MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 39455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_022351	ATC	2	6	127413	127418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945535
3003	NC_022351	TGC	2	6	127420	127425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945535
3004	NC_022351	TAT	2	6	127426	127431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945535
3005	NC_022351	GAAG	2	8	127480	127487	50 %	0 %	50 %	0 %	543945535
3006	NC_022351	GGA	2	6	127517	127522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543945535
3007	NC_022351	ATC	2	6	127552	127557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945535
3008	NC_022351	T	7	7	127578	127584	0 %	100 %	0 %	0 %	543945535
3009	NC_022351	TTA	2	6	127601	127606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945535
3010	NC_022351	T	7	7	127618	127624	0 %	100 %	0 %	0 %	543945535
3011	NC_022351	CAA	2	6	127625	127630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945535
3012	NC_022351	AG	3	6	127636	127641	50 %	0 %	50 %	0 %	543945535
3013	NC_022351	ATA	2	6	127751	127756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_022351	CAA	2	6	127773	127778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_022351	AAGG	2	8	127796	127803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_022351	AAAAG	2	10	127812	127821	80 %	0 %	20 %	0 %	543945536
3017	NC_022351	TTAT	2	8	127829	127836	25 %	75 %	0 %	0 %	543945536
3018	NC_022351	T	8	8	127870	127877	0 %	100 %	0 %	0 %	543945536
3019	NC_022351	A	7	7	127900	127906	100 %	0 %	0 %	0 %	543945536
3020	NC_022351	TCC	2	6	127907	127912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543945536
3021	NC_022351	TGT	2	6	127931	127936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945536
3022	NC_022351	A	6	6	127950	127955	100 %	0 %	0 %	0 %	543945536
3023	NC_022351	GAT	2	6	127977	127982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945536
3024	NC_022351	GAC	2	6	128022	128027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945536
3025	NC_022351	TTTTG	2	10	128132	128141	0 %	80 %	20 %	0 %	543945536
3026	NC_022351	T	7	7	128174	128180	0 %	100 %	0 %	0 %	543945536
3027	NC_022351	TAG	2	6	128215	128220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945536
3028	NC_022351	ATA	2	6	128221	128226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945536
3029	NC_022351	GGT	2	6	128274	128279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945536
3030	NC_022351	GTT	2	6	128289	128294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945536
3031	NC_022351	TGA	2	6	128303	128308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945536
3032	NC_022351	TA	3	6	128328	128333	50 %	50 %	0 %	0 %	543945536
3033	NC_022351	AAG	2	6	128377	128382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945536
3034	NC_022351	TAT	2	6	128487	128492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945536
3035	NC_022351	ATA	2	6	128590	128595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945536
3036	NC_022351	A	6	6	128692	128697	100 %	0 %	0 %	0 %	543945536
3037	NC_022351	ATTT	2	8	128716	128723	25 %	75 %	0 %	0 %	543945536
3038	NC_022351	TAT	2	6	128772	128777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945536
3039	NC_022351	TAA	2	6	128858	128863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945536
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3041	NC_022351	TGC	2	6	128882	128887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945536
3042	NC_022351	TA	3	6	128938	128943	50 %	50 %	0 %	0 %	543945536
3043	NC_022351	TTC	2	6	128960	128965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945536
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3047	NC_022351	ATG	2	6	129145	129150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945536
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3050	NC_022351	ATGG	2	8	129476	129483	25 %	25 %	50 %	0 %	543945537
3051	NC_022351	ATG	2	6	129503	129508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945537
3052	NC_022351	TGA	2	6	129511	129516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945537
3053	NC_022351	A	7	7	129545	129551	100 %	0 %	0 %	0 %	543945537
3054	NC_022351	TAA	2	6	129589	129594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945537
3055	NC_022351	CTA	2	6	129612	129617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945537
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3057	NC_022351	A	8	8	129695	129702	100 %	0 %	0 %	0 %	543945537
3058	NC_022351	TA	3	6	129704	129709	50 %	50 %	0 %	0 %	543945537
3059	NC_022351	T	6	6	129739	129744	0 %	100 %	0 %	0 %	543945537
3060	NC_022351	TCA	2	6	129952	129957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945537
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3062	NC_022351	AAG	2	6	129978	129983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945537
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3091	NC_022351	AATC	2	8	131171	131178	50 %	25 %	0 %	25 %	543945539
3092	NC_022351	T	7	7	131271	131277	0 %	100 %	0 %	0 %	543945539
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3095	NC_022351	TGA	2	6	131363	131368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945539
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3097	NC_022351	A	8	8	131398	131405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_022351	A	6	6	131418	131423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_022351	GT	3	6	131448	131453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_022351	GTT	2	6	131493	131498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_022351	GAA	2	6	131530	131535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_022351	GA	4	8	131562	131569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_022351	ATT	2	6	131716	131721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945540
3104	NC_022351	TA	3	6	131803	131808	50 %	50 %	0 %	0 %	543945540
3105	NC_022351	A	6	6	131862	131867	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3106	NC_022351	A	6	6	131872	131877	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3107	NC_022351	A	8	8	131915	131922	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3108	NC_022351	A	6	6	131929	131934	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3109	NC_022351	GAA	2	6	131935	131940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945540
3110	NC_022351	AAG	2	6	131951	131956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945540
3111	NC_022351	A	6	6	131959	131964	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3112	NC_022351	GAA	2	6	131965	131970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945540
3113	NC_022351	GAA	2	6	132001	132006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945540
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3115	NC_022351	TTGTTA	2	12	132077	132088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945540
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3117	NC_022351	GAA	3	9	132103	132111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945540
3118	NC_022351	A	6	6	132121	132126	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3119	NC_022351	GAA	2	6	132127	132132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945540
3120	NC_022351	A	6	6	132135	132140	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3121	NC_022351	AT	3	6	132149	132154	50 %	50 %	0 %	0 %	543945540
3122	NC_022351	AAT	2	6	132160	132165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945540
3123	NC_022351	TGA	2	6	132204	132209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945540
3124	NC_022351	AAAGAA	2	12	132216	132227	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543945540
3125	NC_022351	A	6	6	132226	132231	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3126	NC_022351	A	8	8	132233	132240	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3127	NC_022351	TTG	2	6	132245	132250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945540
3128	NC_022351	A	6	6	132256	132261	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3129	NC_022351	A	6	6	132272	132277	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3130	NC_022351	T	6	6	132282	132287	0 %	100 %	0 %	0 %	543945540
3131	NC_022351	GAT	2	6	132319	132324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945540
3132	NC_022351	GTA	2	6	132334	132339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945540
3133	NC_022351	A	6	6	132388	132393	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3134	NC_022351	AGA	2	6	132460	132465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945540
3135	NC_022351	A	6	6	132472	132477	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3136	NC_022351	A	7	7	132494	132500	100 %	0 %	0 %	0 %	543945540
3137	NC_022351	AGA	2	6	132507	132512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945540
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3139	NC_022351	GT	3	6	132545	132550	0 %	50 %	50 %	0 %	543945540
3140	NC_022351	AGTGA	2	10	132583	132592	40 %	20 %	40 %	0 %	543945540
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3144	NC_022351	GCT	2	6	132667	132672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945540
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3147	NC_022351	TGA	2	6	132747	132752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945540
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3194	NC_022351	A	6	6	134609	134614	100 %	0 %	0 %	0 %	543945541
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3201	NC_022351	CAG	2	6	134852	134857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945542
3202	NC_022351	GA	3	6	134863	134868	50 %	0 %	50 %	0 %	543945542
3203	NC_022351	GAAAAA	2	12	134932	134943	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543945542
3204	NC_022351	ATC	2	6	134956	134961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945542
3205	NC_022351	A	6	6	135008	135013	100 %	0 %	0 %	0 %	543945542
3206	NC_022351	CTA	2	6	135014	135019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945542
3207	NC_022351	A	7	7	135036	135042	100 %	0 %	0 %	0 %	543945542
3208	NC_022351	TA	3	6	135098	135103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3209	NC_022351	ATTAAA	2	12	135104	135115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3214	NC_022351	AAG	2	6	135230	135235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945543
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3216	NC_022351	GT	3	6	135260	135265	0 %	50 %	50 %	0 %	543945543
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3219	NC_022351	CTT	2	6	135329	135334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945543
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3222	NC_022351	A	6	6	135420	135425	100 %	0 %	0 %	0 %	543945543
3223	NC_022351	GAT	2	6	135439	135444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945543
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3229	NC_022351	TAC	2	6	135633	135638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945543
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3232	NC_022351	TGA	2	6	135699	135704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945543
3233	NC_022351	ATTA	2	8	135715	135722	50 %	50 %	0 %	0 %	543945543
3234	NC_022351	TA	3	6	135802	135807	50 %	50 %	0 %	0 %	543945543
3235	NC_022351	GAAA	2	8	135816	135823	75 %	0 %	25 %	0 %	543945543
3236	NC_022351	A	6	6	135821	135826	100 %	0 %	0 %	0 %	543945543
3237	NC_022351	AGA	2	6	135831	135836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945543
3238	NC_022351	AAT	2	6	135841	135846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945543
3239	NC_022351	TGA	2	6	135924	135929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945543
3240	NC_022351	AGTA	2	8	135957	135964	50 %	25 %	25 %	0 %	543945543
3241	NC_022351	ATA	2	6	135968	135973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945543
3242	NC_022351	TA	3	6	135983	135988	50 %	50 %	0 %	0 %	543945543
3243	NC_022351	AT	3	6	136009	136014	50 %	50 %	0 %	0 %	543945543
3244	NC_022351	A	6	6	136088	136093	100 %	0 %	0 %	0 %	543945543
3245	NC_022351	TA	3	6	136105	136110	50 %	50 %	0 %	0 %	543945543
3246	NC_022351	AATC	2	8	136125	136132	50 %	25 %	0 %	25 %	543945543
3247	NC_022351	GTAA	2	8	136141	136148	50 %	25 %	25 %	0 %	543945543
3248	NC_022351	GAA	2	6	136201	136206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945543
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3250	NC_022351	AAG	3	9	136323	136331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945543
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3369	NC_022351	AAATAA	2	12	140861	140872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_022351	T	6	6	140908	140913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3373	NC_022351	T	6	6	140944	140949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3374	NC_022351	ATT	2	6	140977	140982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3375	NC_022351	ATTA	2	8	141024	141031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3376	NC_022351	AAT	2	6	141045	141050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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