MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR15

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022607	TTCC	2	8	228	235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022607	TCAT	2	8	620	627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022607	GAAC	2	8	771	778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022607	GTAA	2	8	852	859	50 %	25 %	25 %	0 %	554650831
5	NC_022607	AGAA	2	8	913	920	75 %	0 %	25 %	0 %	554650831
6	NC_022607	GGAT	2	8	1625	1632	25 %	25 %	50 %	0 %	554650832
7	NC_022607	GATT	2	8	3897	3904	25 %	50 %	25 %	0 %	554650833
8	NC_022607	ATAA	2	8	4295	4302	75 %	25 %	0 %	0 %	554650833
9	NC_022607	TATT	2	8	4530	4537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022607	AATT	2	8	4918	4925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022607	TCCA	2	8	5681	5688	25 %	25 %	0 %	50 %	554650843
12	NC_022607	TCAA	2	8	5808	5815	50 %	25 %	0 %	25 %	554650843
13	NC_022607	TTAC	2	8	5894	5901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022607	TGAA	2	8	6474	6481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022607	AAAT	2	8	6536	6543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022607	AGAA	2	8	7026	7033	75 %	0 %	25 %	0 %	554650834
17	NC_022607	AAAT	2	8	7051	7058	75 %	25 %	0 %	0 %	554650834
18	NC_022607	GAAA	2	8	7111	7118	75 %	0 %	25 %	0 %	554650835
19	NC_022607	AGCT	2	8	7123	7130	25 %	25 %	25 %	25 %	554650835
20	NC_022607	TCAT	2	8	7513	7520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022607	AAAG	2	8	7682	7689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022607	GGTT	2	8	7723	7730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022607	ACAG	2	8	7868	7875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022607	AACC	2	8	8487	8494	50 %	0 %	0 %	50 %	554650836
25	NC_022607	AGGA	2	8	8532	8539	50 %	0 %	50 %	0 %	554650836
26	NC_022607	ACAA	2	8	9338	9345	75 %	0 %	0 %	25 %	554650844
27	NC_022607	CGAA	2	8	9766	9773	50 %	0 %	25 %	25 %	554650845
28	NC_022607	TGAT	2	8	10290	10297	25 %	50 %	25 %	0 %	554650846
29	NC_022607	ACAG	2	8	10313	10320	50 %	0 %	25 %	25 %	554650846
30	NC_022607	TATT	2	8	10537	10544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022607	GATA	2	8	10681	10688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022607	TAAA	2	8	10711	10718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022607	AGAA	2	8	10923	10930	75 %	0 %	25 %	0 %	554650837
34	NC_022607	AATT	2	8	10935	10942	50 %	50 %	0 %	0 %	554650837
35	NC_022607	AAAT	2	8	11010	11017	75 %	25 %	0 %	0 %	554650837
36	NC_022607	AAAC	2	8	11054	11061	75 %	0 %	0 %	25 %	554650837
37	NC_022607	CATT	2	8	11985	11992	25 %	50 %	0 %	25 %	554650847
38	NC_022607	ATCA	2	8	12025	12032	50 %	25 %	0 %	25 %	554650847
39	NC_022607	ATTT	2	8	12238	12245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022607	TTGA	2	8	12502	12509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022607	TAAA	2	8	12992	12999	75 %	25 %	0 %	0 %	554650838
42	NC_022607	AATA	2	8	13371	13378	75 %	25 %	0 %	0 %	554650838
43	NC_022607	GTGC	2	8	13582	13589	0 %	25 %	50 %	25 %	554650839
44	NC_022607	TCAT	2	8	14007	14014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022607	TATT	2	8	14105	14112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022607	CTTC	2	8	14157	14164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022607	TCTT	2	8	14450	14457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022607	TTTG	2	8	15285	15292	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.