MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR64

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022603	AAATAT	2	12	4308	4319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639963
2	NC_022603	TTAAAC	2	12	6173	6184	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554640014
3	NC_022603	AATGGA	2	12	7215	7226	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554639964
4	NC_022603	TTGATT	2	12	7475	7486	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554640015
5	NC_022603	ACGATA	2	12	7665	7676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554640015
6	NC_022603	TAATGG	2	12	8534	8545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639965
7	NC_022603	TTAATT	2	12	10780	10791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554640018
8	NC_022603	CCGGAG	2	12	18310	18321	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022603	ATCATT	2	12	22534	22545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554639976
10	NC_022603	TTAGTA	2	12	34057	34068	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554639986
11	NC_022603	TTTTAA	2	12	35706	35717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639987
12	NC_022603	TAGAAG	2	12	42228	42239	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554639992
13	NC_022603	AATTAA	2	12	42657	42668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639992
14	NC_022603	TAAAAA	2	12	45684	45695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022603	TTATTT	2	12	46112	46123	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	554639995
16	NC_022603	AAGAGG	2	12	49007	49018	50 %	0 %	50 %	0 %	554640020
17	NC_022603	AAATAC	2	12	49668	49679	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	554640020
18	NC_022603	ATAAAA	2	12	50678	50689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022603	AAAGTC	2	12	54955	54966	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554640005
20	NC_022603	TTCTTA	2	12	55048	55059	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	554640005
21	NC_022603	ACCTTT	2	12	58591	58602	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	554640007
22	NC_022603	ATCTAC	2	12	60630	60641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554640021
23	NC_022603	TCGCTC	2	12	62466	62477	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022603	AAGAAA	2	12	64477	64488	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.