MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid

Total Repeats: 1247

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022354	ATT	2	6	18021	18026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950759
502	NC_022354	ATC	2	6	18045	18050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950759
503	NC_022354	GCTTT	2	10	18056	18065	0 %	60 %	20 %	20 %	543950759
504	NC_022354	T	7	7	18119	18125	0 %	100 %	0 %	0 %	543950759
505	NC_022354	AATTTT	2	12	18148	18159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950760
506	NC_022354	TCT	2	6	18182	18187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950760
507	NC_022354	T	8	8	18207	18214	0 %	100 %	0 %	0 %	543950760
508	NC_022354	TAG	2	6	18272	18277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950760
509	NC_022354	TAA	2	6	18318	18323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950760
510	NC_022354	CTT	2	6	18392	18397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950760
511	NC_022354	CCA	2	6	18404	18409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950760
512	NC_022354	ACC	2	6	18412	18417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950760
513	NC_022354	CTT	2	6	18428	18433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950760
514	NC_022354	AGT	2	6	18448	18453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950760
515	NC_022354	TCT	2	6	18485	18490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950760
516	NC_022354	CT	3	6	18493	18498	0 %	50 %	0 %	50 %	543950760
517	NC_022354	CCTT	2	8	18548	18555	0 %	50 %	0 %	50 %	543950760
518	NC_022354	ATC	2	6	18605	18610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950760
519	NC_022354	TAA	2	6	18751	18756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950760
520	NC_022354	A	6	6	18771	18776	100 %	0 %	0 %	0 %	543950760
521	NC_022354	AAAT	2	8	18783	18790	75 %	25 %	0 %	0 %	543950760
522	NC_022354	TA	3	6	18823	18828	50 %	50 %	0 %	0 %	543950760
523	NC_022354	AAATCA	2	12	18860	18871	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543950760
524	NC_022354	CTTAAT	2	12	18884	18895	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543950760
525	NC_022354	TAG	2	6	18951	18956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950760
526	NC_022354	ATC	2	6	19042	19047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950760
527	NC_022354	T	6	6	19062	19067	0 %	100 %	0 %	0 %	543950760
528	NC_022354	CTACAT	2	12	19128	19139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950760
529	NC_022354	ATAA	2	8	19191	19198	75 %	25 %	0 %	0 %	543950760
530	NC_022354	A	6	6	19234	19239	100 %	0 %	0 %	0 %	543950760
531	NC_022354	GTCT	2	8	19355	19362	0 %	50 %	25 %	25 %	543950760
532	NC_022354	CTT	2	6	19386	19391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950760
533	NC_022354	TAA	2	6	19477	19482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950760
534	NC_022354	CTT	2	6	19514	19519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950760
535	NC_022354	ATA	2	6	19586	19591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950760
536	NC_022354	AAAT	2	8	19606	19613	75 %	25 %	0 %	0 %	543950760
537	NC_022354	T	7	7	19617	19623	0 %	100 %	0 %	0 %	543950760
538	NC_022354	T	6	6	19666	19671	0 %	100 %	0 %	0 %	543950760
539	NC_022354	A	6	6	19698	19703	100 %	0 %	0 %	0 %	543950760
540	NC_022354	CAA	2	6	19704	19709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543950760
541	NC_022354	AAAG	2	8	19733	19740	75 %	0 %	25 %	0 %	543950760
542	NC_022354	ATT	2	6	19811	19816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950760
543	NC_022354	TTTA	2	8	19822	19829	25 %	75 %	0 %	0 %	543950760
544	NC_022354	A	7	7	19835	19841	100 %	0 %	0 %	0 %	543950760
545	NC_022354	TTA	2	6	19851	19856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950760
546	NC_022354	AAT	2	6	19891	19896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950760
547	NC_022354	TAT	2	6	19908	19913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950760
548	NC_022354	TC	3	6	19924	19929	0 %	50 %	0 %	50 %	543950761
549	NC_022354	AAAT	2	8	19955	19962	75 %	25 %	0 %	0 %	543950761
550	NC_022354	TGA	2	6	19985	19990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950761
551	NC_022354	T	6	6	20031	20036	0 %	100 %	0 %	0 %	543950761
552	NC_022354	TTC	2	6	20107	20112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950761
553	NC_022354	CCA	2	6	20144	20149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950761
554	NC_022354	A	6	6	20264	20269	100 %	0 %	0 %	0 %	543950761
555	NC_022354	AAT	2	6	20297	20302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950761
556	NC_022354	TTC	2	6	20335	20340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950761
557	NC_022354	TCT	2	6	20345	20350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950761
558	NC_022354	ATC	2	6	20365	20370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950761
559	NC_022354	GAT	3	9	20434	20442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950761
560	NC_022354	TCTT	2	8	20488	20495	0 %	75 %	0 %	25 %	543950761
561	NC_022354	TA	3	6	20496	20501	50 %	50 %	0 %	0 %	543950761
562	NC_022354	TTC	2	6	20512	20517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950761
563	NC_022354	ATC	2	6	20542	20547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950761
564	NC_022354	AAGA	2	8	20697	20704	75 %	0 %	25 %	0 %	543950761
565	NC_022354	T	6	6	20731	20736	0 %	100 %	0 %	0 %	543950761
566	NC_022354	ATC	2	6	20836	20841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950761
567	NC_022354	ATC	2	6	20869	20874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950761
568	NC_022354	ATCA	2	8	21029	21036	50 %	25 %	0 %	25 %	543950762
569	NC_022354	T	6	6	21037	21042	0 %	100 %	0 %	0 %	543950762
570	NC_022354	GTT	2	6	21104	21109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950762
571	NC_022354	ATC	2	6	21155	21160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950762
572	NC_022354	TCA	2	6	21243	21248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950762
573	NC_022354	ATA	2	6	21273	21278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950762
574	NC_022354	TCCAT	2	10	21321	21330	20 %	40 %	0 %	40 %	543950762
575	NC_022354	GCAA	2	8	21428	21435	50 %	0 %	25 %	25 %	543950762
576	NC_022354	TA	3	6	21482	21487	50 %	50 %	0 %	0 %	543950762
577	NC_022354	ATT	2	6	21692	21697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950762
578	NC_022354	CAA	2	6	21706	21711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543950762
579	NC_022354	TCA	2	6	21807	21812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950762
580	NC_022354	T	6	6	21817	21822	0 %	100 %	0 %	0 %	543950762
581	NC_022354	GAA	2	6	21831	21836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543950762
582	NC_022354	ATT	2	6	21881	21886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950762
583	NC_022354	TTC	2	6	21887	21892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950762
584	NC_022354	CTT	2	6	21901	21906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950762
585	NC_022354	GTT	2	6	21914	21919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950762
586	NC_022354	A	7	7	21954	21960	100 %	0 %	0 %	0 %	543950762
587	NC_022354	CCA	2	6	21972	21977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950762
588	NC_022354	T	7	7	22003	22009	0 %	100 %	0 %	0 %	543950762
589	NC_022354	GAT	2	6	22012	22017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950762
590	NC_022354	T	7	7	22017	22023	0 %	100 %	0 %	0 %	543950762
591	NC_022354	TG	3	6	22040	22045	0 %	50 %	50 %	0 %	543950762
592	NC_022354	TATT	2	8	22108	22115	25 %	75 %	0 %	0 %	543950763
593	NC_022354	TTTA	2	8	22151	22158	25 %	75 %	0 %	0 %	543950763
594	NC_022354	T	6	6	22164	22169	0 %	100 %	0 %	0 %	543950763
595	NC_022354	CTT	2	6	22209	22214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950763
596	NC_022354	T	6	6	22234	22239	0 %	100 %	0 %	0 %	543950763
597	NC_022354	CAT	2	6	22252	22257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950763
598	NC_022354	T	6	6	22268	22273	0 %	100 %	0 %	0 %	543950763
599	NC_022354	CTTT	2	8	22293	22300	0 %	75 %	0 %	25 %	543950763
600	NC_022354	CAG	2	6	22321	22326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543950763
601	NC_022354	TAT	2	6	22339	22344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950763
602	NC_022354	CAT	3	9	22369	22377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950763
603	NC_022354	TTA	2	6	22410	22415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950763
604	NC_022354	TTTA	2	8	22454	22461	25 %	75 %	0 %	0 %	543950763
605	NC_022354	T	7	7	22523	22529	0 %	100 %	0 %	0 %	543950763
606	NC_022354	TTA	2	6	22560	22565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950763
607	NC_022354	TAA	2	6	22612	22617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950763
608	NC_022354	GTTT	2	8	22625	22632	0 %	75 %	25 %	0 %	543950763
609	NC_022354	ATT	2	6	22691	22696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950763
610	NC_022354	TTG	2	6	22700	22705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950763
611	NC_022354	TAA	2	6	22798	22803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950763
612	NC_022354	TCA	2	6	22809	22814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950763
613	NC_022354	T	6	6	22845	22850	0 %	100 %	0 %	0 %	543950763
614	NC_022354	CAT	2	6	22867	22872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950763
615	NC_022354	AGA	2	6	22910	22915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543950763
616	NC_022354	A	6	6	22956	22961	100 %	0 %	0 %	0 %	543950763
617	NC_022354	TCA	2	6	23000	23005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950764
618	NC_022354	ATTCT	2	10	23045	23054	20 %	60 %	0 %	20 %	543950764
619	NC_022354	TGG	2	6	23103	23108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543950764
620	NC_022354	T	6	6	23135	23140	0 %	100 %	0 %	0 %	543950764
621	NC_022354	TAA	2	6	23142	23147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950764
622	NC_022354	T	6	6	23231	23236	0 %	100 %	0 %	0 %	543950764
623	NC_022354	AGTA	2	8	23314	23321	50 %	25 %	25 %	0 %	543950764
624	NC_022354	AAT	2	6	23322	23327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950764
625	NC_022354	GA	3	6	23376	23381	50 %	0 %	50 %	0 %	543950764
626	NC_022354	TCA	2	6	23423	23428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950764
627	NC_022354	GTA	2	6	23456	23461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950764
628	NC_022354	TTA	2	6	23472	23477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950764
629	NC_022354	AGTA	2	8	23503	23510	50 %	25 %	25 %	0 %	543950764
630	NC_022354	TTA	2	6	23576	23581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950764
631	NC_022354	TCAT	2	8	23643	23650	25 %	50 %	0 %	25 %	543950764
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