MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022355	TTAAT	3	15	1948	1962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022355	AACAG	2	10	4797	4806	60 %	0 %	20 %	20 %	543950826
3	NC_022355	CGCTA	2	10	5369	5378	20 %	20 %	20 %	40 %	543950827
4	NC_022355	AAAGC	2	10	7103	7112	60 %	0 %	20 %	20 %	543950827
5	NC_022355	CAATT	2	10	8416	8425	40 %	40 %	0 %	20 %	543950827
6	NC_022355	AAAGC	2	10	9537	9546	60 %	0 %	20 %	20 %	543950827
7	NC_022355	ACTCA	2	10	10223	10232	40 %	20 %	0 %	40 %	543950827
8	NC_022355	TTTTA	2	10	11359	11368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022355	ATTTA	2	10	12762	12771	40 %	60 %	0 %	0 %	543950829
10	NC_022355	AATTT	2	10	14380	14389	40 %	60 %	0 %	0 %	543950831
11	NC_022355	ATAAA	2	10	14434	14443	80 %	20 %	0 %	0 %	543950831
12	NC_022355	AAAAC	2	10	14501	14510	80 %	0 %	0 %	20 %	543950831
13	NC_022355	CTCTT	2	10	17615	17624	0 %	60 %	0 %	40 %	543950834
14	NC_022355	ATTAA	2	10	20351	20360	60 %	40 %	0 %	0 %	543950837
15	NC_022355	AAATC	2	10	21760	21769	60 %	20 %	0 %	20 %	543950840
16	NC_022355	ACAAA	2	10	22134	22143	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022355	AATTA	2	10	22144	22153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022355	AAAAT	2	10	22218	22227	80 %	20 %	0 %	0 %	543950841
19	NC_022355	GAAAA	2	10	26058	26067	80 %	0 %	20 %	0 %	543950844
20	NC_022355	TATTT	2	10	29117	29126	20 %	80 %	0 %	0 %	543950849
21	NC_022355	CACAA	2	10	33137	33146	60 %	0 %	0 %	40 %	543950854
22	NC_022355	TTATT	2	10	34947	34956	20 %	80 %	0 %	0 %	543950855
23	NC_022355	AAAGC	2	10	35643	35652	60 %	0 %	20 %	20 %	543950856
24	NC_022355	TGAAA	2	10	38173	38182	60 %	20 %	20 %	0 %	543950859
25	NC_022355	AAAAT	2	10	40134	40143	80 %	20 %	0 %	0 %	543950861
26	NC_022355	TGACA	2	10	40723	40732	40 %	20 %	20 %	20 %	543950861
27	NC_022355	GCAAT	2	10	40897	40906	40 %	20 %	20 %	20 %	543950861
28	NC_022355	AAACA	2	10	41019	41028	80 %	0 %	0 %	20 %	543950861
29	NC_022355	GCAAT	2	10	41059	41068	40 %	20 %	20 %	20 %	543950861
30	NC_022355	TAAAA	2	10	42166	42175	80 %	20 %	0 %	0 %	543950862
31	NC_022355	ATTAA	2	10	42299	42308	60 %	40 %	0 %	0 %	543950862
32	NC_022355	TAATT	2	10	42322	42331	40 %	60 %	0 %	0 %	543950862
33	NC_022355	AAAGC	2	10	43604	43613	60 %	0 %	20 %	20 %	543950863
34	NC_022355	CGGTG	2	10	43999	44008	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022355	ATTTT	2	10	44216	44225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022355	AAAGC	2	10	45059	45068	60 %	0 %	20 %	20 %	543950864
37	NC_022355	GAAAG	2	10	46983	46992	60 %	0 %	40 %	0 %	543950866
38	NC_022355	GAAGC	2	10	47436	47445	40 %	0 %	40 %	20 %	543950867
39	NC_022355	GAATA	2	10	47752	47761	60 %	20 %	20 %	0 %	543950867
40	NC_022355	ATTAT	2	10	49879	49888	40 %	60 %	0 %	0 %	543950870
41	NC_022355	GATAA	2	10	52490	52499	60 %	20 %	20 %	0 %	543950874
42	NC_022355	AAAAT	2	10	53671	53680	80 %	20 %	0 %	0 %	543950875

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.