MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 34858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022786	CTTCGC	2	12	48720	48731	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	557693488
1002	NC_022786	ACAG	2	8	48734	48741	50 %	0 %	25 %	25 %	557693488
1003	NC_022786	CGA	2	6	48795	48800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693488
1004	NC_022786	ATG	2	6	48821	48826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693488
1005	NC_022786	CCAC	2	8	48927	48934	25 %	0 %	0 %	75 %	557693488
1006	NC_022786	TTC	2	6	49007	49012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693488
1007	NC_022786	AG	3	6	49069	49074	50 %	0 %	50 %	0 %	557693488
1008	NC_022786	AGA	2	6	49096	49101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693488
1009	NC_022786	AGA	2	6	49179	49184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693488
1010	NC_022786	CCA	2	6	49230	49235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693488
1011	NC_022786	ATC	2	6	49298	49303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_022786	AC	3	6	49309	49314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_022786	TA	3	6	49315	49320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022786	CAG	2	6	49346	49351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_022786	T	6	6	49354	49359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_022786	GGC	2	6	49413	49418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693489
1017	NC_022786	GTT	2	6	49455	49460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693489
1018	NC_022786	GCT	2	6	49533	49538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693489
1019	NC_022786	CGCT	2	8	49560	49567	0 %	25 %	25 %	50 %	557693489
1020	NC_022786	GGA	2	6	49595	49600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693489
1021	NC_022786	TCA	2	6	49645	49650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693489
1022	NC_022786	GTGAA	2	10	49687	49696	40 %	20 %	40 %	0 %	557693489
1023	NC_022786	GGA	2	6	49727	49732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693489
1024	NC_022786	GCG	2	6	49747	49752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693489
1025	NC_022786	ATAC	2	8	49754	49761	50 %	25 %	0 %	25 %	557693489
1026	NC_022786	GGT	2	6	49799	49804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693489
1027	NC_022786	CGT	2	6	49823	49828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693489
1028	NC_022786	CT	3	6	49855	49860	0 %	50 %	0 %	50 %	557693489
1029	NC_022786	CAG	2	6	49867	49872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693489
1030	NC_022786	ATA	2	6	49878	49883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693489
1031	NC_022786	GGT	2	6	49907	49912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693489
1032	NC_022786	CTT	2	6	49947	49952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693489
1033	NC_022786	CG	3	6	49955	49960	0 %	0 %	50 %	50 %	557693489
1034	NC_022786	GCTG	2	8	49970	49977	0 %	25 %	50 %	25 %	557693489
1035	NC_022786	GT	3	6	49990	49995	0 %	50 %	50 %	0 %	557693489
1036	NC_022786	CAA	2	6	50114	50119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693489
1037	NC_022786	GAT	2	6	50166	50171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693489
1038	NC_022786	CGA	2	6	50276	50281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693489
1039	NC_022786	TGC	2	6	50296	50301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693489
1040	NC_022786	TTG	2	6	50305	50310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693489
1041	NC_022786	CGG	2	6	50438	50443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693489
1042	NC_022786	ATC	2	6	50461	50466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693489
1043	NC_022786	GAG	2	6	50514	50519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693489
1044	NC_022786	CAA	2	6	50621	50626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693489
1045	NC_022786	CTT	2	6	50708	50713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693489
1046	NC_022786	CGG	2	6	50720	50725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693489
1047	NC_022786	ATG	2	6	50778	50783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693489
1048	NC_022786	TCA	2	6	50785	50790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693489
1049	NC_022786	CAG	2	6	50815	50820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693489
1050	NC_022786	AAAT	2	8	50867	50874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_022786	GGGTA	2	10	50905	50914	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_022786	CCG	2	6	50926	50931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_022786	GGT	2	6	50951	50956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022786	C	6	6	50966	50971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1055	NC_022786	TA	4	8	50981	50988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022786	TGTTTT	2	12	50992	51003	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_022786	TCTA	2	8	51044	51051	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_022786	GCC	2	6	51097	51102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_022786	GATG	2	8	51146	51153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_022786	TTCT	2	8	51170	51177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_022786	TA	3	6	51225	51230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022786	CCT	2	6	51275	51280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_022786	CTC	2	6	51334	51339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_022786	GTT	2	6	51367	51372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022786	ACC	2	6	51408	51413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_022786	ACT	2	6	51459	51464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_022786	TAT	2	6	51554	51559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1069	NC_022786	TCC	2	6	51643	51648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1073	NC_022786	TCA	2	6	52172	52177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_022786	GGA	2	6	52279	52284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_022786	G	6	6	52299	52304	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_022786	AGA	2	6	52321	52326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_022786	TA	3	6	52329	52334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_022786	ATG	2	6	53424	53429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_022786	T	6	6	53538	53543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_022786	TCC	2	6	53622	53627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_022786	CGA	2	6	53641	53646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022786	CAG	2	6	53713	53718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_022786	AGT	2	6	53729	53734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_022786	CCT	2	6	53754	53759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_022786	AGG	2	6	53855	53860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_022786	GAG	3	9	53908	53916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_022786	CTA	2	6	53940	53945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_022786	CCCT	2	8	54327	54334	0 %	25 %	0 %	75 %	557693491
1103	NC_022786	GGAG	2	8	54358	54365	25 %	0 %	75 %	0 %	557693491
1104	NC_022786	CCAA	2	8	54396	54403	50 %	0 %	0 %	50 %	557693491
1105	NC_022786	GAG	2	6	54407	54412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693491
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1108	NC_022786	CAT	2	6	54470	54475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693491
1109	NC_022786	AGG	2	6	54522	54527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693491
1110	NC_022786	ACA	2	6	54628	54633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_022786	CTG	2	6	54679	54684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_022786	TCC	2	6	54701	54706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_022786	AAAT	2	8	54750	54757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_022786	CTC	2	6	54787	54792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_022786	GGA	2	6	54904	54909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1117	NC_022786	TTTG	2	8	54958	54965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022786	GTA	2	6	54979	54984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022786	TTC	2	6	55007	55012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_022786	CT	3	6	55034	55039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_022786	ATC	2	6	55089	55094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_022786	GAT	2	6	55153	55158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022786	TTC	2	6	55194	55199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693492
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1127	NC_022786	ATG	2	6	55363	55368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693492
1128	NC_022786	CAA	2	6	55382	55387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693492
1129	NC_022786	TCCT	2	8	55395	55402	0 %	50 %	0 %	50 %	557693492
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1131	NC_022786	TTA	2	6	55466	55471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693492
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1251	NC_022786	CT	3	6	60672	60677	0 %	50 %	0 %	50 %	557693499
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1256	NC_022786	TAAA	2	8	60950	60957	75 %	25 %	0 %	0 %	557693499
1257	NC_022786	ATCTTC	2	12	61043	61054	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	557693500
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