MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 38338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022352	ATA	2	6	228094	228099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947469
5502	NC_022352	TGG	2	6	228104	228109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543947469
5503	NC_022352	ATA	2	6	228222	228227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947469
5504	NC_022352	TTC	2	6	228229	228234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947469
5505	NC_022352	TTA	2	6	228260	228265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947469
5506	NC_022352	A	6	6	228288	228293	100 %	0 %	0 %	0 %	543947469
5507	NC_022352	ATA	2	6	228361	228366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947469
5508	NC_022352	A	6	6	228421	228426	100 %	0 %	0 %	0 %	543947469
5509	NC_022352	T	6	6	228547	228552	0 %	100 %	0 %	0 %	543947469
5510	NC_022352	TTA	2	6	228684	228689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947469
5511	NC_022352	T	6	6	228730	228735	0 %	100 %	0 %	0 %	543947470
5512	NC_022352	TTTA	2	8	228772	228779	25 %	75 %	0 %	0 %	543947470
5513	NC_022352	AAATG	2	10	228781	228790	60 %	20 %	20 %	0 %	543947470
5514	NC_022352	ATT	2	6	228812	228817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947470
5515	NC_022352	T	6	6	228838	228843	0 %	100 %	0 %	0 %	543947470
5516	NC_022352	T	6	6	228856	228861	0 %	100 %	0 %	0 %	543947470
5517	NC_022352	TTGAT	2	10	228939	228948	20 %	60 %	20 %	0 %	543947470
5518	NC_022352	T	6	6	229007	229012	0 %	100 %	0 %	0 %	543947470
5519	NC_022352	TTTG	2	8	229031	229038	0 %	75 %	25 %	0 %	543947470
5520	NC_022352	TTTAT	2	10	229043	229052	20 %	80 %	0 %	0 %	543947470
5521	NC_022352	ATA	2	6	229053	229058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947470
5522	NC_022352	A	6	6	229101	229106	100 %	0 %	0 %	0 %	543947471
5523	NC_022352	TAT	2	6	229158	229163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947471
5524	NC_022352	GAA	2	6	229183	229188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947471
5525	NC_022352	CAT	2	6	229212	229217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947471
5526	NC_022352	AGA	2	6	229236	229241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947471
5527	NC_022352	A	8	8	229241	229248	100 %	0 %	0 %	0 %	543947471
5528	NC_022352	TGCATT	2	12	229326	229337	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947472
5529	NC_022352	AGA	2	6	229438	229443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947472
5530	NC_022352	T	8	8	229512	229519	0 %	100 %	0 %	0 %	543947472
5531	NC_022352	ATG	2	6	229527	229532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947472
5532	NC_022352	CAG	2	6	229584	229589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947472
5533	NC_022352	ACA	2	6	229595	229600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947472
5534	NC_022352	TGG	2	6	229609	229614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543947472
5535	NC_022352	CAT	2	6	229862	229867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947472
5536	NC_022352	ATC	2	6	229871	229876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947472
5537	NC_022352	GAT	2	6	229883	229888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947472
5538	NC_022352	T	6	6	229917	229922	0 %	100 %	0 %	0 %	543947472
5539	NC_022352	AAG	2	6	229953	229958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947472
5540	NC_022352	ATT	2	6	230101	230106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947472
5541	NC_022352	AGA	2	6	230122	230127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947472
5542	NC_022352	ATA	2	6	230151	230156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947472
5543	NC_022352	AGA	2	6	230185	230190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947472
5544	NC_022352	AGA	2	6	230206	230211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947472
5545	NC_022352	TTTA	2	8	230339	230346	25 %	75 %	0 %	0 %	543947473
5546	NC_022352	AGAT	2	8	230373	230380	50 %	25 %	25 %	0 %	543947473
5547	NC_022352	A	8	8	230384	230391	100 %	0 %	0 %	0 %	543947473
5548	NC_022352	CAT	2	6	230457	230462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947473
5549	NC_022352	AAAGC	2	10	230474	230483	60 %	0 %	20 %	20 %	543947473
5550	NC_022352	ACA	2	6	230485	230490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947473
5551	NC_022352	TGA	2	6	230534	230539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947473
5552	NC_022352	AAT	2	6	230571	230576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_022352	TTAT	2	8	230618	230625	25 %	75 %	0 %	0 %	543947474
5554	NC_022352	TTTTA	2	10	230635	230644	20 %	80 %	0 %	0 %	543947474
5555	NC_022352	ATT	2	6	230665	230670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947474
5556	NC_022352	CTT	2	6	230751	230756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947474
5557	NC_022352	TCA	2	6	230780	230785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947474
5558	NC_022352	A	6	6	230800	230805	100 %	0 %	0 %	0 %	543947474
5559	NC_022352	T	7	7	230810	230816	0 %	100 %	0 %	0 %	543947474
5560	NC_022352	AAT	2	6	230823	230828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947474
5561	NC_022352	T	6	6	230839	230844	0 %	100 %	0 %	0 %	543947474
5562	NC_022352	A	6	6	230891	230896	100 %	0 %	0 %	0 %	543947474
5563	NC_022352	CCAA	2	8	230917	230924	50 %	0 %	0 %	50 %	543947474
5564	NC_022352	T	6	6	231088	231093	0 %	100 %	0 %	0 %	543947474
5565	NC_022352	TCT	2	6	231098	231103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947474
5566	NC_022352	AGCAT	2	10	231116	231125	40 %	20 %	20 %	20 %	543947474
5567	NC_022352	CTT	2	6	231156	231161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947474
5568	NC_022352	GTTT	2	8	231257	231264	0 %	75 %	25 %	0 %	543947474
5569	NC_022352	AT	3	6	231348	231353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_022352	AAAG	2	8	231388	231395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_022352	ATTA	2	8	231406	231413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_022352	CTT	3	9	231420	231428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_022352	TCT	2	6	231433	231438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_022352	ATT	2	6	231444	231449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_022352	N	100	100	231462	231561	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_022352	TAG	2	6	231596	231601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_022352	TCA	2	6	231643	231648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_022352	TAG	2	6	231665	231670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_022352	T	6	6	231676	231681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_022352	CTA	2	6	231746	231751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_022352	T	6	6	231754	231759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_022352	AAT	2	6	231774	231779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_022352	AAT	2	6	231798	231803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_022352	ATTCA	2	10	231825	231834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5585	NC_022352	T	6	6	231855	231860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_022352	AAT	2	6	231963	231968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_022352	AAT	2	6	231996	232001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_022352	AATAAC	2	12	232068	232079	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5589	NC_022352	TTA	2	6	232091	232096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_022352	ATC	2	6	232107	232112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_022352	A	6	6	232159	232164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_022352	CTT	2	6	232199	232204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_022352	CAT	2	6	232250	232255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_022352	T	8	8	232312	232319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_022352	T	6	6	232322	232327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_022352	GCCT	2	8	232380	232387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_022352	TCA	2	6	232399	232404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_022352	A	8	8	232404	232411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_022352	AGA	2	6	232479	232484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_022352	TAAA	2	8	232491	232498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_022352	CTA	2	6	232522	232527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_022352	TAT	2	6	232554	232559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_022352	T	6	6	232579	232584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_022352	CTT	2	6	232700	232705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_022352	TA	4	8	232724	232731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_022352	CTATT	2	10	232878	232887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5607	NC_022352	T	6	6	232924	232929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_022352	ATT	2	6	233002	233007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_022352	TAC	2	6	233043	233048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947475
5610	NC_022352	T	7	7	233096	233102	0 %	100 %	0 %	0 %	543947475
5611	NC_022352	GAT	2	6	233111	233116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947475
5612	NC_022352	CTTT	2	8	233126	233133	0 %	75 %	0 %	25 %	543947475
5613	NC_022352	AT	4	8	233162	233169	50 %	50 %	0 %	0 %	543947475
5614	NC_022352	T	7	7	233257	233263	0 %	100 %	0 %	0 %	543947475
5615	NC_022352	ATTG	2	8	233284	233291	25 %	50 %	25 %	0 %	543947475
5616	NC_022352	AGA	2	6	233332	233337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947475
5617	NC_022352	TCC	2	6	233383	233388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543947475
5618	NC_022352	GCTATA	2	12	233540	233551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543947475
5619	NC_022352	A	6	6	233624	233629	100 %	0 %	0 %	0 %	543947475
5620	NC_022352	TATT	2	8	233635	233642	25 %	75 %	0 %	0 %	543947475
5621	NC_022352	TTG	2	6	233679	233684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947475
5622	NC_022352	TGA	2	6	233773	233778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947475
5623	NC_022352	AAT	2	6	233848	233853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947475
5624	NC_022352	TG	3	6	233986	233991	0 %	50 %	50 %	0 %	543947476
5625	NC_022352	TCA	2	6	234128	234133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947476
5626	NC_022352	AC	3	6	234174	234179	50 %	0 %	0 %	50 %	543947476
5627	NC_022352	T	6	6	234194	234199	0 %	100 %	0 %	0 %	543947476
5628	NC_022352	T	7	7	234208	234214	0 %	100 %	0 %	0 %	543947476
5629	NC_022352	CT	3	6	234241	234246	0 %	50 %	0 %	50 %	543947476
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