MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 genome

Total Repeats: 39440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_022353	ATC	2	6	127406	127411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949093
3003	NC_022353	T	7	7	127432	127438	0 %	100 %	0 %	0 %	543949093
3004	NC_022353	TTA	2	6	127455	127460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949093
3005	NC_022353	T	7	7	127472	127478	0 %	100 %	0 %	0 %	543949093
3006	NC_022353	CAA	2	6	127479	127484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543949093
3007	NC_022353	AG	3	6	127490	127495	50 %	0 %	50 %	0 %	543949093
3008	NC_022353	ATA	2	6	127605	127610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_022353	CAA	2	6	127627	127632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_022353	AAGG	2	8	127650	127657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_022353	AAAAG	2	10	127666	127675	80 %	0 %	20 %	0 %	543949094
3012	NC_022353	TTAT	2	8	127683	127690	25 %	75 %	0 %	0 %	543949094
3013	NC_022353	T	8	8	127724	127731	0 %	100 %	0 %	0 %	543949094
3014	NC_022353	A	7	7	127754	127760	100 %	0 %	0 %	0 %	543949094
3015	NC_022353	TCC	2	6	127761	127766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543949094
3016	NC_022353	TGT	2	6	127785	127790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949094
3017	NC_022353	A	6	6	127804	127809	100 %	0 %	0 %	0 %	543949094
3018	NC_022353	GAT	2	6	127831	127836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949094
3019	NC_022353	GAC	2	6	127876	127881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949094
3020	NC_022353	TTTTG	2	10	127986	127995	0 %	80 %	20 %	0 %	543949094
3021	NC_022353	T	7	7	128028	128034	0 %	100 %	0 %	0 %	543949094
3022	NC_022353	TAG	2	6	128069	128074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949094
3023	NC_022353	ATA	2	6	128075	128080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949094
3024	NC_022353	GGT	2	6	128128	128133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543949094
3025	NC_022353	GTT	2	6	128143	128148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949094
3026	NC_022353	TGA	2	6	128157	128162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949094
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3028	NC_022353	AAG	2	6	128231	128236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949094
3029	NC_022353	TAT	2	6	128341	128346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949094
3030	NC_022353	ATA	2	6	128444	128449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949094
3031	NC_022353	A	6	6	128546	128551	100 %	0 %	0 %	0 %	543949094
3032	NC_022353	ATTT	2	8	128570	128577	25 %	75 %	0 %	0 %	543949094
3033	NC_022353	TAT	2	6	128626	128631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949094
3034	NC_022353	TAA	2	6	128712	128717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949094
3035	NC_022353	GTT	2	6	128728	128733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949094
3036	NC_022353	TGC	2	6	128736	128741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543949094
3037	NC_022353	TA	3	6	128792	128797	50 %	50 %	0 %	0 %	543949094
3038	NC_022353	TTC	2	6	128814	128819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949094
3039	NC_022353	TAA	2	6	128847	128852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949094
3040	NC_022353	A	6	6	128962	128967	100 %	0 %	0 %	0 %	543949094
3041	NC_022353	ATA	2	6	128978	128983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949094
3042	NC_022353	ATG	2	6	128999	129004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949094
3043	NC_022353	A	6	6	129024	129029	100 %	0 %	0 %	0 %	543949094
3044	NC_022353	T	6	6	129144	129149	0 %	100 %	0 %	0 %	543949095
3045	NC_022353	ATGG	2	8	129330	129337	25 %	25 %	50 %	0 %	543949095
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3047	NC_022353	TGA	2	6	129365	129370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949095
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3049	NC_022353	TAA	2	6	129443	129448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949095
3050	NC_022353	CTA	2	6	129466	129471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949095
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3052	NC_022353	A	8	8	129549	129556	100 %	0 %	0 %	0 %	543949095
3053	NC_022353	TA	3	6	129558	129563	50 %	50 %	0 %	0 %	543949095
3054	NC_022353	T	6	6	129593	129598	0 %	100 %	0 %	0 %	543949095
3055	NC_022353	TCA	2	6	129806	129811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949095
3056	NC_022353	TACT	2	8	129823	129830	25 %	50 %	0 %	25 %	543949095
3057	NC_022353	AAG	2	6	129832	129837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949095
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3064	NC_022353	TA	3	6	130233	130238	50 %	50 %	0 %	0 %	543949096
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3090	NC_022353	TGA	2	6	131217	131222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949097
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3092	NC_022353	A	8	8	131252	131259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_022353	A	6	6	131272	131277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_022353	GT	3	6	131302	131307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_022353	GTT	2	6	131347	131352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_022353	GAA	2	6	131384	131389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_022353	GA	4	8	131416	131423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_022353	TA	3	6	131657	131662	50 %	50 %	0 %	0 %	543949098
3100	NC_022353	A	6	6	131716	131721	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
3101	NC_022353	A	6	6	131726	131731	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
3102	NC_022353	A	8	8	131769	131776	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
3103	NC_022353	A	6	6	131783	131788	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
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3107	NC_022353	GAA	2	6	131819	131824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949098
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3109	NC_022353	ATT	2	6	131870	131875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949098
3110	NC_022353	TTGTTA	2	12	131931	131942	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543949098
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3112	NC_022353	GAA	3	9	131957	131965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949098
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3114	NC_022353	GAA	2	6	131981	131986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949098
3115	NC_022353	A	6	6	131989	131994	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
3116	NC_022353	AT	3	6	132003	132008	50 %	50 %	0 %	0 %	543949098
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3120	NC_022353	A	6	6	132080	132085	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
3121	NC_022353	A	8	8	132087	132094	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
3122	NC_022353	TTG	2	6	132099	132104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949098
3123	NC_022353	A	6	6	132110	132115	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
3124	NC_022353	A	6	6	132126	132131	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
3125	NC_022353	T	6	6	132136	132141	0 %	100 %	0 %	0 %	543949098
3126	NC_022353	GAT	2	6	132173	132178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949098
3127	NC_022353	GTA	2	6	132188	132193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949098
3128	NC_022353	A	6	6	132242	132247	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
3129	NC_022353	AGA	2	6	132314	132319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949098
3130	NC_022353	A	6	6	132326	132331	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
3131	NC_022353	A	7	7	132348	132354	100 %	0 %	0 %	0 %	543949098
3132	NC_022353	AGA	2	6	132361	132366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949098
3133	NC_022353	GTAG	2	8	132368	132375	25 %	25 %	50 %	0 %	543949098
3134	NC_022353	GT	3	6	132399	132404	0 %	50 %	50 %	0 %	543949098
3135	NC_022353	AGTGA	2	10	132437	132446	40 %	20 %	40 %	0 %	543949098
3136	NC_022353	ATG	2	6	132470	132475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949098
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3139	NC_022353	GCT	2	6	132521	132526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543949098
3140	NC_022353	TGA	2	6	132562	132567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949098
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3142	NC_022353	TGA	2	6	132601	132606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949098
3143	NC_022353	CAT	2	6	132640	132645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949098
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3148	NC_022353	GAT	2	6	132869	132874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949098
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3153	NC_022353	AGC	2	6	132964	132969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949098
3154	NC_022353	AACTC	2	10	132988	132997	40 %	20 %	0 %	40 %	543949098
3155	NC_022353	AGCA	2	8	133153	133160	50 %	0 %	25 %	25 %	543949098
3156	NC_022353	GTG	2	6	133188	133193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543949098
3157	NC_022353	CTA	2	6	133200	133205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949098
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3160	NC_022353	TAA	2	6	133417	133422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949098
3161	NC_022353	CTA	2	6	133461	133466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949098
3162	NC_022353	TGA	2	6	133477	133482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949098
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3164	NC_022353	ATG	2	6	133593	133598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949098
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3166	NC_022353	AGG	2	6	133630	133635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543949098
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3183	NC_022353	A	6	6	134312	134317	100 %	0 %	0 %	0 %	543949099
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3193	NC_022353	GAT	2	6	134618	134623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949100
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3199	NC_022353	ATC	2	6	134810	134815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949100
3200	NC_022353	A	6	6	134862	134867	100 %	0 %	0 %	0 %	543949100
3201	NC_022353	CTA	2	6	134868	134873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949100
3202	NC_022353	A	7	7	134890	134896	100 %	0 %	0 %	0 %	543949100
3203	NC_022353	TA	3	6	134952	134957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3204	NC_022353	ATTAAA	2	12	134958	134969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3221	NC_022353	A	6	6	135440	135445	100 %	0 %	0 %	0 %	543949101
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3227	NC_022353	TGA	2	6	135553	135558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949101
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3229	NC_022353	TA	3	6	135656	135661	50 %	50 %	0 %	0 %	543949101
3230	NC_022353	CGG	2	6	135679	135684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543949101
3231	NC_022353	AAAAT	2	10	135686	135695	80 %	20 %	0 %	0 %	543949101
3232	NC_022353	AAAAT	2	10	135707	135716	80 %	20 %	0 %	0 %	543949101
3233	NC_022353	ATTTT	2	10	135733	135742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_022353	CTTAAA	2	12	135752	135763	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3235	NC_022353	ATT	2	6	135769	135774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949102
3236	NC_022353	ATTT	2	8	135830	135837	25 %	75 %	0 %	0 %	543949102
3237	NC_022353	CTT	2	6	135841	135846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949102
3238	NC_022353	TTA	2	6	135847	135852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949102
3239	NC_022353	TA	3	6	135860	135865	50 %	50 %	0 %	0 %	543949102
3240	NC_022353	T	6	6	135874	135879	0 %	100 %	0 %	0 %	543949102
3241	NC_022353	CTT	2	6	135910	135915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949102
3242	NC_022353	ATA	2	6	135917	135922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949102
3243	NC_022353	CAT	2	6	135952	135957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949102
3244	NC_022353	T	6	6	136024	136029	0 %	100 %	0 %	0 %	543949102
3245	NC_022353	TCT	2	6	136052	136057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949102
3246	NC_022353	T	6	6	136077	136082	0 %	100 %	0 %	0 %	543949102
3247	NC_022353	TCT	2	6	136107	136112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949102
3248	NC_022353	ATT	2	6	136154	136159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949102
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3250	NC_022353	TCT	2	6	136260	136265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949102
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3372	NC_022353	A	6	6	141414	141419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3373	NC_022353	AAAT	2	8	141445	141452	75 %	25 %	0 %	0 %	543949110
3374	NC_022353	A	6	6	141480	141485	100 %	0 %	0 %	0 %	543949110
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