MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 39455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022351	CCTTAG	2	12	251124	251135	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	543945672
6002	NC_022351	T	6	6	251222	251227	0 %	100 %	0 %	0 %	543945672
6003	NC_022351	A	6	6	251286	251291	100 %	0 %	0 %	0 %	543945672
6004	NC_022351	AAG	2	6	251346	251351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945672
6005	NC_022351	CAT	2	6	251478	251483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945672
6006	NC_022351	T	7	7	251483	251489	0 %	100 %	0 %	0 %	543945672
6007	NC_022351	A	6	6	251493	251498	100 %	0 %	0 %	0 %	543945672
6008	NC_022351	GAG	2	6	251499	251504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543945672
6009	NC_022351	GCT	2	6	251516	251521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945672
6010	NC_022351	TTC	2	6	251545	251550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945672
6011	NC_022351	T	9	9	251565	251573	0 %	100 %	0 %	0 %	543945672
6012	NC_022351	TTTAA	2	10	251576	251585	40 %	60 %	0 %	0 %	543945672
6013	NC_022351	ATA	2	6	251670	251675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945672
6014	NC_022351	A	6	6	251696	251701	100 %	0 %	0 %	0 %	543945672
6015	NC_022351	TAT	2	6	251754	251759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945673
6016	NC_022351	AC	3	6	251881	251886	50 %	0 %	0 %	50 %	543945673
6017	NC_022351	T	6	6	251917	251922	0 %	100 %	0 %	0 %	543945673
6018	NC_022351	CAT	2	6	251958	251963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945673
6019	NC_022351	CCA	2	6	251968	251973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945673
6020	NC_022351	ATG	2	6	252000	252005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945673
6021	NC_022351	ACC	2	6	252072	252077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945673
6022	NC_022351	T	6	6	252174	252179	0 %	100 %	0 %	0 %	543945673
6023	NC_022351	A	6	6	252226	252231	100 %	0 %	0 %	0 %	543945673
6024	NC_022351	CCAT	2	8	252319	252326	25 %	25 %	0 %	50 %	543945673
6025	NC_022351	GGT	2	6	252471	252476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945674
6026	NC_022351	TTCTGT	2	12	252484	252495	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543945674
6027	NC_022351	ATCT	2	8	252517	252524	25 %	50 %	0 %	25 %	543945674
6028	NC_022351	TCC	2	6	252542	252547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543945674
6029	NC_022351	AT	3	6	252582	252587	50 %	50 %	0 %	0 %	543945674
6030	NC_022351	TGA	2	6	252727	252732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945674
6031	NC_022351	CAA	2	6	252787	252792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945674
6032	NC_022351	GAT	2	6	252797	252802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945674
6033	NC_022351	ATC	2	6	252803	252808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945674
6034	NC_022351	T	6	6	252907	252912	0 %	100 %	0 %	0 %	543945675
6035	NC_022351	AT	3	6	252955	252960	50 %	50 %	0 %	0 %	543945675
6036	NC_022351	ATCC	2	8	253079	253086	25 %	25 %	0 %	50 %	543945675
6037	NC_022351	TTG	2	6	253169	253174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945675
6038	NC_022351	AACT	2	8	253184	253191	50 %	25 %	0 %	25 %	543945675
6039	NC_022351	ATC	2	6	253239	253244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945675
6040	NC_022351	GTT	2	6	253271	253276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945675
6041	NC_022351	T	6	6	253284	253289	0 %	100 %	0 %	0 %	543945675
6042	NC_022351	CAT	2	6	253344	253349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945675
6043	NC_022351	CAC	2	6	253385	253390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945675
6044	NC_022351	AAT	2	6	253427	253432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945675
6045	NC_022351	TAA	2	6	253445	253450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945675
6046	NC_022351	TCT	2	6	253456	253461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945675
6047	NC_022351	CTA	2	6	253478	253483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945675
6048	NC_022351	GCTT	2	8	253493	253500	0 %	50 %	25 %	25 %	543945675
6049	NC_022351	AAC	2	6	253515	253520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945675
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6053	NC_022351	CTT	2	6	253916	253921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945675
6054	NC_022351	TGTC	2	8	253922	253929	0 %	50 %	25 %	25 %	543945675
6055	NC_022351	GCTTTT	2	12	253972	253983	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543945675
6056	NC_022351	TTC	2	6	254196	254201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945675
6057	NC_022351	AAC	2	6	254253	254258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945675
6058	NC_022351	TAA	2	6	254333	254338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945675
6059	NC_022351	TTC	2	6	254367	254372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945675
6060	NC_022351	CAT	2	6	254405	254410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945675
6061	NC_022351	TAC	2	6	254522	254527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945675
6062	NC_022351	T	6	6	254541	254546	0 %	100 %	0 %	0 %	543945675
6063	NC_022351	TGT	2	6	254604	254609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945675
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6081	NC_022351	CAT	2	6	255558	255563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945676
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6087	NC_022351	CATTT	2	10	256119	256128	20 %	60 %	0 %	20 %	543945676
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6092	NC_022351	TTGAT	2	10	256274	256283	20 %	60 %	20 %	0 %	543945677
6093	NC_022351	TGA	2	6	256289	256294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945677
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6095	NC_022351	A	6	6	256380	256385	100 %	0 %	0 %	0 %	543945677
6096	NC_022351	T	8	8	256388	256395	0 %	100 %	0 %	0 %	543945677
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6103	NC_022351	ATT	2	6	256552	256557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945677
6104	NC_022351	ATT	2	6	256567	256572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945677
6105	NC_022351	GCT	2	6	256605	256610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945677
6106	NC_022351	A	7	7	256639	256645	100 %	0 %	0 %	0 %	543945677
6107	NC_022351	AAGA	2	8	256647	256654	75 %	0 %	25 %	0 %	543945677
6108	NC_022351	TTC	2	6	256705	256710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945677
6109	NC_022351	T	7	7	256819	256825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_022351	CTTT	2	8	256852	256859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_022351	GTA	2	6	256902	256907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_022351	T	6	6	256911	256916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_022351	ATC	2	6	256996	257001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945678
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6115	NC_022351	T	7	7	257008	257014	0 %	100 %	0 %	0 %	543945678
6116	NC_022351	CTA	2	6	257085	257090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945678
6117	NC_022351	CTTT	2	8	257102	257109	0 %	75 %	0 %	25 %	543945678
6118	NC_022351	GATC	2	8	257178	257185	25 %	25 %	25 %	25 %	543945678
6119	NC_022351	GCTT	2	8	257240	257247	0 %	50 %	25 %	25 %	543945678
6120	NC_022351	GCA	2	6	257255	257260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945678
6121	NC_022351	TTTC	2	8	257274	257281	0 %	75 %	0 %	25 %	543945678
6122	NC_022351	CTT	2	6	257294	257299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945678
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6253	NC_022351	TA	3	6	263529	263534	50 %	50 %	0 %	0 %	543945688
6254	NC_022351	TTTTTC	2	12	263550	263561	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543945688
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6258	NC_022351	TCTT	2	8	263667	263674	0 %	75 %	0 %	25 %	543945688
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6260	NC_022351	ATC	2	6	263766	263771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945688
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6265	NC_022351	CTT	2	6	264224	264229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945688
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6281	NC_022351	A	6	6	265061	265066	100 %	0 %	0 %	0 %	543945689
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6288	NC_022351	AAAAT	2	10	265276	265285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6289	NC_022351	ATTTT	2	10	265302	265311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6290	NC_022351	CTTAAA	2	12	265321	265332	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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6369	NC_022351	ATG	2	6	268226	268231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945693
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6372	NC_022351	AAGA	3	12	268372	268383	75 %	0 %	25 %	0 %	543945693
6373	NC_022351	A	7	7	268411	268417	100 %	0 %	0 %	0 %	543945693
6374	NC_022351	CTT	2	6	268432	268437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945693
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