MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR64

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022603	AATTT	2	10	95	104	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022603	TACTG	2	10	296	305	20 %	40 %	20 %	20 %	554640011
3	NC_022603	AAGAA	2	10	1587	1596	80 %	0 %	20 %	0 %	554639960
4	NC_022603	AACGA	2	10	3280	3289	60 %	0 %	20 %	20 %	554639963
5	NC_022603	TGACT	2	10	3465	3474	20 %	40 %	20 %	20 %	554639963
6	NC_022603	AAGAT	2	10	4013	4022	60 %	20 %	20 %	0 %	554639963
7	NC_022603	AAATC	2	10	4151	4160	60 %	20 %	0 %	20 %	554639963
8	NC_022603	AAAAC	2	10	4209	4218	80 %	0 %	0 %	20 %	554639963
9	NC_022603	TTTGA	2	10	4339	4348	20 %	60 %	20 %	0 %	554639963
10	NC_022603	TCTTT	2	10	5641	5650	0 %	80 %	0 %	20 %	554640013
11	NC_022603	GTTTA	2	10	7495	7504	20 %	60 %	20 %	0 %	554640015
12	NC_022603	TCAAA	2	10	8263	8272	60 %	20 %	0 %	20 %	554640016
13	NC_022603	AAAGA	2	10	8282	8291	80 %	0 %	20 %	0 %	554640016
14	NC_022603	CGCTT	2	10	8419	8428	0 %	40 %	20 %	40 %	554640016
15	NC_022603	TTGAT	2	10	10799	10808	20 %	60 %	20 %	0 %	554640018
16	NC_022603	TCTTG	2	10	10998	11007	0 %	60 %	20 %	20 %	554640018
17	NC_022603	AATAA	2	10	11343	11352	80 %	20 %	0 %	0 %	554640018
18	NC_022603	ATAAA	2	10	12224	12233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022603	AAAAG	2	10	15705	15714	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022603	TGAAA	2	10	16679	16688	60 %	20 %	20 %	0 %	554639971
21	NC_022603	TGAAA	2	10	19098	19107	60 %	20 %	20 %	0 %	554639973
22	NC_022603	ATCGG	2	10	19192	19201	20 %	20 %	40 %	20 %	554639973
23	NC_022603	TATGA	2	10	21164	21173	40 %	40 %	20 %	0 %	554639975
24	NC_022603	TGGTA	2	10	22021	22030	20 %	40 %	40 %	0 %	554639976
25	NC_022603	TTTCT	2	10	25190	25199	0 %	80 %	0 %	20 %	554639979
26	NC_022603	CAACT	2	10	25287	25296	40 %	20 %	0 %	40 %	554639979
27	NC_022603	ACGCC	2	10	25438	25447	20 %	0 %	20 %	60 %	554639980
28	NC_022603	TAAAT	2	10	27098	27107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022603	TGACT	2	10	27493	27502	20 %	40 %	20 %	20 %	554639981
30	NC_022603	TGTTT	2	10	27629	27638	0 %	80 %	20 %	0 %	554639981
31	NC_022603	TTCCG	2	10	29154	29163	0 %	40 %	20 %	40 %	554639982
32	NC_022603	TGAAC	2	10	29492	29501	40 %	20 %	20 %	20 %	554639983
33	NC_022603	TTTGT	2	10	30730	30739	0 %	80 %	20 %	0 %	554639983
34	NC_022603	TTATT	2	10	31502	31511	20 %	80 %	0 %	0 %	554639984
35	NC_022603	TTGAT	2	10	31722	31731	20 %	60 %	20 %	0 %	554639984
36	NC_022603	TAATT	2	10	32530	32539	40 %	60 %	0 %	0 %	554639984
37	NC_022603	TAAGT	2	10	33887	33896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022603	AAAAT	2	10	34310	34319	80 %	20 %	0 %	0 %	554639986
39	NC_022603	CTTTA	2	10	34581	34590	20 %	60 %	0 %	20 %	554639986
40	NC_022603	AACAG	2	10	37791	37800	60 %	0 %	20 %	20 %	554639988
41	NC_022603	AAAAG	2	10	37831	37840	80 %	0 %	20 %	0 %	554639988
42	NC_022603	AAATT	2	10	37921	37930	60 %	40 %	0 %	0 %	554639989
43	NC_022603	AGAAA	2	10	39811	39820	80 %	0 %	20 %	0 %	554639990
44	NC_022603	AAATT	2	10	40289	40298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022603	TAATA	2	10	42813	42822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022603	TTCTG	2	10	44457	44466	0 %	60 %	20 %	20 %	554639993
47	NC_022603	TTAAA	2	10	44569	44578	60 %	40 %	0 %	0 %	554639993
48	NC_022603	AAAAT	2	10	46636	46645	80 %	20 %	0 %	0 %	554639996
49	NC_022603	TTTCT	2	10	46716	46725	0 %	80 %	0 %	20 %	554639996
50	NC_022603	GTGAA	2	10	48846	48855	40 %	20 %	40 %	0 %	554639997
51	NC_022603	CAAGA	2	10	50899	50908	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022603	ATCGC	2	10	52059	52068	20 %	20 %	20 %	40 %	554640001
53	NC_022603	GTTTT	2	10	52454	52463	0 %	80 %	20 %	0 %	554640001
54	NC_022603	ATAAA	2	10	54192	54201	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022603	TTGTC	2	10	54255	54264	0 %	60 %	20 %	20 %	554640004
56	NC_022603	AAATT	2	10	54754	54763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022603	AAAAG	2	10	55965	55974	80 %	0 %	20 %	0 %	554640005
58	NC_022603	GAGAG	2	10	57006	57015	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022603	GAAAA	2	10	57217	57226	80 %	0 %	20 %	0 %	554640006
60	NC_022603	ACCCA	2	10	59901	59910	40 %	0 %	0 %	60 %	554640007
61	NC_022603	ATTCA	2	10	60103	60112	40 %	40 %	0 %	20 %	554640007
62	NC_022603	TTCCA	2	10	60378	60387	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_022603	AATTA	2	10	61726	61735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022603	AAAAT	2	10	62486	62495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022603	GAGAT	2	10	62503	62512	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022603	ATGAA	2	10	62893	62902	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.