MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 798

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022441	GAAGG	2	10	1878	1887	40 %	0 %	60 %	0 %	545632604
2	NC_022441	CAGGG	2	10	5224	5233	20 %	0 %	60 %	20 %	545632606
3	NC_022441	TTTAA	2	10	6534	6543	40 %	60 %	0 %	0 %	545632607
4	NC_022441	TTTTA	2	10	7539	7548	20 %	80 %	0 %	0 %	545632608
5	NC_022441	CTTTT	2	10	7757	7766	0 %	80 %	0 %	20 %	545632609
6	NC_022441	AAAGA	2	10	7912	7921	80 %	0 %	20 %	0 %	545632609
7	NC_022441	GAAAA	2	10	7990	7999	80 %	0 %	20 %	0 %	545632609
8	NC_022441	AAGAT	2	10	8766	8775	60 %	20 %	20 %	0 %	545632609
9	NC_022441	TTGAG	2	10	8807	8816	20 %	40 %	40 %	0 %	545632609
10	NC_022441	AAGGA	2	10	8868	8877	60 %	0 %	40 %	0 %	545632609
11	NC_022441	GAGAG	2	10	9266	9275	40 %	0 %	60 %	0 %	545632609
12	NC_022441	AAGAT	2	10	9729	9738	60 %	20 %	20 %	0 %	545632609
13	NC_022441	GGGAT	2	10	10544	10553	20 %	20 %	60 %	0 %	545632609
14	NC_022441	GAGAA	2	10	12525	12534	60 %	0 %	40 %	0 %	545632610
15	NC_022441	GAAGA	2	10	13139	13148	60 %	0 %	40 %	0 %	545632610
16	NC_022441	GGAAT	2	10	15331	15340	40 %	20 %	40 %	0 %	545632611
17	NC_022441	AGGGG	2	10	17786	17795	20 %	0 %	80 %	0 %	545632614
18	NC_022441	TCGGG	2	10	17967	17976	0 %	20 %	60 %	20 %	545632614
19	NC_022441	GTTGG	2	10	18771	18780	0 %	40 %	60 %	0 %	545632615
20	NC_022441	GATTG	2	10	18854	18863	20 %	40 %	40 %	0 %	545632615
21	NC_022441	ATGAA	2	10	21993	22002	60 %	20 %	20 %	0 %	545632617
22	NC_022441	TTGCT	2	10	22404	22413	0 %	60 %	20 %	20 %	545632617
23	NC_022441	AATCC	2	10	23679	23688	40 %	20 %	0 %	40 %	545632618
24	NC_022441	CTTTT	2	10	24935	24944	0 %	80 %	0 %	20 %	545632618
25	NC_022441	GCAGA	2	10	26482	26491	40 %	0 %	40 %	20 %	545632619
26	NC_022441	GAGCA	2	10	30090	30099	40 %	0 %	40 %	20 %	545632622
27	NC_022441	AGACG	2	10	32122	32131	40 %	0 %	40 %	20 %	545632625
28	NC_022441	AAAGA	2	10	35541	35550	80 %	0 %	20 %	0 %	545632629
29	NC_022441	AATTC	2	10	38147	38156	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022441	GGAGC	2	10	39402	39411	20 %	0 %	60 %	20 %	545632632
31	NC_022441	CAAGC	2	10	39612	39621	40 %	0 %	20 %	40 %	545632632
32	NC_022441	GGTGA	2	10	41000	41009	20 %	20 %	60 %	0 %	545632632
33	NC_022441	AGAGC	2	10	42252	42261	40 %	0 %	40 %	20 %	545632635
34	NC_022441	CCTAT	2	10	43471	43480	20 %	40 %	0 %	40 %	545632637
35	NC_022441	GCGAT	2	10	44636	44645	20 %	20 %	40 %	20 %	545632638
36	NC_022441	AGATG	2	10	44871	44880	40 %	20 %	40 %	0 %	545632638
37	NC_022441	CCTTG	2	10	46888	46897	0 %	40 %	20 %	40 %	545632640
38	NC_022441	TTTGG	2	10	47417	47426	0 %	60 %	40 %	0 %	545632641
39	NC_022441	AGACA	2	10	50790	50799	60 %	0 %	20 %	20 %	545632642
40	NC_022441	GCAAG	2	10	51541	51550	40 %	0 %	40 %	20 %	545632643
41	NC_022441	AAGAT	2	10	51808	51817	60 %	20 %	20 %	0 %	545632643
42	NC_022441	TTTTG	2	10	53414	53423	0 %	80 %	20 %	0 %	545632645
43	NC_022441	AAACA	2	10	54629	54638	80 %	0 %	0 %	20 %	545632646
44	NC_022441	CTTGA	2	10	56407	56416	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022441	AGACA	2	10	57239	57248	60 %	0 %	20 %	20 %	545632649
46	NC_022441	CTTTT	2	10	58105	58114	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022441	TGAAG	2	10	66302	66311	40 %	20 %	40 %	0 %	545632654
48	NC_022441	AAGGC	2	10	71608	71617	40 %	0 %	40 %	20 %	545632660
49	NC_022441	CATTA	2	10	74399	74408	40 %	40 %	0 %	20 %	545632662
50	NC_022441	AACGT	2	10	75287	75296	40 %	20 %	20 %	20 %	545632663
51	NC_022441	TCTTT	2	10	77475	77484	0 %	80 %	0 %	20 %	545632665
52	NC_022441	GATAC	2	10	78419	78428	40 %	20 %	20 %	20 %	545632666
53	NC_022441	GTTGT	2	10	80950	80959	0 %	60 %	40 %	0 %	545632668
54	NC_022441	TGTAG	2	10	81446	81455	20 %	40 %	40 %	0 %	545632668
55	NC_022441	CCTAA	2	10	83507	83516	40 %	20 %	0 %	40 %	545632671
56	NC_022441	CAGAG	2	10	85183	85192	40 %	0 %	40 %	20 %	545632673
57	NC_022441	CTTTT	2	10	86288	86297	0 %	80 %	0 %	20 %	545632674
58	NC_022441	AAAGA	2	10	86379	86388	80 %	0 %	20 %	0 %	545632674
59	NC_022441	TCTTT	2	10	86416	86425	0 %	80 %	0 %	20 %	545632674
60	NC_022441	TAAAA	2	10	88444	88453	80 %	20 %	0 %	0 %	545632674
61	NC_022441	TTTGC	2	10	88501	88510	0 %	60 %	20 %	20 %	545632674
62	NC_022441	GAAAA	2	10	89537	89546	80 %	0 %	20 %	0 %	545632675
63	NC_022441	AAGAG	2	10	89863	89872	60 %	0 %	40 %	0 %	545632675
64	NC_022441	CTGCT	2	10	89894	89903	0 %	40 %	20 %	40 %	545632675
65	NC_022441	CTGCA	2	10	92247	92256	20 %	20 %	20 %	40 %	545632676
66	NC_022441	CTTTT	2	10	93317	93326	0 %	80 %	0 %	20 %	545632677
67	NC_022441	CAATG	2	10	93527	93536	40 %	20 %	20 %	20 %	545632677
68	NC_022441	GCAAA	2	10	93878	93887	60 %	0 %	20 %	20 %	545632677
69	NC_022441	TACAA	2	10	94597	94606	60 %	20 %	0 %	20 %	545632678
70	NC_022441	GATTT	2	10	97507	97516	20 %	60 %	20 %	0 %	545632683
71	NC_022441	CTTTG	2	10	98906	98915	0 %	60 %	20 %	20 %	545632685
72	NC_022441	GGGCA	2	10	99050	99059	20 %	0 %	60 %	20 %	545632685
73	NC_022441	TCCTT	2	10	103953	103962	0 %	60 %	0 %	40 %	545632690
74	NC_022441	ATTTT	2	10	104358	104367	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022441	CTTTT	2	10	104553	104562	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022441	CAAAG	2	10	104864	104873	60 %	0 %	20 %	20 %	545632691
77	NC_022441	AAGGG	2	10	105028	105037	40 %	0 %	60 %	0 %	545632691
78	NC_022441	TGTTA	2	10	108592	108601	20 %	60 %	20 %	0 %	545632698
79	NC_022441	TGCTT	2	10	113201	113210	0 %	60 %	20 %	20 %	545632709
80	NC_022441	GTAGG	2	10	113218	113227	20 %	20 %	60 %	0 %	545632709
81	NC_022441	TGAAA	2	10	114203	114212	60 %	20 %	20 %	0 %	545632709
82	NC_022441	TTTAC	2	10	115402	115411	20 %	60 %	0 %	20 %	545632712
83	NC_022441	AAAAG	2	10	116449	116458	80 %	0 %	20 %	0 %	545632712
84	NC_022441	AAGAG	2	10	119743	119752	60 %	0 %	40 %	0 %	545632716
85	NC_022441	AAGAG	2	10	119827	119836	60 %	0 %	40 %	0 %	545632716
86	NC_022441	CTTGT	2	10	125809	125818	0 %	60 %	20 %	20 %	545632722
87	NC_022441	TAGGT	2	10	126050	126059	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022441	TATGT	2	10	127733	127742	20 %	60 %	20 %	0 %	545632724
89	NC_022441	CTTTT	2	10	128984	128993	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_022441	TTTGA	2	10	133699	133708	20 %	60 %	20 %	0 %	545632728
91	NC_022441	TACAG	2	10	134250	134259	40 %	20 %	20 %	20 %	545632728
92	NC_022441	GATGC	2	10	134605	134614	20 %	20 %	40 %	20 %	545632728
93	NC_022441	ACGAG	2	10	137215	137224	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022441	TTGAT	2	10	138291	138300	20 %	60 %	20 %	0 %	545632733
95	NC_022441	AAGGA	2	10	139433	139442	60 %	0 %	40 %	0 %	545632735
96	NC_022441	AAAGA	2	10	141396	141405	80 %	0 %	20 %	0 %	545632736
97	NC_022441	GAATA	2	10	141443	141452	60 %	20 %	20 %	0 %	545632736
98	NC_022441	TTTTC	2	10	142208	142217	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022441	TTGTT	2	10	143248	143257	0 %	80 %	20 %	0 %	545632738
100	NC_022441	TCTCT	2	10	144331	144340	0 %	60 %	0 %	40 %	545632738
101	NC_022441	TGTTT	2	10	151741	151750	0 %	80 %	20 %	0 %	545632744
102	NC_022441	TTATT	2	10	151757	151766	20 %	80 %	0 %	0 %	545632744
103	NC_022441	GTTTT	2	10	151920	151929	0 %	80 %	20 %	0 %	545632744
104	NC_022441	TCTTT	2	10	153769	153778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022441	TAAAT	2	10	154144	154153	60 %	40 %	0 %	0 %	545632747
106	NC_022441	GCTTT	2	10	155066	155075	0 %	60 %	20 %	20 %	545632748
107	NC_022441	TGTGT	2	10	160528	160537	0 %	60 %	40 %	0 %	545632752
108	NC_022441	AAGTT	2	10	160674	160683	40 %	40 %	20 %	0 %	545632752
109	NC_022441	AAGAG	3	15	161356	161370	60 %	0 %	40 %	0 %	545632753
110	NC_022441	GATTT	2	10	161984	161993	20 %	60 %	20 %	0 %	545632753
111	NC_022441	GGTTG	2	10	165626	165635	0 %	40 %	60 %	0 %	545632759
112	NC_022441	GTTCG	2	10	166220	166229	0 %	40 %	40 %	20 %	545632759
113	NC_022441	TTTAC	2	10	166385	166394	20 %	60 %	0 %	20 %	545632760
114	NC_022441	CAGAA	2	10	169297	169306	60 %	0 %	20 %	20 %	545632764
115	NC_022441	TGCTT	2	10	171901	171910	0 %	60 %	20 %	20 %	545632765
116	NC_022441	AAAAT	2	10	172425	172434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022441	GGAGA	2	10	175275	175284	40 %	0 %	60 %	0 %	545632767
118	NC_022441	GAGAG	2	10	175629	175638	40 %	0 %	60 %	0 %	545632767
119	NC_022441	AATTA	2	10	178975	178984	60 %	40 %	0 %	0 %	545632772
120	NC_022441	TTCTT	2	10	179316	179325	0 %	80 %	0 %	20 %	545632772
121	NC_022441	GGGGA	2	10	180084	180093	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022441	TCTTT	2	10	180242	180251	0 %	80 %	0 %	20 %	545632773
123	NC_022441	GCTGC	2	10	183052	183061	0 %	20 %	40 %	40 %	545632773
124	NC_022441	TACAG	2	10	183576	183585	40 %	20 %	20 %	20 %	545632773
125	NC_022441	TAGCT	2	10	185388	185397	20 %	40 %	20 %	20 %	545632774
126	NC_022441	TATTG	2	10	185577	185586	20 %	60 %	20 %	0 %	545632774
127	NC_022441	TTTAT	2	10	188857	188866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022441	AGAGG	2	10	190446	190455	40 %	0 %	60 %	0 %	545632778
129	NC_022441	TGGAT	2	10	190762	190771	20 %	40 %	40 %	0 %	545632778
130	NC_022441	AAGAA	2	10	191501	191510	80 %	0 %	20 %	0 %	545632779
131	NC_022441	TTTAG	2	10	191643	191652	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022441	GAAGA	2	10	192595	192604	60 %	0 %	40 %	0 %	545632781
133	NC_022441	AAAGT	2	10	193196	193205	60 %	20 %	20 %	0 %	545632781
134	NC_022441	TAAGA	2	10	196561	196570	60 %	20 %	20 %	0 %	545632783
135	NC_022441	CCTAA	2	10	197192	197201	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_022441	TAAAA	2	10	197253	197262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022441	GTTGG	2	10	199213	199222	0 %	40 %	60 %	0 %	545632787
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171	NC_022441	TAAGA	2	10	244794	244803	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022441	GCGTA	2	10	244963	244972	20 %	20 %	40 %	20 %	545632832
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259	NC_022441	CAGGG	2	10	375358	375367	20 %	0 %	60 %	20 %	545632923
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261	NC_022441	GCTTT	2	10	378497	378506	0 %	60 %	20 %	20 %	545632928
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499	NC_022441	GCAAA	2	10	686824	686833	60 %	0 %	20 %	20 %	545633177
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