MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 39455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022351	AG	3	6	166493	166498	50 %	0 %	50 %	0 %	543945577
4002	NC_022351	GTA	2	6	166539	166544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945577
4003	NC_022351	GAT	2	6	166676	166681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945577
4004	NC_022351	TTCA	2	8	166692	166699	25 %	50 %	0 %	25 %	543945577
4005	NC_022351	ATG	2	6	166851	166856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945577
4006	NC_022351	AAT	2	6	166952	166957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945577
4007	NC_022351	GC	3	6	166968	166973	0 %	0 %	50 %	50 %	543945577
4008	NC_022351	GTA	3	9	167037	167045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945577
4009	NC_022351	T	6	6	167104	167109	0 %	100 %	0 %	0 %	543945577
4010	NC_022351	A	6	6	167368	167373	100 %	0 %	0 %	0 %	543945577
4011	NC_022351	ACT	2	6	167381	167386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945577
4012	NC_022351	TTA	2	6	167551	167556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945577
4013	NC_022351	ATA	2	6	167562	167567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945577
4014	NC_022351	GCG	2	6	167678	167683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543945577
4015	NC_022351	TTA	2	6	167751	167756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945577
4016	NC_022351	TTCT	2	8	167842	167849	0 %	75 %	0 %	25 %	543945577
4017	NC_022351	GAT	3	9	167915	167923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945577
4018	NC_022351	TAT	2	6	167945	167950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945577
4019	NC_022351	TCC	2	6	168013	168018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543945577
4020	NC_022351	TGA	2	6	168052	168057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945577
4021	NC_022351	CAAGA	2	10	168129	168138	60 %	0 %	20 %	20 %	543945577
4022	NC_022351	CTT	2	6	168173	168178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945577
4023	NC_022351	TGG	2	6	168268	168273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945577
4024	NC_022351	GCAAA	2	10	168291	168300	60 %	0 %	20 %	20 %	543945577
4025	NC_022351	GAT	2	6	168320	168325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945577
4026	NC_022351	TTA	2	6	168349	168354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945577
4027	NC_022351	ACCA	2	8	168361	168368	50 %	0 %	0 %	50 %	543945577
4028	NC_022351	CA	3	6	168367	168372	50 %	0 %	0 %	50 %	543945577
4029	NC_022351	TAT	2	6	168391	168396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945577
4030	NC_022351	ATTT	2	8	168459	168466	25 %	75 %	0 %	0 %	543945577
4031	NC_022351	CTAT	2	8	168543	168550	25 %	50 %	0 %	25 %	543945577
4032	NC_022351	A	7	7	168627	168633	100 %	0 %	0 %	0 %	543945578
4033	NC_022351	T	7	7	168647	168653	0 %	100 %	0 %	0 %	543945578
4034	NC_022351	TTAAAT	2	12	168658	168669	50 %	50 %	0 %	0 %	543945578
4035	NC_022351	TTC	2	6	168708	168713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945578
4036	NC_022351	CTTTCT	2	12	168745	168756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945578
4037	NC_022351	TGA	2	6	168774	168779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945578
4038	NC_022351	GGT	2	6	168780	168785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945578
4039	NC_022351	TTAT	2	8	168794	168801	25 %	75 %	0 %	0 %	543945578
4040	NC_022351	AT	3	6	168800	168805	50 %	50 %	0 %	0 %	543945578
4041	NC_022351	ATTTT	2	10	168858	168867	20 %	80 %	0 %	0 %	543945578
4042	NC_022351	A	8	8	168871	168878	100 %	0 %	0 %	0 %	543945578
4043	NC_022351	A	6	6	168912	168917	100 %	0 %	0 %	0 %	543945578
4044	NC_022351	A	6	6	168986	168991	100 %	0 %	0 %	0 %	543945578
4045	NC_022351	AGCA	2	8	169065	169072	50 %	0 %	25 %	25 %	543945578
4046	NC_022351	TTGC	2	8	169087	169094	0 %	50 %	25 %	25 %	543945578
4047	NC_022351	CTT	2	6	169187	169192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945578
4048	NC_022351	GCT	2	6	169252	169257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945578
4049	NC_022351	T	6	6	169271	169276	0 %	100 %	0 %	0 %	543945578
4050	NC_022351	A	6	6	169293	169298	100 %	0 %	0 %	0 %	543945578
4051	NC_022351	TA	3	6	169342	169347	50 %	50 %	0 %	0 %	543945578
4052	NC_022351	AGA	2	6	169396	169401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945579
4053	NC_022351	TAT	2	6	169449	169454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945579
4054	NC_022351	CTC	2	6	169476	169481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543945579
4055	NC_022351	GCA	2	6	169522	169527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945579
4056	NC_022351	CAT	2	6	169552	169557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945579
4057	NC_022351	TTTA	2	8	169560	169567	25 %	75 %	0 %	0 %	543945579
4058	NC_022351	ATA	2	6	169575	169580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945579
4059	NC_022351	ATG	2	6	169593	169598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945579
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4061	NC_022351	ATT	2	6	169664	169669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945579
4062	NC_022351	T	6	6	169852	169857	0 %	100 %	0 %	0 %	543945580
4063	NC_022351	GTG	2	6	169882	169887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945580
4064	NC_022351	ATG	2	6	169923	169928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945580
4065	NC_022351	AAG	2	6	169957	169962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945580
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4067	NC_022351	A	6	6	170004	170009	100 %	0 %	0 %	0 %	543945580
4068	NC_022351	A	7	7	170065	170071	100 %	0 %	0 %	0 %	543945580
4069	NC_022351	TAA	2	6	170171	170176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945580
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4071	NC_022351	AAG	2	6	170278	170283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945580
4072	NC_022351	AAG	2	6	170299	170304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945580
4073	NC_022351	TGA	2	6	170330	170335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945580
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4075	NC_022351	ATG	2	6	170392	170397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945580
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4077	NC_022351	A	6	6	170456	170461	100 %	0 %	0 %	0 %	543945580
4078	NC_022351	A	6	6	170520	170525	100 %	0 %	0 %	0 %	543945580
4079	NC_022351	A	7	7	170539	170545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_022351	TTA	2	6	170548	170553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_022351	TGA	2	6	170572	170577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_022351	T	6	6	170592	170597	0 %	100 %	0 %	0 %	543945581
4083	NC_022351	A	6	6	170604	170609	100 %	0 %	0 %	0 %	543945581
4084	NC_022351	T	7	7	170635	170641	0 %	100 %	0 %	0 %	543945581
4085	NC_022351	TA	4	8	170656	170663	50 %	50 %	0 %	0 %	543945581
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4088	NC_022351	AGA	2	6	170768	170773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945581
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4091	NC_022351	TTA	2	6	170883	170888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945581
4092	NC_022351	T	6	6	170894	170899	0 %	100 %	0 %	0 %	543945581
4093	NC_022351	ATT	2	6	170929	170934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945581
4094	NC_022351	T	7	7	170965	170971	0 %	100 %	0 %	0 %	543945581
4095	NC_022351	GCTATT	2	12	170973	170984	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543945581
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4099	NC_022351	AG	3	6	171155	171160	50 %	0 %	50 %	0 %	543945581
4100	NC_022351	TGA	2	6	171187	171192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945581
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4103	NC_022351	T	6	6	171284	171289	0 %	100 %	0 %	0 %	543945581
4104	NC_022351	A	6	6	171290	171295	100 %	0 %	0 %	0 %	543945581
4105	NC_022351	AGG	2	6	171338	171343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543945581
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4107	NC_022351	T	7	7	171520	171526	0 %	100 %	0 %	0 %	543945581
4108	NC_022351	TAA	2	6	171650	171655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945581
4109	NC_022351	TA	4	8	171728	171735	50 %	50 %	0 %	0 %	543945581
4110	NC_022351	T	6	6	171780	171785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_022351	A	6	6	171801	171806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_022351	TAA	2	6	171838	171843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_022351	TAA	2	6	171848	171853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_022351	TATTT	2	10	171854	171863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_022351	GTT	3	9	171953	171961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945582
4116	NC_022351	T	7	7	171988	171994	0 %	100 %	0 %	0 %	543945582
4117	NC_022351	CGT	2	6	172025	172030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945582
4118	NC_022351	A	8	8	172056	172063	100 %	0 %	0 %	0 %	543945582
4119	NC_022351	TTGG	2	8	172155	172162	0 %	50 %	50 %	0 %	543945582
4120	NC_022351	TTA	2	6	172203	172208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945582
4121	NC_022351	TTA	2	6	172227	172232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945582
4122	NC_022351	ATT	2	6	172250	172255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945582
4123	NC_022351	ATT	2	6	172265	172270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945582
4124	NC_022351	TTGCAG	2	12	172320	172331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543945582
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4126	NC_022351	T	6	6	172408	172413	0 %	100 %	0 %	0 %	543945582
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4247	NC_022351	T	6	6	177085	177090	0 %	100 %	0 %	0 %	543945587
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4373	NC_022351	ACTT	2	8	181626	181633	25 %	50 %	0 %	25 %	543945592
4374	NC_022351	AAAG	2	8	181693	181700	75 %	0 %	25 %	0 %	543945592
4375	NC_022351	AAT	2	6	181713	181718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945592
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