MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Chlamydia pecorum W73

Total Repeats: 418

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022440	GGTAAA	2	12	2009	2020	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545631678
2	NC_022440	TGAAGA	2	12	12806	12817	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545631684
3	NC_022440	TATGGA	2	12	14916	14927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631685
4	NC_022440	AAAAGA	2	12	18952	18963	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545631689
5	NC_022440	GAAAGC	2	12	22492	22503	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545631691
6	NC_022440	CAGAAG	2	12	22592	22603	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545631691
7	NC_022440	CACCTA	2	12	24472	24483	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545631692
8	NC_022440	CATAAG	2	12	24826	24837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545631692
9	NC_022440	ATTAAG	2	12	25028	25039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545631692
10	NC_022440	TAAAAA	2	12	26257	26268	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022440	CAGGGA	2	12	26643	26654	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	545631693
12	NC_022440	CTGGGT	2	12	28254	28265	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	545631693
13	NC_022440	TTTTTC	2	12	33713	33724	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545631702
14	NC_022440	CATCTG	2	12	35480	35491	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545631703
15	NC_022440	TTTTTA	2	12	38423	38434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022440	AAAAAG	2	12	39537	39548	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545631706
17	NC_022440	AGAAAA	2	12	42204	42215	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545631709
18	NC_022440	CTTTCT	2	12	46517	46528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631714
19	NC_022440	TAAGAA	2	12	48543	48554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545631716
20	NC_022440	AGATGC	2	12	49083	49094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545631716
21	NC_022440	GCGTTT	2	12	50004	50015	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631716
22	NC_022440	TCGTCA	2	12	50473	50484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545631716
23	NC_022440	TCATAT	2	12	58362	58373	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022440	CCTCTT	2	12	60557	60568	0 %	50 %	0 %	50 %	545631724
25	NC_022440	GATGCT	2	12	62498	62509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631725
26	NC_022440	TTTCTG	2	12	68682	68693	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022440	TTTTGT	2	12	75894	75905	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022440	TTAAAA	2	12	75944	75955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022440	AGCTGC	2	12	76057	76068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545631738
30	NC_022440	TCTTTA	2	12	81100	81111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545631742
31	NC_022440	TTTCTT	2	12	83701	83712	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545631746
32	NC_022440	TGTTTA	2	12	84611	84622	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022440	CGATAT	2	12	87949	87960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545631748
34	NC_022440	TCCATT	2	12	88179	88190	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545631748
35	NC_022440	AAGCAA	2	12	89866	89877	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545631749
36	NC_022440	GGAATC	2	12	90761	90772	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022440	CAGAAT	2	12	94498	94509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545631752
38	NC_022440	CAAAAT	2	12	96673	96684	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545631755
39	NC_022440	TTCTAA	2	12	101443	101454	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545631761
40	NC_022440	TGAGGT	2	12	105432	105443	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545631766
41	NC_022440	TCAAGC	2	12	115009	115020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545631785
42	NC_022440	GAAGTT	2	12	115250	115261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631785
43	NC_022440	TTCTGA	2	12	122908	122919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545631795
44	NC_022440	ATATGA	2	12	123994	124005	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545631795
45	NC_022440	TTTGTA	2	12	126770	126781	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545631797
46	NC_022440	AAAGGA	2	12	133778	133789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631802
47	NC_022440	TTAATA	2	12	135728	135739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022440	TTCTTT	2	12	135748	135759	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022440	TTATCG	2	12	135889	135900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545631805
50	NC_022440	AGATTT	2	12	136234	136245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545631805
51	NC_022440	CTGTAG	2	12	141777	141788	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631811
52	NC_022440	TGTTTC	2	12	143139	143150	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	545631812
53	NC_022440	TTTGTA	2	12	144303	144314	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545631812
54	NC_022440	TTTGAT	2	12	144527	144538	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545631813
55	NC_022440	CTTAGG	2	12	147546	147557	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631814
56	NC_022440	AGGAGA	2	12	150908	150919	50 %	0 %	50 %	0 %	545631817
57	NC_022440	ATAAGG	2	12	151585	151596	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545631817
58	NC_022440	ATGGAT	2	12	154380	154391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631821
59	NC_022440	GTTGCT	2	12	158367	158378	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631826
60	NC_022440	CAGAAG	2	12	159144	159155	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545631826
61	NC_022440	GGAAAA	2	12	159860	159871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631826
62	NC_022440	AGAAAA	2	12	160025	160036	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545631826
63	NC_022440	GGAGAG	2	12	161320	161331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631827
64	NC_022440	GTTGCC	2	12	164669	164680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631831
65	NC_022440	CAAGAG	2	12	164926	164937	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545631832
66	NC_022440	GATTTG	2	12	168428	168439	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631836
67	NC_022440	ATGGTG	2	12	171370	171381	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545631839
68	NC_022440	AGCTCC	2	12	172172	172183	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545631839
69	NC_022440	TTTTCC	2	12	177309	177320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631844
70	NC_022440	AATAAA	2	12	177637	177648	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545631844
71	NC_022440	GCTAGA	2	12	191228	191239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545631852
72	NC_022440	AAAGAA	2	12	198137	198148	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545631859
73	NC_022440	TTGTGC	2	12	198709	198720	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631860
74	NC_022440	TGCTGT	2	12	199697	199708	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631862
75	NC_022440	CCATTT	3	18	210316	210333	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545631872
76	NC_022440	TTGAGT	2	12	210735	210746	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631872
77	NC_022440	TGCAGC	4	24	211920	211943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545631872
78	NC_022440	TCATGG	2	12	213561	213572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631873
79	NC_022440	ATTTCT	2	12	220205	220216	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022440	GAGAGG	2	12	220977	220988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631881
81	NC_022440	CTCTTC	2	12	221476	221487	0 %	50 %	0 %	50 %	545631881
82	NC_022440	GGAGTG	2	12	222064	222075	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	545631882
83	NC_022440	TGAGTT	2	12	226164	226175	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022440	ATGTGT	2	12	226892	226903	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631886
85	NC_022440	CTCCTA	2	12	227403	227414	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022440	TAAAGA	2	12	229577	229588	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545631888
87	NC_022440	GGATTT	2	12	234289	234300	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631894
88	NC_022440	AAGCTG	2	12	236784	236795	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545631895
89	NC_022440	ACGCTA	2	12	243871	243882	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545631904
90	NC_022440	GGAGCA	2	12	243919	243930	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	545631904
91	NC_022440	CAAATC	2	12	247348	247359	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	545631907
92	NC_022440	CTGTAG	2	12	248301	248312	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631908
93	NC_022440	AGATAG	2	12	251707	251718	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545631911
94	NC_022440	CGAAAA	2	12	254487	254498	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545631912
95	NC_022440	AGAGAA	2	12	258337	258348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022440	TTATTG	2	12	258460	258471	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545631917
97	NC_022440	GAAAAT	2	12	262795	262806	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545631920
98	NC_022440	TTCTGT	2	12	267493	267504	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	545631925
99	NC_022440	CCCTCC	2	12	267706	267717	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	545631925
100	NC_022440	TTCATT	2	12	267918	267929	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545631926
101	NC_022440	GGAGAA	2	12	273819	273830	50 %	0 %	50 %	0 %	545631930
102	NC_022440	TTCGTA	2	12	275116	275127	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545631931
103	NC_022440	GGCGTA	2	12	280764	280775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545631934
104	NC_022440	AGCTAT	2	12	284764	284775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545631936
105	NC_022440	GTAATT	2	12	286348	286359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545631937
106	NC_022440	GTAGAG	2	12	287923	287934	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545631938
107	NC_022440	GTATGC	2	12	288408	288419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631938
108	NC_022440	TTTGGG	2	12	288506	288517	0 %	50 %	50 %	0 %	545631938
109	NC_022440	TTGATT	2	12	290280	290291	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545631938
110	NC_022440	GGAATG	2	12	290841	290852	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022440	GGTGTG	2	12	293433	293444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545631939
112	NC_022440	GGTTGA	2	12	296033	296044	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545631940
113	NC_022440	GTTCCT	2	12	296220	296231	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	545631940
114	NC_022440	GCTACA	2	12	298226	298237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545631941
115	NC_022440	GGTTAT	2	12	304755	304766	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631944
116	NC_022440	TTTAGC	2	12	305609	305620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545631945
117	NC_022440	AGAAAG	2	12	307993	308004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631945
118	NC_022440	GATAGG	2	12	308177	308188	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545631945
119	NC_022440	GAATAA	2	12	308925	308936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022440	TGTTTG	2	12	309995	310006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631946
121	NC_022440	GCAATC	2	12	310800	310811	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545631946
122	NC_022440	GCCATT	2	12	311351	311362	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545631946
123	NC_022440	GCTTGT	2	12	313297	313308	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631947
124	NC_022440	ACAAAA	2	12	314568	314579	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_022440	GCAAAC	2	12	318373	318384	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545631949
126	NC_022440	CAATAG	2	12	319517	319528	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545631949
127	NC_022440	TAGCTT	2	12	319943	319954	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545631949
128	NC_022440	GTCGTT	2	12	321163	321174	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631949
129	NC_022440	GTCGTA	2	12	321232	321243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631949
130	NC_022440	CTGCGA	3	18	321576	321593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545631949
131	NC_022440	CTCTGG	2	12	321594	321605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631949
132	NC_022440	GCCCTT	2	12	326980	326991	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	545631954
133	NC_022440	CAAGAA	2	12	327593	327604	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545631955
134	NC_022440	CTTGAA	2	12	328791	328802	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545631956
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136	NC_022440	CCTCAG	2	12	338220	338231	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545631964
137	NC_022440	TAATTC	2	12	344516	344527	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545631970
138	NC_022440	TCAGGA	2	12	348625	348636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545631973
139	NC_022440	AGGAGA	2	12	353758	353769	50 %	0 %	50 %	0 %	545631978
140	NC_022440	TCAGAA	2	12	353933	353944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545631978
141	NC_022440	GCAGAA	2	12	358561	358572	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545631982
142	NC_022440	GCTGGA	2	12	358666	358677	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545631982
143	NC_022440	TTTAGG	2	12	359893	359904	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631983
144	NC_022440	TTTAGA	2	12	360448	360459	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545631983
145	NC_022440	TCAATC	2	12	368595	368606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631990
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147	NC_022440	TTTATG	2	12	372939	372950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022440	ATGGGG	2	12	373181	373192	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	545631996
149	NC_022440	ATTTTA	2	12	376018	376029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631998
150	NC_022440	GACAGC	2	12	377001	377012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631999
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152	NC_022440	AAGGAA	2	12	385282	385293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632007
153	NC_022440	CAGCTC	2	12	386046	386057	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632007
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155	NC_022440	AGCTTG	2	12	391342	391353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545632010
156	NC_022440	AACTTT	2	12	392702	392713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545632014
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160	NC_022440	TTTTTC	2	12	399302	399313	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_022440	AGCCTT	2	12	399777	399788	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632022
162	NC_022440	TAGAGA	2	12	403734	403745	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022440	TGTCGG	2	12	403914	403925	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	545632026
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174	NC_022440	AAAAAT	2	12	442517	442528	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_022440	TTCATT	2	12	449825	449836	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632069
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203	NC_022440	ATAGCC	2	12	521483	521494	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632129
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211	NC_022440	CCTATG	2	12	558044	558055	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632161
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219	NC_022440	ATTTTT	2	12	579188	579199	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_022440	CAGAGA	2	12	581749	581760	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545632187
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222	NC_022440	TTGCCA	2	12	585101	585112	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632191
223	NC_022440	GATAAA	2	12	589020	589031	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632195
224	NC_022440	TCTATG	2	12	589585	589596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
225	NC_022440	CTATCC	2	12	591978	591989	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	545632199
226	NC_022440	TATCTT	2	12	594092	594103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632200
227	NC_022440	TTTTTG	2	12	596791	596802	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	545632202
228	NC_022440	TGAGGG	2	12	598891	598902	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
229	NC_022440	GGAAGT	2	12	598960	598971	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
230	NC_022440	GGATTA	2	12	598972	598983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
231	NC_022440	AGAAAA	2	12	599186	599197	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
232	NC_022440	AAATGT	2	12	600787	600798	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
233	NC_022440	CCTCTC	2	12	602873	602884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632203
234	NC_022440	TCCTAT	2	12	603084	603095	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632203
235	NC_022440	AAAACT	2	12	603417	603428	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545632203
236	NC_022440	TTTAAG	2	12	603495	603506	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545632203
237	NC_022440	TGATTT	2	12	603759	603770	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545632203
238	NC_022440	GAGATG	2	12	604321	604332	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545632203
239	NC_022440	GATATC	2	12	604576	604587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632203
240	NC_022440	TAAAGC	2	12	604788	604799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545632203
241	NC_022440	CAAAAA	2	12	608306	608317	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	545632203
242	NC_022440	ACACAG	2	12	611171	611182	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632203
243	NC_022440	GGTGAT	2	12	615623	615634	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545632205
244	NC_022440	CTTCCC	2	12	615667	615678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632205
245	NC_022440	AAGGAA	2	12	619517	619528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632206
246	NC_022440	GCAACA	2	12	621851	621862	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632206
247	NC_022440	TCCTCT	2	12	626593	626604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
248	NC_022440	GAAGGG	2	12	627565	627576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
249	NC_022440	CGAGTA	2	12	627726	627737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_022440	TAAAGG	2	12	628275	628286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545632207
251	NC_022440	CGCATA	2	12	629587	629598	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632208
252	NC_022440	AAAATA	2	12	631547	631558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545632210
253	NC_022440	ACCTCC	2	12	632969	632980	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	545632211
254	NC_022440	TTCGCT	2	12	633035	633046	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	545632211
255	NC_022440	CAAAAA	2	12	634222	634233	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	545632213
256	NC_022440	GCTCCA	2	12	636387	636398	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632215
257	NC_022440	GCTCCA	2	12	636402	636413	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632215
258	NC_022440	GCTCCA	3	18	636417	636434	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632215
259	NC_022440	GCTCCA	2	12	636438	636449	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632215
260	NC_022440	GCTCCA	2	12	636453	636464	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632215
261	NC_022440	TCTTGT	2	12	637829	637840	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	545632217
262	NC_022440	AGCAAC	2	12	638757	638768	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632217
263	NC_022440	CGCAAC	2	12	639493	639504	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	545632218
264	NC_022440	CTCTCC	2	12	639788	639799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632218
265	NC_022440	CAAGCC	2	12	640103	640114	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	545632218
266	NC_022440	GTTCCA	2	12	644780	644791	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632221
267	NC_022440	TTGCAG	2	12	644874	644885	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545632221
268	NC_022440	ATTAGC	2	12	648413	648424	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632225
269	NC_022440	CTCAAC	2	12	651493	651504	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545632227
270	NC_022440	CTTGCG	2	12	653653	653664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632228
271	NC_022440	CTTGCC	2	12	656002	656013	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	545632231
272	NC_022440	AGAATA	2	12	659233	659244	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_022440	ACTACA	2	12	660809	660820	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	545632234
274	NC_022440	AACCAC	2	12	660873	660884	50 %	0 %	0 %	50 %	545632234
275	NC_022440	CAGCCC	2	12	664586	664597	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	545632237
276	NC_022440	TAAAGA	2	12	667089	667100	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632238
277	NC_022440	AATAAA	2	12	667615	667626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_022440	TCCTCT	2	12	668404	668415	0 %	50 %	0 %	50 %	545632239
279	NC_022440	GTTTAA	2	12	669049	669060	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545632240
280	NC_022440	ATATGC	2	12	670853	670864	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632241
281	NC_022440	CCATAG	2	12	671980	671991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632241
282	NC_022440	TTCCCT	2	12	672557	672568	0 %	50 %	0 %	50 %	545632241
283	NC_022440	TTTCCA	2	12	676282	676293	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632242
284	NC_022440	AAAATT	2	12	679236	679247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_022440	TTTTTG	2	12	680049	680060	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	545632245
286	NC_022440	GACAAA	2	12	680632	680643	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545632245
287	NC_022440	AAAAGA	2	12	681168	681179	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
288	NC_022440	AAGATA	2	12	682599	682610	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632247
289	NC_022440	TAAAAA	2	12	683182	683193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545632247
290	NC_022440	TCGCAT	2	12	684828	684839	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632247
291	NC_022440	ATGGCC	2	12	688504	688515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545632251
292	NC_022440	CTGTAT	2	12	692465	692476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545632256
293	NC_022440	AATATG	2	12	697764	697775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545632260
294	NC_022440	TATTCT	2	12	701160	701171	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632263
295	NC_022440	CGAGCA	2	12	705452	705463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632268
296	NC_022440	CCTTAT	2	12	709682	709693	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632273
297	NC_022440	ATTTCT	2	12	711087	711098	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632275
298	NC_022440	TATTTT	2	12	711216	711227	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	545632275
299	NC_022440	TATCCG	2	12	717021	717032	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632277
300	NC_022440	ATTGTA	2	12	720223	720234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545632280
301	NC_022440	CACTCT	2	12	721570	721581	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	545632281
302	NC_022440	CAAGCA	2	12	722074	722085	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632282
303	NC_022440	TCCTAA	2	12	730217	730228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632289
304	NC_022440	ATCAGG	2	12	731885	731896	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545632289
305	NC_022440	TTATCT	2	12	733461	733472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632289
306	NC_022440	ACAGCA	2	12	740332	740343	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632291
307	NC_022440	TTAACC	2	12	742156	742167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632294
308	NC_022440	AGCTAA	2	12	748946	748957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545632299
309	NC_022440	ATATAA	2	12	756131	756142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632304
310	NC_022440	GCAACA	2	12	760998	761009	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632307
311	NC_022440	AACTCT	2	12	761353	761364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_022440	AAACCA	2	12	762533	762544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632310
313	NC_022440	CAACTT	2	12	765472	765483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632313
314	NC_022440	TTCTTA	2	12	769248	769259	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632317
315	NC_022440	AGCTCT	2	12	771337	771348	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632320
316	NC_022440	AAAATA	2	12	774063	774074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545632323
317	NC_022440	GAGCAA	2	12	781782	781793	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545632329
318	NC_022440	GAAGAG	2	12	786763	786774	50 %	0 %	50 %	0 %	545632334
319	NC_022440	GATCCC	2	12	786945	786956	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632334
320	NC_022440	TGGGCA	2	12	790946	790957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545632339
321	NC_022440	CGGAAT	2	12	796857	796868	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545632344
322	NC_022440	GTGCTG	2	12	797282	797293	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	545632345
323	NC_022440	TACCAA	2	12	797953	797964	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	545632345
324	NC_022440	TCCTAT	2	12	798871	798882	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632346
325	NC_022440	TAACTT	2	12	802201	802212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
326	NC_022440	AAGCAG	2	12	806739	806750	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545632352
327	NC_022440	AGATCA	2	12	809175	809186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545632354
328	NC_022440	TTAGGA	2	12	812823	812834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632358
329	NC_022440	ACTATT	2	12	817354	817365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545632360
330	NC_022440	TTCTTT	2	12	823829	823840	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545632367
331	NC_022440	TCATTA	2	12	824915	824926	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545632368
332	NC_022440	TGAGGT	2	12	830547	830558	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545632376
333	NC_022440	AGGAAT	2	12	833175	833186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545632377
334	NC_022440	ATTTAA	2	12	842178	842189	50 %	50 %	0 %	0 %	545632386
335	NC_022440	TAACAT	2	12	843891	843902	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545632388
336	NC_022440	TAAAAA	2	12	844702	844713	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
337	NC_022440	GCAGCT	2	12	849867	849878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545632392
338	NC_022440	TTTAAA	2	12	850363	850374	50 %	50 %	0 %	0 %	545632393
339	NC_022440	CAAGTT	2	12	853204	853215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632394
340	NC_022440	CCGATA	2	12	856566	856577	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632396
341	NC_022440	CTATAG	2	12	856780	856791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632396
342	NC_022440	CATACC	2	12	860187	860198	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545632399
343	NC_022440	GCAATT	2	12	862743	862754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632402
344	NC_022440	TCTTCA	2	12	863823	863834	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632402
345	NC_022440	ATCCCC	2	12	865020	865031	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	545632403
346	NC_022440	AAAGTA	2	12	866859	866870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632404
347	NC_022440	TGAAAA	2	12	869681	869692	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632406
348	NC_022440	TAATAC	2	12	869765	869776	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545632406
349	NC_022440	CTGCAA	2	12	875938	875949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632408
350	NC_022440	CTTCGT	2	12	879228	879239	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	545632411
351	NC_022440	AAGTAA	2	12	886692	886703	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632417
352	NC_022440	GATTTA	2	12	888995	889006	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
353	NC_022440	TGAAGT	2	12	889122	889133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632422
354	NC_022440	ATTTAC	2	12	890268	890279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545632422
355	NC_022440	ATTTGG	2	12	891311	891322	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
356	NC_022440	TCTATC	2	12	907008	907019	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632436
357	NC_022440	AAAAAT	2	12	909471	909482	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
358	NC_022440	TCAAGC	2	12	910622	910633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632440
359	NC_022440	AAGAAT	2	12	919055	919066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632447
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364	NC_022440	TTTTTC	2	12	927461	927472	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
365	NC_022440	CTAAAG	2	12	935116	935127	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545632464
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372	NC_022440	TCCTTA	2	12	962783	962794	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
373	NC_022440	ATAAAA	2	12	971776	971787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545632487
374	NC_022440	ATTTGT	2	12	972439	972450	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545632487
375	NC_022440	TATTTT	2	12	977550	977561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	545632492
376	NC_022440	GCCATT	2	12	978969	978980	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632493
377	NC_022440	TGCCAT	2	12	978995	979006	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632493
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380	NC_022440	AGGAAA	2	12	981423	981434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632495
381	NC_022440	CCCCCT	2	12	987909	987920	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	545632503
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386	NC_022440	CTAAAA	2	12	1000855	1000866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545632512
387	NC_022440	TCTGAT	2	12	1002528	1002539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545632512
388	NC_022440	ACTATA	2	12	1004436	1004447	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
389	NC_022440	TAAAGA	2	12	1005091	1005102	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632514
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393	NC_022440	ACCATC	2	12	1021749	1021760	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545632525
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402	NC_022440	TCCTAA	2	12	1043601	1043612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632547
403	NC_022440	AGGAGC	2	12	1044597	1044608	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	545632548
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.