA	2	6	120657	120662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693554
2515	NC_022786	AC	3	6	120686	120691	50 %	0 %	0 %	50 %	557693554
2516	NC_022786	TCG	2	6	120770	120775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693554
2517	NC_022786	GTTT	2	8	120823	120830	0 %	75 %	25 %	0 %	557693554
2518	NC_022786	GGT	2	6	120866	120871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693554
2519	NC_022786	CAG	2	6	120901	120906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693554
2520	NC_022786	TAAG	2	8	120925	120932	50 %	25 %	25 %	0 %	557693554
2521	NC_022786	TCT	2	6	120948	120953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693554
2522	NC_022786	CTT	2	6	120958	120963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693554
2523	NC_022786	ATT	2	6	121001	121006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_022786	TAT	2	6	121037	121042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_022786	TGA	2	6	121061	121066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693555
2526	NC_022786	CGT	2	6	121131	121136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693555
2527	NC_022786	TCT	2	6	121162	121167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693555
2528	NC_022786	CGC	2	6	121267	121272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693555
2529	NC_022786	TGT	2	6	121316	121321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693555
2530	NC_022786	CGG	3	9	121377	121385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693555
2531	NC_022786	TCC	2	6	121465	121470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693555
2532	NC_022786	GCC	2	6	121497	121502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693555
2533	NC_022786	GGA	2	6	121507	121512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693555
2534	NC_022786	ACC	2	6	121609	121614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693555
2535	NC_022786	CTT	2	6	121653	121658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693555
2536	NC_022786	TGC	2	6	121676	121681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693555
2537	NC_022786	CTT	2	6	121758	121763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693555
2538	NC_022786	AACG	2	8	121768	121775	50 %	0 %	25 %	25 %	557693555
2539	NC_022786	A	6	6	121817	121822	100 %	0 %	0 %	0 %	557693555
2540	NC_022786	TTC	2	6	121867	121872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693555
2541	NC_022786	ATA	2	6	121876	121881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693555
2542	NC_022786	TGC	3	9	121940	121948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693555
2543	NC_022786	CGC	2	6	121983	121988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693555
2544	NC_022786	TTTC	2	8	122040	122047	0 %	75 %	0 %	25 %	557693555
2545	NC_022786	TTTC	2	8	122065	122072	0 %	75 %	0 %	25 %	557693555
2546	NC_022786	TTG	2	6	122098	122103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693555
2547	NC_022786	GTT	2	6	122173	122178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693555
2548	NC_022786	CCT	2	6	122204	122209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693555
2549	NC_022786	G	6	6	122232	122237	0 %	0 %	100 %	0 %	557693555
2550	NC_022786	GCC	2	6	122248	122253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693555
2551	NC_022786	TC	3	6	122365	122370	0 %	50 %	0 %	50 %	557693555
2552	NC_022786	GCCATA	2	12	122371	122382	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	557693555
2553	NC_022786	GCA	2	6	122383	122388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693555
2554	NC_022786	GCCCTC	2	12	122398	122409	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	557693555
2555	NC_022786	ATC	2	6	122454	122459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693555
2556	NC_022786	ATC	2	6	122482	122487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_022786	GAA	2	6	122493	122498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693556
2558	NC_022786	GGC	2	6	122530	122535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693556
2559	NC_022786	GTC	2	6	122536	122541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693556
2560	NC_022786	AGC	2	6	122542	122547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693556
2561	NC_022786	GCC	2	6	122566	122571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693556
2562	NC_022786	TCCG	2	8	122590	122597	0 %	25 %	25 %	50 %	557693556
2563	NC_022786	GAC	2	6	122692	122697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693556
2564	NC_022786	GACCTC	2	12	122710	122721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	557693556
2565	NC_022786	AAC	2	6	122748	122753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693556
2566	NC_022786	AAC	2	6	122772	122777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693556
2567	NC_022786	GA	3	6	122809	122814	50 %	0 %	50 %	0 %	557693556
2568	NC_022786	GT	3	6	122835	122840	0 %	50 %	50 %	0 %	557693556
2569	NC_022786	TGA	2	6	122862	122867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693556
2570	NC_022786	AGA	2	6	122875	122880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693556
2571	NC_022786	TGG	2	6	122925	122930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693556
2572	NC_022786	GAG	2	6	122989	122994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693556
2573	NC_022786	TTGT	2	8	123010	123017	0 %	75 %	25 %	0 %	557693556
2574	NC_022786	AAG	2	6	123155	123160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693556
2575	NC_022786	ATT	2	6	123275	123280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693556
2576	NC_022786	GA	3	6	123321	123326	50 %	0 %	50 %	0 %	557693556
2577	NC_022786	GCTG	2	8	123402	123409	0 %	25 %	50 %	25 %	557693556
2578	NC_022786	AGG	2	6	123428	123433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693556
2579	NC_022786	GAG	2	6	123493	123498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693556
2580	NC_022786	AAG	2	6	123513	123518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693556
2581	NC_022786	ATG	2	6	123539	123544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693556
2582	NC_022786	GGC	2	6	123559	123564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693556
2583	NC_022786	AGA	2	6	123571	123576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693556
2584	NC_022786	AGG	2	6	123783	123788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693556
2585	NC_022786	TCA	2	6	123821	123826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693556
2586	NC_022786	CA	3	6	123901	123906	50 %	0 %	0 %	50 %	557693556
2587	NC_022786	AGA	2	6	123923	123928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693556
2588	NC_022786	TTC	2	6	124000	124005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693556
2589	NC_022786	ATCT	2	8	124031	124038	25 %	50 %	0 %	25 %	557693556
2590	NC_022786	GCG	2	6	124081	124086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693556
2591	NC_022786	GA	3	6	124090	124095	50 %	0 %	50 %	0 %	557693556
2592	NC_022786	AGC	2	6	124110	124115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693556
2593	NC_022786	TCT	3	9	124140	124148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693557
2594	NC_022786	AGC	2	6	124171	124176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693557
2595	NC_022786	GCC	2	6	124198	124203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693557
2596	NC_022786	CA	3	6	124225	124230	50 %	0 %	0 %	50 %	557693557
2597	NC_022786	CTCGA	2	10	124267	124276	20 %	20 %	20 %	40 %	557693557
2598	NC_022786	TG	3	6	124303	124308	0 %	50 %	50 %	0 %	557693557
2599	NC_022786	GAT	2	6	124314	124319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693557
2600	NC_022786	GAT	2	6	124323	124328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693557
2601	NC_022786	GCT	2	6	124340	124345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693557
2602	NC_022786	GA	3	6	124366	124371	50 %	0 %	50 %	0 %	557693557
2603	NC_022786	AGG	2	6	124375	124380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693557
2604	NC_022786	GCT	2	6	124421	124426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693557
2605	NC_022786	CAG	2	6	124512	124517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693557
2606	NC_022786	GCG	2	6	124529	124534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693557
2607	NC_022786	TCA	2	6	124601	124606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693557
2608	NC_022786	CCA	2	6	124628	124633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693557
2609	NC_022786	CAG	2	6	124644	124649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693557
2610	NC_022786	CCT	2	6	124712	124717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693557
2611	NC_022786	GGC	2	6	124737	124742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693557
2612	NC_022786	GTT	2	6	124756	124761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693557
2613	NC_022786	TAT	2	6	124767	124772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693557
2614	NC_022786	GAG	2	6	124788	124793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693557
2615	NC_022786	GAA	2	6	124803	124808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693557
2616	NC_022786	TTG	2	6	124809	124814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693557
2617	NC_022786	AGAA	2	8	124895	124902	75 %	0 %	25 %	0 %	557693557
2618	NC_022786	TCT	2	6	124912	124917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693557
2619	NC_022786	TC	3	6	124983	124988	0 %	50 %	0 %	50 %	557693557
2620	NC_022786	GTTT	2	8	125039	125046	0 %	75 %	25 %	0 %	557693557
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2622	NC_022786	TGA	2	6	125111	125116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693557
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2742	NC_022786	TGT	2	6	129915	129920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693563
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2993	NC_022786	CGA	2	6	141604	141609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693577
2994	NC_022786	CTT	2	6	141634	141639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693577
2995	NC_022786	GCG	2	6	141659	141664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693577
2996	NC_022786	GGC	2	6	141755	141760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693577
2997	NC_022786	GCT	2	6	141844	141849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693577
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2999	NC_022786	ATG	2	6	141920	141925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693577
3000	NC_022786	AGC	2	6	141935	141940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693577

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