MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR64

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022603	TA	3	6	873	878	50 %	50 %	0 %	0 %	554640012
2	NC_022603	TA	3	6	903	908	50 %	50 %	0 %	0 %	554640012
3	NC_022603	GT	3	6	2972	2977	0 %	50 %	50 %	0 %	554639963
4	NC_022603	AT	3	6	3426	3431	50 %	50 %	0 %	0 %	554639963
5	NC_022603	AG	3	6	5081	5086	50 %	0 %	50 %	0 %	554640013
6	NC_022603	TC	3	6	5187	5192	0 %	50 %	0 %	50 %	554640013
7	NC_022603	AG	3	6	5250	5255	50 %	0 %	50 %	0 %	554640013
8	NC_022603	AT	3	6	5257	5262	50 %	50 %	0 %	0 %	554640013
9	NC_022603	TA	3	6	6561	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	554639964
10	NC_022603	AT	3	6	6791	6796	50 %	50 %	0 %	0 %	554639964
11	NC_022603	GT	3	6	8066	8071	0 %	50 %	50 %	0 %	554640016
12	NC_022603	CA	3	6	9570	9575	50 %	0 %	0 %	50 %	554639965
13	NC_022603	TA	3	6	13385	13390	50 %	50 %	0 %	0 %	554639968
14	NC_022603	AT	3	6	15164	15169	50 %	50 %	0 %	0 %	554639968
15	NC_022603	TA	3	6	15672	15677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022603	TA	3	6	16972	16977	50 %	50 %	0 %	0 %	554639971
17	NC_022603	TG	3	6	20031	20036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022603	CA	3	6	20079	20084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022603	GT	3	6	20517	20522	0 %	50 %	50 %	0 %	554639975
20	NC_022603	GA	3	6	21263	21268	50 %	0 %	50 %	0 %	554639975
21	NC_022603	GA	3	6	23949	23954	50 %	0 %	50 %	0 %	554639978
22	NC_022603	TA	3	6	24839	24844	50 %	50 %	0 %	0 %	554639979
23	NC_022603	GT	4	8	25406	25413	0 %	50 %	50 %	0 %	554639980
24	NC_022603	TC	3	6	28403	28408	0 %	50 %	0 %	50 %	554639981
25	NC_022603	TC	3	6	28445	28450	0 %	50 %	0 %	50 %	554639981
26	NC_022603	TA	3	6	28965	28970	50 %	50 %	0 %	0 %	554639982
27	NC_022603	AT	3	6	29087	29092	50 %	50 %	0 %	0 %	554639982
28	NC_022603	TA	3	6	30015	30020	50 %	50 %	0 %	0 %	554639983
29	NC_022603	AT	3	6	31347	31352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022603	TA	3	6	31355	31360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022603	AT	3	6	31467	31472	50 %	50 %	0 %	0 %	554639984
32	NC_022603	TA	3	6	32006	32011	50 %	50 %	0 %	0 %	554639984
33	NC_022603	AT	3	6	32195	32200	50 %	50 %	0 %	0 %	554639984
34	NC_022603	AT	3	6	32396	32401	50 %	50 %	0 %	0 %	554639984
35	NC_022603	AT	3	6	32429	32434	50 %	50 %	0 %	0 %	554639984
36	NC_022603	AT	4	8	32557	32564	50 %	50 %	0 %	0 %	554639984
37	NC_022603	TA	3	6	32619	32624	50 %	50 %	0 %	0 %	554639984
38	NC_022603	CT	3	6	33069	33074	0 %	50 %	0 %	50 %	554639985
39	NC_022603	TA	3	6	33089	33094	50 %	50 %	0 %	0 %	554639985
40	NC_022603	GA	3	6	33104	33109	50 %	0 %	50 %	0 %	554639985
41	NC_022603	TA	3	6	33648	33653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022603	AT	3	6	33659	33664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022603	GT	3	6	33895	33900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022603	TA	3	6	34349	34354	50 %	50 %	0 %	0 %	554639986
45	NC_022603	CA	3	6	34373	34378	50 %	0 %	0 %	50 %	554639986
46	NC_022603	TA	3	6	34676	34681	50 %	50 %	0 %	0 %	554639986
47	NC_022603	TA	3	6	34968	34973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022603	AT	4	8	35073	35080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022603	TA	3	6	35552	35557	50 %	50 %	0 %	0 %	554639987
50	NC_022603	TA	3	6	37549	37554	50 %	50 %	0 %	0 %	554639988
51	NC_022603	AC	3	6	39371	39376	50 %	0 %	0 %	50 %	554639989
52	NC_022603	TA	3	6	39460	39465	50 %	50 %	0 %	0 %	554639989
53	NC_022603	AG	3	6	39571	39576	50 %	0 %	50 %	0 %	554639989
54	NC_022603	AT	3	6	39758	39763	50 %	50 %	0 %	0 %	554639990
55	NC_022603	TA	3	6	39830	39835	50 %	50 %	0 %	0 %	554639990
56	NC_022603	AG	3	6	40238	40243	50 %	0 %	50 %	0 %	554639990
57	NC_022603	TA	3	6	40359	40364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022603	TA	3	6	41836	41841	50 %	50 %	0 %	0 %	554639991
59	NC_022603	AT	3	6	42130	42135	50 %	50 %	0 %	0 %	554639992
60	NC_022603	AC	3	6	42735	42740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022603	TA	3	6	43313	43318	50 %	50 %	0 %	0 %	554639993
62	NC_022603	TG	3	6	43585	43590	0 %	50 %	50 %	0 %	554639993
63	NC_022603	TC	4	8	44203	44210	0 %	50 %	0 %	50 %	554639993
64	NC_022603	CA	3	6	44689	44694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022603	TA	3	6	44839	44844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022603	GA	3	6	44891	44896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022603	TA	3	6	47078	47083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022603	AT	3	6	47088	47093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022603	TA	3	6	47101	47106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022603	TG	3	6	47564	47569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022603	GT	3	6	47772	47777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022603	TC	3	6	47927	47932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022603	TA	3	6	47980	47985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022603	GA	3	6	49056	49061	50 %	0 %	50 %	0 %	554640020
75	NC_022603	GA	3	6	52377	52382	50 %	0 %	50 %	0 %	554640001
76	NC_022603	AC	3	6	52677	52682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022603	TA	3	6	54787	54792	50 %	50 %	0 %	0 %	554640005
78	NC_022603	AC	3	6	55490	55495	50 %	0 %	0 %	50 %	554640005
79	NC_022603	CT	3	6	56031	56036	0 %	50 %	0 %	50 %	554640005
80	NC_022603	GA	3	6	57390	57395	50 %	0 %	50 %	0 %	554640006
81	NC_022603	CT	3	6	57707	57712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022603	AT	3	6	60972	60977	50 %	50 %	0 %	0 %	554640008
83	NC_022603	AT	3	6	61106	61111	50 %	50 %	0 %	0 %	554640008
84	NC_022603	GA	3	6	63086	63091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022603	GA	4	8	63215	63222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022603	AG	3	6	64250	64255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.