MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni 4031 genome sequence

Total Repeats: 39642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022529	ATA	2	6	167910	167915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549692150
4002	NC_022529	TA	3	6	167972	167977	50 %	50 %	0 %	0 %	549692150
4003	NC_022529	TAT	2	6	168247	168252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692150
4004	NC_022529	AAT	2	6	168257	168262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549692150
4005	NC_022529	TCCTTA	2	12	168291	168302	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549692150
4006	NC_022529	TTC	2	6	168326	168331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549692150
4007	NC_022529	TGA	2	6	168341	168346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549692150
4008	NC_022529	TGA	2	6	168403	168408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549692150
4009	NC_022529	CAG	2	6	168415	168420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549692150
4010	NC_022529	CTTC	2	8	168429	168436	0 %	50 %	0 %	50 %	549692150
4011	NC_022529	TAA	2	6	168451	168456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549692150
4012	NC_022529	T	6	6	168499	168504	0 %	100 %	0 %	0 %	549692150
4013	NC_022529	T	6	6	168512	168517	0 %	100 %	0 %	0 %	549692150
4014	NC_022529	GAT	2	6	168518	168523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549692150
4015	NC_022529	CAT	2	6	168535	168540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549692150
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4017	NC_022529	T	7	7	168613	168619	0 %	100 %	0 %	0 %	549692150
4018	NC_022529	TTA	2	6	168655	168660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692151
4019	NC_022529	AGCA	2	8	168692	168699	50 %	0 %	25 %	25 %	549692151
4020	NC_022529	AAAGC	2	10	168700	168709	60 %	0 %	20 %	20 %	549692151
4021	NC_022529	ATT	2	6	168730	168735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692151
4022	NC_022529	T	7	7	168734	168740	0 %	100 %	0 %	0 %	549692151
4023	NC_022529	ATATTA	2	12	168779	168790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_022529	TAA	2	6	168885	168890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_022529	TAAA	2	8	168900	168907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_022529	GGT	2	6	168933	168938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_022529	T	6	6	168954	168959	0 %	100 %	0 %	0 %	549692152
4028	NC_022529	A	6	6	168966	168971	100 %	0 %	0 %	0 %	549692152
4029	NC_022529	T	7	7	168997	169003	0 %	100 %	0 %	0 %	549692152
4030	NC_022529	TA	4	8	169018	169025	50 %	50 %	0 %	0 %	549692152
4031	NC_022529	CAAT	2	8	169045	169052	50 %	25 %	0 %	25 %	549692152
4032	NC_022529	ATTCTA	2	12	169108	169119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549692152
4033	NC_022529	A	6	6	169123	169128	100 %	0 %	0 %	0 %	549692152
4034	NC_022529	AGA	2	6	169130	169135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549692152
4035	NC_022529	ATA	2	6	169147	169152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549692152
4036	NC_022529	TAT	3	9	169230	169238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692152
4037	NC_022529	TTA	2	6	169245	169250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692152
4038	NC_022529	T	6	6	169256	169261	0 %	100 %	0 %	0 %	549692152
4039	NC_022529	ATT	2	6	169291	169296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692152
4040	NC_022529	T	7	7	169327	169333	0 %	100 %	0 %	0 %	549692152
4041	NC_022529	GCTATT	2	12	169335	169346	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549692152
4042	NC_022529	GAT	2	6	169452	169457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549692152
4043	NC_022529	GAAG	2	8	169464	169471	50 %	0 %	50 %	0 %	549692152
4044	NC_022529	AAG	2	6	169486	169491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549692152
4045	NC_022529	AG	3	6	169517	169522	50 %	0 %	50 %	0 %	549692152
4046	NC_022529	TGA	2	6	169549	169554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549692152
4047	NC_022529	TGT	2	6	169595	169600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549692152
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4049	NC_022529	T	6	6	169646	169651	0 %	100 %	0 %	0 %	549692152
4050	NC_022529	A	6	6	169652	169657	100 %	0 %	0 %	0 %	549692152
4051	NC_022529	AGG	2	6	169700	169705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549692152
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4054	NC_022529	TA	4	8	170090	170097	50 %	50 %	0 %	0 %	549692152
4055	NC_022529	T	6	6	170142	170147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_022529	A	6	6	170163	170168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_022529	TAA	2	6	170200	170205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_022529	TAA	2	6	170210	170215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_022529	TATTT	2	10	170216	170225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_022529	GTT	3	9	170315	170323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549692153
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4062	NC_022529	CGT	2	6	170387	170392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549692153
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4065	NC_022529	TTA	2	6	170565	170570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692153
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4096	NC_022529	A	7	7	171572	171578	100 %	0 %	0 %	0 %	549692153
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4105	NC_022529	GTA	2	6	171953	171958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549692154
4106	NC_022529	TTTTC	2	10	172011	172020	0 %	80 %	0 %	20 %	549692154
4107	NC_022529	TAA	2	6	172112	172117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549692154
4108	NC_022529	TTA	2	6	172156	172161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692154
4109	NC_022529	AT	3	6	172204	172209	50 %	50 %	0 %	0 %	549692154
4110	NC_022529	TCT	2	6	172218	172223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549692154
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4112	NC_022529	ATG	2	6	172280	172285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549692154
4113	NC_022529	T	7	7	172288	172294	0 %	100 %	0 %	0 %	549692154
4114	NC_022529	T	6	6	172328	172333	0 %	100 %	0 %	0 %	549692154
4115	NC_022529	T	7	7	172361	172367	0 %	100 %	0 %	0 %	549692154
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4120	NC_022529	T	8	8	172428	172435	0 %	100 %	0 %	0 %	549692154
4121	NC_022529	T	7	7	172449	172455	0 %	100 %	0 %	0 %	549692154
4122	NC_022529	ACAT	2	8	172491	172498	50 %	25 %	0 %	25 %	549692154
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4125	NC_022529	TAT	2	6	172729	172734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692154
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