MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 38338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022352	AG	3	6	166494	166499	50 %	0 %	50 %	0 %	543947398
4002	NC_022352	GTA	2	6	166540	166545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947398
4003	NC_022352	GAT	2	6	166677	166682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947398
4004	NC_022352	TTCA	2	8	166693	166700	25 %	50 %	0 %	25 %	543947398
4005	NC_022352	ATG	2	6	166852	166857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947398
4006	NC_022352	AAT	2	6	166953	166958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947398
4007	NC_022352	GC	3	6	166969	166974	0 %	0 %	50 %	50 %	543947398
4008	NC_022352	GTA	3	9	167038	167046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947398
4009	NC_022352	T	6	6	167105	167110	0 %	100 %	0 %	0 %	543947398
4010	NC_022352	A	6	6	167369	167374	100 %	0 %	0 %	0 %	543947398
4011	NC_022352	ACT	2	6	167382	167387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947398
4012	NC_022352	TTA	2	6	167552	167557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947398
4013	NC_022352	ATA	2	6	167563	167568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947398
4014	NC_022352	GCG	2	6	167679	167684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543947398
4015	NC_022352	TTA	2	6	167752	167757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947398
4016	NC_022352	TTCT	2	8	167843	167850	0 %	75 %	0 %	25 %	543947398
4017	NC_022352	GAT	3	9	167916	167924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947398
4018	NC_022352	TAT	2	6	167946	167951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947398
4019	NC_022352	TCC	2	6	168014	168019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543947398
4020	NC_022352	TGA	2	6	168053	168058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947398
4021	NC_022352	CAAGA	2	10	168130	168139	60 %	0 %	20 %	20 %	543947398
4022	NC_022352	CTT	2	6	168174	168179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947398
4023	NC_022352	TGG	2	6	168269	168274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543947398
4024	NC_022352	GCAAA	2	10	168292	168301	60 %	0 %	20 %	20 %	543947398
4025	NC_022352	GAT	2	6	168321	168326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947398
4026	NC_022352	TTA	2	6	168350	168355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947398
4027	NC_022352	ACCA	2	8	168362	168369	50 %	0 %	0 %	50 %	543947398
4028	NC_022352	CA	3	6	168368	168373	50 %	0 %	0 %	50 %	543947398
4029	NC_022352	TAT	2	6	168392	168397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947398
4030	NC_022352	ATTT	2	8	168460	168467	25 %	75 %	0 %	0 %	543947398
4031	NC_022352	CTAT	2	8	168544	168551	25 %	50 %	0 %	25 %	543947398
4032	NC_022352	A	7	7	168628	168634	100 %	0 %	0 %	0 %	543947399
4033	NC_022352	T	7	7	168648	168654	0 %	100 %	0 %	0 %	543947399
4034	NC_022352	TTAAAT	2	12	168659	168670	50 %	50 %	0 %	0 %	543947399
4035	NC_022352	TTC	2	6	168709	168714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947399
4036	NC_022352	CTTTCT	2	12	168746	168757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947399
4037	NC_022352	TGA	2	6	168775	168780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947399
4038	NC_022352	GGT	2	6	168781	168786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543947399
4039	NC_022352	TTAT	2	8	168795	168802	25 %	75 %	0 %	0 %	543947399
4040	NC_022352	AT	3	6	168801	168806	50 %	50 %	0 %	0 %	543947399
4041	NC_022352	ATTTT	2	10	168859	168868	20 %	80 %	0 %	0 %	543947399
4042	NC_022352	A	8	8	168872	168879	100 %	0 %	0 %	0 %	543947399
4043	NC_022352	A	6	6	168913	168918	100 %	0 %	0 %	0 %	543947399
4044	NC_022352	A	6	6	168987	168992	100 %	0 %	0 %	0 %	543947399
4045	NC_022352	AGCA	2	8	169066	169073	50 %	0 %	25 %	25 %	543947399
4046	NC_022352	TTGC	2	8	169088	169095	0 %	50 %	25 %	25 %	543947399
4047	NC_022352	CTT	2	6	169188	169193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947399
4048	NC_022352	GCT	2	6	169253	169258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947399
4049	NC_022352	T	6	6	169272	169277	0 %	100 %	0 %	0 %	543947399
4050	NC_022352	A	6	6	169294	169299	100 %	0 %	0 %	0 %	543947399
4051	NC_022352	TA	3	6	169343	169348	50 %	50 %	0 %	0 %	543947399
4052	NC_022352	AGA	2	6	169397	169402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947400
4053	NC_022352	TAT	2	6	169450	169455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947400
4054	NC_022352	CTC	2	6	169477	169482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543947400
4055	NC_022352	GCA	2	6	169523	169528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947400
4056	NC_022352	CAT	2	6	169553	169558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947400
4057	NC_022352	TTTA	2	8	169561	169568	25 %	75 %	0 %	0 %	543947400
4058	NC_022352	ATA	2	6	169576	169581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947400
4059	NC_022352	ATG	2	6	169594	169599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947400
4060	NC_022352	AGA	2	6	169658	169663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947400
4061	NC_022352	ATT	2	6	169665	169670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947400
4062	NC_022352	T	6	6	169853	169858	0 %	100 %	0 %	0 %	543947401
4063	NC_022352	GTG	2	6	169883	169888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543947401
4064	NC_022352	ATG	2	6	169924	169929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947401
4065	NC_022352	AAG	2	6	169958	169963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947401
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4067	NC_022352	A	6	6	170005	170010	100 %	0 %	0 %	0 %	543947401
4068	NC_022352	A	7	7	170066	170072	100 %	0 %	0 %	0 %	543947401
4069	NC_022352	TAA	2	6	170172	170177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947401
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4071	NC_022352	AAG	2	6	170279	170284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947401
4072	NC_022352	AAG	2	6	170300	170305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947401
4073	NC_022352	TGA	2	6	170331	170336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947401
4074	NC_022352	A	6	6	170365	170370	100 %	0 %	0 %	0 %	543947401
4075	NC_022352	ATG	2	6	170393	170398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947401
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4077	NC_022352	A	6	6	170457	170462	100 %	0 %	0 %	0 %	543947401
4078	NC_022352	A	6	6	170521	170526	100 %	0 %	0 %	0 %	543947401
4079	NC_022352	A	7	7	170540	170546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_022352	TTA	2	6	170549	170554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_022352	TGA	2	6	170573	170578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_022352	T	6	6	170593	170598	0 %	100 %	0 %	0 %	543947402
4083	NC_022352	A	6	6	170605	170610	100 %	0 %	0 %	0 %	543947402
4084	NC_022352	T	7	7	170636	170642	0 %	100 %	0 %	0 %	543947402
4085	NC_022352	TA	4	8	170657	170664	50 %	50 %	0 %	0 %	543947402
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4088	NC_022352	AGA	2	6	170769	170774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947402
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4090	NC_022352	TAT	3	9	170869	170877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947402
4091	NC_022352	TTA	2	6	170884	170889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947402
4092	NC_022352	T	6	6	170895	170900	0 %	100 %	0 %	0 %	543947402
4093	NC_022352	ATT	2	6	170930	170935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947402
4094	NC_022352	T	7	7	170966	170972	0 %	100 %	0 %	0 %	543947402
4095	NC_022352	GCTATT	2	12	170974	170985	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947402
4096	NC_022352	GAT	2	6	171091	171096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947402
4097	NC_022352	GAAG	2	8	171103	171110	50 %	0 %	50 %	0 %	543947402
4098	NC_022352	AAG	2	6	171125	171130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947402
4099	NC_022352	AG	3	6	171156	171161	50 %	0 %	50 %	0 %	543947402
4100	NC_022352	TGA	2	6	171188	171193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947402
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4102	NC_022352	T	8	8	171276	171283	0 %	100 %	0 %	0 %	543947402
4103	NC_022352	T	6	6	171285	171290	0 %	100 %	0 %	0 %	543947402
4104	NC_022352	A	6	6	171291	171296	100 %	0 %	0 %	0 %	543947402
4105	NC_022352	AGG	2	6	171339	171344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543947402
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4107	NC_022352	T	7	7	171521	171527	0 %	100 %	0 %	0 %	543947402
4108	NC_022352	TAA	2	6	171651	171656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947402
4109	NC_022352	TA	4	8	171729	171736	50 %	50 %	0 %	0 %	543947402
4110	NC_022352	T	6	6	171781	171786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_022352	A	6	6	171802	171807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_022352	TAA	2	6	171839	171844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_022352	TAA	2	6	171849	171854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_022352	TATTT	2	10	171855	171864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_022352	GTT	3	9	171954	171962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947403
4116	NC_022352	T	7	7	171989	171995	0 %	100 %	0 %	0 %	543947403
4117	NC_022352	CGT	2	6	172026	172031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947403
4118	NC_022352	A	8	8	172057	172064	100 %	0 %	0 %	0 %	543947403
4119	NC_022352	TTGG	2	8	172156	172163	0 %	50 %	50 %	0 %	543947403
4120	NC_022352	TTA	2	6	172204	172209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947403
4121	NC_022352	TTA	2	6	172228	172233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947403
4122	NC_022352	ATT	2	6	172251	172256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947403
4123	NC_022352	ATT	2	6	172266	172271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947403
4124	NC_022352	TTGCAG	2	12	172321	172332	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543947403
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4126	NC_022352	T	6	6	172409	172414	0 %	100 %	0 %	0 %	543947403
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4131	NC_022352	A	6	6	172633	172638	100 %	0 %	0 %	0 %	543947403
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4156	NC_022352	GTA	2	6	173594	173599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947405
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4234	NC_022352	CTA	2	6	176583	176588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947409
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4236	NC_022352	TCTA	2	8	176701	176708	25 %	50 %	0 %	25 %	543947409
4237	NC_022352	T	8	8	176722	176729	0 %	100 %	0 %	0 %	543947409
4238	NC_022352	A	6	6	176735	176740	100 %	0 %	0 %	0 %	543947409
4239	NC_022352	TCCT	2	8	176796	176803	0 %	50 %	0 %	50 %	543947409
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4241	NC_022352	T	6	6	176964	176969	0 %	100 %	0 %	0 %	543947409
4242	NC_022352	AAC	2	6	176976	176981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947409
4243	NC_022352	CAAT	2	8	177005	177012	50 %	25 %	0 %	25 %	543947409
4244	NC_022352	ATA	2	6	177014	177019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947409
4245	NC_022352	T	6	6	177025	177030	0 %	100 %	0 %	0 %	543947409
4246	NC_022352	T	6	6	177043	177048	0 %	100 %	0 %	0 %	543947409
4247	NC_022352	T	6	6	177088	177093	0 %	100 %	0 %	0 %	543947409
4248	NC_022352	CCA	2	6	177156	177161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947409
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4251	NC_022352	A	7	7	177194	177200	100 %	0 %	0 %	0 %	543947409
4252	NC_022352	T	7	7	177237	177243	0 %	100 %	0 %	0 %	543947409
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4322	NC_022352	T	8	8	179867	179874	0 %	100 %	0 %	0 %	543947412
4323	NC_022352	TCA	2	6	179886	179891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947412
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4326	NC_022352	TCA	2	6	179982	179987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947412
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4328	NC_022352	A	7	7	180036	180042	100 %	0 %	0 %	0 %	543947412
4329	NC_022352	A	6	6	180081	180086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4352	NC_022352	AAAT	2	8	180874	180881	75 %	25 %	0 %	0 %	543947414
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4358	NC_022352	CTA	2	6	181091	181096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947414
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4360	NC_022352	TCA	2	6	181159	181164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947414
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4362	NC_022352	T	6	6	181257	181262	0 %	100 %	0 %	0 %	543947414
4363	NC_022352	TCA	3	9	181270	181278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947414
4364	NC_022352	TGCGC	2	10	181348	181357	0 %	20 %	40 %	40 %	543947414
4365	NC_022352	TTC	2	6	181392	181397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947414
4366	NC_022352	ACCAT	2	10	181414	181423	40 %	20 %	0 %	40 %	543947414
4367	NC_022352	ACC	2	6	181482	181487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947414
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4371	NC_022352	TCA	2	6	181612	181617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947414
4372	NC_022352	T	6	6	181623	181628	0 %	100 %	0 %	0 %	543947414
4373	NC_022352	ACTT	2	8	181629	181636	25 %	50 %	0 %	25 %	543947414
4374	NC_022352	AAAG	2	8	181696	181703	75 %	0 %	25 %	0 %	543947414
4375	NC_022352	AAT	2	6	181716	181721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947414
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4377	NC_022352	TGAG	2	8	181843	181850	25 %	25 %	50 %	0 %	543947414
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