MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 23515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022439	TAGA	2	8	69539	69546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_022439	TAT	2	6	69621	69626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630810
1503	NC_022439	GAG	2	6	69688	69693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630810
1504	NC_022439	ATCC	2	8	69733	69740	25 %	25 %	0 %	50 %	545630810
1505	NC_022439	GTA	2	6	69745	69750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630810
1506	NC_022439	AG	3	6	69751	69756	50 %	0 %	50 %	0 %	545630810
1507	NC_022439	TAT	2	6	69781	69786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630810
1508	NC_022439	TGT	2	6	69849	69854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630810
1509	NC_022439	ATG	2	6	69865	69870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630810
1510	NC_022439	GAT	2	6	69874	69879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630810
1511	NC_022439	TGC	2	6	69882	69887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630810
1512	NC_022439	TCAT	2	8	69962	69969	25 %	50 %	0 %	25 %	545630810
1513	NC_022439	AGC	2	6	70148	70153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630810
1514	NC_022439	CTT	2	6	70201	70206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630810
1515	NC_022439	CAA	2	6	70222	70227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630810
1516	NC_022439	A	6	6	70265	70270	100 %	0 %	0 %	0 %	545630810
1517	NC_022439	GAG	2	6	70399	70404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630810
1518	NC_022439	CTT	2	6	70470	70475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_022439	T	6	6	70493	70498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_022439	AAC	2	6	70507	70512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_022439	GAA	2	6	70554	70559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_022439	TTC	2	6	70697	70702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630811
1523	NC_022439	TAA	2	6	70784	70789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545630811
1524	NC_022439	GAG	2	6	70810	70815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630811
1525	NC_022439	AAT	2	6	71018	71023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545630811
1526	NC_022439	CTG	2	6	71066	71071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630811
1527	NC_022439	C	6	6	71075	71080	0 %	0 %	0 %	100 %	545630811
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1530	NC_022439	AGA	2	6	71300	71305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630811
1531	NC_022439	TTG	2	6	71464	71469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630811
1532	NC_022439	CAGC	2	8	71486	71493	25 %	0 %	25 %	50 %	545630811
1533	NC_022439	GTA	3	9	71504	71512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630811
1534	NC_022439	AG	3	6	71516	71521	50 %	0 %	50 %	0 %	545630811
1535	NC_022439	CTT	2	6	71579	71584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630812
1536	NC_022439	CT	3	6	71593	71598	0 %	50 %	0 %	50 %	545630812
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1539	NC_022439	AAG	2	6	71748	71753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630812
1540	NC_022439	T	6	6	71804	71809	0 %	100 %	0 %	0 %	545630812
1541	NC_022439	TGT	2	6	71870	71875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630812
1542	NC_022439	ATC	2	6	71881	71886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630812
1543	NC_022439	CCT	2	6	72040	72045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630812
1544	NC_022439	TGA	2	6	72085	72090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630812
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1547	NC_022439	GA	4	8	72140	72147	50 %	0 %	50 %	0 %	545630812
1548	NC_022439	GTT	3	9	72176	72184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630812
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1550	NC_022439	GAG	2	6	72339	72344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630812
1551	NC_022439	GAA	2	6	72347	72352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630812
1552	NC_022439	GTGC	2	8	72353	72360	0 %	25 %	50 %	25 %	545630812
1553	NC_022439	TTG	2	6	72408	72413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630812
1554	NC_022439	TAT	2	6	72548	72553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_022439	AGT	2	6	72634	72639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630813
1556	NC_022439	A	6	6	72731	72736	100 %	0 %	0 %	0 %	545630813
1557	NC_022439	A	6	6	72757	72762	100 %	0 %	0 %	0 %	545630813
1558	NC_022439	ATC	2	6	72774	72779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630813
1559	NC_022439	GTT	2	6	72790	72795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630813
1560	NC_022439	ATT	2	6	72827	72832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630813
1561	NC_022439	AGA	2	6	72862	72867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630813
1562	NC_022439	GGA	2	6	72916	72921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630813
1563	NC_022439	T	6	6	72926	72931	0 %	100 %	0 %	0 %	545630813
1564	NC_022439	AAC	2	6	72967	72972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630813
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1566	NC_022439	TGT	2	6	73084	73089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630813
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1568	NC_022439	T	7	7	73112	73118	0 %	100 %	0 %	0 %	545630813
1569	NC_022439	TGA	2	6	73120	73125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630813
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1572	NC_022439	AGA	2	6	73234	73239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630813
1573	NC_022439	ATG	2	6	73316	73321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630814
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1585	NC_022439	TAG	2	6	73868	73873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630814
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1587	NC_022439	AGG	2	6	73965	73970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630814
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1589	NC_022439	AGAA	2	8	74028	74035	75 %	0 %	25 %	0 %	545630814
1590	NC_022439	ATG	2	6	74093	74098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630814
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1592	NC_022439	CTT	2	6	74324	74329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630814
1593	NC_022439	TGT	3	9	74361	74369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630814
1594	NC_022439	CATTA	2	10	74454	74463	40 %	40 %	0 %	20 %	545630814
1595	NC_022439	TTCT	2	8	74477	74484	0 %	75 %	0 %	25 %	545630814
1596	NC_022439	A	8	8	74530	74537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_022439	TC	4	8	74584	74591	0 %	50 %	0 %	50 %	545630815
1598	NC_022439	AAG	2	6	74640	74645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630815
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1601	NC_022439	A	6	6	74705	74710	100 %	0 %	0 %	0 %	545630815
1602	NC_022439	GCC	2	6	74714	74719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545630815
1603	NC_022439	GAC	2	6	74742	74747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630815
1604	NC_022439	TCGC	2	8	74856	74863	0 %	25 %	25 %	50 %	545630815
1605	NC_022439	GCTC	2	8	74878	74885	0 %	25 %	25 %	50 %	545630815
1606	NC_022439	GCTCT	2	10	74894	74903	0 %	40 %	20 %	40 %	545630815
1607	NC_022439	GAG	2	6	74930	74935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630815
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1610	NC_022439	ATG	2	6	74997	75002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630815
1611	NC_022439	GTC	2	6	75041	75046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630815
1612	NC_022439	TTA	2	6	75119	75124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630815
1613	NC_022439	CTT	2	6	75224	75229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630815
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1619	NC_022439	GCT	2	6	75638	75643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630815
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1621	NC_022439	CTTC	2	8	75808	75815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_022439	TG	4	8	75864	75871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_022439	GTT	2	6	75877	75882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_022439	TTTTGT	2	12	75904	75915	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_022439	TAA	2	6	75919	75924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_022439	ATTT	2	8	75946	75953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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