MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium saccharobutylicum DSM 13864

Total Repeats: 142088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_022571	GTTAT	2	10	224506	224515	20 %	60 %	20 %	0 %	550916710
6003	NC_022571	CAA	2	6	224520	224525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550916710
6004	NC_022571	GAT	2	6	224563	224568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916710
6005	NC_022571	A	6	6	224590	224595	100 %	0 %	0 %	0 %	550916710
6006	NC_022571	AGG	2	6	224622	224627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_022571	AAG	2	6	224664	224669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916711
6008	NC_022571	TGACT	2	10	224800	224809	20 %	40 %	20 %	20 %	550916711
6009	NC_022571	ACT	2	6	225015	225020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550916711
6010	NC_022571	TGA	2	6	225121	225126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916711
6011	NC_022571	ATT	2	6	225139	225144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916711
6012	NC_022571	AAT	2	6	225171	225176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916711
6013	NC_022571	AGG	2	6	225178	225183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_022571	TAT	2	6	225205	225210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916712
6015	NC_022571	A	7	7	225292	225298	100 %	0 %	0 %	0 %	550916712
6016	NC_022571	AGG	2	6	225394	225399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_022571	TTA	2	6	225435	225440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916713
6018	NC_022571	AATGCT	2	12	225453	225464	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550916713
6019	NC_022571	CTT	2	6	225490	225495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550916713
6020	NC_022571	AAG	2	6	225504	225509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916713
6021	NC_022571	AT	3	6	225520	225525	50 %	50 %	0 %	0 %	550916713
6022	NC_022571	TA	3	6	225540	225545	50 %	50 %	0 %	0 %	550916713
6023	NC_022571	GTT	2	6	225573	225578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916713
6024	NC_022571	AAAG	2	8	225615	225622	75 %	0 %	25 %	0 %	550916713
6025	NC_022571	AAGA	2	8	225675	225682	75 %	0 %	25 %	0 %	550916713
6026	NC_022571	TGT	2	6	225719	225724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916713
6027	NC_022571	TAGA	2	8	225748	225755	50 %	25 %	25 %	0 %	550916713
6028	NC_022571	AGAA	2	8	225762	225769	75 %	0 %	25 %	0 %	550916713
6029	NC_022571	AT	3	6	225806	225811	50 %	50 %	0 %	0 %	550916713
6030	NC_022571	AAG	2	6	225823	225828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_022571	A	6	6	225829	225834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_022571	ATA	2	6	225858	225863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_022571	AGG	2	6	225865	225870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_022571	GTAG	2	8	225887	225894	25 %	25 %	50 %	0 %	550916714
6035	NC_022571	CTG	2	6	225912	225917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550916714
6036	NC_022571	TGTAAC	3	18	225919	225936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550916714
6037	NC_022571	GTT	2	6	225947	225952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916714
6038	NC_022571	AAC	2	6	226019	226024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550916714
6039	NC_022571	ATTA	2	8	226090	226097	50 %	50 %	0 %	0 %	550916714
6040	NC_022571	ATA	2	6	226098	226103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916714
6041	NC_022571	AAG	2	6	226119	226124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916714
6042	NC_022571	GTTGGT	2	12	226148	226159	0 %	50 %	50 %	0 %	550916714
6043	NC_022571	A	7	7	226180	226186	100 %	0 %	0 %	0 %	550916714
6044	NC_022571	TGA	2	6	226191	226196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916714
6045	NC_022571	CTA	2	6	226263	226268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550916714
6046	NC_022571	AGT	3	9	226270	226278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916714
6047	NC_022571	AAG	2	6	226395	226400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916714
6048	NC_022571	ATA	2	6	226417	226422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916714
6049	NC_022571	A	6	6	226458	226463	100 %	0 %	0 %	0 %	550916715
6050	NC_022571	AT	4	8	226555	226562	50 %	50 %	0 %	0 %	550916715
6051	NC_022571	TGA	2	6	226574	226579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916715
6052	NC_022571	TAG	2	6	226597	226602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916715
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6054	NC_022571	AAG	2	6	226648	226653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916715
6055	NC_022571	TTG	2	6	226663	226668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916715
6056	NC_022571	AAG	2	6	226708	226713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916715
6057	NC_022571	AGC	2	6	226769	226774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916715
6058	NC_022571	GAG	2	6	226805	226810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_022571	AAAT	2	8	226813	226820	75 %	25 %	0 %	0 %	550916716
6060	NC_022571	GTT	2	6	226858	226863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916716
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6062	NC_022571	GGT	2	6	226894	226899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550916716
6063	NC_022571	GTT	2	6	226924	226929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916716
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6071	NC_022571	A	7	7	227372	227378	100 %	0 %	0 %	0 %	550916717
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6074	NC_022571	TAA	2	6	227505	227510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916717
6075	NC_022571	AGG	2	6	227514	227519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_022571	CAG	3	9	227552	227560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916718
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6081	NC_022571	AG	3	6	227717	227722	50 %	0 %	50 %	0 %	550916718
6082	NC_022571	AAG	2	6	227743	227748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916718
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6086	NC_022571	A	6	6	227930	227935	100 %	0 %	0 %	0 %	550916718
6087	NC_022571	AGC	2	6	227940	227945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916718
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6101	NC_022571	GTA	2	6	228416	228421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916719
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6107	NC_022571	TGT	2	6	228616	228621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916719
6108	NC_022571	TTGC	2	8	228626	228633	0 %	50 %	25 %	25 %	550916719
6109	NC_022571	AAT	2	6	228634	228639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916719
6110	NC_022571	AG	3	6	228658	228663	50 %	0 %	50 %	0 %	550916719
6111	NC_022571	GTAATA	2	12	228702	228713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916719
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6115	NC_022571	A	7	7	228884	228890	100 %	0 %	0 %	0 %	550916719
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6118	NC_022571	T	6	6	229043	229048	0 %	100 %	0 %	0 %	550916719
6119	NC_022571	GGA	2	6	229079	229084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550916719
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6121	NC_022571	TTG	2	6	229119	229124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916719
6122	NC_022571	ACAGGA	2	12	229157	229168	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	550916719
6123	NC_022571	ATTA	2	8	229171	229178	50 %	50 %	0 %	0 %	550916719
6124	NC_022571	AAG	2	6	229204	229209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916719
6125	NC_022571	TCC	2	6	229304	229309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550916720
6126	NC_022571	ATCA	2	8	229337	229344	50 %	25 %	0 %	25 %	550916720
6127	NC_022571	TAA	2	6	229346	229351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916720
6128	NC_022571	AGAA	2	8	229389	229396	75 %	0 %	25 %	0 %	550916720
6129	NC_022571	TGA	2	6	229463	229468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916720
6130	NC_022571	AGAT	2	8	229490	229497	50 %	25 %	25 %	0 %	550916720
6131	NC_022571	CAG	2	6	229500	229505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916720
6132	NC_022571	GAT	2	6	229506	229511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916720
6133	NC_022571	TTA	2	6	229527	229532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916720
6134	NC_022571	ATT	2	6	229613	229618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916720
6135	NC_022571	AGAA	2	8	229646	229653	75 %	0 %	25 %	0 %	550916720
6136	NC_022571	AGA	2	6	229662	229667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916720
6137	NC_022571	CAT	2	6	229675	229680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550916720
6138	NC_022571	TCC	2	6	229709	229714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550916720
6139	NC_022571	TG	3	6	229738	229743	0 %	50 %	50 %	0 %	550916720
6140	NC_022571	AAAGA	2	10	229759	229768	80 %	0 %	20 %	0 %	550916720
6141	NC_022571	ATTA	2	8	229826	229833	50 %	50 %	0 %	0 %	550916720
6142	NC_022571	ATA	2	6	229843	229848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916720
6143	NC_022571	A	6	6	229848	229853	100 %	0 %	0 %	0 %	550916720
6144	NC_022571	AAT	2	6	229930	229935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916720
6145	NC_022571	TAA	2	6	229941	229946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916721
6146	NC_022571	ATG	2	6	229953	229958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916721
6147	NC_022571	TAG	2	6	229989	229994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916721
6148	NC_022571	ATTGCT	2	12	230002	230013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	550916721
6149	NC_022571	AAC	2	6	230038	230043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550916721
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6151	NC_022571	TAGT	2	8	230202	230209	25 %	50 %	25 %	0 %	550916721
6152	NC_022571	TGC	2	6	230248	230253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550916721
6153	NC_022571	AATT	2	8	230295	230302	50 %	50 %	0 %	0 %	550916721
6154	NC_022571	AG	3	6	230314	230319	50 %	0 %	50 %	0 %	550916721
6155	NC_022571	TTTC	2	8	230320	230327	0 %	75 %	0 %	25 %	550916721
6156	NC_022571	AAAT	2	8	230353	230360	75 %	25 %	0 %	0 %	550916721
6157	NC_022571	AT	3	6	230367	230372	50 %	50 %	0 %	0 %	550916721
6158	NC_022571	TTG	2	6	230427	230432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916721
6159	NC_022571	ATGGT	2	10	230514	230523	20 %	40 %	40 %	0 %	550916721
6160	NC_022571	CAG	2	6	230598	230603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916721
6161	NC_022571	A	6	6	230684	230689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6162	NC_022571	ATA	2	6	230715	230720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6163	NC_022571	AGT	2	6	230797	230802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916722
6164	NC_022571	TGT	3	9	230839	230847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916722
6165	NC_022571	AGAT	2	8	230853	230860	50 %	25 %	25 %	0 %	550916722
6166	NC_022571	AAT	2	6	230861	230866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916722
6167	NC_022571	AAG	2	6	230912	230917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916722
6168	NC_022571	ATT	2	6	230936	230941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916722
6169	NC_022571	AGA	2	6	230944	230949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916722
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6172	NC_022571	A	7	7	231010	231016	100 %	0 %	0 %	0 %	550916722
6173	NC_022571	AGG	2	6	231042	231047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550916722
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6176	NC_022571	GAG	2	6	231320	231325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6179	NC_022571	ATT	2	6	231463	231468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6180	NC_022571	AAAT	2	8	231476	231483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6181	NC_022571	ATA	2	6	231488	231493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6182	NC_022571	TA	3	6	231523	231528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6183	NC_022571	TAAT	2	8	231535	231542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6184	NC_022571	CAA	2	6	231543	231548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6185	NC_022571	GGC	2	6	231559	231564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6186	NC_022571	GATA	2	8	231569	231576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6187	NC_022571	CTAT	2	8	231577	231584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6188	NC_022571	TAT	2	6	231598	231603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6189	NC_022571	AGG	2	6	231640	231645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6190	NC_022571	AG	3	6	231694	231699	50 %	0 %	50 %	0 %	550916725
6191	NC_022571	A	6	6	231748	231753	100 %	0 %	0 %	0 %	550916725
6192	NC_022571	AGA	3	9	231803	231811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916725
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6199	NC_022571	AAG	2	6	231996	232001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916725
6200	NC_022571	AAG	2	6	232014	232019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916725
6201	NC_022571	AGG	2	6	232028	232033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6202	NC_022571	AAG	2	6	232059	232064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916726
6203	NC_022571	AGA	3	9	232068	232076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916726
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6205	NC_022571	A	6	6	232085	232090	100 %	0 %	0 %	0 %	550916726
6206	NC_022571	TGC	2	6	232103	232108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550916726
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6209	NC_022571	GCA	2	6	232242	232247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916726
6210	NC_022571	AGC	2	6	232262	232267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916726
6211	NC_022571	AGC	2	6	232328	232333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916726
6212	NC_022571	AGC	2	6	232349	232354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916726
6213	NC_022571	TTAA	2	8	232371	232378	50 %	50 %	0 %	0 %	550916726
6214	NC_022571	ACC	2	6	232412	232417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550916726
6215	NC_022571	AGA	3	9	232422	232430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916726
6216	NC_022571	AGG	2	6	232449	232454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6217	NC_022571	AGA	2	6	232500	232505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916727
6218	NC_022571	AGA	2	6	232566	232571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916727
6219	NC_022571	ACA	2	6	232586	232591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550916727
6220	NC_022571	GAA	2	6	232604	232609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916727
6221	NC_022571	AAG	2	6	232652	232657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916727
6222	NC_022571	AT	3	6	232659	232664	50 %	50 %	0 %	0 %	550916727
6223	NC_022571	ACTT	2	8	232735	232742	25 %	50 %	0 %	25 %	550916727
6224	NC_022571	ATT	2	6	232745	232750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916727
6225	NC_022571	ATG	2	6	232888	232893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916727
6226	NC_022571	AGT	2	6	233006	233011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916727
6227	NC_022571	AGA	2	6	233027	233032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916727
6228	NC_022571	TTG	2	6	233062	233067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916727
6229	NC_022571	ATA	2	6	233081	233086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916727
6230	NC_022571	AT	3	6	233117	233122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6231	NC_022571	ATA	2	6	233147	233152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6232	NC_022571	AGGG	2	8	233172	233179	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6233	NC_022571	AAT	2	6	233207	233212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916728
6234	NC_022571	TG	3	6	233217	233222	0 %	50 %	50 %	0 %	550916728
6235	NC_022571	GTT	2	6	233256	233261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916728
6236	NC_022571	AAG	2	6	233306	233311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916728
6237	NC_022571	ATT	2	6	233315	233320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916728
6238	NC_022571	ATC	2	6	233321	233326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550916728
6239	NC_022571	AGA	2	6	233402	233407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916728
6240	NC_022571	AATT	2	8	233416	233423	50 %	50 %	0 %	0 %	550916728
6241	NC_022571	AATG	2	8	233450	233457	50 %	25 %	25 %	0 %	550916728
6242	NC_022571	TTAT	2	8	233473	233480	25 %	75 %	0 %	0 %	550916728
6243	NC_022571	GTT	2	6	233544	233549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916728
6244	NC_022571	TAA	2	6	233612	233617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916728
6245	NC_022571	AAAATA	2	12	233638	233649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550916728
6246	NC_022571	TGA	2	6	233654	233659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916728
6247	NC_022571	TCA	2	6	233670	233675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550916728
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