MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium tetani 12124569

Total Repeats: 244

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022778	AT	3	6	79	84	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022778	AG	3	6	210	215	50 %	0 %	50 %	0 %	557606927
3	NC_022778	TA	3	6	887	892	50 %	50 %	0 %	0 %	557606928
4	NC_022778	TA	4	8	1127	1134	50 %	50 %	0 %	0 %	557606929
5	NC_022778	AT	3	6	1543	1548	50 %	50 %	0 %	0 %	557606931
6	NC_022778	TA	4	8	1590	1597	50 %	50 %	0 %	0 %	557606931
7	NC_022778	AT	3	6	1899	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	557606932
8	NC_022778	TA	3	6	1932	1937	50 %	50 %	0 %	0 %	557606932
9	NC_022778	AT	3	6	2315	2320	50 %	50 %	0 %	0 %	557606933
10	NC_022778	AT	4	8	2342	2349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022778	AT	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	557606934
12	NC_022778	TA	3	6	2711	2716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022778	AT	4	8	2983	2990	50 %	50 %	0 %	0 %	557606935
14	NC_022778	AT	3	6	3460	3465	50 %	50 %	0 %	0 %	557606936
15	NC_022778	TA	3	6	3575	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	557606936
16	NC_022778	TA	3	6	4172	4177	50 %	50 %	0 %	0 %	557606937
17	NC_022778	TA	3	6	4751	4756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022778	AT	3	6	4810	4815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022778	AT	3	6	5132	5137	50 %	50 %	0 %	0 %	557606938
20	NC_022778	CT	3	6	5507	5512	0 %	50 %	0 %	50 %	557606939
21	NC_022778	AT	3	6	5620	5625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022778	AT	3	6	5798	5803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022778	TA	3	6	5967	5972	50 %	50 %	0 %	0 %	557606940
24	NC_022778	TA	3	6	6207	6212	50 %	50 %	0 %	0 %	557606940
25	NC_022778	TA	3	6	6385	6390	50 %	50 %	0 %	0 %	557606940
26	NC_022778	AT	3	6	6536	6541	50 %	50 %	0 %	0 %	557606940
27	NC_022778	TA	3	6	6775	6780	50 %	50 %	0 %	0 %	557606940
28	NC_022778	AT	4	8	6885	6892	50 %	50 %	0 %	0 %	557606941
29	NC_022778	AT	3	6	7245	7250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022778	TA	3	6	7694	7699	50 %	50 %	0 %	0 %	557606942
31	NC_022778	TA	3	6	8594	8599	50 %	50 %	0 %	0 %	557606943
32	NC_022778	AT	3	6	8733	8738	50 %	50 %	0 %	0 %	557606943
33	NC_022778	AT	3	6	9138	9143	50 %	50 %	0 %	0 %	557606944
34	NC_022778	TA	4	8	9556	9563	50 %	50 %	0 %	0 %	557606945
35	NC_022778	TA	3	6	9742	9747	50 %	50 %	0 %	0 %	557606945
36	NC_022778	AT	3	6	10077	10082	50 %	50 %	0 %	0 %	557606945
37	NC_022778	AT	3	6	10244	10249	50 %	50 %	0 %	0 %	557606946
38	NC_022778	AT	3	6	10655	10660	50 %	50 %	0 %	0 %	557606946
39	NC_022778	AT	3	6	10942	10947	50 %	50 %	0 %	0 %	557606946
40	NC_022778	AT	3	6	11049	11054	50 %	50 %	0 %	0 %	557606946
41	NC_022778	AT	3	6	11056	11061	50 %	50 %	0 %	0 %	557606946
42	NC_022778	TA	3	6	11222	11227	50 %	50 %	0 %	0 %	557606946
43	NC_022778	AT	3	6	11349	11354	50 %	50 %	0 %	0 %	557606946
44	NC_022778	TA	3	6	12261	12266	50 %	50 %	0 %	0 %	557606946
45	NC_022778	AT	3	6	12732	12737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022778	TA	3	6	13257	13262	50 %	50 %	0 %	0 %	557606948
47	NC_022778	TA	4	8	13511	13518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022778	AT	3	6	13541	13546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022778	TA	3	6	14012	14017	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
50	NC_022778	TA	3	6	14117	14122	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
51	NC_022778	AT	3	6	14481	14486	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
52	NC_022778	TA	6	12	14548	14559	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
53	NC_022778	TA	3	6	14599	14604	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
54	NC_022778	TA	3	6	14945	14950	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
55	NC_022778	AT	3	6	14976	14981	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
56	NC_022778	TA	3	6	15184	15189	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
57	NC_022778	AT	3	6	15473	15478	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
58	NC_022778	AT	3	6	15480	15485	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
59	NC_022778	AT	3	6	15766	15771	50 %	50 %	0 %	0 %	557606950
60	NC_022778	TA	3	6	15869	15874	50 %	50 %	0 %	0 %	557606950
61	NC_022778	TA	3	6	16307	16312	50 %	50 %	0 %	0 %	557606950
62	NC_022778	TA	3	6	16651	16656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022778	AT	3	6	16691	16696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022778	TA	3	6	16728	16733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022778	TA	3	6	16969	16974	50 %	50 %	0 %	0 %	557606952
66	NC_022778	TA	3	6	17240	17245	50 %	50 %	0 %	0 %	557606952
67	NC_022778	AT	3	6	17590	17595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022778	TA	3	6	17861	17866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022778	AT	3	6	17877	17882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022778	TA	4	8	18186	18193	50 %	50 %	0 %	0 %	557606954
71	NC_022778	AT	3	6	18218	18223	50 %	50 %	0 %	0 %	557606954
72	NC_022778	AT	3	6	18331	18336	50 %	50 %	0 %	0 %	557606954
73	NC_022778	TA	4	8	18375	18382	50 %	50 %	0 %	0 %	557606954
74	NC_022778	TA	3	6	18715	18720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022778	AT	3	6	18794	18799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022778	AT	4	8	19347	19354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022778	AT	3	6	19683	19688	50 %	50 %	0 %	0 %	557606956
78	NC_022778	TA	3	6	19848	19853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022778	TA	4	8	19972	19979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022778	TA	3	6	20019	20024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022778	TA	3	6	20093	20098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022778	AT	3	6	20136	20141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022778	TA	3	6	20368	20373	50 %	50 %	0 %	0 %	557606957
84	NC_022778	AT	3	6	20453	20458	50 %	50 %	0 %	0 %	557606958
85	NC_022778	AT	3	6	20735	20740	50 %	50 %	0 %	0 %	557606958
86	NC_022778	AT	3	6	21279	21284	50 %	50 %	0 %	0 %	557606959
87	NC_022778	AT	3	6	21466	21471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022778	AT	3	6	21862	21867	50 %	50 %	0 %	0 %	557606960
89	NC_022778	AT	3	6	22358	22363	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
90	NC_022778	TA	3	6	22371	22376	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
91	NC_022778	AT	3	6	22387	22392	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
92	NC_022778	AT	3	6	22646	22651	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
93	NC_022778	TA	3	6	22679	22684	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
94	NC_022778	TA	4	8	23180	23187	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
95	NC_022778	TA	3	6	23476	23481	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
96	NC_022778	AT	3	6	23731	23736	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
97	NC_022778	AT	3	6	24024	24029	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
98	NC_022778	AT	3	6	24100	24105	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
99	NC_022778	TA	3	6	24388	24393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022778	TA	3	6	24574	24579	50 %	50 %	0 %	0 %	557606962
101	NC_022778	AT	3	6	24611	24616	50 %	50 %	0 %	0 %	557606962
102	NC_022778	AT	4	8	25052	25059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022778	AT	3	6	25283	25288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022778	TA	3	6	25618	25623	50 %	50 %	0 %	0 %	557606963
105	NC_022778	AT	3	6	25806	25811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022778	TA	3	6	26128	26133	50 %	50 %	0 %	0 %	557606964
107	NC_022778	AT	3	6	26172	26177	50 %	50 %	0 %	0 %	557606965
108	NC_022778	AT	3	6	26410	26415	50 %	50 %	0 %	0 %	557606965
109	NC_022778	AT	3	6	26482	26487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022778	AT	3	6	27446	27451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022778	GT	3	6	27591	27596	0 %	50 %	50 %	0 %	557606968
112	NC_022778	TA	3	6	28148	28153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022778	AT	3	6	28504	28509	50 %	50 %	0 %	0 %	557606970
114	NC_022778	AT	4	8	28642	28649	50 %	50 %	0 %	0 %	557606970
115	NC_022778	TC	3	6	28680	28685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022778	AT	3	6	28707	28712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022778	AT	3	6	29324	29329	50 %	50 %	0 %	0 %	557606971
118	NC_022778	AT	4	8	30565	30572	50 %	50 %	0 %	0 %	557606971
119	NC_022778	AT	3	6	30653	30658	50 %	50 %	0 %	0 %	557606971
120	NC_022778	TA	3	6	31205	31210	50 %	50 %	0 %	0 %	557606971
121	NC_022778	TA	3	6	32233	32238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022778	AT	3	6	32259	32264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022778	AT	3	6	32393	32398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022778	AT	4	8	32678	32685	50 %	50 %	0 %	0 %	557606973
125	NC_022778	AT	3	6	32843	32848	50 %	50 %	0 %	0 %	557606973
126	NC_022778	TA	3	6	32895	32900	50 %	50 %	0 %	0 %	557606973
127	NC_022778	AT	4	8	33149	33156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022778	AT	3	6	33187	33192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022778	AT	3	6	33449	33454	50 %	50 %	0 %	0 %	557606974
130	NC_022778	TA	4	8	33476	33483	50 %	50 %	0 %	0 %	557606974
131	NC_022778	TA	3	6	33774	33779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022778	AT	3	6	33926	33931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022778	TA	3	6	33938	33943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022778	TA	3	6	34028	34033	50 %	50 %	0 %	0 %	557606975
135	NC_022778	AT	4	8	34251	34258	50 %	50 %	0 %	0 %	557606975
136	NC_022778	AT	3	6	34466	34471	50 %	50 %	0 %	0 %	557606975
137	NC_022778	TA	3	6	34776	34781	50 %	50 %	0 %	0 %	557606975
138	NC_022778	AG	3	6	34880	34885	50 %	0 %	50 %	0 %	557606975
139	NC_022778	TA	3	6	34899	34904	50 %	50 %	0 %	0 %	557606975
140	NC_022778	AG	3	6	34979	34984	50 %	0 %	50 %	0 %	557606975
141	NC_022778	AT	3	6	35538	35543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022778	AT	3	6	35615	35620	50 %	50 %	0 %	0 %	557606976
143	NC_022778	TG	3	6	36084	36089	0 %	50 %	50 %	0 %	557606977
144	NC_022778	AT	3	6	36117	36122	50 %	50 %	0 %	0 %	557606977
145	NC_022778	AT	3	6	36363	36368	50 %	50 %	0 %	0 %	557606977
146	NC_022778	GA	3	6	36646	36651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022778	AT	4	8	36677	36684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022778	AT	3	6	36874	36879	50 %	50 %	0 %	0 %	557606978
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.