MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 39455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022351	ACTT	2	8	21724	21731	25 %	50 %	0 %	25 %	543945430
502	NC_022351	GTT	2	6	21777	21782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945430
503	NC_022351	AAGAT	2	10	21819	21828	60 %	20 %	20 %	0 %	543945430
504	NC_022351	AAGA	2	8	21903	21910	75 %	0 %	25 %	0 %	543945431
505	NC_022351	ACT	2	6	21983	21988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945431
506	NC_022351	TCT	2	6	21989	21994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945431
507	NC_022351	CTT	2	6	22101	22106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945431
508	NC_022351	TGT	2	6	22191	22196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945431
509	NC_022351	AAGATA	2	12	22210	22221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543945431
510	NC_022351	TCT	2	6	22358	22363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945431
511	NC_022351	T	6	6	22379	22384	0 %	100 %	0 %	0 %	543945431
512	NC_022351	AAGA	2	8	22394	22401	75 %	0 %	25 %	0 %	543945431
513	NC_022351	TTTG	2	8	22402	22409	0 %	75 %	25 %	0 %	543945431
514	NC_022351	GAAT	2	8	22419	22426	50 %	25 %	25 %	0 %	543945431
515	NC_022351	GAT	2	6	22453	22458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945431
516	NC_022351	CTT	2	6	22500	22505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945431
517	NC_022351	ATT	2	6	22516	22521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945431
518	NC_022351	TCA	2	6	22634	22639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945431
519	NC_022351	TTG	2	6	22661	22666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945431
520	NC_022351	AAGA	2	8	22748	22755	75 %	0 %	25 %	0 %	543945431
521	NC_022351	CTT	2	6	22782	22787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945431
522	NC_022351	ATG	2	6	22796	22801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945431
523	NC_022351	AGG	2	6	22849	22854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543945431
524	NC_022351	GAT	2	6	22897	22902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945431
525	NC_022351	CTG	2	6	22917	22922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945431
526	NC_022351	GCAAAA	2	12	22994	23005	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	543945431
527	NC_022351	ACA	2	6	23024	23029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945431
528	NC_022351	TAC	2	6	23038	23043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945431
529	NC_022351	CTG	2	6	23151	23156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945431
530	NC_022351	AGC	2	6	23170	23175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945431
531	NC_022351	GT	3	6	23355	23360	0 %	50 %	50 %	0 %	543945431
532	NC_022351	T	6	6	23366	23371	0 %	100 %	0 %	0 %	543945431
533	NC_022351	CCTT	2	8	23397	23404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_022351	ATT	2	6	23413	23418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022351	A	7	7	23452	23458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022351	ACCAA	2	10	23482	23491	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
537	NC_022351	TTTTCT	2	12	23500	23511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
538	NC_022351	T	6	6	23514	23519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022351	TAA	2	6	23547	23552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022351	AAAAT	2	10	23623	23632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022351	GTTAA	2	10	23650	23659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022351	A	6	6	23669	23674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022351	GA	3	6	23732	23737	50 %	0 %	50 %	0 %	543945432
544	NC_022351	TAT	2	6	23738	23743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945432
545	NC_022351	TTG	2	6	23907	23912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945432
546	NC_022351	TTTC	2	8	23936	23943	0 %	75 %	0 %	25 %	543945432
547	NC_022351	TGT	2	6	23975	23980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945432
548	NC_022351	TTG	2	6	23988	23993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945432
549	NC_022351	ACA	2	6	24073	24078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945432
550	NC_022351	CTA	2	6	24224	24229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945432
551	NC_022351	ATC	2	6	24369	24374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945432
552	NC_022351	CAT	2	6	24441	24446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945432
553	NC_022351	TGA	2	6	24475	24480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945432
554	NC_022351	AT	3	6	24544	24549	50 %	50 %	0 %	0 %	543945432
555	NC_022351	CTT	2	6	24608	24613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945432
556	NC_022351	GCTA	2	8	24615	24622	25 %	25 %	25 %	25 %	543945432
557	NC_022351	ATG	2	6	24658	24663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945432
558	NC_022351	T	7	7	24666	24672	0 %	100 %	0 %	0 %	543945432
559	NC_022351	TAA	2	6	24678	24683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945432
560	NC_022351	A	6	6	24687	24692	100 %	0 %	0 %	0 %	543945432
561	NC_022351	ATA	2	6	24698	24703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945432
562	NC_022351	TAAA	2	8	24743	24750	75 %	25 %	0 %	0 %	543945432
563	NC_022351	GTT	2	6	24788	24793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945432
564	NC_022351	ATT	2	6	24813	24818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945432
565	NC_022351	AGA	2	6	24828	24833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945432
566	NC_022351	ATA	2	6	24844	24849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945432
567	NC_022351	A	7	7	24883	24889	100 %	0 %	0 %	0 %	543945432
568	NC_022351	T	6	6	24904	24909	0 %	100 %	0 %	0 %	543945432
569	NC_022351	CAT	2	6	24911	24916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945432
570	NC_022351	TTTC	2	8	24923	24930	0 %	75 %	0 %	25 %	543945432
571	NC_022351	GTTGA	2	10	24939	24948	20 %	40 %	40 %	0 %	543945432
572	NC_022351	TGT	2	6	24954	24959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945432
573	NC_022351	T	6	6	24959	24964	0 %	100 %	0 %	0 %	543945432
574	NC_022351	GTT	2	6	25017	25022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945432
575	NC_022351	TTC	2	6	25050	25055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945432
576	NC_022351	AAT	2	6	25058	25063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945432
577	NC_022351	AAAT	2	8	25077	25084	75 %	25 %	0 %	0 %	543945432
578	NC_022351	AAT	2	6	25124	25129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945432
579	NC_022351	TCT	2	6	25159	25164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945432
580	NC_022351	T	8	8	25217	25224	0 %	100 %	0 %	0 %	543945432
581	NC_022351	T	6	6	25286	25291	0 %	100 %	0 %	0 %	543945432
582	NC_022351	GTT	2	6	25307	25312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945432
583	NC_022351	TAT	2	6	25334	25339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945432
584	NC_022351	GAA	2	6	25348	25353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945432
585	NC_022351	TTA	2	6	25357	25362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945432
586	NC_022351	ATA	2	6	25366	25371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945432
587	NC_022351	TAA	2	6	25374	25379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945432
588	NC_022351	ATA	2	6	25414	25419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945432
589	NC_022351	T	7	7	25439	25445	0 %	100 %	0 %	0 %	543945432
590	NC_022351	CAT	2	6	25578	25583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945433
591	NC_022351	TCT	2	6	25679	25684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945433
592	NC_022351	TTC	2	6	25696	25701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945433
593	NC_022351	T	6	6	25713	25718	0 %	100 %	0 %	0 %	543945433
594	NC_022351	TGA	2	6	25748	25753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945433
595	NC_022351	T	6	6	25792	25797	0 %	100 %	0 %	0 %	543945433
596	NC_022351	T	6	6	25869	25874	0 %	100 %	0 %	0 %	543945433
597	NC_022351	T	6	6	25927	25932	0 %	100 %	0 %	0 %	543945433
598	NC_022351	AAG	2	6	25975	25980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945433
599	NC_022351	A	6	6	26012	26017	100 %	0 %	0 %	0 %	543945433
600	NC_022351	ATT	3	9	26342	26350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945433
601	NC_022351	T	7	7	26349	26355	0 %	100 %	0 %	0 %	543945433
602	NC_022351	TAA	2	6	26423	26428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945434
603	NC_022351	T	6	6	26435	26440	0 %	100 %	0 %	0 %	543945434
604	NC_022351	A	6	6	26501	26506	100 %	0 %	0 %	0 %	543945434
605	NC_022351	ATA	2	6	26555	26560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945434
606	NC_022351	TTC	2	6	26593	26598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945434
607	NC_022351	TCA	2	6	26654	26659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945434
608	NC_022351	AGG	2	6	26686	26691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543945434
609	NC_022351	TTGT	2	8	26767	26774	0 %	75 %	25 %	0 %	543945434
610	NC_022351	ATA	2	6	26810	26815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945434
611	NC_022351	AAAT	2	8	26877	26884	75 %	25 %	0 %	0 %	543945434
612	NC_022351	TCTT	2	8	26995	27002	0 %	75 %	0 %	25 %	543945434
613	NC_022351	A	6	6	27047	27052	100 %	0 %	0 %	0 %	543945434
614	NC_022351	ATA	2	6	27068	27073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945434
615	NC_022351	ATA	2	6	27179	27184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945434
616	NC_022351	ATTC	2	8	27186	27193	25 %	50 %	0 %	25 %	543945434
617	NC_022351	T	6	6	27314	27319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022351	ATT	2	6	27349	27354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022351	T	7	7	27353	27359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022351	A	6	6	27375	27380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022351	TGAT	2	8	27382	27389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022351	CAT	2	6	27405	27410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_022351	TTTAT	2	10	27411	27420	20 %	80 %	0 %	0 %	543945435
624	NC_022351	TTG	2	6	27425	27430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945435
625	NC_022351	TGT	2	6	27584	27589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945435
626	NC_022351	TGT	2	6	27659	27664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945435
627	NC_022351	CTT	2	6	27753	27758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945435
628	NC_022351	CAT	2	6	27783	27788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945435
629	NC_022351	TCT	2	6	27833	27838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945435
630	NC_022351	T	8	8	27880	27887	0 %	100 %	0 %	0 %	543945435
631	NC_022351	T	6	6	27916	27921	0 %	100 %	0 %	0 %	543945435
632	NC_022351	TATAAG	2	12	27931	27942	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543945435
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641	NC_022351	T	7	7	28203	28209	0 %	100 %	0 %	0 %	543945435
642	NC_022351	T	6	6	28274	28279	0 %	100 %	0 %	0 %	543945435
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