MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 23515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1003	NC_022439	AGA	2	6	45065	45070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630791
1004	NC_022439	ATC	2	6	45131	45136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630791
1005	NC_022439	CTT	2	6	45154	45159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630791
1006	NC_022439	TCT	4	12	45162	45173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630791
1007	NC_022439	A	6	6	45226	45231	100 %	0 %	0 %	0 %	545630791
1008	NC_022439	CTG	2	6	45235	45240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630791
1009	NC_022439	AGA	2	6	45251	45256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630791
1010	NC_022439	AGA	4	12	45269	45280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630791
1011	NC_022439	TGC	2	6	45308	45313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630791
1012	NC_022439	GCA	2	6	45464	45469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630791
1013	NC_022439	AGC	2	6	45605	45610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630791
1014	NC_022439	AAT	2	6	45624	45629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545630791
1015	NC_022439	AGC	2	6	45634	45639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630791
1016	NC_022439	GTG	2	6	45708	45713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545630791
1017	NC_022439	CAA	2	6	45819	45824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630791
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1019	NC_022439	CTTT	2	8	45932	45939	0 %	75 %	0 %	25 %	545630792
1020	NC_022439	AGA	2	6	45956	45961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630792
1021	NC_022439	GGC	2	6	46079	46084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545630792
1022	NC_022439	GT	3	6	46102	46107	0 %	50 %	50 %	0 %	545630792
1023	NC_022439	GA	3	6	46144	46149	50 %	0 %	50 %	0 %	545630792
1024	NC_022439	T	8	8	46152	46159	0 %	100 %	0 %	0 %	545630792
1025	NC_022439	AGA	3	9	46166	46174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630792
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1029	NC_022439	GCA	2	6	46481	46486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630792
1030	NC_022439	CTTTCT	2	12	46524	46535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630792
1031	NC_022439	AG	3	6	46637	46642	50 %	0 %	50 %	0 %	545630792
1032	NC_022439	CTC	2	6	46753	46758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630792
1033	NC_022439	CTCCC	2	10	46786	46795	0 %	20 %	0 %	80 %	545630792
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1037	NC_022439	CCTTG	2	10	46952	46961	0 %	40 %	20 %	40 %	545630792
1038	NC_022439	A	7	7	47065	47071	100 %	0 %	0 %	0 %	545630793
1039	NC_022439	GTG	2	6	47139	47144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545630793
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1041	NC_022439	TTTGG	2	10	47481	47490	0 %	60 %	40 %	0 %	545630793
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1045	NC_022439	CTTT	2	8	47643	47650	0 %	75 %	0 %	25 %	545630793
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1048	NC_022439	TAT	2	6	47943	47948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630793
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1053	NC_022439	AG	4	8	48074	48081	50 %	0 %	50 %	0 %	545630793
1054	NC_022439	T	6	6	48208	48213	0 %	100 %	0 %	0 %	545630793
1055	NC_022439	CTT	2	6	48250	48255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630793
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1057	NC_022439	TGA	2	6	48320	48325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630793
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1059	NC_022439	TTA	2	6	48478	48483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630793
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1064	NC_022439	CTG	2	6	48642	48647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630794
1065	NC_022439	TGC	2	6	48657	48662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630794
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1075	NC_022439	A	7	7	48960	48966	100 %	0 %	0 %	0 %	545630794
1076	NC_022439	A	7	7	49027	49033	100 %	0 %	0 %	0 %	545630794
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1082	NC_022439	CAT	2	6	49166	49171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630794
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1105	NC_022439	TA	4	8	50250	50257	50 %	50 %	0 %	0 %	545630794
1106	NC_022439	TCC	2	6	50404	50409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630794
1107	NC_022439	ATG	2	6	50474	50479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630794
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1109	NC_022439	CTTA	2	8	50560	50567	25 %	50 %	0 %	25 %	545630794
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1120	NC_022439	ATG	2	6	51223	51228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630794
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1122	NC_022439	GAA	2	6	51305	51310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022439	T	6	6	51347	51352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022439	T	6	6	51360	51365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022439	GTC	2	6	51424	51429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_022439	GCAAG	2	10	51602	51611	40 %	0 %	40 %	20 %	545630795
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1157	NC_022439	AAT	2	6	53133	53138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1159	NC_022439	AAC	2	6	53164	53169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1232	NC_022439	AT	3	6	56450	56455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1233	NC_022439	CTTGA	2	10	56468	56477	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1234	NC_022439	GAA	2	6	56507	56512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1235	NC_022439	ATT	2	6	56670	56675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1237	NC_022439	A	7	7	56706	56712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1238	NC_022439	AGA	2	6	56716	56721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_022439	A	6	6	57927	57932	100 %	0 %	0 %	0 %	545630801
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1387	NC_022439	GTT	2	6	64761	64766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630805
1388	NC_022439	TCC	2	6	64782	64787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630805
1389	NC_022439	GTT	2	6	64812	64817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630805
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1423	NC_022439	G	6	6	66238	66243	0 %	0 %	100 %	0 %	545630806
1424	NC_022439	TTG	2	6	66298	66303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630806
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1426	NC_022439	AAG	2	6	66545	66550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630806
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1432	NC_022439	AGA	2	6	66771	66776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630807
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1496	NC_022439	T	7	7	69350	69356	0 %	100 %	0 %	0 %	545630809
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1498	NC_022439	T	7	7	69430	69436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1499	NC_022439	A	8	8	69480	69487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_022439	TAA	2	6	69525	69530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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