MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium tetani 12124569 main chromosome

Total Repeats: 44715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022777	TGT	2	6	71	76	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022777	CAA	2	6	84	89	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022777	TAT	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022777	GTT	2	6	218	223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022777	TAT	2	6	258	263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022777	AAT	2	6	280	285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
7	NC_022777	TAA	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
8	NC_022777	CTT	2	6	406	411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
9	NC_022777	CTT	2	6	467	472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
10	NC_022777	TCT	2	6	508	513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
11	NC_022777	TCA	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
12	NC_022777	ATA	2	6	529	534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
13	NC_022777	CTT	2	6	554	559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
14	NC_022777	ATT	3	9	721	729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
15	NC_022777	TCT	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
16	NC_022777	TCT	2	6	864	869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
17	NC_022777	TCA	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
18	NC_022777	TTA	2	6	977	982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
19	NC_022777	AAT	2	6	1000	1005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
20	NC_022777	TCT	2	6	1107	1112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
21	NC_022777	TAA	2	6	1185	1190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
22	NC_022777	CTT	2	6	1199	1204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
23	NC_022777	ATC	2	6	1260	1265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
24	NC_022777	TCT	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
25	NC_022777	TTC	2	6	1299	1304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
26	NC_022777	GCT	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557604011
27	NC_022777	CTT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
28	NC_022777	CTA	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
29	NC_022777	CCT	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
30	NC_022777	TAT	2	6	1601	1606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
31	NC_022777	CTC	2	6	1638	1643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
32	NC_022777	TCT	2	6	1662	1667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
33	NC_022777	TTC	2	6	1704	1709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
34	NC_022777	CTC	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
35	NC_022777	GCA	2	6	1771	1776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557604011
36	NC_022777	CTC	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
37	NC_022777	CTA	2	6	1868	1873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
38	NC_022777	TAA	2	6	1938	1943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
39	NC_022777	TAT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
40	NC_022777	ATT	2	6	2055	2060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
41	NC_022777	TCT	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
42	NC_022777	ACA	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557604011
43	NC_022777	ATC	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
44	NC_022777	ATT	2	6	2328	2333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
45	NC_022777	TAA	2	6	2388	2393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
46	NC_022777	TCT	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
47	NC_022777	ATT	2	6	2452	2457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
48	NC_022777	TAG	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604011
49	NC_022777	TTA	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022777	TTA	2	6	2669	2674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022777	AGG	2	6	2759	2764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022777	TTC	2	6	2805	2810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604012
53	NC_022777	TAA	2	6	2824	2829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
54	NC_022777	TAA	3	9	2887	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
55	NC_022777	ACC	2	6	2903	2908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557604012
56	NC_022777	GAT	2	6	3021	3026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604012
57	NC_022777	AAT	2	6	3087	3092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
58	NC_022777	CAT	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604012
59	NC_022777	ATA	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
60	NC_022777	AAT	2	6	3591	3596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
61	NC_022777	TAA	2	6	3607	3612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
62	NC_022777	TCA	2	6	3702	3707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604012
63	NC_022777	TAT	2	6	3791	3796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604012
64	NC_022777	ATT	2	6	3966	3971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604012
65	NC_022777	CTA	2	6	3991	3996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604012
66	NC_022777	GAA	2	6	4065	4070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604012
67	NC_022777	AGA	2	6	4085	4090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604012
68	NC_022777	GTT	2	6	4187	4192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557604012
69	NC_022777	TTC	2	6	4193	4198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604012
70	NC_022777	AGG	2	6	4218	4223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022777	AGA	3	9	4251	4259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022777	GAT	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022777	AGA	2	6	4377	4382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604013
74	NC_022777	AGC	2	6	4401	4406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557604013
75	NC_022777	GAA	2	6	4517	4522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604013
76	NC_022777	CCT	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604013
77	NC_022777	ATT	2	6	4612	4617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604013
78	NC_022777	CTA	2	6	4664	4669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604013
79	NC_022777	ATC	2	6	4733	4738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604013
80	NC_022777	AGA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604013
81	NC_022777	ATT	2	6	4868	4873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604014
82	NC_022777	TTA	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604014
83	NC_022777	TCA	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604014
84	NC_022777	TCC	2	6	4920	4925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604014
85	NC_022777	CTA	2	6	4937	4942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604014
86	NC_022777	TCT	2	6	4951	4956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
87	NC_022777	TTC	2	6	4980	4985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
88	NC_022777	TCT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
89	NC_022777	CTT	3	9	5060	5068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
90	NC_022777	TCT	2	6	5110	5115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
91	NC_022777	TAT	2	6	5129	5134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604014
92	NC_022777	TTG	2	6	5148	5153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557604014
93	NC_022777	TCT	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
94	NC_022777	TAT	2	6	5178	5183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604014
95	NC_022777	TTC	2	6	5235	5240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
96	NC_022777	TGA	2	6	5256	5261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604014
97	NC_022777	CAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557604014
98	NC_022777	ATA	2	6	5421	5426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022777	ATT	2	6	5481	5486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022777	AAT	2	6	5810	5815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022777	AAT	2	6	5838	5843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022777	TGC	2	6	5888	5893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022777	TCG	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022777	CTC	2	6	6093	6098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_022777	ACG	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022777	CTA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022777	ACC	2	6	6337	6342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_022777	AGG	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022777	GGT	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022777	GCC	2	6	6831	6836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_022777	CCG	2	6	7062	7067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_022777	CTT	2	6	7480	7485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022777	CTC	2	6	7514	7519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_022777	GGT	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022777	GCT	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022777	GTT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022777	TGT	2	6	7808	7813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022777	GAG	2	6	7883	7888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022777	TCC	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_022777	AGT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022777	CTA	2	6	8493	8498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022777	TCC	2	6	8522	8527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_022777	GCT	2	6	8815	8820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022777	TAC	2	6	8840	8845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022777	TTA	2	6	8881	8886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022777	AGG	2	6	9004	9009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022777	ATG	2	6	9339	9344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022777	TCC	2	6	9365	9370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_022777	CTG	2	6	9411	9416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022777	CTA	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022777	GAC	2	6	9479	9484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022777	CAC	2	6	9492	9497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_022777	TTC	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022777	GCT	2	6	9603	9608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022777	CCT	2	6	9706	9711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_022777	TCC	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_022777	GCT	2	6	10020	10025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022777	ACA	2	6	10078	10083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022777	TCA	2	6	10106	10111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022777	TGC	2	6	10124	10129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022777	CTG	2	6	10163	10168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_022777	TCG	2	6	10238	10243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022777	TCC	2	6	10356	10361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_022777	CCG	2	6	10417	10422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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146	NC_022777	GTT	2	6	10720	10725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_022777	ATT	3	9	10940	10948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_022777	TAA	2	6	17924	17929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_022777	ATT	2	6	18024	18029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_022777	TAT	2	6	18043	18048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_022777	ATA	2	6	18056	18061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_022777	ATA	2	6	18074	18079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_022777	TAT	2	6	18130	18135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604025
263	NC_022777	TGC	2	6	18201	18206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557604025
264	NC_022777	ACC	2	6	18227	18232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557604025
265	NC_022777	GTA	2	6	18341	18346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604025
266	NC_022777	TCA	2	6	18374	18379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604025
267	NC_022777	TCT	2	6	18607	18612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604025
268	NC_022777	TTA	2	6	18638	18643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604025
269	NC_022777	AGC	2	6	18657	18662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557604025
270	NC_022777	GAA	2	6	18749	18754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604025
271	NC_022777	AGC	2	6	18900	18905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557604025
272	NC_022777	CAA	2	6	18917	18922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557604025
273	NC_022777	TTA	2	6	18998	19003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604025
274	NC_022777	ATT	2	6	19036	19041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604025
275	NC_022777	TAT	2	6	19074	19079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604025
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278	NC_022777	CTT	2	6	19437	19442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604025
279	NC_022777	TTC	3	9	19443	19451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604025
280	NC_022777	TTC	2	6	19548	19553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604025
281	NC_022777	AAT	2	6	19578	19583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604025
282	NC_022777	ACT	2	6	19605	19610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604025
283	NC_022777	ATT	2	6	19684	19689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604025
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285	NC_022777	ATA	2	6	19837	19842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604025
286	NC_022777	AAT	2	6	19932	19937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604026
287	NC_022777	TAT	2	6	20070	20075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604026
288	NC_022777	TAT	2	6	20118	20123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604026
289	NC_022777	ACA	2	6	20224	20229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557604027
290	NC_022777	CTT	2	6	20396	20401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604027
291	NC_022777	TTA	2	6	20420	20425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604027
292	NC_022777	TCT	2	6	20434	20439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604027
293	NC_022777	AAT	2	6	20444	20449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604027
294	NC_022777	CCT	2	6	20498	20503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_022777	TAT	2	6	20644	20649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_022777	CTT	2	6	20695	20700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604028
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311	NC_022777	TAT	2	6	21777	21782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_022777	TAG	2	6	21972	21977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604030
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330	NC_022777	TTA	2	6	22785	22790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_022777	TTC	2	6	22848	22853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604032
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367	NC_022777	TTA	2	6	24740	24745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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369	NC_022777	TCA	2	6	24807	24812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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371	NC_022777	AAT	2	6	25210	25215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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374	NC_022777	TAT	2	6	25301	25306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604034
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378	NC_022777	TGG	2	6	25553	25558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
379	NC_022777	AAT	2	6	25565	25570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_022777	ATT	2	6	25676	25681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_022777	AAT	2	6	25686	25691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_022777	TAA	2	6	25698	25703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
384	NC_022777	TTG	2	6	25713	25718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
385	NC_022777	TAT	2	6	25857	25862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604035
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