MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 39455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022351	ATA	2	6	228091	228096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945649
5502	NC_022351	TGG	2	6	228101	228106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945649
5503	NC_022351	ATA	2	6	228219	228224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945649
5504	NC_022351	TTC	2	6	228226	228231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945649
5505	NC_022351	TTA	2	6	228257	228262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945649
5506	NC_022351	A	6	6	228285	228290	100 %	0 %	0 %	0 %	543945649
5507	NC_022351	ATA	2	6	228358	228363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945649
5508	NC_022351	A	6	6	228418	228423	100 %	0 %	0 %	0 %	543945649
5509	NC_022351	T	6	6	228544	228549	0 %	100 %	0 %	0 %	543945649
5510	NC_022351	TTA	2	6	228681	228686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945649
5511	NC_022351	T	6	6	228727	228732	0 %	100 %	0 %	0 %	543945650
5512	NC_022351	TTTA	2	8	228769	228776	25 %	75 %	0 %	0 %	543945650
5513	NC_022351	AAATG	2	10	228778	228787	60 %	20 %	20 %	0 %	543945650
5514	NC_022351	ATT	2	6	228809	228814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945650
5515	NC_022351	T	6	6	228835	228840	0 %	100 %	0 %	0 %	543945650
5516	NC_022351	T	6	6	228853	228858	0 %	100 %	0 %	0 %	543945650
5517	NC_022351	TTGAT	2	10	228936	228945	20 %	60 %	20 %	0 %	543945650
5518	NC_022351	T	6	6	229004	229009	0 %	100 %	0 %	0 %	543945650
5519	NC_022351	TTTG	2	8	229028	229035	0 %	75 %	25 %	0 %	543945650
5520	NC_022351	TTTAT	2	10	229040	229049	20 %	80 %	0 %	0 %	543945650
5521	NC_022351	ATA	2	6	229050	229055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945650
5522	NC_022351	A	6	6	229098	229103	100 %	0 %	0 %	0 %	543945651
5523	NC_022351	TAT	2	6	229155	229160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945651
5524	NC_022351	GAA	2	6	229180	229185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945651
5525	NC_022351	CAT	2	6	229209	229214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945651
5526	NC_022351	AGA	2	6	229233	229238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945651
5527	NC_022351	A	8	8	229238	229245	100 %	0 %	0 %	0 %	543945651
5528	NC_022351	TGCATT	2	12	229323	229334	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543945652
5529	NC_022351	AGA	2	6	229435	229440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945652
5530	NC_022351	T	8	8	229509	229516	0 %	100 %	0 %	0 %	543945652
5531	NC_022351	ATG	2	6	229524	229529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945652
5532	NC_022351	CAG	2	6	229581	229586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945652
5533	NC_022351	ACA	2	6	229592	229597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945652
5534	NC_022351	TGG	2	6	229606	229611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945652
5535	NC_022351	CAT	2	6	229859	229864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945652
5536	NC_022351	ATC	2	6	229868	229873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945652
5537	NC_022351	GAT	2	6	229880	229885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945652
5538	NC_022351	T	6	6	229914	229919	0 %	100 %	0 %	0 %	543945652
5539	NC_022351	AAG	2	6	229950	229955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945652
5540	NC_022351	ATT	2	6	230098	230103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945652
5541	NC_022351	AGA	2	6	230119	230124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945652
5542	NC_022351	ATA	2	6	230148	230153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945652
5543	NC_022351	AGA	2	6	230182	230187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945652
5544	NC_022351	AGA	2	6	230203	230208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945652
5545	NC_022351	TTTA	2	8	230336	230343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_022351	AGAT	2	8	230370	230377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_022351	A	8	8	230381	230388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_022351	CAT	2	6	230454	230459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_022351	AAAGC	2	10	230471	230480	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5550	NC_022351	ACA	2	6	230482	230487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_022351	TGA	2	6	230531	230536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_022351	AAT	2	6	230568	230573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_022351	TTAT	2	8	230615	230622	25 %	75 %	0 %	0 %	543945653
5554	NC_022351	TTTTA	2	10	230632	230641	20 %	80 %	0 %	0 %	543945653
5555	NC_022351	ATT	2	6	230662	230667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945653
5556	NC_022351	CTT	2	6	230748	230753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945653
5557	NC_022351	TCA	2	6	230777	230782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945653
5558	NC_022351	A	6	6	230797	230802	100 %	0 %	0 %	0 %	543945653
5559	NC_022351	T	7	7	230807	230813	0 %	100 %	0 %	0 %	543945653
5560	NC_022351	AAT	2	6	230820	230825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945653
5561	NC_022351	T	6	6	230836	230841	0 %	100 %	0 %	0 %	543945653
5562	NC_022351	A	6	6	230888	230893	100 %	0 %	0 %	0 %	543945653
5563	NC_022351	CCAA	2	8	230914	230921	50 %	0 %	0 %	50 %	543945653
5564	NC_022351	T	6	6	231085	231090	0 %	100 %	0 %	0 %	543945653
5565	NC_022351	TCT	2	6	231095	231100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945653
5566	NC_022351	AGCAT	2	10	231113	231122	40 %	20 %	20 %	20 %	543945653
5567	NC_022351	CTT	2	6	231153	231158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945653
5568	NC_022351	GTTT	2	8	231254	231261	0 %	75 %	25 %	0 %	543945653
5569	NC_022351	AT	3	6	231345	231350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_022351	AAAG	2	8	231385	231392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_022351	ATTA	2	8	231403	231410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_022351	CTT	3	9	231417	231425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_022351	TCT	2	6	231430	231435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_022351	ATT	2	6	231441	231446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_022351	N	100	100	231461	231560	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_022351	TAG	2	6	231597	231602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_022351	TCA	2	6	231644	231649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_022351	TAG	2	6	231666	231671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_022351	T	6	6	231677	231682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_022351	CTA	2	6	231747	231752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_022351	T	6	6	231755	231760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_022351	AAT	2	6	231775	231780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_022351	AAT	2	6	231799	231804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_022351	ATTCA	2	10	231826	231835	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5585	NC_022351	T	6	6	231856	231861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_022351	AAT	2	6	231964	231969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_022351	AAT	2	6	231997	232002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_022351	AATAAC	2	12	232069	232080	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5589	NC_022351	TTA	2	6	232092	232097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_022351	ATC	2	6	232108	232113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_022351	A	6	6	232160	232165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_022351	CTT	2	6	232200	232205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_022351	CAT	2	6	232251	232256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_022351	T	8	8	232313	232320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_022351	T	6	6	232323	232328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_022351	GCCT	2	8	232381	232388	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_022351	TCA	2	6	232400	232405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_022351	A	8	8	232405	232412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_022351	AGA	2	6	232480	232485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_022351	TAAA	2	8	232492	232499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_022351	CTA	2	6	232523	232528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_022351	TAT	2	6	232555	232560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_022351	T	6	6	232580	232585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_022351	CTT	2	6	232701	232706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_022351	TA	4	8	232725	232732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_022351	CTATT	2	10	232879	232888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5607	NC_022351	T	6	6	232925	232930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_022351	ATT	2	6	233003	233008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_022351	TAC	2	6	233044	233049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945654
5610	NC_022351	T	7	7	233097	233103	0 %	100 %	0 %	0 %	543945654
5611	NC_022351	GAT	2	6	233112	233117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945654
5612	NC_022351	CTTT	2	8	233127	233134	0 %	75 %	0 %	25 %	543945654
5613	NC_022351	AT	4	8	233163	233170	50 %	50 %	0 %	0 %	543945654
5614	NC_022351	T	7	7	233258	233264	0 %	100 %	0 %	0 %	543945654
5615	NC_022351	ATTG	2	8	233285	233292	25 %	50 %	25 %	0 %	543945654
5616	NC_022351	AGA	2	6	233333	233338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945654
5617	NC_022351	TCC	2	6	233384	233389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543945654
5618	NC_022351	GCTATA	2	12	233541	233552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543945654
5619	NC_022351	A	6	6	233625	233630	100 %	0 %	0 %	0 %	543945654
5620	NC_022351	TATT	2	8	233636	233643	25 %	75 %	0 %	0 %	543945654
5621	NC_022351	TTG	2	6	233680	233685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945654
5622	NC_022351	TGA	2	6	233774	233779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945654
5623	NC_022351	AAT	2	6	233849	233854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945654
5624	NC_022351	TG	3	6	233987	233992	0 %	50 %	50 %	0 %	543945655
5625	NC_022351	TCA	2	6	234129	234134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945655
5626	NC_022351	AC	3	6	234175	234180	50 %	0 %	0 %	50 %	543945655
5627	NC_022351	ACT	2	6	234183	234188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945655
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5629	NC_022351	T	7	7	234208	234214	0 %	100 %	0 %	0 %	543945656
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