MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Campylobacter coli 15-537360

Total Repeats: 1052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022660	TGCAAA	2	12	1694	1705	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	556577983
2	NC_022660	TATAGA	2	12	2757	2768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	556577984
3	NC_022660	TGCTAG	2	12	3474	3485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556577984
4	NC_022660	AGTGAA	2	12	3820	3831	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	556577984
5	NC_022660	AATGAA	2	12	4489	4500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556577984
6	NC_022660	TTTAAA	2	12	7604	7615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022660	CTATAG	2	12	8066	8077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556577986
8	NC_022660	TGGATT	2	12	9128	9139	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	556577986
9	NC_022660	AGAAAT	2	12	10530	10541	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556577988
10	NC_022660	ATTTAA	2	12	13413	13424	50 %	50 %	0 %	0 %	556577989
11	NC_022660	TTTTCA	2	12	18271	18282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556577992
12	NC_022660	AATTTA	2	12	21644	21655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022660	AAGAAA	2	12	21824	21835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	556577995
14	NC_022660	AAGATA	2	12	22748	22759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556577996
15	NC_022660	AGCAAA	2	12	23522	23533	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	556577996
16	NC_022660	TTTTCT	2	12	24032	24043	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	556577997
17	NC_022660	TATTTT	2	12	25030	25041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022660	GCAAGG	2	12	25570	25581	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	556577999
19	NC_022660	CATTTT	2	12	26070	26081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022660	CGAGCT	2	12	27560	27571	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556578001
21	NC_022660	CGCCAC	2	12	33503	33514	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	556578004
22	NC_022660	TAAAAA	2	12	35087	35098	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578005
23	NC_022660	TCTTAT	2	12	42700	42711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022660	TATGTT	2	12	42865	42876	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022660	TTAAAT	2	12	45284	45295	50 %	50 %	0 %	0 %	556578009
26	NC_022660	TAAATT	2	12	49505	49516	50 %	50 %	0 %	0 %	556578010
27	NC_022660	GAAAAT	2	12	49938	49949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556578011
28	NC_022660	GAAAGA	2	12	51047	51058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556578011
29	NC_022660	TAAAAA	2	12	51077	51088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578011
30	NC_022660	TGTTAA	2	12	51647	51658	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	556578011
31	NC_022660	TGAAAA	2	12	54756	54767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556578014
32	NC_022660	TAAACT	2	12	55209	55220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556578014
33	NC_022660	TCTTCA	2	12	55879	55890	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	556578015
34	NC_022660	TTCTTT	2	12	56362	56373	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	556578016
35	NC_022660	CGCCTT	2	12	56767	56778	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	556578016
36	NC_022660	TTAATT	2	12	60339	60350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578018
37	NC_022660	CAAAAT	2	12	60467	60478	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578018
38	NC_022660	ACAAAT	2	12	60665	60676	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578019
39	NC_022660	TAATTT	2	12	63175	63186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578021
40	NC_022660	ATTTTA	2	12	63427	63438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578021
41	NC_022660	AAATAT	2	12	63784	63795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556578021
42	NC_022660	GTTGGA	2	12	64724	64735	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	556578021
43	NC_022660	ATTTTA	2	12	65279	65290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578022
44	NC_022660	GCTATT	2	12	66347	66358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	556578023
45	NC_022660	TTGCTT	2	12	67376	67387	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	556578023
46	NC_022660	ATTTAT	2	12	72933	72944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022660	ACGCAC	2	12	73182	73193	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	556578028
48	NC_022660	GCTTTA	2	12	73848	73859	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	556578029
49	NC_022660	AATATC	2	12	75256	75267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556578030
50	NC_022660	TCATTT	2	12	76204	76215	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578032
51	NC_022660	CATCTT	2	12	77919	77930	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	556578033
52	NC_022660	TTCTTT	2	12	78369	78380	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	556578034
53	NC_022660	ATTTTT	2	12	79208	79219	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022660	TTTAAA	2	12	80356	80367	50 %	50 %	0 %	0 %	556578036
55	NC_022660	GATGCT	2	12	82233	82244	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556578038
56	NC_022660	TTGGAT	2	12	83561	83572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	556578040
57	NC_022660	ATATAA	2	12	89066	89077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022660	TTTTTG	2	12	89439	89450	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	556578045
59	NC_022660	TGGTTA	2	12	90645	90656	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	556578046
60	NC_022660	CGAGTT	2	12	92068	92079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556578047
61	NC_022660	CAGGAA	2	12	96894	96905	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	556578053
62	NC_022660	ATTTTT	2	12	97964	97975	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022660	GATTAT	2	12	98645	98656	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	556578054
64	NC_022660	TTTTGA	2	12	98965	98976	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	556578054
65	NC_022660	TTTTTA	2	12	100003	100014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	556578056
66	NC_022660	AGCTTA	2	12	102272	102283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578059
67	NC_022660	AAAAAT	2	12	103841	103852	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578061
68	NC_022660	TATCAA	2	12	105487	105498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556578063
69	NC_022660	AAAAAC	2	12	109119	109130	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	556578067
70	NC_022660	TCCAAG	2	12	109233	109244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556578067
71	NC_022660	AGCCGC	2	12	110400	110411	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556578067
72	NC_022660	GCTTCT	2	12	110521	110532	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	556578067
73	NC_022660	CTTTAT	2	12	110702	110713	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578067
74	NC_022660	AAAAAT	2	12	111066	111077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022660	TCTAGC	2	12	111318	111329	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556578068
76	NC_022660	TAAAAA	2	12	112195	112206	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578069
77	NC_022660	TTTGCT	2	12	113428	113439	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	556578070
78	NC_022660	TAAAGA	2	12	114387	114398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556578072
79	NC_022660	ATAAAA	2	12	114581	114592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578072
80	NC_022660	CTATAG	2	12	115343	115354	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578073
81	NC_022660	GCGCAA	2	12	115577	115588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556578073
82	NC_022660	CTAAAA	2	12	116261	116272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578074
83	NC_022660	TTCAAA	2	12	116286	116297	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556578074
84	NC_022660	ATTTTC	2	12	116847	116858	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578075
85	NC_022660	CAAAAA	2	12	118102	118113	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	556578076
86	NC_022660	TAGCAA	2	12	118419	118430	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	556578077
87	NC_022660	AGCATT	2	12	118721	118732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578077
88	NC_022660	ATCTTT	2	12	120050	120061	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578079
89	NC_022660	AAATTT	2	12	121050	121061	50 %	50 %	0 %	0 %	556578079
90	NC_022660	TAAATT	2	12	122372	122383	50 %	50 %	0 %	0 %	556578080
91	NC_022660	TTTTGG	2	12	123040	123051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556578081
92	NC_022660	TATCTC	2	12	124445	124456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	556578083
93	NC_022660	AAAGAT	2	12	129647	129658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556578089
94	NC_022660	AGTAAA	2	12	132476	132487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022660	TAAAAA	2	12	134221	134232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022660	TTATAG	2	12	134244	134255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022660	ATATTA	2	12	135221	135232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022660	TGCTAA	2	12	135588	135599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022660	AATTTA	2	12	136207	136218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022660	TATCAA	2	12	136494	136505	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022660	AAATTT	2	12	136794	136805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022660	CAATAT	2	12	137004	137015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022660	CAAGTT	2	12	139345	139356	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578091
104	NC_022660	GCCATA	2	12	139646	139657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556578091
105	NC_022660	CTTTTG	2	12	140014	140025	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	556578092
106	NC_022660	GAAGAT	2	12	140214	140225	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	556578093
107	NC_022660	ATACAA	2	12	140521	140532	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578093
108	NC_022660	AATAAA	2	12	142099	142110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022660	TAATTT	2	12	142438	142449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578096
110	NC_022660	AAATTA	2	12	143032	143043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556578097
111	NC_022660	TACAAA	2	12	146313	146324	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578099
112	NC_022660	TAAAAA	2	12	146639	146650	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578100
113	NC_022660	TCTCAT	2	12	147524	147535	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	556578101
114	NC_022660	GTTTGT	2	12	148026	148037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556578102
115	NC_022660	ATAACT	2	12	148186	148197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556578102
116	NC_022660	AGCATT	2	12	156402	156413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578108
117	NC_022660	CAAAAT	2	12	158248	158259	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578110
118	NC_022660	TATAAT	2	12	158938	158949	50 %	50 %	0 %	0 %	556578111
119	NC_022660	ATAATT	2	12	160190	160201	50 %	50 %	0 %	0 %	556578111
120	NC_022660	TTATAT	2	12	161499	161510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578112
121	NC_022660	GAAAAT	2	12	161812	161823	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556578112
122	NC_022660	AGTTTT	2	12	165443	165454	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	556578117
123	NC_022660	TTTAAA	2	12	168694	168705	50 %	50 %	0 %	0 %	556578120
124	NC_022660	ATCTTT	2	12	170127	170138	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578122
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126	NC_022660	AAAATA	2	12	172287	172298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578125
127	NC_022660	CTAAAG	2	12	173047	173058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	556578126
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131	NC_022660	TAAAAA	2	12	175969	175980	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022660	ATTTTT	2	12	176044	176055	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022660	TACTTT	2	12	179312	179323	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578135
134	NC_022660	TCTTTT	2	12	182793	182804	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_022660	TGCATT	2	12	183044	183055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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141	NC_022660	GAAAAA	2	12	186983	186994	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	556578142
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153	NC_022660	ATTTTT	2	12	214566	214577	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	556578167
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233	NC_022660	TAAAAA	2	12	346561	346572	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578296
234	NC_022660	GTTTTA	2	12	353467	353478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	556578302
235	NC_022660	ACTGCT	2	12	355731	355742	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556578304
236	NC_022660	CCTTAT	2	12	355956	355967	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	556578304
237	NC_022660	ATCAGT	2	12	358337	358348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578308
238	NC_022660	TATAAA	2	12	358986	358997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556578309
239	NC_022660	ATCAGG	2	12	360408	360419	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	556578310
240	NC_022660	AAGTCT	2	12	361032	361043	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578311
241	NC_022660	AGTTTA	2	12	362520	362531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
242	NC_022660	TGGTAG	2	12	364420	364431	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	556578315
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284	NC_022660	TATGTT	2	12	435307	435318	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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