MICAS: Microsatellite Analysis Server

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia pecorum W73

Total Repeats: 2389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022440	TC	3	6	32	37	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022440	TA	3	6	89	94	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022440	AG	3	6	855	860	50 %	0 %	50 %	0 %	545631677
4	NC_022440	CG	3	6	1069	1074	0 %	0 %	50 %	50 %	545631677
5	NC_022440	AC	3	6	1758	1763	50 %	0 %	0 %	50 %	545631678
6	NC_022440	GT	3	6	1899	1904	0 %	50 %	50 %	0 %	545631678
7	NC_022440	GC	3	6	1995	2000	0 %	0 %	50 %	50 %	545631678
8	NC_022440	TG	3	6	2121	2126	0 %	50 %	50 %	0 %	545631678
9	NC_022440	TG	3	6	3056	3061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022440	TA	3	6	3936	3941	50 %	50 %	0 %	0 %	545631680
11	NC_022440	CT	3	6	4155	4160	0 %	50 %	0 %	50 %	545631680
12	NC_022440	TA	3	6	4369	4374	50 %	50 %	0 %	0 %	545631680
13	NC_022440	TG	3	6	4431	4436	0 %	50 %	50 %	0 %	545631680
14	NC_022440	TC	3	6	4840	4845	0 %	50 %	0 %	50 %	545631680
15	NC_022440	AG	3	6	4935	4940	50 %	0 %	50 %	0 %	545631680
16	NC_022440	GC	3	6	4974	4979	0 %	0 %	50 %	50 %	545631680
17	NC_022440	TC	3	6	5822	5827	0 %	50 %	0 %	50 %	545631681
18	NC_022440	AT	3	6	6508	6513	50 %	50 %	0 %	0 %	545631681
19	NC_022440	AG	3	6	7229	7234	50 %	0 %	50 %	0 %	545631682
20	NC_022440	TA	3	6	7728	7733	50 %	50 %	0 %	0 %	545631683
21	NC_022440	GA	3	6	7904	7909	50 %	0 %	50 %	0 %	545631683
22	NC_022440	GA	3	6	8086	8091	50 %	0 %	50 %	0 %	545631683
23	NC_022440	AG	4	8	8175	8182	50 %	0 %	50 %	0 %	545631683
24	NC_022440	GA	3	6	8315	8320	50 %	0 %	50 %	0 %	545631683
25	NC_022440	AG	3	6	8457	8462	50 %	0 %	50 %	0 %	545631683
26	NC_022440	GA	3	6	8903	8908	50 %	0 %	50 %	0 %	545631683
27	NC_022440	AG	3	6	9064	9069	50 %	0 %	50 %	0 %	545631683
28	NC_022440	AG	3	6	9912	9917	50 %	0 %	50 %	0 %	545631683
29	NC_022440	AG	3	6	10072	10077	50 %	0 %	50 %	0 %	545631683
30	NC_022440	GA	3	6	10116	10121	50 %	0 %	50 %	0 %	545631683
31	NC_022440	TG	3	6	10125	10130	0 %	50 %	50 %	0 %	545631683
32	NC_022440	AG	4	8	10776	10783	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
33	NC_022440	GA	3	6	11048	11053	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
34	NC_022440	AC	3	6	11160	11165	50 %	0 %	0 %	50 %	545631684
35	NC_022440	GA	3	6	11367	11372	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
36	NC_022440	GA	3	6	11445	11450	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
37	NC_022440	GA	3	6	11664	11669	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
38	NC_022440	AG	3	6	11800	11805	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
39	NC_022440	GA	3	6	11932	11937	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
40	NC_022440	AG	3	6	12154	12159	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
41	NC_022440	AG	3	6	12226	12231	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
42	NC_022440	AG	3	6	12762	12767	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
43	NC_022440	GA	3	6	12795	12800	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
44	NC_022440	GA	3	6	12909	12914	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
45	NC_022440	GA	4	8	13353	13360	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
46	NC_022440	TA	3	6	13791	13796	50 %	50 %	0 %	0 %	545631685
47	NC_022440	CT	3	6	14190	14195	0 %	50 %	0 %	50 %	545631685
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49	NC_022440	TC	3	6	14618	14623	0 %	50 %	0 %	50 %	545631685
50	NC_022440	AT	3	6	15229	15234	50 %	50 %	0 %	0 %	545631685
51	NC_022440	TG	3	6	15266	15271	0 %	50 %	50 %	0 %	545631685
52	NC_022440	TA	3	6	15477	15482	50 %	50 %	0 %	0 %	545631686
53	NC_022440	GT	3	6	17260	17265	0 %	50 %	50 %	0 %	545631687
54	NC_022440	TC	4	8	17271	17278	0 %	50 %	0 %	50 %	545631687
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60	NC_022440	GA	3	6	21884	21889	50 %	0 %	50 %	0 %	545631691
61	NC_022440	CA	3	6	23277	23282	50 %	0 %	0 %	50 %	545631691
62	NC_022440	AG	3	6	23961	23966	50 %	0 %	50 %	0 %	545631692
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65	NC_022440	GC	3	6	28036	28041	0 %	0 %	50 %	50 %	545631693
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69	NC_022440	AG	3	6	29877	29882	50 %	0 %	50 %	0 %	545631696
70	NC_022440	CA	4	8	30319	30326	50 %	0 %	0 %	50 %	545631696
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72	NC_022440	GA	3	6	30747	30752	50 %	0 %	50 %	0 %	545631697
73	NC_022440	GA	3	6	32111	32116	50 %	0 %	50 %	0 %	545631699
74	NC_022440	GT	3	6	32158	32163	0 %	50 %	50 %	0 %	545631699
75	NC_022440	AG	3	6	32629	32634	50 %	0 %	50 %	0 %	545631699
76	NC_022440	GA	3	6	32913	32918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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81	NC_022440	AT	3	6	33535	33540	50 %	50 %	0 %	0 %	545631701
82	NC_022440	AG	3	6	34002	34007	50 %	0 %	50 %	0 %	545631702
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88	NC_022440	AT	3	6	38116	38121	50 %	50 %	0 %	0 %	545631704
89	NC_022440	AT	3	6	42450	42455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022440	CT	3	6	42602	42607	0 %	50 %	0 %	50 %	545631710
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92	NC_022440	CA	3	6	42874	42879	50 %	0 %	0 %	50 %	545631710
93	NC_022440	GA	5	10	43005	43014	50 %	0 %	50 %	0 %	545631710
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95	NC_022440	GT	3	6	43459	43464	0 %	50 %	50 %	0 %	545631711
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102	NC_022440	AT	3	6	49478	49483	50 %	50 %	0 %	0 %	545631716
103	NC_022440	TA	3	6	50245	50250	50 %	50 %	0 %	0 %	545631716
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107	NC_022440	TC	3	6	55157	55162	0 %	50 %	0 %	50 %	545631721
108	NC_022440	TC	3	6	55561	55566	0 %	50 %	0 %	50 %	545631721
109	NC_022440	GA	3	6	55705	55710	50 %	0 %	50 %	0 %	545631722
110	NC_022440	TC	3	6	56120	56125	0 %	50 %	0 %	50 %	545631722
111	NC_022440	AT	3	6	56443	56448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022440	AG	3	6	56676	56681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022440	GC	3	6	56785	56790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022440	AG	3	6	57228	57233	50 %	0 %	50 %	0 %	545631723
115	NC_022440	TA	3	6	57425	57430	50 %	50 %	0 %	0 %	545631723
116	NC_022440	AC	3	6	58127	58132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022440	TG	3	6	58192	58197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022440	TG	3	6	58440	58445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022440	GT	3	6	59100	59105	0 %	50 %	50 %	0 %	545631724
120	NC_022440	GA	3	6	59351	59356	50 %	0 %	50 %	0 %	545631724
121	NC_022440	AG	3	6	59692	59697	50 %	0 %	50 %	0 %	545631724
122	NC_022440	CT	3	6	60145	60150	0 %	50 %	0 %	50 %	545631724
123	NC_022440	CT	3	6	60912	60917	0 %	50 %	0 %	50 %	545631724
124	NC_022440	TG	3	6	61530	61535	0 %	50 %	50 %	0 %	545631724
125	NC_022440	AG	3	6	61691	61696	50 %	0 %	50 %	0 %	545631724
126	NC_022440	GA	3	6	61753	61758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022440	TA	3	6	62205	62210	50 %	50 %	0 %	0 %	545631725
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135	NC_022440	GT	3	6	65529	65534	0 %	50 %	50 %	0 %	545631728
136	NC_022440	AG	3	6	65613	65618	50 %	0 %	50 %	0 %	545631728
137	NC_022440	AG	3	6	65679	65684	50 %	0 %	50 %	0 %	545631728
138	NC_022440	GA	3	6	65882	65887	50 %	0 %	50 %	0 %	545631728
139	NC_022440	TA	3	6	66721	66726	50 %	50 %	0 %	0 %	545631729
140	NC_022440	AC	3	6	66846	66851	50 %	0 %	0 %	50 %	545631729
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144	NC_022440	AG	3	6	68701	68706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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