MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 23620

< Previous12...36373839404142434445464748Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_022441	GTA	2	6	1100632	1100637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633522
23502	NC_022441	TG	3	6	1100667	1100672	0 %	50 %	50 %	0 %	545633522
23503	NC_022441	GAA	2	6	1100742	1100747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633522
23504	NC_022441	CTC	2	6	1100756	1100761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633522
23505	NC_022441	TCT	2	6	1100778	1100783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633522
23506	NC_022441	CTA	3	9	1100815	1100823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633522
23507	NC_022441	AGG	2	6	1100878	1100883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633522
23508	NC_022441	GCT	2	6	1100890	1100895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633522
23509	NC_022441	TAAA	2	8	1100905	1100912	75 %	25 %	0 %	0 %	545633522
23510	NC_022441	ACA	2	6	1100919	1100924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633522
23511	NC_022441	TTC	2	6	1100988	1100993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633522
23512	NC_022441	GTA	2	6	1101014	1101019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633522
23513	NC_022441	A	6	6	1101060	1101065	100 %	0 %	0 %	0 %	545633522
23514	NC_022441	AAC	3	9	1101078	1101086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633522
23515	NC_022441	TC	3	6	1101160	1101165	0 %	50 %	0 %	50 %	545633522
23516	NC_022441	GAT	2	6	1101211	1101216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633522
23517	NC_022441	A	9	9	1101219	1101227	100 %	0 %	0 %	0 %	545633522
23518	NC_022441	AGA	2	6	1101266	1101271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633522
23519	NC_022441	TTCC	2	8	1101287	1101294	0 %	50 %	0 %	50 %	545633522
23520	NC_022441	T	8	8	1101329	1101336	0 %	100 %	0 %	0 %	545633522
23521	NC_022441	T	6	6	1101388	1101393	0 %	100 %	0 %	0 %	545633522
23522	NC_022441	CATCT	2	10	1101416	1101425	20 %	40 %	0 %	40 %	545633522
23523	NC_022441	A	8	8	1101435	1101442	100 %	0 %	0 %	0 %	545633522
23524	NC_022441	CTT	2	6	1101472	1101477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633522
23525	NC_022441	TCT	2	6	1101492	1101497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633522
23526	NC_022441	TCA	2	6	1101501	1101506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633522
23527	NC_022441	GA	3	6	1101514	1101519	50 %	0 %	50 %	0 %	545633522
23528	NC_022441	TGT	2	6	1101591	1101596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633522
23529	NC_022441	GAA	2	6	1101600	1101605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633522
23530	NC_022441	GAA	2	6	1101624	1101629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633522
23531	NC_022441	TTC	2	6	1101632	1101637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633522
23532	NC_022441	AAC	2	6	1101700	1101705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633522
23533	NC_022441	ATAA	2	8	1101706	1101713	75 %	25 %	0 %	0 %	545633522
23534	NC_022441	A	8	8	1101730	1101737	100 %	0 %	0 %	0 %	545633522
23535	NC_022441	A	6	6	1101747	1101752	100 %	0 %	0 %	0 %	545633522
23536	NC_022441	ACA	2	6	1101827	1101832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23537	NC_022441	TA	4	8	1101847	1101854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23538	NC_022441	A	6	6	1101888	1101893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23539	NC_022441	T	7	7	1101897	1101903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23540	NC_022441	AAT	2	6	1101919	1101924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23541	NC_022441	TTG	2	6	1101945	1101950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23542	NC_022441	TTGAA	2	10	1102023	1102032	40 %	40 %	20 %	0 %	545633523
23543	NC_022441	TTA	2	6	1102065	1102070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633523
23544	NC_022441	CCTCTG	2	12	1102095	1102106	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	545633523
23545	NC_022441	TCC	2	6	1102160	1102165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633523
23546	NC_022441	TTGTT	2	10	1102179	1102188	0 %	80 %	20 %	0 %	545633523
23547	NC_022441	AGA	2	6	1102201	1102206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633523
23548	NC_022441	TTA	2	6	1102247	1102252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633523
23549	NC_022441	TTC	2	6	1102309	1102314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633523
23550	NC_022441	AC	3	6	1102403	1102408	50 %	0 %	0 %	50 %	545633523
23551	NC_022441	AGA	2	6	1102486	1102491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633523
23552	NC_022441	A	6	6	1102556	1102561	100 %	0 %	0 %	0 %	545633523
23553	NC_022441	AGA	2	6	1102621	1102626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633523
23554	NC_022441	TTTC	2	8	1102637	1102644	0 %	75 %	0 %	25 %	545633523
23555	NC_022441	CTTTCT	2	12	1102650	1102661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23556	NC_022441	CT	3	6	1102660	1102665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23557	NC_022441	GTAA	2	8	1102667	1102674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23558	NC_022441	AT	3	6	1102724	1102729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23559	NC_022441	CTT	3	9	1102746	1102754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633524
23560	NC_022441	T	8	8	1102753	1102760	0 %	100 %	0 %	0 %	545633524
23561	NC_022441	TCTA	2	8	1102799	1102806	25 %	50 %	0 %	25 %	545633524
23562	NC_022441	A	6	6	1102897	1102902	100 %	0 %	0 %	0 %	545633524
23563	NC_022441	ATT	2	6	1102970	1102975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633524
23564	NC_022441	A	6	6	1103065	1103070	100 %	0 %	0 %	0 %	545633524
23565	NC_022441	CGT	2	6	1103234	1103239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633524
23566	NC_022441	A	6	6	1103260	1103265	100 %	0 %	0 %	0 %	545633524
23567	NC_022441	AGA	2	6	1103411	1103416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633525
23568	NC_022441	CTT	2	6	1103505	1103510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633525
23569	NC_022441	ATGC	2	8	1103513	1103520	25 %	25 %	25 %	25 %	545633525
23570	NC_022441	GAT	2	6	1103604	1103609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633525
23571	NC_022441	ATG	3	9	1103626	1103634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633525
23572	NC_022441	ATT	2	6	1103684	1103689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633525
23573	NC_022441	CAT	2	6	1103692	1103697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633525
23574	NC_022441	GCA	2	6	1103712	1103717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633525
23575	NC_022441	A	6	6	1103742	1103747	100 %	0 %	0 %	0 %	545633525
23576	NC_022441	ATT	2	6	1103796	1103801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633525
23577	NC_022441	ACG	2	6	1103854	1103859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633525
23578	NC_022441	T	7	7	1103865	1103871	0 %	100 %	0 %	0 %	545633525
23579	NC_022441	CAA	2	6	1103873	1103878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633525
23580	NC_022441	A	8	8	1103909	1103916	100 %	0 %	0 %	0 %	545633525
23581	NC_022441	TGG	2	6	1103960	1103965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545633525
23582	NC_022441	TCAAA	2	10	1104026	1104035	60 %	20 %	0 %	20 %	545633525
23583	NC_022441	GAC	2	6	1104036	1104041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633525
23584	NC_022441	CTG	2	6	1104120	1104125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633525
23585	NC_022441	CT	3	6	1104163	1104168	0 %	50 %	0 %	50 %	545633525
23586	NC_022441	TTA	2	6	1104208	1104213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633525
23587	NC_022441	TTAA	2	8	1104232	1104239	50 %	50 %	0 %	0 %	545633525
23588	NC_022441	ATG	2	6	1104411	1104416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633526
23589	NC_022441	AGA	2	6	1104434	1104439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633526
23590	NC_022441	GTT	2	6	1104566	1104571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633526
23591	NC_022441	AAATAA	2	12	1104605	1104616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23592	NC_022441	CAG	2	6	1104617	1104622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23593	NC_022441	AG	3	6	1104621	1104626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23594	NC_022441	TCA	2	6	1104719	1104724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633527
23595	NC_022441	AGA	2	6	1104735	1104740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633527
23596	NC_022441	ATTG	2	8	1104781	1104788	25 %	50 %	25 %	0 %	545633527
23597	NC_022441	CGA	2	6	1104789	1104794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633527
23598	NC_022441	CAT	2	6	1104948	1104953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633527
23599	NC_022441	AGT	2	6	1105033	1105038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633527
23600	NC_022441	AAG	2	6	1105039	1105044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633527
23601	NC_022441	TG	3	6	1105055	1105060	0 %	50 %	50 %	0 %	545633527
23602	NC_022441	CAA	2	6	1105104	1105109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633527
23603	NC_022441	CT	3	6	1105165	1105170	0 %	50 %	0 %	50 %	545633527
23604	NC_022441	TCT	2	6	1105205	1105210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633527
23605	NC_022441	GCA	2	6	1105280	1105285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633527
23606	NC_022441	TTC	2	6	1105351	1105356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633527
23607	NC_022441	GAA	2	6	1105620	1105625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633527
23608	NC_022441	TCA	2	6	1105803	1105808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633527
23609	NC_022441	TCC	2	6	1105891	1105896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633527
23610	NC_022441	AGC	2	6	1105921	1105926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633527
23611	NC_022441	CTC	2	6	1105959	1105964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633527
23612	NC_022441	CTG	2	6	1106019	1106024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633527
23613	NC_022441	CAA	2	6	1106098	1106103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633527
23614	NC_022441	TTC	2	6	1106171	1106176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633527
23615	NC_022441	TGA	2	6	1106246	1106251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633527
23616	NC_022441	A	6	6	1106280	1106285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23617	NC_022441	CAC	2	6	1106294	1106299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23618	NC_022441	ACT	2	6	1106313	1106318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23619	NC_022441	A	6	6	1106326	1106331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23620	NC_022441	A	6	6	1106339	1106344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...36373839404142434445464748Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.