MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium autoethanogenum DSM 10061

Total Repeats: 4338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022592	AAAAT	2	10	1281	1290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022592	GTATA	2	10	5137	5146	40 %	40 %	20 %	0 %	554377801
3	NC_022592	TTATA	2	10	5405	5414	40 %	60 %	0 %	0 %	554377801
4	NC_022592	GAAAA	2	10	9228	9237	80 %	0 %	20 %	0 %	554377803
5	NC_022592	CAATT	2	10	9382	9391	40 %	40 %	0 %	20 %	554377804
6	NC_022592	TAATA	2	10	11369	11378	60 %	40 %	0 %	0 %	554377805
7	NC_022592	TAATC	2	10	13988	13997	40 %	40 %	0 %	20 %	554377809
8	NC_022592	GTTTA	2	10	16344	16353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022592	TAATA	2	10	16373	16382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022592	ATGAA	2	10	16739	16748	60 %	20 %	20 %	0 %	554377813
11	NC_022592	TAATT	2	10	17393	17402	40 %	60 %	0 %	0 %	554377814
12	NC_022592	TGCTA	2	10	18891	18900	20 %	40 %	20 %	20 %	554377815
13	NC_022592	TTAAT	2	10	19129	19138	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022592	TATTT	2	10	20146	20155	20 %	80 %	0 %	0 %	554377817
15	NC_022592	AAAGA	2	10	22777	22786	80 %	0 %	20 %	0 %	554377818
16	NC_022592	ATTCA	2	10	25811	25820	40 %	40 %	0 %	20 %	554377822
17	NC_022592	ATGAT	2	10	27007	27016	40 %	40 %	20 %	0 %	554377825
18	NC_022592	CAAAG	2	10	28026	28035	60 %	0 %	20 %	20 %	554377826
19	NC_022592	ATGTA	2	10	28219	28228	40 %	40 %	20 %	0 %	554377826
20	NC_022592	CCAAT	2	10	32559	32568	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_022592	AAAAG	2	10	33300	33309	80 %	0 %	20 %	0 %	554377832
22	NC_022592	TAGAA	2	10	33600	33609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022592	TTAAA	2	10	34004	34013	60 %	40 %	0 %	0 %	554377833
24	NC_022592	CATTT	2	10	34904	34913	20 %	60 %	0 %	20 %	554377834
25	NC_022592	ATTTT	2	10	35202	35211	20 %	80 %	0 %	0 %	554377834
26	NC_022592	CTGTC	2	10	35594	35603	0 %	40 %	20 %	40 %	554377835
27	NC_022592	ATCTT	2	10	35840	35849	20 %	60 %	0 %	20 %	554377835
28	NC_022592	AGAAA	2	10	36895	36904	80 %	0 %	20 %	0 %	554377836
29	NC_022592	TACCA	2	10	38534	38543	40 %	20 %	0 %	40 %	554377838
30	NC_022592	TTATA	2	10	38650	38659	40 %	60 %	0 %	0 %	554377838
31	NC_022592	CAGAA	2	10	38903	38912	60 %	0 %	20 %	20 %	554377838
32	NC_022592	AAAAT	2	10	39439	39448	80 %	20 %	0 %	0 %	554377838
33	NC_022592	TTATT	2	10	39583	39592	20 %	80 %	0 %	0 %	554377839
34	NC_022592	TTTTA	2	10	40158	40167	20 %	80 %	0 %	0 %	554377839
35	NC_022592	CTAAT	2	10	41633	41642	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022592	TGAAA	2	10	41980	41989	60 %	20 %	20 %	0 %	554377841
37	NC_022592	CTTAG	2	10	43147	43156	20 %	40 %	20 %	20 %	554377843
38	NC_022592	TTTTC	2	10	43266	43275	0 %	80 %	0 %	20 %	554377843
39	NC_022592	TTATT	2	10	46267	46276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022592	GGTAT	2	10	46479	46488	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022592	GTATT	2	10	46543	46552	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022592	GTGGA	2	10	46564	46573	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022592	TAAGT	2	10	47268	47277	40 %	40 %	20 %	0 %	554377845
44	NC_022592	TTACA	2	10	48896	48905	40 %	40 %	0 %	20 %	554377848
45	NC_022592	TAAAA	2	10	50061	50070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022592	TTAAT	2	10	50454	50463	40 %	60 %	0 %	0 %	554377849
47	NC_022592	AAAAC	2	10	50619	50628	80 %	0 %	0 %	20 %	554377849
48	NC_022592	GCTTT	2	10	52734	52743	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022592	ATAAG	2	10	53217	53226	60 %	20 %	20 %	0 %	554377850
50	NC_022592	TTCCA	2	10	53660	53669	20 %	40 %	0 %	40 %	554377850
51	NC_022592	CAGTT	2	10	54225	54234	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022592	TAATA	2	10	58180	58189	60 %	40 %	0 %	0 %	554377854
53	NC_022592	ACTAT	2	10	59136	59145	40 %	40 %	0 %	20 %	554377856
54	NC_022592	GAAAT	2	10	59930	59939	60 %	20 %	20 %	0 %	554377857
55	NC_022592	TAATT	2	10	60398	60407	40 %	60 %	0 %	0 %	554377857
56	NC_022592	GCTCC	2	10	61222	61231	0 %	20 %	20 %	60 %	554377858
57	NC_022592	CTTCA	2	10	63438	63447	20 %	40 %	0 %	40 %	554377859
58	NC_022592	CAAGA	2	10	65364	65373	60 %	0 %	20 %	20 %	554377861
59	NC_022592	TATTT	2	10	66270	66279	20 %	80 %	0 %	0 %	554377862
60	NC_022592	ATAAA	2	10	67274	67283	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022592	TACTT	2	10	67657	67666	20 %	60 %	0 %	20 %	554377864
62	NC_022592	TGGGA	2	10	70227	70236	20 %	20 %	60 %	0 %	554377866
63	NC_022592	TAATT	3	15	70509	70523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022592	TGAAT	2	10	71237	71246	40 %	40 %	20 %	0 %	554377867
65	NC_022592	TAAAG	2	10	71968	71977	60 %	20 %	20 %	0 %	554377868
66	NC_022592	ATTAT	2	10	72352	72361	40 %	60 %	0 %	0 %	554377868
67	NC_022592	TTACT	2	10	72678	72687	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022592	ATGAA	2	10	75925	75934	60 %	20 %	20 %	0 %	554377871
69	NC_022592	GTATA	2	10	78441	78450	40 %	40 %	20 %	0 %	554377873
70	NC_022592	GATTT	2	10	78839	78848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022592	AATTA	2	10	81680	81689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022592	CTTTA	2	10	82097	82106	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022592	ATAGG	2	10	84227	84236	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022592	AATAT	2	10	84289	84298	60 %	40 %	0 %	0 %	554377881
75	NC_022592	TATTT	2	10	85263	85272	20 %	80 %	0 %	0 %	554377881
76	NC_022592	TGCAT	2	10	87063	87072	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022592	TAATA	2	10	87911	87920	60 %	40 %	0 %	0 %	554377884
78	NC_022592	AAATT	2	10	89268	89277	60 %	40 %	0 %	0 %	554377885
79	NC_022592	TTAAA	2	10	89442	89451	60 %	40 %	0 %	0 %	554377885
80	NC_022592	GAAAA	2	10	89527	89536	80 %	0 %	20 %	0 %	554377885
81	NC_022592	AGGAA	2	10	89683	89692	60 %	0 %	40 %	0 %	554377885
82	NC_022592	AGAAA	2	10	89726	89735	80 %	0 %	20 %	0 %	554377885
83	NC_022592	GAATA	2	10	90148	90157	60 %	20 %	20 %	0 %	554377885
84	NC_022592	ATGAA	2	10	93660	93669	60 %	20 %	20 %	0 %	554377887
85	NC_022592	AATTT	2	10	94669	94678	40 %	60 %	0 %	0 %	554377889
86	NC_022592	GGAAG	2	10	96410	96419	40 %	0 %	60 %	0 %	554377890
87	NC_022592	AAAAT	2	10	96943	96952	80 %	20 %	0 %	0 %	554377891
88	NC_022592	GAAGA	2	10	97348	97357	60 %	0 %	40 %	0 %	554377891
89	NC_022592	TCATA	2	10	97493	97502	40 %	40 %	0 %	20 %	554377891
90	NC_022592	AATAT	2	10	97990	97999	60 %	40 %	0 %	0 %	554377891
91	NC_022592	TAATA	2	10	98489	98498	60 %	40 %	0 %	0 %	554377891
92	NC_022592	GATAA	2	10	98789	98798	60 %	20 %	20 %	0 %	554377892
93	NC_022592	GATAA	2	10	99136	99145	60 %	20 %	20 %	0 %	554377893
94	NC_022592	AAAGA	2	10	104213	104222	80 %	0 %	20 %	0 %	554377897
95	NC_022592	TATAA	2	10	105153	105162	60 %	40 %	0 %	0 %	554377897
96	NC_022592	CTATA	2	10	105489	105498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022592	TAAAA	2	10	105824	105833	80 %	20 %	0 %	0 %	554377898
98	NC_022592	ATTTT	2	10	106835	106844	20 %	80 %	0 %	0 %	554377899
99	NC_022592	AAAGA	2	10	108115	108124	80 %	0 %	20 %	0 %	554377901
100	NC_022592	AGTTC	2	10	111357	111366	20 %	40 %	20 %	20 %	554377902
101	NC_022592	TTATT	2	10	112524	112533	20 %	80 %	0 %	0 %	554377903
102	NC_022592	TGTTT	2	10	113286	113295	0 %	80 %	20 %	0 %	554377903
103	NC_022592	TAATA	2	10	113662	113671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022592	TAAAA	2	10	115174	115183	80 %	20 %	0 %	0 %	554377905
105	NC_022592	GAAGA	2	10	115799	115808	60 %	0 %	40 %	0 %	554377905
106	NC_022592	AAAAT	2	10	116376	116385	80 %	20 %	0 %	0 %	554377905
107	NC_022592	CAAGA	2	10	116759	116768	60 %	0 %	20 %	20 %	554377905
108	NC_022592	AAAGA	2	10	117380	117389	80 %	0 %	20 %	0 %	554377905
109	NC_022592	CAGGT	2	10	119455	119464	20 %	20 %	40 %	20 %	554377907
110	NC_022592	AAAAT	2	10	119653	119662	80 %	20 %	0 %	0 %	554377907
111	NC_022592	CAGAA	2	10	119924	119933	60 %	0 %	20 %	20 %	554377908
112	NC_022592	TAAAA	2	10	120886	120895	80 %	20 %	0 %	0 %	554377908
113	NC_022592	ATGGA	2	10	122783	122792	40 %	20 %	40 %	0 %	554377910
114	NC_022592	AATGA	2	10	125255	125264	60 %	20 %	20 %	0 %	554377912
115	NC_022592	TTAAT	2	10	125428	125437	40 %	60 %	0 %	0 %	554377912
116	NC_022592	ATAAA	2	10	126863	126872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022592	GAAAG	2	10	128119	128128	60 %	0 %	40 %	0 %	554377914
118	NC_022592	TGTAA	2	10	129261	129270	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022592	TAATT	2	10	131760	131769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022592	CTAAT	2	10	132306	132315	40 %	40 %	0 %	20 %	554377916
121	NC_022592	ATTCC	2	10	132342	132351	20 %	40 %	0 %	40 %	554377916
122	NC_022592	AAGTA	2	10	133756	133765	60 %	20 %	20 %	0 %	554377917
123	NC_022592	ACAAT	2	10	134451	134460	60 %	20 %	0 %	20 %	554377918
124	NC_022592	ACAAA	2	10	136961	136970	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022592	TATAA	2	10	137461	137470	60 %	40 %	0 %	0 %	554377920
126	NC_022592	CTACT	2	10	137805	137814	20 %	40 %	0 %	40 %	554377920
127	NC_022592	ATTTA	2	10	138135	138144	40 %	60 %	0 %	0 %	554377920
128	NC_022592	GACTG	2	10	139128	139137	20 %	20 %	40 %	20 %	554377921
129	NC_022592	ATGGA	2	10	140031	140040	40 %	20 %	40 %	0 %	554377921
130	NC_022592	AAAGA	2	10	140112	140121	80 %	0 %	20 %	0 %	554377921
131	NC_022592	TACTT	2	10	143533	143542	20 %	60 %	0 %	20 %	554377926
132	NC_022592	CTGCT	2	10	143813	143822	0 %	40 %	20 %	40 %	554377926
133	NC_022592	TTAAA	2	10	143916	143925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022592	TACTT	2	10	144786	144795	20 %	60 %	0 %	20 %	554377927
135	NC_022592	TGACA	2	10	145772	145781	40 %	20 %	20 %	20 %	554377928
136	NC_022592	AAGTA	2	10	146719	146728	60 %	20 %	20 %	0 %	554377929
137	NC_022592	GAATG	2	10	148018	148027	40 %	20 %	40 %	0 %	554377930
138	NC_022592	AAAGG	2	10	149442	149451	60 %	0 %	40 %	0 %	554377932
139	NC_022592	TAAAT	2	10	150295	150304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_022592	TTAAT	2	10	437468	437477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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