MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 genome

Total Repeats: 39440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022353	AT	4	8	43337	43344	50 %	50 %	0 %	0 %	543949001
1002	NC_022353	ATC	2	6	43378	43383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949001
1003	NC_022353	ACT	2	6	43384	43389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949001
1004	NC_022353	A	6	6	43391	43396	100 %	0 %	0 %	0 %	543949001
1005	NC_022353	GAAAT	2	10	43397	43406	60 %	20 %	20 %	0 %	543949001
1006	NC_022353	TA	3	6	43610	43615	50 %	50 %	0 %	0 %	543949001
1007	NC_022353	TTG	2	6	43621	43626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949001
1008	NC_022353	AAAG	2	8	43633	43640	75 %	0 %	25 %	0 %	543949001
1009	NC_022353	AGA	2	6	43659	43664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949001
1010	NC_022353	TAT	2	6	43714	43719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949001
1011	NC_022353	AAAAG	2	10	43731	43740	80 %	0 %	20 %	0 %	543949001
1012	NC_022353	TAT	2	6	43885	43890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949001
1013	NC_022353	TAT	2	6	43931	43936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949001
1014	NC_022353	AAAT	2	8	43970	43977	75 %	25 %	0 %	0 %	543949001
1015	NC_022353	A	6	6	43988	43993	100 %	0 %	0 %	0 %	543949001
1016	NC_022353	AAAAT	2	10	44075	44084	80 %	20 %	0 %	0 %	543949001
1017	NC_022353	GAA	3	9	44119	44127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949001
1018	NC_022353	AAT	2	6	44147	44152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949001
1019	NC_022353	AGT	2	6	44163	44168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949002
1020	NC_022353	T	6	6	44168	44173	0 %	100 %	0 %	0 %	543949002
1021	NC_022353	A	8	8	44178	44185	100 %	0 %	0 %	0 %	543949002
1022	NC_022353	AAT	2	6	44190	44195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1023	NC_022353	GAA	2	6	44196	44201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949002
1024	NC_022353	TA	3	6	44220	44225	50 %	50 %	0 %	0 %	543949002
1025	NC_022353	AT	3	6	44258	44263	50 %	50 %	0 %	0 %	543949002
1026	NC_022353	AGT	2	6	44271	44276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949002
1027	NC_022353	TGT	2	6	44277	44282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949002
1028	NC_022353	ATA	2	6	44350	44355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1029	NC_022353	A	6	6	44391	44396	100 %	0 %	0 %	0 %	543949002
1030	NC_022353	TAAT	2	8	44407	44414	50 %	50 %	0 %	0 %	543949002
1031	NC_022353	TAA	2	6	44429	44434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1032	NC_022353	TAA	2	6	44444	44449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1033	NC_022353	AAT	2	6	44541	44546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1034	NC_022353	CTA	2	6	44617	44622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949002
1035	NC_022353	TTTGAA	2	12	44682	44693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543949002
1036	NC_022353	AGTT	2	8	44699	44706	25 %	50 %	25 %	0 %	543949002
1037	NC_022353	TAA	2	6	44741	44746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1038	NC_022353	A	6	6	44791	44796	100 %	0 %	0 %	0 %	543949002
1039	NC_022353	AT	3	6	44924	44929	50 %	50 %	0 %	0 %	543949002
1040	NC_022353	AGA	2	6	44930	44935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949002
1041	NC_022353	ATA	2	6	45037	45042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1042	NC_022353	GAAAGA	2	12	45083	45094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949002
1043	NC_022353	GGT	2	6	45111	45116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543949002
1044	NC_022353	ATA	2	6	45118	45123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1045	NC_022353	A	6	6	45145	45150	100 %	0 %	0 %	0 %	543949002
1046	NC_022353	A	7	7	45152	45158	100 %	0 %	0 %	0 %	543949002
1047	NC_022353	TAA	2	6	45163	45168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1048	NC_022353	A	7	7	45167	45173	100 %	0 %	0 %	0 %	543949002
1049	NC_022353	CAA	2	6	45179	45184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543949002
1050	NC_022353	TA	3	6	45228	45233	50 %	50 %	0 %	0 %	543949002
1051	NC_022353	TGT	2	6	45248	45253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949002
1052	NC_022353	T	6	6	45290	45295	0 %	100 %	0 %	0 %	543949002
1053	NC_022353	ATT	2	6	45303	45308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949002
1054	NC_022353	ATA	2	6	45345	45350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1055	NC_022353	ATT	2	6	45354	45359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949002
1056	NC_022353	TAG	2	6	45434	45439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949002
1057	NC_022353	TCA	2	6	45564	45569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949002
1058	NC_022353	TTA	2	6	45585	45590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949002
1059	NC_022353	ATA	2	6	45598	45603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1060	NC_022353	TAT	2	6	45613	45618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949002
1061	NC_022353	TTA	2	6	45660	45665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949002
1062	NC_022353	TTA	2	6	45669	45674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949002
1063	NC_022353	ATT	2	6	45675	45680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949002
1064	NC_022353	TTA	2	6	45682	45687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949002
1065	NC_022353	TAT	2	6	45724	45729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949002
1066	NC_022353	TTAT	2	8	45733	45740	25 %	75 %	0 %	0 %	543949002
1067	NC_022353	T	6	6	45800	45805	0 %	100 %	0 %	0 %	543949002
1068	NC_022353	ATTT	2	8	45807	45814	25 %	75 %	0 %	0 %	543949002
1069	NC_022353	TTTA	2	8	45839	45846	25 %	75 %	0 %	0 %	543949002
1070	NC_022353	GTT	2	6	45909	45914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949002
1071	NC_022353	T	6	6	45952	45957	0 %	100 %	0 %	0 %	543949002
1072	NC_022353	A	6	6	45988	45993	100 %	0 %	0 %	0 %	543949002
1073	NC_022353	AGCA	2	8	46031	46038	50 %	0 %	25 %	25 %	543949002
1074	NC_022353	ATA	2	6	46116	46121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1075	NC_022353	A	6	6	46229	46234	100 %	0 %	0 %	0 %	543949002
1076	NC_022353	AGA	2	6	46241	46246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949002
1077	NC_022353	ACA	2	6	46261	46266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543949002
1078	NC_022353	TAA	2	6	46289	46294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949002
1079	NC_022353	AAATT	2	10	46302	46311	60 %	40 %	0 %	0 %	543949002
1080	NC_022353	A	6	6	46570	46575	100 %	0 %	0 %	0 %	543949002
1081	NC_022353	A	6	6	46583	46588	100 %	0 %	0 %	0 %	543949002
1082	NC_022353	AGCTT	2	10	46615	46624	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_022353	ATC	2	6	46633	46638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949003
1084	NC_022353	AGT	2	6	46648	46653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949003
1085	NC_022353	TAG	2	6	46660	46665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949003
1086	NC_022353	T	6	6	46740	46745	0 %	100 %	0 %	0 %	543949003
1087	NC_022353	CTT	2	6	46813	46818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949003
1088	NC_022353	ATC	2	6	46874	46879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949003
1089	NC_022353	TCT	2	6	47067	47072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949003
1090	NC_022353	TGA	2	6	47098	47103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949003
1091	NC_022353	TTC	2	6	47126	47131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949003
1092	NC_022353	TTG	2	6	47148	47153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949003
1093	NC_022353	CTT	2	6	47200	47205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949003
1094	NC_022353	TACACT	2	12	47222	47233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949003
1095	NC_022353	ATT	2	6	47324	47329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949003
1096	NC_022353	T	6	6	47338	47343	0 %	100 %	0 %	0 %	543949003
1097	NC_022353	AT	3	6	47365	47370	50 %	50 %	0 %	0 %	543949004
1098	NC_022353	CA	3	6	47394	47399	50 %	0 %	0 %	50 %	543949004
1099	NC_022353	A	6	6	47620	47625	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1100	NC_022353	ATC	2	6	47663	47668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949004
1101	NC_022353	T	6	6	47685	47690	0 %	100 %	0 %	0 %	543949004
1102	NC_022353	GAC	2	6	47734	47739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949004
1103	NC_022353	AGCAA	2	10	47765	47774	60 %	0 %	20 %	20 %	543949004
1104	NC_022353	A	6	6	47794	47799	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1105	NC_022353	CGC	2	6	47842	47847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543949004
1106	NC_022353	AAG	2	6	47856	47861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949004
1107	NC_022353	TA	3	6	47869	47874	50 %	50 %	0 %	0 %	543949004
1108	NC_022353	ATG	2	6	47926	47931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949004
1109	NC_022353	T	6	6	47938	47943	0 %	100 %	0 %	0 %	543949004
1110	NC_022353	ATC	2	6	47984	47989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949004
1111	NC_022353	A	7	7	47990	47996	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1112	NC_022353	CAAA	2	8	48012	48019	75 %	0 %	0 %	25 %	543949004
1113	NC_022353	CAT	2	6	48106	48111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949004
1114	NC_022353	CTT	2	6	48132	48137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949004
1115	NC_022353	A	6	6	48205	48210	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1116	NC_022353	ATC	2	6	48235	48240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949004
1117	NC_022353	CA	3	6	48247	48252	50 %	0 %	0 %	50 %	543949004
1118	NC_022353	AAAC	2	8	48253	48260	75 %	0 %	0 %	25 %	543949004
1119	NC_022353	GAA	2	6	48271	48276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949004
1120	NC_022353	AT	3	6	48331	48336	50 %	50 %	0 %	0 %	543949004
1121	NC_022353	A	7	7	48361	48367	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1122	NC_022353	A	6	6	48389	48394	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1123	NC_022353	GT	3	6	48524	48529	0 %	50 %	50 %	0 %	543949004
1124	NC_022353	ATT	2	6	48549	48554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022353	AAT	2	6	48587	48592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_022353	CAAAT	2	10	48664	48673	60 %	20 %	0 %	20 %	543949005
1127	NC_022353	CAAG	2	8	48738	48745	50 %	0 %	25 %	25 %	543949005
1128	NC_022353	A	8	8	48758	48765	100 %	0 %	0 %	0 %	543949005
1129	NC_022353	TGA	3	9	48771	48779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949005
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1260	NC_022353	TAC	2	6	54821	54826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949010
1261	NC_022353	A	6	6	54844	54849	100 %	0 %	0 %	0 %	543949010
1262	NC_022353	A	6	6	54890	54895	100 %	0 %	0 %	0 %	543949010
1263	NC_022353	AAAG	2	8	54918	54925	75 %	0 %	25 %	0 %	543949010
1264	NC_022353	A	7	7	54934	54940	100 %	0 %	0 %	0 %	543949010
1265	NC_022353	AGA	3	9	54962	54970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949010
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1288	NC_022353	TAA	2	6	55703	55708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949010
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1293	NC_022353	A	6	6	55904	55909	100 %	0 %	0 %	0 %	543949010
1294	NC_022353	ATA	2	6	55980	55985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1295	NC_022353	A	6	6	55985	55990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1378	NC_022353	T	6	6	59142	59147	0 %	100 %	0 %	0 %	543949013
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1382	NC_022353	T	6	6	59268	59273	0 %	100 %	0 %	0 %	543949013
1383	NC_022353	AT	3	6	59274	59279	50 %	50 %	0 %	0 %	543949013
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