MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 2719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022441	TGCA	2	8	620	627	25 %	25 %	25 %	25 %	545632603
2	NC_022441	GAAG	2	8	873	880	50 %	0 %	50 %	0 %	545632603
3	NC_022441	TTTA	2	8	914	921	25 %	75 %	0 %	0 %	545632603
4	NC_022441	AGTC	2	8	943	950	25 %	25 %	25 %	25 %	545632603
5	NC_022441	GGGT	2	8	1018	1025	0 %	25 %	75 %	0 %	545632603
6	NC_022441	AGAA	2	8	1669	1676	75 %	0 %	25 %	0 %	545632604
7	NC_022441	TTTG	2	8	3273	3280	0 %	75 %	25 %	0 %	545632606
8	NC_022441	TTTC	2	8	3590	3597	0 %	75 %	0 %	25 %	545632606
9	NC_022441	TTTC	2	8	3650	3657	0 %	75 %	0 %	25 %	545632606
10	NC_022441	TCTT	2	8	4273	4280	0 %	75 %	0 %	25 %	545632606
11	NC_022441	ATAA	2	8	5014	5021	75 %	25 %	0 %	0 %	545632606
12	NC_022441	GTTG	2	8	5068	5075	0 %	50 %	50 %	0 %	545632606
13	NC_022441	AATC	2	8	5385	5392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022441	CTGC	2	8	5637	5644	0 %	25 %	25 %	50 %	545632607
15	NC_022441	ACAT	2	8	6416	6423	50 %	25 %	0 %	25 %	545632607
16	NC_022441	TTAT	2	8	6920	6927	25 %	75 %	0 %	0 %	545632608
17	NC_022441	AGAA	2	8	8242	8249	75 %	0 %	25 %	0 %	545632609
18	NC_022441	TTCG	2	8	8959	8966	0 %	50 %	25 %	25 %	545632609
19	NC_022441	TGAT	2	8	9333	9340	25 %	50 %	25 %	0 %	545632609
20	NC_022441	GCAT	2	8	9342	9349	25 %	25 %	25 %	25 %	545632609
21	NC_022441	AAGC	2	8	10160	10167	50 %	0 %	25 %	25 %	545632609
22	NC_022441	TTTC	2	8	10826	10833	0 %	75 %	0 %	25 %	545632610
23	NC_022441	GGGA	2	8	11006	11013	25 %	0 %	75 %	0 %	545632610
24	NC_022441	GAAG	2	8	11242	11249	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
25	NC_022441	CTTT	2	8	11392	11399	0 %	75 %	0 %	25 %	545632610
26	NC_022441	GTTG	2	8	11683	11690	0 %	50 %	50 %	0 %	545632610
27	NC_022441	GGAA	2	8	11733	11740	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
28	NC_022441	TTTG	2	8	11949	11956	0 %	75 %	25 %	0 %	545632610
29	NC_022441	GAAA	2	8	12061	12068	75 %	0 %	25 %	0 %	545632610
30	NC_022441	GAGG	2	8	12470	12477	25 %	0 %	75 %	0 %	545632610
31	NC_022441	GGAT	2	8	12481	12488	25 %	25 %	50 %	0 %	545632610
32	NC_022441	GATT	2	8	13168	13175	25 %	50 %	25 %	0 %	545632610
33	NC_022441	TTTA	2	8	13398	13405	25 %	75 %	0 %	0 %	545632610
34	NC_022441	AAAT	2	8	13479	13486	75 %	25 %	0 %	0 %	545632610
35	NC_022441	GGAT	2	8	14560	14567	25 %	25 %	50 %	0 %	545632611
36	NC_022441	AAAG	2	8	15464	15471	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022441	GTTT	2	8	15549	15556	0 %	75 %	25 %	0 %	545632612
38	NC_022441	TAAA	2	8	16575	16582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022441	GCTT	2	8	16839	16846	0 %	50 %	25 %	25 %	545632613
40	NC_022441	TAAA	2	8	16894	16901	75 %	25 %	0 %	0 %	545632613
41	NC_022441	TCTT	2	8	17052	17059	0 %	75 %	0 %	25 %	545632613
42	NC_022441	GAAA	2	8	17087	17094	75 %	0 %	25 %	0 %	545632613
43	NC_022441	TTTC	2	8	18572	18579	0 %	75 %	0 %	25 %	545632615
44	NC_022441	CGAG	2	8	19193	19200	25 %	0 %	50 %	25 %	545632615
45	NC_022441	TCCC	2	8	19319	19326	0 %	25 %	0 %	75 %	545632615
46	NC_022441	TTTA	2	8	19579	19586	25 %	75 %	0 %	0 %	545632615
47	NC_022441	GCAT	2	8	19668	19675	25 %	25 %	25 %	25 %	545632615
48	NC_022441	AGAA	2	8	20340	20347	75 %	0 %	25 %	0 %	545632616
49	NC_022441	GCAT	2	8	20363	20370	25 %	25 %	25 %	25 %	545632616
50	NC_022441	TGAG	2	8	20570	20577	25 %	25 %	50 %	0 %	545632616
51	NC_022441	CAGC	2	8	20811	20818	25 %	0 %	25 %	50 %	545632616
52	NC_022441	GAAA	2	8	20834	20841	75 %	0 %	25 %	0 %	545632616
53	NC_022441	AACA	2	8	20871	20878	75 %	0 %	0 %	25 %	545632616
54	NC_022441	TGAA	2	8	20906	20913	50 %	25 %	25 %	0 %	545632616
55	NC_022441	ACTA	2	8	21121	21128	50 %	25 %	0 %	25 %	545632616
56	NC_022441	TCTT	2	8	21293	21300	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022441	ATGA	2	8	21767	21774	50 %	25 %	25 %	0 %	545632617
58	NC_022441	AACA	2	8	21887	21894	75 %	0 %	0 %	25 %	545632617
59	NC_022441	GCAA	2	8	21979	21986	50 %	0 %	25 %	25 %	545632617
60	NC_022441	AAGA	2	8	22462	22469	75 %	0 %	25 %	0 %	545632617
61	NC_022441	TTAA	2	8	22637	22644	50 %	50 %	0 %	0 %	545632617
62	NC_022441	TCAG	2	8	22923	22930	25 %	25 %	25 %	25 %	545632617
63	NC_022441	TGGA	2	8	23166	23173	25 %	25 %	50 %	0 %	545632617
64	NC_022441	CTTT	2	8	23201	23208	0 %	75 %	0 %	25 %	545632617
65	NC_022441	ATAC	2	8	23287	23294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_022441	GTAT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022441	GATA	2	8	24087	24094	50 %	25 %	25 %	0 %	545632618
68	NC_022441	AATT	2	8	24131	24138	50 %	50 %	0 %	0 %	545632618
69	NC_022441	TTAA	2	8	24142	24149	50 %	50 %	0 %	0 %	545632618
70	NC_022441	TGCT	2	8	24165	24172	0 %	50 %	25 %	25 %	545632618
71	NC_022441	TAAA	2	8	24199	24206	75 %	25 %	0 %	0 %	545632618
72	NC_022441	ATTT	2	8	24443	24450	25 %	75 %	0 %	0 %	545632618
73	NC_022441	TATG	2	8	24620	24627	25 %	50 %	25 %	0 %	545632618
74	NC_022441	CCAA	2	8	24669	24676	50 %	0 %	0 %	50 %	545632618
75	NC_022441	GTAT	2	8	24726	24733	25 %	50 %	25 %	0 %	545632618
76	NC_022441	TCCA	2	8	24874	24881	25 %	25 %	0 %	50 %	545632618
77	NC_022441	TCTG	2	8	25474	25481	0 %	50 %	25 %	25 %	545632618
78	NC_022441	TCTT	2	8	26089	26096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022441	TGTT	3	12	26155	26166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022441	TCTT	2	8	26313	26320	0 %	75 %	0 %	25 %	545632619
81	NC_022441	GAAT	2	8	26883	26890	50 %	25 %	25 %	0 %	545632619
82	NC_022441	ATAC	2	8	27689	27696	50 %	25 %	0 %	25 %	545632619
83	NC_022441	CAAG	2	8	27961	27968	50 %	0 %	25 %	25 %	545632619
84	NC_022441	CTTC	2	8	27988	27995	0 %	50 %	0 %	50 %	545632619
85	NC_022441	GAAA	2	8	29720	29727	75 %	0 %	25 %	0 %	545632621
86	NC_022441	TCTA	2	8	29962	29969	25 %	50 %	0 %	25 %	545632622
87	NC_022441	GAAA	2	8	30002	30009	75 %	0 %	25 %	0 %	545632622
88	NC_022441	AATA	2	8	30411	30418	75 %	25 %	0 %	0 %	545632623
89	NC_022441	CTGT	2	8	30470	30477	0 %	50 %	25 %	25 %	545632623
90	NC_022441	AACG	2	8	30568	30575	50 %	0 %	25 %	25 %	545632623
91	NC_022441	TAGG	2	8	31272	31279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022441	GCTA	2	8	31463	31470	25 %	25 %	25 %	25 %	545632624
93	NC_022441	TAAA	2	8	31778	31785	75 %	25 %	0 %	0 %	545632625
94	NC_022441	ATAG	2	8	31972	31979	50 %	25 %	25 %	0 %	545632625
95	NC_022441	CTTT	2	8	32140	32147	0 %	75 %	0 %	25 %	545632625
96	NC_022441	TAGA	2	8	33060	33067	50 %	25 %	25 %	0 %	545632626
97	NC_022441	GTTT	2	8	33591	33598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022441	TCTT	2	8	33733	33740	0 %	75 %	0 %	25 %	545632628
99	NC_022441	AGCT	2	8	33828	33835	25 %	25 %	25 %	25 %	545632628
100	NC_022441	AGAA	2	8	33894	33901	75 %	0 %	25 %	0 %	545632628
101	NC_022441	GAAT	2	8	34309	34316	50 %	25 %	25 %	0 %	545632628
102	NC_022441	GAAG	2	8	34600	34607	50 %	0 %	50 %	0 %	545632628
103	NC_022441	TGCA	2	8	34645	34652	25 %	25 %	25 %	25 %	545632628
104	NC_022441	TTTG	2	8	34782	34789	0 %	75 %	25 %	0 %	545632628
105	NC_022441	CATG	2	8	35021	35028	25 %	25 %	25 %	25 %	545632628
106	NC_022441	AATA	2	8	35284	35291	75 %	25 %	0 %	0 %	545632629
107	NC_022441	AAAT	2	8	35332	35339	75 %	25 %	0 %	0 %	545632629
108	NC_022441	AAAG	3	12	35358	35369	75 %	0 %	25 %	0 %	545632629
109	NC_022441	CTTG	2	8	35857	35864	0 %	50 %	25 %	25 %	545632629
110	NC_022441	TTAA	2	8	35871	35878	50 %	50 %	0 %	0 %	545632629
111	NC_022441	GTTT	2	8	35905	35912	0 %	75 %	25 %	0 %	545632629
112	NC_022441	CAAT	2	8	36573	36580	50 %	25 %	0 %	25 %	545632629
113	NC_022441	GAGT	2	8	36838	36845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022441	TTGT	2	8	37047	37054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022441	TATT	2	8	38275	38282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022441	GTTA	2	8	38899	38906	25 %	50 %	25 %	0 %	545632632
117	NC_022441	AGCA	2	8	39663	39670	50 %	0 %	25 %	25 %	545632632
118	NC_022441	ATTT	2	8	39909	39916	25 %	75 %	0 %	0 %	545632632
119	NC_022441	CTCC	2	8	40299	40306	0 %	25 %	0 %	75 %	545632632
120	NC_022441	AGAA	2	8	40558	40565	75 %	0 %	25 %	0 %	545632632
121	NC_022441	CATT	2	8	40876	40883	25 %	50 %	0 %	25 %	545632632
122	NC_022441	TCTT	2	8	40891	40898	0 %	75 %	0 %	25 %	545632632
123	NC_022441	GCGT	2	8	41085	41092	0 %	25 %	50 %	25 %	545632632
124	NC_022441	GAAG	2	8	41302	41309	50 %	0 %	50 %	0 %	545632632
125	NC_022441	AATA	2	8	41333	41340	75 %	25 %	0 %	0 %	545632632
126	NC_022441	TTTC	2	8	42181	42188	0 %	75 %	0 %	25 %	545632635
127	NC_022441	TTTC	2	8	43299	43306	0 %	75 %	0 %	25 %	545632637
128	NC_022441	ACGA	2	8	43520	43527	50 %	0 %	25 %	25 %	545632637
129	NC_022441	CGAT	2	8	44146	44153	25 %	25 %	25 %	25 %	545632637
130	NC_022441	TAGA	2	8	44480	44487	50 %	25 %	25 %	0 %	545632638
131	NC_022441	CAGC	2	8	45061	45068	25 %	0 %	25 %	50 %	545632639
132	NC_022441	CTTT	2	8	45868	45875	0 %	75 %	0 %	25 %	545632640
133	NC_022441	GCTC	2	8	46795	46802	0 %	25 %	25 %	50 %	545632640
134	NC_022441	CTTT	2	8	47579	47586	0 %	75 %	0 %	25 %	545632641
135	NC_022441	AAGA	2	8	47744	47751	75 %	0 %	25 %	0 %	545632641
136	NC_022441	CAAT	2	8	47757	47764	50 %	25 %	0 %	25 %	545632641
137	NC_022441	AATT	2	8	48208	48215	50 %	50 %	0 %	0 %	545632641
138	NC_022441	GTAA	2	8	49240	49247	50 %	25 %	25 %	0 %	545632642
139	NC_022441	TAGC	2	8	49937	49944	25 %	25 %	25 %	25 %	545632642
140	NC_022441	CTTA	2	8	50499	50506	25 %	50 %	0 %	25 %	545632642
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